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曲面を用いた結び目の研究

研究課題

研究課題/領域番号 18540069
研究種目

基盤研究(C)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 幾何学
研究機関埼玉大学

研究代表者

下川 航也  埼玉大学, 大学院・理工学研究科, 准教授 (60312633)

研究分担者 水谷 忠良  埼玉大学, 理工学研究科, 教授 (20080492)
阪本 邦夫  埼玉大学, 理工学研究科, 教授 (70089829)
長瀬 正義  埼玉大学, 理工学研究科, 教授 (30175509)
江頭 信二  埼玉大学, 理工学研究科, 助教 (00261876)
連携研究者 水谷 忠良  埼玉大学, 大学院・理工学研究科, 教授 (20080492)
阪本 邦夫  埼玉大学, 大学院・理工学研究科, 教授 (70089829)
長瀬 正義  埼玉大学, 大学院・理工学研究科, 教授 (30175509)
江頭 信二  埼玉大学, 大学院・理工学研究科, 助教 (00261876)
研究期間 (年度) 2006 – 2007
研究課題ステータス 完了 (2008年度)
配分額 *注記
4,060千円 (直接経費: 3,400千円、間接経費: 660千円)
2008年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
2007年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
2006年度: 1,200千円 (直接経費: 1,200千円)
キーワード位相幾何 / 結び目 / デーン手術 / 双曲多様体 / 3次元多様体 / DNA / Xer / FtsK / DNAの組み換え / XerCD / レンズ空間 / 本質的曲面
研究概要

結び目理論におけるデーン手術の研究と、その結果のDNAの研究への応用を行った
結び目のデーン手術とは結び目の近傍であるソリッドトーラスを取り除き、異なる貼り方で貼ることにより3次元多様体を構成する方法である。現在のデーン手術の研究の中心的な課題は、双曲結び目や絡み目の例外デーン手術(非双曲多様体が得られるもの)の研究である
一方DNAに作用する酵素は結び目理論の有理タングル手術を持ちいてモデル化されている。有理タングル手術の2重分岐被覆を考えると結び目のデーン手術が対応するため、DNAの酵素の働きの位相幾何学的研究は結び目のデーン手術の研究と深い関係がある
今回の主な研究成果は以下の通りである。1, 長さ3のプレッツェル結び目の有限デーン手術の分類。2, 有理タングル手術の研究とその結果のDNAに働く酵素Xerの研究への応用。3, XerによるDNA絡み目の絡み目解消操作の特徴付け

報告書

(4件)
  • 2008 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2007 実績報告書
  • 2006 実績報告書
  • 研究成果

    (21件)

すべて 2009 2008 2007 2006 その他

すべて 雑誌論文 (8件) (うち査読あり 3件) 学会発表 (12件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] Finite surgeries on three-tangle pretzel knots2009

    • 著者名/発表者名
      David Futer, Masaharu Ishikawa, YuichiKabaya, Thomas W. Mattman and KoyaShimokawa
    • 雑誌名

      Algebr.Geom.Topol 9

      ページ: 743-771

    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Tangle analysis of DNA unlinking by the Xer/FtsK system2009

    • 著者名/発表者名
      Koya Shimokawa, Kai Ishihara and MarielVazquez
    • 雑誌名

      To appear in Bussei Kenkyu

    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [雑誌論文] Finite surgeries on three-tangle pretzel knots2009

    • 著者名/発表者名
      Koya Shimokawa 他4名
    • 雑誌名

      Algebr. Geom. Topol 9

      ページ: 743-771

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Tangle analysis of DNA unlinking by the Xer/FtsK system2009

    • 著者名/発表者名
      Koya Shimokawa 他2名
    • 雑誌名

      物性研究 92(掲載決定)

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [雑誌論文] Exceptional surgery and boundary slopesOsaka2006

    • 著者名/発表者名
      Masaharu Ishikawa and Thomas W. Mattman and Koya Shimokawa
    • 雑誌名

      J.Math 43

      ページ: 807-821

    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Exceptional surgery and boundary slopes2006

    • 著者名/発表者名
      Masaharu Ishikawa, Thomas W. Mattman, Koya Shimokawa
    • 雑誌名

      Osaka Journal of Mathematics 43.4

      ページ: 807-821

    • NAID

      120004845749

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] A Lie algebroid and a Dirac structure associated to an almost Dirac structure2006

    • 著者名/発表者名
      Kentaro Mikami, Tadayoshi Mizutani
    • 雑誌名

      FOLIATIONS 2005, ed. by P. Walczak et al.

