| 研究課題/領域番号 |
18K07451
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| 研究種目 |
基盤研究(C)
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| 配分区分 | 基金 |
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| 応募区分 | 一般 |
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| 審査区分 |
小区分52010:内科学一般関連
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| 研究機関 | 佐賀大学 |
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研究代表者 |
佐藤 明美 佐賀大学, 医学部, 助教 (20568357)
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| 研究分担者 |
末岡 榮三朗 佐賀大学, 医学部, 教授 (00270603)
中村 秀明 佐賀大学, 医学部, 助教 (10452616)
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| 研究期間 (年度) |
2018-04-01 – 2021-03-31
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| 研究課題ステータス |
完了 (2020年度)
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| 配分額 *注記 |
4,030千円 (直接経費: 3,100千円、間接経費: 930千円)
2020年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
2019年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円)
2018年度: 1,170千円 (直接経費: 900千円、間接経費: 270千円)
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| キーワード | Liquid biopsy / cfDNA / 品質管理 / 遺伝子検査 / NGS / 品質 / 保存 |
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| 研究成果の概要 |
circulating cell free DNA(cfDNA）を使用したLiquid biopsyは、再生検の推奨される代替方法である。cfDNAによる品質管理が不可欠であり、高品質のcfDNA分離を実現することが望まれている。今回、標準的な臨床検査室で通常の手順として実行されるcfDNA分析に対する分析前の手順の影響と、長期保管によるcfDNA品質の低下の程度の2点について調べた。cfDNA分析に対する分析前の手順の影響については抗凝固剤はEDTA 2Kよりも3.2％クエン酸ナトリウムを含む方がcfDNAの品質は優れており採血後最大72時間、4℃で保存して維持したものが良いことがわかった。
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| 研究成果の学術的意義や社会的意義 |
Liquid biopsy検体については国内外多くの研究があり、それは主に検査系の開発やその機能解析である。検体そのものについては4～5年前から少しずつ論文となっているが、現在cfDNAについては血清ではなく血漿から抽出されているのが現状である。今回の研究成果では。cfDNA分析に対する分析前の手順の影響については抗凝固剤の種類、保存温度、および血液分離の期間の間の比較は、cfDNAの定量化、cfDNAのサイズ分布、およびEGFR変異の検出の観点から解析を行い、Liquid biopsyの標準化された分析前手順の確立に近づいていると考えている。
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