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胚発生期の自然発生変異に注目した高解像度な細胞系譜の解析

研究課題

研究課題/領域番号 18K19340
研究種目

挑戦的研究(萌芽)

配分区分基金
審査区分 中区分44:細胞レベルから個体レベルの生物学およびその関連分野
研究機関大阪大学

研究代表者

内村 有邦  大阪大学, 生命機能研究科, 招へい教員 (20513063)

研究期間 (年度) 2018-06-29 – 2021-03-31
研究課題ステータス 完了 (2020年度)
配分額 *注記
6,240千円 (直接経費: 4,800千円、間接経費: 1,440千円)
2019年度: 2,860千円 (直接経費: 2,200千円、間接経費: 660千円)
2018年度: 3,380千円 (直接経費: 2,600千円、間接経費: 780千円)
キーワード突然変異 / 次世代シーケンサー / 細胞系譜 / モザイク変異 / 胚発生 / マウス
研究成果の概要

多細胞生物の生体システムを理解する上では、発生段階からの細胞の系譜を理解することが重要である。本研究では、マウス成体の組織試料に対して全ゲノムシーケンシングを行い、初期発生期の細胞分裂とともに自然発生する変異(組織中ではモザイク状態の変異として観察される)を正確に捉え、組織中での変異の存在頻度を数理モデルにより解析することで、生体試料を直接シーケンシングするだけで「初期発生期の細胞系譜を解析できる方法論」の開発に成功した。

研究成果の学術的意義や社会的意義

本研究で開発に成功した「細胞系譜の解析技術」は、既存の方法に比べて、大きな優位性をもつが、シーケンシング時のカバレッジを増加させれば、さらに詳細な細胞系譜図の構築が可能になる。また、遺伝子組み換え技術を必要としないため、ヒト検体でも、すぐに応用可能な方法論である。医学研究も含めて、今後の生命科学の様々な領域で活用されていくと考えられる技術であり、学術的にも社会的にも意義の大きい研究だと考えられる。

報告書

(4件)
  • 2020 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2019 実施状況報告書
  • 2018 実施状況報告書
  • 研究成果

    (10件)

すべて 2020 2019 2018

すべて 雑誌論文 (2件) (うち査読あり 1件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (8件) (うち国際学会 3件、 招待講演 3件)

  • [雑誌論文] 実験用マウスを用いた放射線被ばくの次世代遺伝影響の解析2020

    • 著者名/発表者名
      佐藤康成、内村有邦
    • 雑誌名

      広島医学

      巻: 73 ページ: 228-232

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [雑誌論文] Characteristics of induced mutations in offspring derived from irradiated mouse spermatogonia and mature oocytes2020

    • 著者名/発表者名
      Yasunari Satoh, Jun-ichi Asakawa, Mayumi Nishimura, Tony Kuo, Norio Shinkai, Harry M. Cullings, Yohei Minakuchi, Jun Sese, Atsushi Toyoda, Yoshiya Shimada, Nori Nakamura, Arikuni Uchimura
    • 雑誌名

      Scientific Reports

      巻: 10 号: 1 ページ: 37-37

    • DOI

      10.1038/s41598-019-56881-2

    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] De novo生殖系列変異の特徴と後世代影響2020

    • 著者名/発表者名
      内村有邦、佐藤康成、樋口真弓、水口洋平、豊田敦、八木健
    • 学会等名
      日本遺伝学会第92回大会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] De novo germline mutations and their phenotypic effects on future generations2019

    • 著者名/発表者名
      Arikuni Uchimura, Yasunari Satoh
    • 学会等名
      第6回アジア環境変異原学会/日本環境変異原学会第48回大会 合同大会
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] A new approach for de novo germline mutations using a mutation accumulation mouse model2019

    • 著者名/発表者名
      Arikuni Uchimura, Mayumi Higuchi, Yasunari Satoh, Yohei Minakuchi, Takahiro Tsuji, Masaaki Imanaka, Akiko Miura, Atsushi Toyoda, Takeshi Yagi
    • 学会等名
      日本放射線影響学会第62回大会
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Mutation spectrum in the genome of offspring derived from irradiated mouse spermatogonia and mature oocytes2019

    • 著者名/発表者名
      Yasunari Satoh, Mayumi Nishimura, Tony Kuo, Norio Shinkai, Harry M. Cullings, Yohei Minakuchi, Jun Sese, Atsushi Toyoda, Yoshiya Shimada, Nori Nakamura, Arikuni Uchimura
    • 学会等名
      日本放射線影響学会第62回大会
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
  • [学会発表] De novo germline mutations and the phenotypic effects of mutation accumulation in laboratory mice2019

    • 著者名/発表者名
      Arikuni Uchimura, Yasunari Satoh, Mayumi Higuchi, Yohei Minakuchi, Jo Nishino, Atsushi Toyoda, Takeshi Yagi
    • 学会等名
      The 16th International Congress of Radiation Research 2019
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Induced mutations in offspring derived from irradiated mouse spermatogonia and mature oocytes2019

    • 著者名/発表者名
      Yasunari Satoh, Jun-ichi Asakawa, Mayumi Nishimura, Harry M. Cullings, Yoshiya Shimada, Nori Nakamura, Arikuni Uchimura
    • 学会等名
      The 16th International Congress of Radiation Research 2019
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] マウスの生殖系列で発生する挿入欠失変異の発生頻度とその特徴2018

    • 著者名/発表者名
      内村有邦、樋口真弓、水口洋平、佐藤康成、辻隆弘、中本芳子、今中正明、三浦昭子、豊田敦、八木健
    • 学会等名
      日本放射線影響学会第61回大会
    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
  • [学会発表] マウス生殖系列で発生するde novo変異から見る哺乳類ゲノムの進化2018

    • 著者名/発表者名
      内村有邦、樋口真弓、水口洋平、松本拡高、若山清香、若山照彦、佐藤康成、福村龍太郎、辻隆弘、今中正明、中本芳子、三浦昭子、権藤洋一、豊田敦、八木健
    • 学会等名
      第41回日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
    • 招待講演

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公開日: 2018-07-25   更新日: 2022-01-27  

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