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イネ小胞子に潜在する個体分化能と倍数化能を活用した育種基盤の新構築

研究課題

研究課題/領域番号 19H00937
研究種目

基盤研究(A)

配分区分補助金
応募区分一般
審査区分 中区分39:生産環境農学およびその関連分野
研究機関北海道大学

研究代表者

貴島 祐治  北海道大学, 農学研究院, 教授 (60192556)

研究分担者 山本 敏央  岡山大学, 資源植物科学研究所, 教授 (00442830)
長岐 清孝  岡山大学, 資源植物科学研究所, 准教授 (70305481)
小出 陽平  北海道大学, 農学研究院, 准教授 (70712008)
金 鍾明  東京大学, 大学院農学生命科学研究科(農学部), 特任准教授 (90415141)
研究期間 (年度) 2019-04-01 – 2023-03-31
研究課題ステータス 完了 (2023年度)
配分額 *注記
45,890千円 (直接経費: 35,300千円、間接経費: 10,590千円)
2022年度: 8,840千円 (直接経費: 6,800千円、間接経費: 2,040千円)
2021年度: 8,840千円 (直接経費: 6,800千円、間接経費: 2,040千円)
2020年度: 8,840千円 (直接経費: 6,800千円、間接経費: 2,040千円)
2019年度: 19,370千円 (直接経費: 14,900千円、間接経費: 4,470千円)
キーワードイネ / 小胞子 / 葯培養 / 倍数体 / 種間雑種 / 減数分裂 / 雑種不稔 / 稔性 / カルス / カルス形成率 / japonica / Indica / 個体分化能 / 倍数化能 / 育種 / 四倍体 / 非還元性配偶子 / 染色体異常 / イネ種間雑種 / 非還元減数分裂 / 雑種不稔性 / 育種基盤
研究開始時の研究の概要

植物の未成熟葯を培養すると、小胞子からカルスや胚が形成され植物個体が得られる。葯培養は広い植物種で普及した技術であるが、なぜ小胞子が高い個体分化能を保持するのか、未だに明らかではない。本申請に先駆けて、アジアイネとアフリカイネのF1雑種の葯培養から倍数性を獲得し稔性を有する複数の個体を得た。本研究では、イネの小胞子がもつ個体分化能を理解し、小胞子から直接植物体を得る培養法を開発する。倍数体がなぜ発生し、アジアイネとアフリカイネの雑種不稔を回避できたのかを探る。得られた知見をもとに、新しい育種素材として異なるゲノムを持つ4倍体を小胞子培養によって作出し、育種基盤の構築をめざす。

研究成果の概要

本研究はイネの小胞子に潜在する能力を利用して、新しい育種基盤の構築を目指し実施した。1)小胞子の脱分化には低温が必要で、2)脱分化する小胞子は葯全体のわずか1%程度であった。3)アジアイネ(S)とアフリカイネ(G)の雑種個体を葯培養して得た稔性を持つ四倍体の後代集団は、F1の花粉母細胞で生じた減数分裂の異常によって発生した二倍体の配偶子に起因した。4)S/G種間雑種の四倍体が稔性を獲得したのは、雑種不稔遺伝子座のKiller-Protector 対立遺伝子量に依存することを明らかにした。5)強力な雑種不稔遺伝子を固定すると二倍体でも稔性を有する個体が得られることが判明した。

研究成果の学術的意義や社会的意義

本研究はイネの小胞子に潜在する個体分化能と倍数化能を利用して、新しい品種育成の基盤を構築することを目標に実施した。アジアイネ(Oryza sativa: S)とアフリカイネ(O. glaberrima: G)の雑種個体を葯培養することによって、稔性を持つ後代集団を得た。S/Gの間で発生する強力な雑種不稔遺伝子を固定すると二倍体でも稔性を有する個体が得られることが判明し、四倍体種間雑種を介して両種の多様な遺伝子の組合せを有する遺伝資源の構築が、初めて可能となった。

報告書

(6件)
  • 2023 研究成果報告書 ( PDF )
  • 2022 実績報告書
  • 2021 実績報告書
  • 2020 実績報告書
  • 2019 審査結果の所見   実績報告書
  • 研究成果

    (42件)

