個人識別実務に即したSNPタイピングの迅速化および効率化の検討

• 研究課題/領域番号: 19590667
• 研究種目: 基盤研究(C)
• 配分区分: 補助金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 法医学
• 研究機関: 東北大学
• 研究代表者: 橋谷田 真樹 東北大学, 大学院・医学系研究科, 技術専門員 (40374938)
• 研究分担者: 境 純 東北大学, 大学院医学系研究科, 助教 (20431504)
• 研究期間 (年度): 2007 – 2008
• 研究課題ステータス: 完了 (2008年度)
• 配分額: 4,680千円 (直接経費: 3,600千円、間接経費: 1,080千円); 2008年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円); 2007年度: 3,120千円 (直接経費: 2,400千円、間接経費: 720千円)
• キーワード: DNA多型医学 / SNP / 社会医学 / 核酸 / ゲノム / 個人 / 暗号・認証等 / 個人識別

研究概要

次のsingle nucleotide polymorphism(SNP)データベースを構築し, その個人識別有用性を確認した. 常染色体上SNP150座位(100名),Y染色体上SNP24座位(243名), およびミトコンドリアDNA上のSNP24座位(215名)である. さらに, 通常は約45分かかるFast TaqMan法の反応時間を検討し,DNAの抽出からタイピング結果を得るまで,わずか30分しか要さない反応系を確立した. また, Microsoft Excelによるスプレッドシートを新たに作製することで, 一度に最大96SNPの解析を可能にし, 識別精度の向上が図られた.

