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超保存領域に内在されたRNAメチル化スイッチと大腸がん進展の分子基盤

研究課題

研究課題/領域番号 18K07941
研究種目

基盤研究(C)

配分区分基金
応募区分一般
審査区分 小区分53010:消化器内科学関連
研究機関徳島大学

研究代表者

桑野 由紀  徳島大学, 大学院医歯薬学研究部(医学域), 講師 (00563454)

研究期間 (年度) 2018-04-01 – 2021-03-31
研究課題ステータス 完了 (2020年度)
配分額 *注記
4,290千円 (直接経費: 3,300千円、間接経費: 990千円)
2020年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
2019年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
2018年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
キーワードRNA / 超保存領域 / RNAプロセシング / 大腸がん / RNAメチル化 / RNA修飾 / RNAスプライシング / 選択的スプライシング
研究成果の概要

高等生物のゲノムのみに完全保存された配列である超保存領域(UCR)はヒトゲノムに481か所あるが、生理的意義は明らかになっていない。UCR領域より転写されるRNA(Transcribed-UCR: T-UCR)の一部が、がん化した細胞に高発現し、その細胞増殖に寄与する可能性がある。
本研究では、T-UCRsががん細胞の核に蓄積するメカニズムとして、1) ステムループ構造を取り、核内RNA結合タンパク質と結合すること、2)がん細胞において選択的にRNAメチル化され、二次構造を変化させること、3) RNAメチル化はUCRを含んだエクソンの挿入を促進する可能性があること、を明らかにした。

研究成果の学術的意義や社会的意義

超保存領域(UCR)はマウス以上の高等生物のみ進化の過程で獲得したゲノム配列であるが、その生理学的意義は不明である。UCRから転写されるRNA群(T-UCR)の発現異常は、がんを含めた高等生物の複雑な細胞恒常性の破綻を判定するRNAバイオマーカーと成りうる。
UCRの多くはタンパク質をコードしておらず、一部のT-UCRはがん悪性化とともに核への蓄積が認められることから、T-UCRの配列特異的なノックダウンは、正規タンパク質の発現に影響を与えず、新しいコンセプトの核酸医療の開発に繋がる可能性がある。

報告書

(4件)
  • 2020 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2019 実施状況報告書
  • 2018 実施状況報告書
  • 研究成果

    (9件)

すべて 2020 2019 2018

すべて 雑誌論文 (5件) (うち査読あり 5件、 オープンアクセス 5件) 学会発表 (4件) (うち国際学会 1件)

  • [雑誌論文] The MicroRNA-23b/27b/24 Cluster Facilitates Colon Cancer Cell Migration by Targeting FOXP22020

    • 著者名/発表者名
      Nishida Kensei、Kuwano Yuki、Rokutan Kazuhito
    • 雑誌名

      Cancers

      巻: 12 号: 1 ページ: 174-174

    • DOI

      10.3390/cancers12010174

    • NAID

      120006783218

    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] A novel long non-coding RNA from the HOXA6-HOXA5 locus facilitates colon cancer cell growth2019

    • 著者名/発表者名
      Saijo Saki、Kuwano Yuki、Tange Shoichiro、Rokutan Kazuhito、Nishida Kensei
    • 雑誌名

      BMC Cancer

      巻: 19 号: 1

    • DOI

      10.1186/s12885-019-5715-0

    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] HnRNPA1 interacts with G-quadruplex in the TRA2B promoter and stimulates its transcription in human colon cancer cells2019

    • 著者名/発表者名
      Nishikawa Tatsuya、Kuwano Yuki、Takahara Yumiko、Nishida Kensei、Rokutan Kazuhito
    • 雑誌名

      Scientific Reports

      巻: 9 号: 1 ページ: 10276-10276

    • DOI

      10.1038/s41598-019-46659-x

    • NAID

      120006732015

    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Nucleolin facilitates nuclear retention of an ultraconserved region containing <i>TRA2B</i> and accelerates colon cancer cell growth2018

    • 著者名/発表者名
      Satake Yuzuru、Kuwano Yuki、Nishikawa Tatsuya、Fujita Kinuyo、Saijo Saki、Itai Miki、Tanaka Hiroki、Nishida Kensei、Rokutan Kazuhito
    • 雑誌名

      Oncotarget

      巻: 9 号: 42 ページ: 26817-26833

    • DOI

      10.18632/oncotarget.25510

    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Diverse roles of RNA-binding proteins in cancer traits and their implications in gastrointestinal cancers.2018

    • 著者名/発表者名
      Masuda K, Kuwano Y.
    • 雑誌名

      Wiley Interdiscip Rev RNA.

      巻: 10 号: 3

    • DOI

      10.1002/wrna.1520

    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] The transcribed ultraconserved region uc.138 accelerates colon cancer progression2020

    • 著者名/発表者名
      桑野由紀、西田憲生、六反一仁
    • 学会等名
      第43回日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] 超保存領域を内在するT-UCRのRNAメチル化を介した大腸がん悪性化機構2019

    • 著者名/発表者名
      桑野由紀、西田憲生、六反一仁
    • 学会等名
      第42回日本分子生物学会年会 (福岡)
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
  • [学会発表] Nuclear retention of transcribed ultraconserved region uc.138 promotes colon cancer cell growth2019

    • 著者名/発表者名
      Y. Kuwano, K. Nishida, Y. Satake, K. Rokutan
    • 学会等名
      Cell Symposium-Regulatory RNAs (Berlin, Germany)
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 機能性RNA TRA2 b 4の核局在が誘導する大腸がん悪性化メカニズム2018

    • 著者名/発表者名
      Y. Kuwano, T. Nishikawa, S. Saijo, K. Nishida, K. Rokutan
    • 学会等名
      第41回日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書

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公開日: 2018-04-23   更新日: 2022-01-27  

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