すべて 2024 2023 2022 2021 2020 2019

すべて 雑誌論文 (16件) (うち国際共著 7件、 査読あり 15件、 オープンアクセス 14件) 学会発表 (26件)

  • [雑誌論文] Different contributions of PROG1 and TAC1 to the angular kinematics of the main culm and tillers of wild rice (Oryza rufipogon)2023

    • 著者名/発表者名
      Tokuyama Yoshiki、Omachi Miku、Kushida Shiori、Hikichi Kiwamu、Okada Shuhei、Onishi Kazumitsu、Ishii Takashige、Kishima Yuji、Koide Yohei
    • 雑誌名

      Planta

      巻: 259 号: 1 ページ: 19-19

    • DOI

      10.1007/s00425-023-04300-2

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Genetics of chilling response at early growth stage in rice: a recessive gene for tolerance and importance of acclimation2023

    • 著者名/発表者名
      Baruah Akhil Ranjan、Bannai Hiroaki、Meija Yan、Kimura Ayumi、Ueno Haruka、Koide Yohei、Kishima Yuji、Palta Jiwan、Kasuga Jun、Yamamoto Masayuki P、Onishi Kazumitsu
    • 雑誌名

      AoB PLANTS

      巻: 15 号: 6

    • DOI

      10.1093/aobpla/plad075

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Phylogenetic analysis of endogenous viral elements in the rice genome reveals local chromosomal evolution in Oryza AA-genome species2023

    • 著者名/発表者名
      Saito Nozomi、Chen Sunlu、Kitajima Katsuya、Zhou Zhitong、Koide Yohei、Encabo Jaymee R.、Diaz Maria Genaleen Q.、Choi Il-Ryong、Koyanagi Kanako O.、Kishima Yuji
    • 雑誌名

      Frontiers in Plant Science

      巻: 14 ページ: 1261705-1261705

    • DOI

      10.3389/fpls.2023.1261705

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] How to establish a mutually beneficial relationship between a transposon and its host: lessons from Tam3 in <i>Antirrhinum</i>2022

    • 著者名/発表者名
      Wang, S., Koide, Y., Kishima Y.
    • 雑誌名

      Genes & Genetic Systems

      巻: 97 号: 4 ページ: 177-184

    • DOI

      10.1266/ggs.22-00063

    • ISSN
      1341-7568, 1880-5779
    • 年月日
      2022-08-01
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Identification of a Saltol-Independent Salinity Tolerance Polymorphism in Rice Mekong Delta Landraces and Characterization of a Promising Line, Doc Phung2022

    • 著者名/発表者名
      Nguyen Tam Thanh、Dwiyanti Maria Stefanie、Sakaguchi Shuntaro、Koide Yohei、Le Dung Viet、Watanabe Toshihiro、Kishima Yuji
    • 雑誌名

      Rice

      巻: 15 号: 1 ページ: 65-65

    • DOI

      10.1186/s12284-022-00613-0

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Seed management using NGS technology to rapidly eliminate a deleterious allele from rice breeder seeds2022

    • 著者名/発表者名
      2.Balimponya, E. G., Dwiyanti, M. S., Ito, T., Sakaguchi, S., Yamamori, K., Kanaoka, Y. Koide Y., Nagayoshi, Y., Kishima, Y.
    • 雑誌名

      Breeding Science

      巻: 72 号: 5 ページ: 362-371

    • DOI

      10.1270/jsbbs.22058

    • ISSN
      1344-7610, 1347-3735
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Temporal changes in transcripts of miniature inverted-repeat transposable elements during rice endosperm development2022

    • 著者名/発表者名
      Hiroki Nagata, Akemi Ono, Kaoru Tonosaki, Taiji Kawakatsu, Yutaka Sato, Kentaro Yano, Yuji Kishima, Tetsu Kinoshita
    • 雑誌名

      The Plant Journal

      巻: 109 号: 5 ページ: 1035-1047

    • DOI

      10.1111/tpj.15698

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Genetic Mapping of the Gamete Eliminator Locus, S2, Causing Hybrid Sterility and Transmission Ratio Distortion Found between Oryza sativa and Oryza glaberrima Cross Combination2021