研究成果

• [雑誌論文] Polymorphism of eight X-chromosomal STRs in a Japanese population (2008)
  • 著者名/発表者名: Masaki Hashiyada, Yukio Itakura, Masato Funayama
  • 雑誌名: Forensic Sci. Int. Genetics Supplement Series 1 ページ: 150-152
  • 査読あり
• [雑誌論文] Population genetics of 17 Y-chromosomal STR loci in Japanese (2008)
  • 著者名/発表者名: Masaki Hashiyada, Kazuo Umetsu, Isao Yuasa, Akiyoshi Tamura, Aya Matsusue, Koichi Suzuki, Seiichi Kashimura, and Masato Funayama
  • 雑誌名: Forensic Sci. Int. Genetics Vol.2 ページ: 69-70
  • 査読あり
• [雑誌論文] Population genetics of 17 Y-chromosomal STR loci in Japanese (2008)
  • 著者名/発表者名: Masaki Hashiyada, et.al.
  • 雑誌名: Forensic Science International Genetics 2
  • 査読あり
• [雑誌論文] Polymorphism of eight X-chromosomal STRs in a Japanese population (2008)
  • 著者名/発表者名: Masaki Hashiyada, et.al.
  • 雑誌名: Forensic Science International Genetics Supplement Series 1 ページ: 150-152
  • 査読あり
• [雑誌論文] Paradox in the Biometric Personal Authentication System Using STR Polymorphism (2007)
  • 著者名/発表者名: Hashiyada M, Itakura Y, Funayama M.
  • 雑誌名: - Practical Matching Probabilities Evaluate the DNA personal ID System -. Res Pract Forens Med 50 ページ: 235-239
  • 査読あり
• [雑誌論文] The Birthday Paradox in the Biometric Personal Authentication System using STR Polymorphism -Personal Matching Probabilities Evaluate the DNA Personal ID System- (2007)
  • 著者名/発表者名: Masaki Hashiyada, Jun Sakai, Toshio Nagashima, et. al.
  • 雑誌名: Res Pract Forens Med 50 ページ: 235-239
  • 査読あり
• [雑誌論文] SNPデータベースの構築と解析の高速化 (2007)
  • 著者名/発表者名: 橋谷田真樹, 板倉征男, 長嶋登志男他
  • 雑誌名: DNA多型 15 ページ: 293-295
• [学会発表] 新たな一塩基多型(SNP)情報による個人識別精度の向上 (2009)
  • 著者名/発表者名: 橋谷田真樹, 板倉征男, 舟山眞人
  • 学会等名: 2009年暗号と情報セキュリティシンポジウム
  • 発表場所: 大津.大津プリンスホテル
• [学会発表] 新たな-塩基多型(SNP)情報による個人識別精度の向上 (2009)
  • 著者名/発表者名: 橋谷田真樹, 板倉征男, 舟山眞人
  • 学会等名: 2009年暗号と情報セキュリティシンポジウム
  • 発表場所: 大津プリンスホテル, 大津
• [学会発表] 日本人におけるSNPsデータベースの充実と識別精度向上の検討 (2008)
  • 著者名/発表者名: 橋谷田真樹, 板倉征男, 舟山眞人
  • 学会等名: 日本DNA多型学会第17回学術集会
  • 発表場所: 東京.私学会館
• [学会発表] Haplogroup determination of mitochondrial DNA in Japanese using single nucleotide polymorphisms analysis (2008)
  • 著者名/発表者名: Masaki Hashiyada, Yukio Itakura, Masato Funayama
  • 学会等名: The 19th International Symposium on Human Identification
  • 発表場所: Identification. Hollywood, California, USA.
• [学会発表] Development of a spreadsheet for SNPs typing using MicrosoftR EXCEL (2008)
  • 著者名/発表者名: Masaki Hashiyada, Yukio Itakura, Shirushi Takahashi, Jun Sakai, Masato Funayama
  • 学会等名: The 7th International Symposium Advances in Legal Medicine
  • 発表場所: Osaka, JAPAN
• [学会発表] Development of a spreadsheet for SNPs typing using Microsoft^R EXCEL (2008)
  • 著者名/発表者名: Masaki Hashiyada, Yukio Itakura, Masato Funayama, et.al.
  • 学会等名: The 7th International Symposium Advances in Legal Medicine
  • 発表場所: Osaka, Japan
• [学会発表] Haplogroup determination of mitochondrial DNA in Japanese using single nucleotide polymorphisms analysis (2008)
  • 著者名/発表者名: Masaki Hashiyada, Yukio Itakura, Masato Funayama
  • 学会等名: The 19th International Symposium on Human Identification
  • 発表場所: Hollywood, California, USA
• [学会発表] 日本人におけるSNPsデータベースの充実と識別精度向上の検討 (2008)
  • 著者名/発表者名: 橋谷田真樹, 板倉征男, 舟山眞人
  • 学会等名: 日本DNA多型学会第17回学術集会
  • 発表場所: 私学会館, 東京
• [学会発表] Fast TaqMan法を用いた日本人におけるY-SNP解析 (2007)
  • 著者名/発表者名: 橋谷田真樹, 板倉征男, 舟山眞人
  • 学会等名: 日本DNA多型学会第16回学術集会
  • 発表場所: 大阪
• [学会発表] Population genetics of eight X-chromosomal STRs in a Japanese population (2007)
  • 著者名/発表者名: Hashiyada M, Itakura Y, Funayama M.
  • 学会等名: The 18th International Symposium on Human Identification
  • 発表場所: Hollywood, California, USA.
• [学会発表] Polymorphism of eight X-chromosomal STRs in a Japanese population (2007)
  • 著者名/発表者名: Hashiyada M, Itakura Y, Funayama M.
  • 学会等名: 22nd Congress of the International Society for Forensic Genetics
  • 発表場所: Copenhagen, Denmark
• [学会発表] Studies on differentially methylated parental allele in imprinted genes (2007)
  • 著者名/発表者名: Nakayashiki N, Takamiya M, Shimamoto K, Aoki Y, Hashiyada M.
  • 学会等名: 22nd Congress of the International Society for Forensic Genetics
  • 発表場所: Copenhagen, Denmark
• [学会発表] 複数の人間をSNPで検出するには何座位必要か? (2007)
  • 著者名/発表者名: 境純, 橋谷田真樹, 高橋識志, 金涌佳雅, 金武潤, 舟山眞人
  • 学会等名: 第91次日本法医学会総会
  • 発表場所: 秋田
• [図書] Fast TaqMan法を用いた日本人におけるY-SNP解析. DNA多型16 (2008)
  • 著者名/発表者名: 橋谷田真樹, 板倉征男, 舟山眞人
  • 出版者: 東京 : 東洋書籍
• [図書] DNA多型Vol.16 (2008)
  • 著者名/発表者名: 橋谷田真樹, 板倉征男, 舟山眞人
  • 出版者: Fast TaqMan法を用いた日本人におけるY-SNP解析
• [図書] SNPデータベースの構築と解析の高速化. DNA多型15 (2007)
  • 著者名/発表者名: 橋谷田真樹、板倉征男、長嶋登志男、境純、舟山眞人
  • 出版者: 東京 : 東洋書籍
• [図書] 擬父と擬父の祖父のいずれかが生物学的な父親かを問う場合の父権肯定確率計算法. DNA多型15. (2007)
  • 著者名/発表者名: 境純、橋谷田真樹、金武 潤、舟山眞人
  • 出版者: 東京 : 東洋書籍
• [図書] DMPA(differentiallymethylated parental allele)検出法に関する検討III.DNA多型15. (2007)
  • 著者名/発表者名: 中屋敷徳, 高宮正隆, 熊谷章子, 青木康博, 橋谷田真樹
  • 出版者: 東京 : 東洋書籍
• [図書] 2007年 暗号と情報セキュリティシンポジウム(SCIS2007)予稿集 (2007)
  • 著者名/発表者名: 橋谷田真樹, 斉藤 直, 板倉征男, 舟山眞人
  • 出版者: 一塩基多型(SNP)による個人識別の実験的検証と解析の高速化(CD-ROM)