      ページ: 341-352

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] Lie Algebroids Associated with Deformed Schouten Bracket of 2-Vector Fields2006

    • 著者名/発表者名
      Kentaro Mikami, Tadayoshi Mizutani
    • 雑誌名

      From Geometry to Quantum Mechanics, in Hornor of Hideki Omori, Birkhauser

      ページ: 147-160

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [学会発表] Tangle analysis of DNAcatenane unlinking by the Xer/FtsK system2009

    • 著者名/発表者名
      下川航也
    • 学会等名
      国際会議「 San Francisco internationalmeeting on DNA topology 」
    • 発表場所
      University of California SanFrancisco
    • 年月日
      2009-04-24
    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [学会発表] Site-specific recombination of DNA and Dehn surgery2009

    • 著者名/発表者名
      下川航也
    • 学会等名
      Friday Seminar on Knot Theory
    • 発表場所
      大阪市立大学数学研究所
    • 年月日
      2009-01-23
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] DNA and Dehn surgery on knots2008

    • 著者名/発表者名
      下川航也
    • 学会等名
      小研究集会「曲線と曲面の非線型解析」
    • 発表場所
      埼玉大学大宮ソニックシティカレッジ
    • 年月日
      2008-12-17
    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [学会発表] DNA and Dehn surgery on knots2008

    • 著者名/発表者名
      下川航也
    • 学会等名
      小研究集会「曲線と曲面の非線型解析
    • 発表場所
      埼玉大学大宮ソニックシティカレッジ
    • 年月日
      2008-12-17
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] DNAと結び目理論2008

    • 著者名/発表者名
      下川航也
    • 学会等名
      明治大学生田幾何セミナー
    • 発表場所
      明治大学
    • 年月日
      2008-12-05
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] Tangle analysis of DNA catenane unlinking by the Xer/FtsK system2008

    • 著者名/発表者名
      下川航也
    • 学会等名
      信州大学理学部数理・自然情報科学教室談話会
    • 発表場所
      信州大学理学部
    • 年月日
      2008-11-28
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] Tangle analysis of DNAcatenane unlinking by the Xer/FtsK system2008

    • 著者名/発表者名
      下川航也
    • 学会等名
      国際会議「結び目とソフトマター物理学 : 高分子のトポロジー、そして物理学、数学および生物学における関連する話題」
    • 発表場所
      京都大学基礎物理学研究所
    • 年月日
      2008-08-28
    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [学会発表] Tangle analysis of DNA unlinking by the Xer/FtsK system2008

    • 著者名/発表者名
      下川航也
    • 学会等名
      国際会議「結び目とソフトマター物理学」
    • 発表場所
      京都大学基礎物理学研究所
    • 年月日
      2008-08-28
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] Ideal pointから見つからないboumdary slopeについて2008

    • 著者名/発表者名
      下川航也
    • 学会等名
      東京女子大学トポロジーセミナー
    • 発表場所
      東京女子大学
    • 年月日
      2008-04-19
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] Tangle analysis of unlinking DNA links by XerCD2007

    • 著者名/発表者名
      下川航也
    • 学会等名
      研究集会「結び目のトポロジーX」
    • 発表場所
      東京女子大学
    • 年月日
      2007-12-23
    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [学会発表]2007

    • 著者名/発表者名
      下川 航也
    • 学会等名
      研究集会 結び目のトポロジーX
    • 発表場所
      東京女子大学
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [学会発表] DNA and lens space surgery2006

    • 著者名/発表者名
      下川航也
    • 学会等名
      研究集会「結び目のトポロジーIX」
    • 発表場所
      日本大学
    • 年月日
      2006-12-06
    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [備考] 国際会議「結び目とソフトマター物理学 : 高分子のトポロジー、そして物理学、数学および生物学における関連する話題」 (Knots andsoft-matter physics : topology of polymersand related topics in physics, mathematicsand biology)を、2008年8月26日-29日に京都大学基礎物理学研究所において、 出口哲生(お茶の水女子大学)等と共催

    • URL

      http://www.rimath.saitama-u.ac.jp/lab.jp/KoyaShimokawa.html

    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書

URL: 

公開日: 2006-04-01   更新日: 2016-04-21  

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