海藻類の系統、生物地理及び種分化過程に関する研究

• 研究課題/領域番号: 19F19796
• 研究種目: 特別研究員奨励費
• 配分区分: 補助金
• 応募区分: 外国
• 審査区分: 小区分45030:多様性生物学および分類学関連
• 研究機関: 神戸大学
• 研究代表者: 川井 浩史 神戸大学, 内海域環境教育研究センター, 特命教授 (30161269)
• 研究分担者: VIEIRA CHRISTOPHE 神戸大学, 内海域環境教育研究センター, 外国人特別研究員
• 研究期間 (年度): 2019-11-08 – 2022-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2021年度)
• 配分額: 2,100千円 (直接経費: 2,100千円); 2021年度: 700千円 (直接経費: 700千円); 2020年度: 1,000千円 (直接経費: 1,000千円); 2019年度: 400千円 (直接経費: 400千円)
• キーワード: 褐藻 / 紅藻 / 生物地理 / 分子系統 / Lobophora / Newhousia / Hildenbrandia / 生物多様性

研究開始時の研究の概要

褐藻類，特にアミジグサ目，シオミドロ目，ヒバマタ目，コンブ目の高次の系統関係を，すでに公表されているゲノム情報と，これまでに解析されていないが，鍵となる分類群の一般的に用いられている核，葉緑体およびミトコンドリア遺伝子の塩基配列情報に基づき解明する。これによって得られた系統樹と，分布及び系統関係の詳細が明らかになった種を対象に，それぞれの系統群の系統地理学的な解析を行い，海藻類の多様化のパターンについて議論する。

研究実績の概要

海藻類の系統分類に関しては，日本およびニューカレドニアなどの熱帯域に分布する褐藻アミジグサ目のLobophora属，Newhousia属，Taonia属，紅藻Hildenbrandia属などの種について分類の再検討を行い，多くの新種を報告すると共に，生物地理学的な情報の整理を行った。また，これらの知見とこれまでに報告されているフロラ研究の成果をふまえて，地球規模での褐藻類の分布拡大と種分化におけるパターンについて考察を行った。また，フランスを中心に国際コンソーシアムで進められている褐藻類の網羅的なゲノム解析プロジェクトに参加して，解析対象となった種の系統関係についてドラフトゲノム情報を用いて効率的に明らかにするため，数十個の核コードのシングルコピー遺伝子に基づく分子系統解析を行い，信頼度の高い分子系統樹を得た。また，褐藻類の多様性と進化に関する総説の執筆に参加して，分子系統および分類についての章を担当した。これらの成果は8編の国際誌における原著論文，総説として公表された。

現在までの達成度 (段落)

