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翻訳後修飾に伴うヒストン様因子の機能変化がプラスミド保持細菌に与える影響の解明

研究課題

研究課題/領域番号 18K05408
研究種目

基盤研究(C)

配分区分基金
応募区分一般
審査区分 小区分38020:応用微生物学関連
研究機関東京大学

研究代表者

水口 千穂 (鈴木千穂)  東京大学, 生物生産工学研究センター, 助教 (10733032)

研究期間 (年度) 2018-04-01 – 2021-03-31
研究課題ステータス 完了 (2020年度)
配分額 *注記
4,420千円 (直接経費: 3,400千円、間接経費: 1,020千円)
2020年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
2019年度: 1,170千円 (直接経費: 900千円、間接経費: 270千円)
2018年度: 1,950千円 (直接経費: 1,500千円、間接経費: 450千円)
キーワード核様体タンパク質 / 翻訳後修飾 / アセチル化 / プラスミド / Pseudomonas / トランスクリプトーム
研究成果の概要

プラスミドは細胞間を水平伝播(親子関係による遺伝ではなく、遺伝子が細胞から細胞へと移動すること)する遺伝因子である。細菌のプラスミド上には薬剤耐性遺伝子や難分解性物質分解遺伝子など人間社会にとっても重要な遺伝子がしばしば存在するが、これらの遺伝子が宿主細菌内で発現するためには、宿主染色体由来の因子による適切な制御が必要である。本研究では、プラスミドを制御する因子として細菌の核様体タンパク質(真核生物のヒストンのようにDNAの折り畳みと遺伝子の転写制御に関与する)に着目し、核様体タンパク質の翻訳後修飾、特にアセチル化がタンパク質の機能に及ぼす影響を評価した。

研究成果の学術的意義や社会的意義

真核生物では翻訳後修飾の研究が進んでおり、例えばヒストンが修飾を受けることによりクロマチンの構造変化やそれに伴う遺伝子の転写調節が起こることはよく知られている。一方、細菌においては二成分制御系におけるリン酸化など、ごく一部のタンパク質を除いて研究例が乏しい状態であった。本研究の成果は、細菌の「ヒストン様因子」である核様体タンパク質が翻訳後修飾により機能が変化すること、翻訳後修飾がプラスミドの制御に重要な役割を果たす可能性を示唆するものであり、プラスミド上遺伝子の発現制御を考える上で新たな知見をもたらすものである。

報告書

(4件)
  • 2020 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2019 実施状況報告書
  • 2018 実施状況報告書
  • 研究成果

    (17件)

すべて 2021 2020 2019 2018 その他

すべて 国際共同研究 (1件) 雑誌論文 (1件) (うち査読あり 1件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (15件) (うち国際学会 1件、 招待講演 1件)

  • [国際共同研究] ライデン大学(オランダ)

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [雑誌論文] H-NS Family Proteins Drastically Change Their Targets in Response to the Horizontal Transfer of the Catabolic Plasmid pCAR12020

    • 著者名/発表者名
      Nakamura T, Suzuki-Minakuchi C, Kawano H, Kanesaki Y, Kawasaki S, Okada K, Nojiri H.
    • 雑誌名

      Frontiers in Microbiology

      巻: 11 ページ: 1099-1099

    • DOI

      10.3389/fmicb.2020.01099

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] Pseudomonas属細菌由来のMvaT ホモログが形成する核様体構造の解析2021

    • 著者名/発表者名
      津島和生,角埜裕基,水口千穂,尾花 望,野村暢彦,岡田憲典,野尻秀昭
    • 学会等名
      第15回日本ゲノム微生物学会年会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] 細菌は接合伝達で獲得したプラスミドにどのように「順応」するのか?2021

    • 著者名/発表者名
      水口千穂,野尻秀昭
    • 学会等名
      日本農芸化学会2021年度大会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Differential interactions of H-NS family proteins encoded on the chromosome of Pseudomonas putida KT2440 and IncP-7 plasmid pCAR12020