    • 著者名/発表者名
      Zin Mar Myint、Koide Yohei、Ogata Mei、Kuniyoshi Daichi、Tokuyama Yoshiki、Hikichi Kiwamu、Obara Mitsuhiro、Kishima Yuji
    • 雑誌名

      Agriculture

      巻: 11 号: 3 ページ: 268-268

    • DOI

      10.3390/agriculture11030268

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Development of phenotyping system using low altitude UAV imagery and deep learning2021

    • 著者名/発表者名
      Lyu Suxing、1. Graduate School of Frontier Sciences, The University of Tokyo, Kashiwa 277-8561, Japan、Noguchi Noboru、Ospina Ricardo、Kishima Yuji、2. Graduate School of Agriculture, Hokkaido University, Sapporo 060-8589, Japan、3. Research Faculty of Agriculture, Hokkaido University, Sapporo 060-8589, Japan
    • 雑誌名

      International Journal of Agricultural and Biological Engineering

      巻: 14 号: 1 ページ: 207-215

    • DOI

      10.25165/j.ijabe.20211401.6025

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Diploid Male Gametes Circumvent Hybrid Sterility Between Asian and African Rice Species2020

    • 著者名/発表者名
      Kuniyoshi Daichi、Masuda Itaru、Kanaoka Yoshitaka、Shimazaki-Kishi Yuki、Okamoto Yoshihiro、Yasui Hideshi、Yamamoto Toshio、Nagaki Kiyotaka、Hoshino Yoichiro、Koide Yohei、Takamure Itsuro、Kishima Yuji
    • 雑誌名

      Frontiers in Plant Science

      巻: 11 ページ: 579305-579305

    • DOI

      10.3389/fpls.2020.579305

    • NAID

      120007193548

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Fertile Tetraploids: New Resources for Future Rice Breeding?2020

    • 著者名/発表者名
      Koide Yohei、Kuniyoshi Daichi、Kishima Yuji
    • 雑誌名

      Frontiers in Plant Science

      巻: 11 ページ: 1231-1231

    • DOI

      10.3389/fpls.2020.01231

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] イネ育種における遺伝的多様性を拡大するための2,3のアプローチ2020

    • 著者名/発表者名
      山本敏央,古田智敬,小川大輔,米丸淳一,國吉大地,貴島祐治
    • 雑誌名

      作物研究

      巻: 65 ページ: 83-87

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [雑誌論文] Infection with an asymptomatic virus in rice results in a delayed drought response2020

    • 著者名/発表者名
      Encabo Jaymee R.、Macalalad-Cabral Reena Jesusa A.、Matres Jerlie Mhay K.、Coronejo Sapphire Charlene Thea P.、Jonson Gilda B.、Kishima Yuji、Henry Amelia、Choi Il-Ryong
    • 雑誌名

      Functional Plant Biology

      巻: 47 号: 3 ページ: 239-239

    • DOI

      10.1071/fp19241

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Innate Vulnerability of <i>Oryza glaberrima</i> to <i>Rice tungro bacilliform virus</i>2019

    • 著者名/発表者名
      SAITO Nozomi、ENCABO Jaymee R.、CHEN Sunlu、JONSON Gilda、KISHIMA Yuji、CHOI Il-Ryong
    • 雑誌名

      Japan Agricultural Research Quarterly: JARQ

      巻: 53 号: 1 ページ: 1-6

    • DOI

      10.6090/jarq.53.1

    • NAID

      130007585213

    • ISSN
      0021-3551, 2185-8896
    • 年月日
      2019-01-01
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Profiling SNP and Nucleotide Diversity to Characterize Mekong Delta Rice Landraces in Southeast Asian Populations2019

    • 著者名/発表者名
      Tam Nguyen Thanh、Dwiyanti Maria Stefanie、Koide Yohei、Nagano Atsushi J.、Ky Huynh、Tin Huynh Quang、Hien Nguyen Loc、Dung Le Viet、Kishima Yuji
    • 雑誌名

      The Plant Genome

      巻: 12 号: 3 ページ: 190042-190042

    • DOI

      10.3835/plantgenome2019.06.0042

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Genetic Properties Responsible for the Transgressive Segregation of Days to Heading in Rice2019