令和3年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

令和3年度が最終年度であるため、記入しない。

研究成果

• [雑誌論文] Providing a phylogenetic framework for trait-based analyses in brown algae: Phylogenomic tree inferred from 32 nuclear protein-coding sequences (2022)
  • 著者名/発表者名: Akita Shingo、Vieira Christophe、Hanyuda Takeaki、Rousseau Florence、Cruaud Corinne、Couloux Arnaud、Heesch Svenja、Cock J. Mark、Kawai Hiroshi
  • 雑誌名: Molecular Phylogenetics and Evolution 巻: 168 ページ: 107408-107408
  • DOI: 10.1016/j.ympev.2022.107408
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Phylogenetic position of <i>Newhousia</i> (Dictyotales, Phaeophyceae) and the description of <i>N. sumayensis sp. nov</i>. from Guam (2022)
  • 著者名/発表者名: Vieira Christophe、Schils Tom、Kawai Hiroshi、D’hondt Sofie、Paiano Monica O.、Sherwood Alison R.、De Clerck Olivier、Zubia Mayalen
  • 雑誌名: Phycologia 巻: 61 号: 3 ページ: 1-10
  • DOI: 10.1080/00318884.2022.2034364
  • 査読あり / 国際共著
• [雑誌論文] Global diversification and biogeography of a group of brown seaweeds (Phaeophyceae) driven by clade-specific evolutionary processes (2021)
  • 著者名/発表者名: Vieira, C., Steen, F., D’hondt, S., Bafort, Q., Tyberghein, L., Fernandez- Garcia, C., Wysor, B., Tronholm, A., Mattio, L., Payri, C., Kawai, H., Saunders, G.W., Leliaert, F., Verbruggen, H., De Clerck, O.
  • 雑誌名: J. Biogeography 巻: nil 号: 4 ページ: 703-715
  • DOI: 10.1111/jbi.14047
  • 査読あり / 国際共著
• [雑誌論文] Hildenbrandia (Hildenbrandiales, Florideophyceae) from Japan and taxonomic lumping of H. jigongshanensis and H. japananensis (2021)
  • 著者名/発表者名: Vieira, C., Akita, S., Uwai, S., Hanyuda, T., Shimada, S., Kawai, H.
  • 雑誌名: Phycologia 巻: nil 号: 3 ページ: 1-5
  • DOI: 10.1111/pre.12456
  • 査読あり / 国際共著
• [雑誌論文] Marine macroalgal biodiversity of northern Madagascar: morpho-genetic systematics and implications of anthropic impacts for conservation (2021)
  • 著者名/発表者名: Vieira Christophe、De Ramon N’Yeurt Antoine、Rasoamanendrika Faravavy A.、D’Hondt Sofie、Tran Lan-Anh Thi、Van den Spiegel Didier、Kawai Hiroshi、De Clerck Olivier
  • 雑誌名: Biodiversity and Conservation 巻: 30 号: 5 ページ: 1501-1546
  • DOI: 10.1007/s10531-021-02156-0
  • 査読あり / 国際共著
• [雑誌論文] Lobophora (Dictyotales, Phaeophyceae) from the western Indian Ocean: diversity and biogeography (2021)
  • 著者名/発表者名: Vieira Christophe、Rasoamanendrika Faravavy A.、Zubia Mayalen、Bolton John J.、Anderson Robert J.、Engelen Aschwin H.、D'hondt Sofie、Leliaert Frederik、Payri Claude、Kawai Hiroshi、De Clerck Olivier
  • 雑誌名: South African Journal of Botany 巻: 142 ページ: 230-246
  • DOI: 10.1016/j.sajb.2021.06.015
  • 査読あり / 国際共著
• [雑誌論文] First record of the genus Hildenbrandia (Florideophyceae: Hildenbrandiales) from French Polynesia and description of H.?tahitiensis sp. nov. (2021)
  • 著者名/発表者名: Vieira Christophe、Akita Shingo、Kim Yi Sun、Shimada Satoshi、Kawai Hiroshi、Zubia Mayalen
  • 雑誌名: Journal of Asia-Pacific Biodiversity 巻: 14 号: 4 ページ: 607-612
  • DOI: 10.1016/j.japb.2021.07.008
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Whole‐genome sequencing reveals forgotten lineages and recurrent hybridizations within the kelp genus <i>Alaria</i> (Phaeophyceae) (2021)
  • 著者名/発表者名: Bringloe Trevor T.、Zaparenkov Dani、Starko Samuel、Grant William Stewart、Vieira Christophe、Kawai Hiroshi、Hanyuda Takeaki、Filbee‐Dexter Karen、Klimova Anna、Klochkova Tatyana A.、Krause‐Jensen Dorte、Olesen Birgit、Verbruggen Heroen
  • 雑誌名: Journal of Phycology 巻: 57 号: 6 ページ: 1721-1738
  • DOI: 10.1111/jpy.13212
  • 査読あり / 国際共著
• [雑誌論文] Lobophora (Dictyotales) from the western Indian Ocean: diversity and biogeography (2021)
  • 著者名/発表者名: Vieira, C., Faravavy, R.A., Zubia, M., Bolton, J.J., Anderson, R.J., Engelen, A.H., D’Hondt, S., Leliaert, F., Payri, C., Kawai, H., De Clerke, O.
  • 雑誌名: South African J. Botany 巻: nil
  • 査読あり / 国際共著
• [雑誌論文] Phylogeny and evolution of the brown macroalgae (2020)
  • 著者名/発表者名: Bringloe, T., Starko, S. Wade, R.M., Vieira, C., Kawai, H., De Clerck, O., Cock, M., Coelho, S., Destombe, C., Valero, M., Neiva, J., Pearson, G.A., Faugeron, S., Serrao, E.A., Verbruggen, H.
  • 雑誌名: Critical Reviews in Plant Sciences 巻: nil 号: 4 ページ: 281-321
  • DOI: 10.1080/07352689.2020.1787679
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [学会発表] Diversity, biogeography and evolution of the most basal Florideophycean order, Hildenbrandiales (2021)
  • 著者名/発表者名: Vieira C., Saunders G., Akita S., Kawai H.
  • 学会等名: 45th Annual Meeting of the Japanese Society of Phycology
• [学会発表] iversity, biogeography and evolution of Hildenbrandiales (Florideophyceae, Rhodophyta). (2021)
  • 著者名/発表者名: Vieira, C., Saunders, G., Akita, S., Kawai, H.
  • 学会等名: 日本藻類学会第45回大会