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ライブセルイメージにおける特定オルガネラ領域の自動認識システムの開発

研究課題

研究課題/領域番号 19800062
研究種目

若手研究(スタートアップ)

配分区分補助金
研究分野 生体生命情報学
研究機関独立行政法人理化学研究所

研究代表者

竹本 智子  独立行政法人理化学研究所 (00450403)

研究期間 (年度) 2007 – 2008
研究課題ステータス 完了 (2008年度)
配分額 *注記
3,115千円 (直接経費: 2,710千円、間接経費: 405千円)
2008年度: 1,755千円 (直接経費: 1,350千円、間接経費: 405千円)
2007年度: 1,360千円 (直接経費: 1,360千円)
キーワード領域抽出 / パターン認識 / 細胞内画像処理 / 特徴抽出 / 画像認識 / ライブセル / ノイズリダクション
研究概要

細胞生物・分子生物学にとって、画像解析によるオルガネラの定量分析は極めて重要だが、大量かつノイズが多い画像において、画像解析の前処理として欠かせない領域抽出を実現することは難しく、研究のボトルネックとなっている。本研究では、研究者が注目するオルガネラの画像特徴を自動解析し、その特徴に適した領域抽出アルゴリズムを自動選択するシステムを開発した。これによって、時間変化する大量画像から注目対象を精度よく自動抽出できるようになった。抽出結果によって、オルガネラ領域の3次元観察、体積・表面積の計測などが容易に可能となり、よりスムーズな研究発展に大きく寄与することが期待されている。

報告書

(3件)
  • 2008 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2007 実績報告書
  • 研究成果

    (16件)

すべて 2009 2008 2007

すべて 雑誌論文 (4件) (うち査読あり 2件) 学会発表 (11件) 産業財産権 (1件)

  • [雑誌論文] Segmentation of Anatomical Structure by Using a Local Classifier Derived from Neighborhood Information2009

    • 著者名/発表者名
      S. Takemoto, H. Yokota, R. Himeno, T. Mishima
    • 雑誌名

      Advances in Intelligent and Soft Com-putting, (Springer) (in press)

      ページ: 0-0

    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Segmentation of Anatomical Structure by Using a Local Classifier Derived from Neighborhood Information2009

    • 著者名/発表者名
      S. Takemoto, H. Yokota, R. Himeno, T. Mishima
    • 雑誌名

      Human-Computer Systems Interaction Backgrounds and Applications (印刷中)

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] 領域抽出:画像特徴と形状の評価によるオブジェクト抽出2008

    • 著者名/発表者名
      竹本智子, 横田秀夫
    • 雑誌名

      理研シンポジウムVCADシステム研究2008 1

      ページ: 139-140

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [雑誌論文] Live Cell Modeling Project2008

    • 著者名/発表者名
      H. Yokota, S. Yoshizawa, S. Takemoto, et al.
    • 雑誌名

      理研シンポジウムVCADシステム研究2008 1

      ページ: 123-124

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] ライブセルイメージにおける領域抽出2008

    • 著者名/発表者名
      竹本 智子
    • 学会等名
      理研シンポジウム生物研究基盤ツールとしてのライブセルモデリング
    • 発表場所
      理化学研究所和光本所
    • 年月日
      2008-03-03
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [学会発表] ライブセルイメージにおける領域抽出2008

    • 著者名/発表者名
      竹本智子
    • 学会等名
      理研シンポジウム 生物研究基盤ツールとしてのライブセルモデリング
    • 発表場所
      埼玉
    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [学会発表] Seguemtation of Anatomical Structure by using a Loal Classifier Drived from Neighborhood Informaton2008

    • 著者名/発表者名
      Satoko Takemoto
    • 学会等名
      IEEE International Conference on Human System Interactions
    • 発表場所
      Krakow, Poland
    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [学会発表] Image Segmentation for Live Cell Modeling2008

    • 著者名/発表者名
      Satoko Takemoto
    • 学会等名
      1^<st> Joint Workshop on Computational Science
    • 発表場所
      埼玉
    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [学会発表] Live Cell Modeling Project2008

    • 著者名/発表者名
      Shin Yoshizawa(発表者)
    • 学会等名
      The 9^<th> international Conference on Systems Biology
    • 発表場所
      Gothenburg, Sweden
    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [学会発表] 領域抽出:画像特徴と形状の評価によるオブジェクト抽出2008

    • 著者名/発表者名
      竹本智子
    • 学会等名
      理研シンポジウムVCADシステム研究2008
    • 発表場所
      埼玉
    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [学会発表] Segmentation of Anatomical Structure by Using a Local Classifier Derived from Neighborhood Information2008

    • 著者名/発表者名
      S. Takemoto, H. Yokota, R. Himeno, T. Mishima
    • 学会等名
      IEEE International Conference on Human System Interactions
    • 発表場所
      Krakow, Poland
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] Live cell modeling project2008

    • 著者名/発表者名
      H. Yokota, S. Yoshizawa, S. Takemoto, et al.
    • 学会等名
      Internatilnal Conference on Systems Biology
    • 発表場所
      Gothenburg, Sweden
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] Image Segmentation for Live Cell Modeling2008

    • 著者名/発表者名
      S. Takemoto
    • 学会等名
      1st Joint Workshop on Computational Science
    • 発表場所
      Saitama, Japan
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] 生物の内部構造の理解・解析のための画像領域抽出2007

    • 著者名/発表者名
      竹本 智子
    • 学会等名
      理研シンポジウムVCADシステム研究2007
    • 発表場所
      理化学研究所和光本所
    • 年月日
      2007-10-18
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [学会発表] 生物の内部構造理解・解析のための画像領域抽出2007

    • 著者名/発表者名
      竹本智子
    • 学会等名
      理研シンポジウムVCADシステム研究2007
    • 発表場所
      埼玉
    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [産業財産権] 画像処理装置、画像処理方法およびプログラム2009

    • 発明者名
      竹本智子、横田秀夫
    • 権利者名
      独立行政法人 理化学研究所
    • 産業財産権番号
      2009-110683
    • 出願年月日
      2009-04-30
    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書

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公開日: 2007-04-01   更新日: 2016-04-21  

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