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酵素活性の網羅的解析手法(enzymomics)の高度化に基づく創薬研究

研究課題

研究課題/領域番号 19H02846
研究種目

基盤研究(B)

配分区分補助金
応募区分一般
審査区分 小区分37030:ケミカルバイオロジー関連
研究機関東京大学

研究代表者

小松 徹  東京大学, 大学院薬学系研究科(薬学部), 助教 (40599172)

研究期間 (年度) 2019-04-01 – 2023-03-31
研究課題ステータス 完了 (2022年度)
配分額 *注記
17,420千円 (直接経費: 13,400千円、間接経費: 4,020千円)
2021年度: 2,990千円 (直接経費: 2,300千円、間接経費: 690千円)
2020年度: 2,990千円 (直接経費: 2,300千円、間接経費: 690千円)
2019年度: 8,450千円 (直接経費: 6,500千円、間接経費: 1,950千円)
キーワードケミカルバイオロジー / 創薬化学
研究開始時の研究の概要

生体内には,数千種類を超える酵素が存在するが,いまだ疾患との関わりの理解が得られていない酵素は多く,これらは,未来の創薬標的,バイオマーカー候補としてその機能解明が待たれている.本研究では,酵素の活性を直接的に可視化することのできるケミカルバイオロジーの方法論に基づき,生体サンプル中の酵素活性を網羅的に評価する「enzymomics(enzymeのomics)」の技術開発をおこない,新たな創薬標的,バイオマーカー探索をおこなう技術基盤としてこれを確立することを目指す.

研究成果の概要

本研究では,これまで申請者が確立してきた酵素活性の網羅的解析法であるenzymomicsの方法論を用いて種々の疾患関連タンパク質を見出す応用研究を展開すると同時に,これを支える基盤技術として,特にタンパク質の翻訳後修飾を担う各種酵素群の活性検出を指向した新たな蛍光プローブライブラリの開発による「網羅性」の向上と,マイクロデバイスを用いた活性検出の仕組みを用いたバイオマーカー酵素活性検出の仕組みによる「感度」の向上の2点について技術開発をおこなう.これらの系を合わせることで,申請者が提唱した「enzymomics」の手法を真に実用的な技術として確立することを本研究期間中に達成した.

研究成果の学術的意義や社会的意義

本研究を通じて,enzymomics の高度化に繋がる研究成果を,J. Am. Chem. Soc. 誌,Science Advances 誌,Cell Reports 誌などに発表し,分野の発展に努めた.特に,これを利用した疾患診断技術の重要性は世界的にも認知され,activity-based diagnosis という診断技術の意義が提唱されるに至っている.申請者らの研究は,その重要性の認知に先駆けて網羅性,感度を高めた形で実現しており,世界をリードする研究成果を継続的に発表できる基盤が整ったと言える.

報告書

(4件)
  • 2022 研究成果報告書 ( PDF )
  • 2021 実績報告書
  • 2020 実績報告書
  • 2019 実績報告書
  • 研究成果

    (29件)

すべて 2022 2021 2020 2019

すべて 雑誌論文 (10件) (うち国際共著 1件、 査読あり 10件、 オープンアクセス 6件) 学会発表 (15件) (うち国際学会 1件、 招待講演 14件) 図書 (3件) 産業財産権 (1件)

  • [雑誌論文] Establishment of live-cell-based coupled assay system for identification of compounds to modulate metabolic activities of cells2021

    • 著者名/発表者名
      Yanagi Kouichi、Komatsu Toru、Ogihara Shusuke、Okabe Takayoshi、Kojima Hirotatsu、Nagano Tetsuo、Ueno Tasuku、Hanaoka Kenjiro、Urano Yasuteru
    • 雑誌名

      Cell Reports

      巻: 36 号: 1 ページ: 109311-109311

    • DOI

      10.1016/j.celrep.2021.109311

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Discovery of an F-actin-binding small molecule serving as a fluorescent probe and a scaffold for functional probes2021

    • 著者名/発表者名
      Takagi T, Ueno T, Ikawa K, Asanuma D, Nomura Y, Uno S, Komatsu T, Kamiya M, Hanaoka K, Okimura C, Iwadate Y, Hirose K, Nagano T, Sugimura K and Urano Y.
    • 雑誌名

      Science Advances

      巻: 7(47) 号: 47

    • DOI

      10.1126/sciadv.abg8585

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] MITOL promotes cell survival by degrading Parkin during mitophagy2021