    • 著者名/発表者名
      Koide Yohei、Sakaguchi Shuntaro、Uchiyama Takashi、Ota Yuya、Tezuka Ayumi、Nagano Atsushi J.、Ishiguro Seiya、Takamure Itsuro、Kishima Yuji
    • 雑誌名

      G3&amp;#58; Genes|Genomes|Genetics

      巻: 9 号: 5 ページ: 1655-1662

    • DOI

      10.1534/g3.119.201011

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] イネの脂質関連遺伝子群 OsGELP は緯度に適応した ハプロタイプを持つ2024

    • 著者名/発表者名
      KAYYIS MUAYADAH LUBBA, 山森晃一, 貴島祐治
    • 学会等名
      日本育種学会 第145回講演会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] アフリカ野生イネ Oryza longistaminata に見出され た雑種不稔遺伝子 S13 の単離2024

    • 著者名/発表者名
      高西若菜, ジン マー ミント, 貴島祐治, 金 澤章, 小出陽平
    • 学会等名
      日本育種学会 第145回講演会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] イネ葯小胞子はカルス形成能を持つか?2024

    • 著者名/発表者名
      徐美蘭, 工藤七海, Christabell Nachilima, 宮本康介, 金鍾明, 貴島祐治
    • 学会等名
      日本育種学会 第145回講演会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] 比較ゲノム解析による O. sativa ssp. japonica とイ ネ属 AA ゲノム種のイントログレッション領域の 探索2024

    • 著者名/発表者名
      小柳香奈子, 神徳雄太, 貴島祐治
    • 学会等名
      日本育種学会 第145回講演会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] イネ 3 品種における試験管内花粉発芽と花粉管伸 長に及ぼすスクロース濃度と培養期間の影響2023

    • 著者名/発表者名
      Neema Yona Yohana, 中野有紗, 貴島祐治, 星野洋一郎
    • 学会等名
      日本育種学会 第144回講演会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] イネのデジタル 3D モデルによる計測法の開発2023

    • 著者名/発表者名
      Sorawich Pongpiyapaiboon, 田中秀典, 平野翔也, 貴島祐治, 明石良
    • 学会等名
      日本育種学会 第144回講演会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] デジタル 3D モデルを用いた同一イネ品種の 2 倍 体と 4 倍体成長パターンの比較2023

    • 著者名/発表者名
      平野翔也, Sorawich Pongpiyapaiboon, 笹川静香, 高牟禮逸朗, 田中秀典, 明石良, 貴島祐治
    • 学会等名
      日本育種学会 第144回講演会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] イネ葯培養効率の日印間差異を生じる遺伝因子の探索2023

    • 著者名/発表者名
      工藤七海, Elias Balimponya, 岡本吉弘, 貴島祐治
    • 学会等名
      日本育種学会 第144回講演会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] アフリカイネとアジアイネの 4 倍体種間雑種にお ける HS 座2023

    • 著者名/発表者名
      國吉大地, 石原萌, 佐藤裕, 貴島祐治
    • 学会等名
      日本育種学会 第144回講演会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] O. sativa と O. glaberrimaの4 倍体種間雑種イネで見い出だされた種子および花粉稔性の向上に関わる遺伝領域2023

    • 著者名/発表者名
      岡大晴, 古田智敬, 柏原壱成, 牟竑瑞, 貴島祐治, 長岐清孝, 山本敏央
    • 学会等名
      日本育種学会 第144回講演会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] 同質四倍体イネ分離集団における遺伝解析法の構 築および QTL の探索2023

    • 著者名/発表者名
      岡田脩平, 蒲池行美, Zin Mar Myint, 貴島祐治, 小出 陽平
    • 学会等名
      日本育種学会 第144回講演会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] イネ種間雑種 4 倍体の後代分離集団の GWAS 結果から予測される QTL の dosage 効果とヘテロシス2023

    • 著者名/発表者名
      岡大晴,古田智敬,牟 竑瑞,柏原壱成,長岐清孝,貴島祐治,山本 敏央
    • 学会等名
      日本育種学会 第144回講演会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] 種間雑種 4 倍体イネとその両親栽培イネにおける遺伝子発現の比較プロファイル2023

