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ゲノムのヘテロ接合度が生産性に与える影響-カキにおける近交弱勢打破に向けて-

研究課題

研究課題/領域番号 18K14463
研究種目

若手研究

配分区分基金
審査区分 小区分39030:園芸科学関連
研究機関国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構

研究代表者

尾上 典之  国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構, 果樹茶業研究部門, 主任研究員 (50613121)

研究期間 (年度) 2018-04-01 – 2022-03-31
研究課題ステータス 完了 (2021年度)
配分額 *注記
4,290千円 (直接経費: 3,300千円、間接経費: 990千円)
2021年度: 390千円 (直接経費: 300千円、間接経費: 90千円)
2020年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円)
2019年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
2018年度: 1,040千円 (直接経費: 800千円、間接経費: 240千円)
キーワードカキ / 多収 / 近親交配 / 近交弱勢 / 高次倍数体 / ヘテロ接合度 / 六倍体 / GBS / RAD-seq / 果樹育種 / マーカー近縁度 / NGS / 量的多型 / 近縁度
研究成果の概要

カキ育種では、近親交配が進んでおり、その悪影響である近交弱勢による生産性低下が大きな問題となっている。本研究は、近交弱勢の研究にこれまで用いられることが少なかった、ゲノム情報を活用することで、カキにおける近交弱勢の実態を明らかにしようとするものである。ゲノム情報から近親交配の強さを推定することで、近親交配が進むにつれて、果実重、収量および樹勢の低下、また結果樹齢の遅延が生じることを見出した。

研究成果の学術的意義や社会的意義

果樹の交雑育種において、近親交配は生産性を低下させる大きな要因の一つである。果樹は、果実が実るまで長い年数を必要とすること等から、少ない世代で優良品種を生み出すため、少数の優良品種を交雑親として用いる傾向があり、近親交配に陥りやすい状況にある。近親交配を避けて、高生産性個体を効率的に育種する手法の開発は、果樹では大きな課題であるが、研究が十分進んでいるとは言い難い。本研究により、ゲノム情報を元にして、遠縁にあたる両親の組合せを選ぶことで、集団全体としての生産性向上につながり、高生産性個体を育成する有効な手段になりうると分かった。

報告書

(4件)
  • 2021 研究成果報告書 ( PDF )
  • 2020 実施状況報告書
  • 2019 実施状況報告書
  • 2018 実施状況報告書
  • 研究成果

    (1件)

すべて 2019

すべて 学会発表 (1件)

  • [学会発表] 六倍体であるカキ品種間の近縁度推定に向けたゲノムワイドな量的多型の利用2019

    • 著者名/発表者名
      尾上典之・永野惇・河野淳・東暁史・佐藤明彦
    • 学会等名
      園芸学会平成31年度春季大会
    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書

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公開日: 2018-04-23   更新日: 2023-01-30  

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