    • 著者名/発表者名
      Shiiba Isshin、Takeda Keisuke、Nagashima Shun、Ito Naoki、Tokuyama Takeshi、Yamashita Shun‐Ichi、Kanki Tomotake、Komatsu Toru、Urano Yasuteru、Fujikawa Yuuta、Inatome Ryoko、Yanagi Shigeru
    • 雑誌名

      EMBO reports

      巻: 22 号: 3

    • DOI

      10.15252/embr.201949097

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Covalent Self-labeling of Tagged Proteins with Chemical Fluorescent Dyes in BY-2 Cells and Arabidopsis Seedlings2020

    • 著者名/発表者名
      Iwatate, J.R., Yoshinari, A., Yagi, N., Grzybowski, M., Ogasawara, H., Kamiya, M., Komatsu, T., Taki, M., Yamaguchi, S., Frommer, W.B. and Nakamura, M.
    • 雑誌名

      The Plant Cell

      巻: 32 号: 10 ページ: 3081-3094

    • DOI

      10.1105/tpc.20.00439

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Antibody Clicking as a Strategy to Modify Antibody Functionalities on the Surface of Targeted Cells2020

    • 著者名/発表者名
      Komatsu Toru、Kyo Etsu、Ishii Haruki、Tsuchikama Kyoji、Yamaguchi Aiko、Ueno Tasuku、Hanaoka Kenjiro、Urano Yasuteru
    • 雑誌名

      Journal of the American Chemical Society

      巻: 142 号: 37 ページ: 15644-15648

    • DOI

      10.1021/jacs.0c05331

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] A cytosolically localized far-red to near-infrared rhodamine-based fluorescent probe for calcium ions2020

    • 著者名/発表者名
      Numasawa Koji、Hanaoka Kenjiro、Ikeno Takayuki、Echizen Honami、Ishikawa Tomoe、Morimoto Masakazu、Komatsu Toru、Ueno Tasuku、Ikegaya Yuji、Nagano Tetsuo、Urano Yasuteru
    • 雑誌名

      The Analyst

      巻: 145 号: 23 ページ: 7736-7740

    • DOI

      10.1039/d0an01739f

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Multiplexed single-molecule enzyme activity analysis for counting disease-related proteins in biological samples2020

    • 著者名/発表者名
      Shingo Sakamoto, Toru Komatsu, Rikiya Watanabe, Yi Zhang, Taiki Inoue, Mitsuyasu Kawaguchi, Hidehiko Nakagawa, Takaaki Ueno, Takuji Okusaka, Kazufumi Honda, Hiroyuki Noji, Yasuteru Urano
    • 雑誌名

      Science Advances

      巻: 6 号: 11

    • DOI

      10.1126/sciadv.aay0888

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Separation-Based Enzymomics Assay for the Discovery of Altered Peptide-Metabolizing Enzymatic Activities in Biosamples2019

    • 著者名/発表者名
      Ichihashi Yuki、Komatsu Toru、Kyo Etsu、Matsuzaki Hiroyuki、Hata Keisuke、Watanabe Toshiaki、Ueno Tasuku、Hanaoka Kenjiro、Urano Yasuteru
    • 雑誌名

      Analytical Chemistry

      巻: 91 号: 18 ページ: 11497-11501

    • DOI

      10.1021/acs.analchem.9b03016

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Development of ratiometric carbohydrate sensor based on boron dipyrromethene (BODIPY) scaffold2019

    • 著者名/発表者名
      Cheruthu Nusaiba Madappuram、Komatsu Toru、Ueno Tasuku、Hanaoka Kenjiro、Urano Yasuteru
    • 雑誌名

      Bioorganic & Medicinal Chemistry Letters

      巻: 29 号: 22 ページ: 126684-126684

    • DOI

      10.1016/j.bmcl.2019.126684

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Metabolic-Pathway-Oriented Screening Targeting S-Adenosyl-l-methionine Reveals the Epigenetic Remodeling Activities of Naturally Occurring Catechols2019

    • 著者名/発表者名
      Ogihara Shusuke、Komatsu Toru、Itoh Yukihiro、Miyake Yuka、Suzuki Takayoshi、Yanagi Kouichi、Kimura Yusuke、Ueno Tasuku、Hanaoka Kenjiro、Kojima Hirotatsu、Okabe Takayoshi、Nagano Tetsuo、Urano Yasuteru
    • 雑誌名

      Journal of the American Chemical Society

      巻: 142 号: 1 ページ: 21-26

    • DOI

      10.1021/jacs.9b08698

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] 酵素のはたらきを網羅的に見て疾患を知る~1分子計測リキッドバイオプシー技術の確立を目指して~2022