    • 著者名/発表者名
      Delyana Vasileva, Sun Zongping, Chiho Suzuki-Minakuchi, Kazunori Okada, Hideaki Nojiri
    • 学会等名
      ASM Microbe online
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] H-NSファミリータンパク質の転写制御対象遺伝子はプラスミド保持に伴い劇的に変化する2020

    • 著者名/発表者名
      中村泰輔, 河野響, 兼崎友, 川崎信治, 水口千穂, 岡田憲典, 野尻秀昭
    • 学会等名
      第20回東京大学生命科学シンポジウム
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] “Backup”だけではない-プラスミド由来H-NS様因子の機能-2020

    • 著者名/発表者名
      中村泰輔、河野響、兼崎友、川崎信治、水口千穂、岡田憲典、野尻秀昭
    • 学会等名
      第14回日本ゲノム微生物学会年会
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
  • [学会発表] Pseudomonas属細菌由来の核様体タンパク質NdpAにおける多量体化ドメインの探索2020

    • 著者名/発表者名
      佐道陽弘、水口千穂、岡田憲典、野尻秀昭
    • 学会等名
      第14回日本ゲノム微生物学会年会
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
  • [学会発表] Pseudomonas属細菌のH-NSファミリータンパク質における翻訳後修飾部位の同定2020

    • 著者名/発表者名
      ヴァシレヴァデリアナ、水口千穂、孫悦、古園さおり、吉田稔、岡田憲典、野尻秀昭
    • 学会等名
      日本農芸化学会2020年度大会
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
  • [学会発表] プラスミド・宿主染色体由来のMvaTホモログのDNA結合能の評価2020

    • 著者名/発表者名
      津島和生、角埜裕基、水口千穂、岡田憲典、野尻秀昭
    • 学会等名
      日本農芸化学会2020年度大会
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
  • [学会発表] H-NSファミリータンパク質のレギュロンはプラスミド保持に伴い劇的に変化する2020

    • 著者名/発表者名
      中村泰輔、河野響、兼崎友、川崎信治、水口千穂、岡田憲典、野尻秀昭
    • 学会等名
      日本農芸化学会2020年度大会
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
  • [学会発表] H-NSファミリータンパク質が制御する遺伝子群はプラスミド保持に伴い劇的に変化する2019

    • 著者名/発表者名
      中村泰輔、河野響、兼崎友、川崎信治、水口千穂、岡田憲典、野尻秀昭
    • 学会等名
      第18回微生物研究会
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
  • [学会発表] H-NSファミリータンパク質の塩基配列嗜好性とそのメカニズムの解析2019

    • 著者名/発表者名
      津島和生、角埜裕基、水口千穂、岡田憲典、野尻秀昭
    • 学会等名
      第18回微生物研究会
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
  • [学会発表] 新規核様体タンパク質NdpAホモログの多量体形成能2019

    • 著者名/発表者名
      佐道 陽弘,水口 千穂,岡田 憲典,野尻 秀昭
    • 学会等名
      第13回日本ゲノム微生物学会年会
    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
  • [学会発表] 核様体タンパク質の一種NdpAホモログの多量体形成能の解析2019

    • 著者名/発表者名
      佐道 陽弘,水口 千穂,岡田 憲典,野尻 秀昭
    • 学会等名
      日本農芸化学会2019年度大会
    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
  • [学会発表] Protein-protein binding affinities of H-NS family proteins encoded on the chromosome of Pseudomonas putida KT2440 and IncP-7 plasmid pCAR12019

    • 著者名/発表者名
      Sun Yue, Sun Zongping, Vasileva Delyana, Suzuki-Minakuchi Chiho, Okada Kazunori, Nojiri Hideaki
    • 学会等名
      日本農芸化学会2019年度大会
    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
  • [学会発表] 核様体タンパク質NdpAホモログの多量体形成能の解析2018

    • 著者名/発表者名
      佐道 陽弘,水口 千穂,岡田 憲典,野尻 秀昭
    • 学会等名
      第17回微生物研究会
    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書

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公開日: 2018-04-23   更新日: 2022-01-27  

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