    • 著者名/発表者名
      牟竑瑞,古田智敬,岡大晴,長岐清孝,貴島 祐治,山本 敏央
    • 学会等名
      日本育種学会 第144回講演会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] イネの障害型冷害における葯の異常形態の多様性と花粉不稔との相関2021

    • 著者名/発表者名
      山森 晃一, 小笠原慧, 石黒聖也, 小出陽平, 高牟禮逸郎, 佐藤裕, 貴島祐治
    • 学会等名
      一般社団法人日本育種学会 139回講演会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] イネの種間雑種不稔遺伝子S2の遺伝的マッピング2021

    • 著者名/発表者名
      Zin Mar Myint, 緒方萌衣, 徳山芳樹, 曳地究, 貴島祐治, 小出陽平
    • 学会等名
      一般社団法人日本育種学会 139回講演会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] アジアとアフリカの栽培イネから なる 4 倍体雑種イネのゲノム構成2021

    • 著者名/発表者名
      古田智敬, 長岐清孝, 柏原壱成, 國吉大地, 北島克哉, 小出陽平, 貴島 祐治, 山本敏央
    • 学会等名
      一般社団法人日本育種学会 139回講演会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] アジアとアフリカの栽培イネからなる4倍体雑種イネのゲノム構成2021

    • 著者名/発表者名
      古田智敬, 長岐清孝, 柏原壱成, 國吉大地, 北島克哉, 小出陽平, 貴島祐治, 山本敏央
    • 学会等名
      日本育種学会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] 4倍体のOryza sativaとO. glaberrimaを交雑した雑種による雑種不稔性の克服2021

    • 著者名/発表者名
      國吉大地, 石原萌, 小出陽平, 貴島祐治
    • 学会等名
      日本育種学会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] イネの種間雑種不稔遺伝子S2の遺伝的マッピング2021

    • 著者名/発表者名
      Zin Mar Myint, 緒方萌衣, 徳山芳樹, 曳地究, 貴島祐治, 小出陽平
    • 学会等名
      日本育種学会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] イネの障害型冷害における葯の異常形態の多様性と花粉不稔との相関2021

    • 著者名/発表者名
      山森晃一, 小笠原慧, 石黒聖也, 小出陽平, 高牟禮逸郎, 佐藤裕, 貴島祐治
    • 学会等名
      日本育種学会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] A2 fusion rice の作出とその特徴化 稔性を有 するアジアとアフリカの栽培イネ種間雑種2020

    • 著者名/発表者名
      北島克哉, 増田到, 齋藤希, 國吉大地, 金岡義高, 高牟禮逸朗, 星野洋一郎, 小出陽平, 貴島祐治
    • 学会等名
      一般社団法人日本育種学会 138回講演会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] イネ穂ばらみ期の低温鈍感力を示す遺伝子群のスクリーニング2020

    • 著者名/発表者名
      山森晃一, 石黒聖也, 小笠原慧, 小出陽平, 藤野介延, 佐藤裕, 貴島祐治
    • 学会等名
      一般社団法人日本育種学会 138回講演会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] 北海道イネ系統を用いた穂揃い性とその環境応答性の遺伝的解析2019

    • 著者名/発表者名
      坂口俊太郎, 太田雄也, 内山尭, 小出陽平, 高牟礼逸朗, 貴島祐治
    • 学会等名
      日本育種学会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] 内在性ウイルス配列を指標としたOryza-AAゲノム種の染色体領域特異的な小進化2019

    • 著者名/発表者名
      齋籐希, 陳孫禄, 山田加奈恵, 小出陽平, Il-Ryong Choi, 貴島祐治
    • 学会等名
      日本育種学会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] イネ葯ゲノムの高温応答と反復配列の発現活性化2019

    • 著者名/発表者名
      金岡義高, 金鍾明, 石黒聖也, 陳孫禄, 内山暁, 山森晃一, 小出陽平, 貴島祐治
    • 学会等名
      日本育種学会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] 葯培養を介した雑種不稔性イネの雄性配偶子ゲノムの解析と雌性配偶子ゲノムの比較2019

    • 著者名/発表者名
      國吉大地, 山形悦透, 島﨑優樹, 金岡義高, 小出陽平1, 安井秀, 貴島祐治
    • 学会等名
      日本育種学会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書

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公開日: 2019-04-18   更新日: 2025-01-30  

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