    • 著者名/発表者名
      小松徹
    • 学会等名
      2021 年度第 2 回バイオ単分子研究会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 抗体クリック反応による細胞表面選択的凝集による細胞機能制御2021

    • 著者名/発表者名
      小松徹
    • 学会等名
      第 2 回 発動分子科学研究会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 酵素活性の網羅的解析(enzymomics)による疾患関連タンパク質の探索2021

    • 著者名/発表者名
      小松徹
    • 学会等名
      3新学術領域合同シンポジウム
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 酵素活性の網羅的計測(enzymomics)による疾患関連タンパク質の探索2021

    • 著者名/発表者名
      小松徹
    • 学会等名
      第15回次世代を担う若手医療薬科学シンポジウム
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 酵素活性の網羅的計測(enzymomics)による疾患関連タンパク質の探索2021

    • 著者名/発表者名
      小松徹
    • 学会等名
      第71回日本電気泳動学会シンポジウム
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 抗体クリック反応による細胞表面選択的凝集による機能制御2021

    • 著者名/発表者名
      小松徹, 姜悦, 石井 遥暁, 山口藍子, 土釜恭直, 浦野 泰照
    • 学会等名
      第21回日本蛋白質科学会年会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 血液中1分子酵素活性の網羅的検出による新規疾患関連酵素の探索2021

    • 著者名/発表者名
      小松徹
    • 学会等名
      第75回 日本口腔科学会学術集会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] Diced electrophoresis gel アッセイ法を用いた疾患関連酵素の探索2020

    • 著者名/発表者名
      小松徹
    • 学会等名
      第71回日本電気泳動学会総会(オンライン開催)
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 酵素活性の網羅的解析(enzymomics)に基づく新規疾患診断技術の開発の試み2020

    • 著者名/発表者名
      小松徹
    • 学会等名
      東北大学 生命科学研究科生命科学 web セミナー(オンライン)
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Development of Enzymomics Platform for Screening Altered Enzymatic Functions in Diseases2020

    • 著者名/発表者名
      Toru Komatsu
    • 学会等名
      iPoPS 2020
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] 物質代謝の局所性の制御と理解を目指すケミカルバイオロジー研究2019

    • 著者名/発表者名
      小松徹
    • 学会等名
      第19回日本蛋白質科学会年会・第71回日本細胞生物学会大会 合同年次大会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Diced electrophoresis gel 法を用いたがんにおけるペプチド代謝活性異常の網羅的解析2019

    • 著者名/発表者名
      小松徹
    • 学会等名
      日本プロテオーム学会2019年大会/第70回日本電気泳動学会総会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 緑茶カテキンによる細胞内「メチル化」状態の制御と健康寿命2019

    • 著者名/発表者名
      小松徹
    • 学会等名
      科学的根拠に基づく健康寿命を延ばす会 第15回講演・研究会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 酵素活性の網羅的探索(enzymomics)に基づく疾患関連タンパク質の探索2019

    • 著者名/発表者名
      小松徹
    • 学会等名
      第92回日本生化学会大会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Diced electrophoresis gel 法を用いたがんにおけるペプチド代謝活性異常の網羅的解析2019

    • 著者名/発表者名
      小松徹
    • 学会等名
      第69回日本電気泳動学会シンポジウム
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 招待講演
  • [図書] 酵素のはたらきを見て疾患を知る ~Activity-based diagnosticsの最新動向~2021

    • 著者名/発表者名
      小松徹, 坂本眞伍, 鏡味優, 浦野泰照
    • 総ページ数
      4
    • 出版者
      月刊「細胞」
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [図書] (+)-カテキンを介した大腸がん細胞のヒストンメチル化の減少2020

    • 著者名/発表者名
      荻原洲介,小松徹,浦野泰照
    • 総ページ数
      3
    • 出版者
      一般財団法人 バイオインダストリー協会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [図書] 1分子計測リキッドバイオプシーの夜明け2020

    • 著者名/発表者名
      小松徹,坂本眞伍,浦野泰照
    • 総ページ数
      6
    • 出版者
      日本プロテオーム学会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [産業財産権] 固相抽出を利用した蛍光プローブライブラリの調整方法、及びこれを用いた酵素活性計測方法2021

    • 発明者名
      浦野泰照,小松徹,坂本眞伍,渡邉力也
    • 権利者名
      浦野泰照,小松徹,坂本眞伍,渡邉力也
    • 産業財産権種類
      特許
    • 産業財産権番号
      2021-009683
    • 出願年月日
      2021
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書

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公開日: 2019-04-18   更新日: 2024-01-30  

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