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タンパク質発現可能化ルールの解明

研究課題

研究課題/領域番号 18K19187
研究種目

挑戦的研究(萌芽)

配分区分基金
審査区分 中区分38:農芸化学およびその関連分野
研究機関名城大学

研究代表者

田村 廣人  名城大学, 農学部, 教授 (90267972)

研究分担者 加藤 晃代  名古屋大学, 生命農学研究科, 招へい教員 (40727640)
研究期間 (年度) 2018-06-29 – 2020-03-31
研究課題ステータス 完了 (2019年度)
配分額 *注記
6,370千円 (直接経費: 4,900千円、間接経費: 1,470千円)
2019年度: 4,160千円 (直接経費: 3,200千円、間接経費: 960千円)
2018年度: 2,210千円 (直接経費: 1,700千円、間接経費: 510千円)
キーワードリボソームタンパク質 / 発現量 / タンパク質生産 / タンパク質発現系 / 異種発現
研究成果の概要

本研究では、あらゆる発現系において目的タンパク質を簡単に発現可能なルールを見出すため、計約50種類の生物種(細菌、酵母、糸状菌、植物、昆虫、哺乳動物)のリボソームサブユニットタンパク質の塩基配列を独自にデータベース化した。次に、細菌と真核生物のwhole cell画分を質量分析計MALDI-TOF MSにて解析した。その結果、特異的なリボソームサブユニットタンパク質の検出シグナルが高く、それらのN末端の傾向はAla、Lys、Ser、Val、Thrの偏りが強いというルールが明らかとなった。各生物種で生産されやすいタンパク質の指標として新生鎖のアミノ酸を利用できる可能性が示唆された。

研究成果の学術的意義や社会的意義

現在、どの発現系を用いれば目的タンパク質を自由自在に組換え生産できるかのルールが無く、経験と運に頼らざるをえない。
そのルールを見出すため、質量分析計で検出可能なリボソームタンパク質と、そのN末端付近のアミノ酸配列に着目し、より検出シグナルの高いものとその配列を解析した。その結果、N末端の傾向は、Ala、Lys、Ser、Val、Thrの偏りが強いことが判明し、各生物種で生産されやすいタンパク質の指標として新生鎖のアミノ酸を利用できる可能性が示唆され、目的タンパク質の発現ルールが存在する可能性を見出すことできた。本成果の発展は、自由自在な目的タンパク質の生産に貢献でき、社会的インパクトが大きい。

報告書

(3件)
  • 2019 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2018 実施状況報告書

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公開日: 2018-07-25   更新日: 2021-02-19  

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