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酵素学の観点からのケモエンザイマティック反応によるアミノ酸やペプチド合成法の開発

研究課題

研究課題/領域番号 19K05775
研究種目

基盤研究(C)

配分区分基金
応募区分一般
審査区分 小区分38020:応用微生物学関連
研究機関立命館大学 (2020-2021)
富山県立大学 (2019)

研究代表者

松井 大亮  立命館大学, 生命科学部, 助教 (40748513)

研究分担者 平田 佳之  大阪医科薬科大学, 薬学部, 助教 (00745854)
研究期間 (年度) 2019-04-01 – 2022-03-31
研究課題ステータス 完了 (2021年度)
配分額 *注記
4,290千円 (直接経費: 3,300千円、間接経費: 990千円)
2021年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円)
2020年度: 1,040千円 (直接経費: 800千円、間接経費: 240千円)
2019年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円)
キーワードアミノ酸酸化酵素 / ケト酸 / アミド化合物 / アミド結合 / ペプチド合成 / ケモエンザイマティック反応 / アミノ酸合成 / 酵素
研究開始時の研究の概要

本研究では、ペタシスやボーディが開発したアミノ酸やペプチド合成の中間体であるケト酸を、有機合成ではなくアミノ酸酸化酵素及び脱水素酵素を用いた酵素反応で、迅速(一段階反応)・簡便(保護や脱保護が不必要)・有毒な試薬を使用せず合成する。様々な関連酵素に関する研究を実施しており、これまでに見出した酵素を使用してケト酸を合成することが可能である。その酵素反応で生成したケト酸を連続的に有機合成でアミノ酸やペプチドに変換する技術を確立する。新技術を確立した後に、その技術の“これまでに見出した酵素”の他に“自然界から得た酵素や変異導入酵素”をあてはめ、ケモエンザイマティック反応で新しい酵素反応を探索する。

研究成果の概要

創薬分野において非天然アミノ酸や特殊ペプチドの合成は重要な基盤技術であり、特に多品種合成や大量生産の技術が求められている。本研究では、有機合成が困難なケト酸を、アミノ酸から酵素を用いて安価に合成し、次いでケト酸とヒドロキシルアミン誘導体を、化学反応剤非存在下で縮合させる新技術で、アミノ酸やペプチドを合成した。本技術は多品種を合成するパラレル合成や、固定化酵素を用いて大量生産に利用できるフロー合成の要素を取り入れており、様々なアミノ酸やペプチド合成の大量生産の有用な合成技術となりうる。

研究成果の学術的意義や社会的意義

1. ケモエンザイマティック反応による非天然アミノ酸や特殊ペプチド合成:有機合成ではなくアミノ酸酸化酵素を用いた酵素反応で、迅速(一段階反応)・簡便(保護や脱保護が不必要)・有毒な試薬を使用せず合成するケモエンザイマティック反応自体に新規性があり、今後のペプチド医薬品開発に貢献できた。
2. 酵素学の観点からのケモエンザイマティック反応の改良:本研究では新技術を確立した後に、自然界から得た酵素や変異導入酵素をあてはめ、ケモエンザイマティック反応で新しい酵素反応を探索した。これにより従来の酵素探索から応用までの間に起こりうる問題を回避することができ、産業用酵素の開発の時間短縮につながった。

報告書

(4件)
  • 2021 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2020 実施状況報告書
  • 2019 実施状況報告書
  • 研究成果

    (26件)

すべて 2022 2021 2020 2019

すべて 雑誌論文 (9件) (うち国際共著 2件、 査読あり 9件、 オープンアクセス 6件) 学会発表 (17件) (うち国際学会 2件、 招待講演 2件)

  • [雑誌論文] Combination of Enzymatic Oxidation of Amino Acid and Native Chemical Ligation with Hydroxylamine for Amide Formation toward a One-pot Process2021

    • 著者名/発表者名
      Matsui Daisuke、Hirata Yoshiyuki、Iwakawa Akihisa、Toyotake Yosuke、Wakayama Mamoru、Asano Yasuhisa
    • 雑誌名

      Chemistry Letters

      巻: 50 号: 9 ページ: 1632-1634

    • DOI

      10.1246/cl.210286

    • NAID

      130008088183

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Protein engineering of the aldoxime dehydratase from Bacillus sp. OxB-1 based on a rational sequence alignment approach2021

    • 著者名/発表者名
      Oike Keiko、Spro? Jens、Matsui Daisuke、Asano Yasuhisa、Gr?ger Harald
    • 雑誌名

      Scientific Reports

      巻: 11 号: 1 ページ: 14316-14316

    • DOI

      10.1038/s41598-021-92749-0

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Catalytic mechanism of ancestral L-lysine oxidase assigned by sequence data mining2021

    • 著者名/発表者名
      Sugiura Sayaka、Nakano Shogo、Niwa Masazumi、Hasebe Fumihito、Matsui Daisuke、Ito Sohei
    • 雑誌名

      Journal of Biological Chemistry

      巻: 297 号: 3 ページ: 101043-101043

    • DOI

      10.1016/j.jbc.2021.101043

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Identification of l-histidine oxidase activity in Achromobacter sp. TPU 5009 for l-histidine determination2021

    • 著者名/発表者名
      Matsui Daisuke、Okayama Yusuke、Yamamoto Yoshiki、Miyauchi Yuna、Zhai Zhenyu、Asano Yasuhisa
    • 雑誌名

      Journal of Bioscience and Bioengineering

      巻: - 号: 5 ページ: 469-474

    • DOI

      10.1016/j.jbiosc.2020.12.006

    • NAID

      40022568945

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Mechanistic insights into the dual activities of the single active site of l-lysine oxidase/monooxygenase from Pseudomonas sp. AIU 8132020

    • 著者名/発表者名
      Trisrivirat Duangthip、Lawan Narin、Chenprakhon Pirom、Matsui Daisuke、Asano Yasuhisa、Chaiyen Pimchai
    • 雑誌名

      Journal of Biological Chemistry

      巻: 295 号: 32 ページ: 11246-11261

    • DOI

      10.1074/jbc.ra120.014055

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Crystal structure of the catalytic unit of thermostable GH87 α-1,3-glucanase from Streptomyces thermodiastaticus strain HF3-32020

    • 著者名/発表者名
      Itoh Takafumi、Panti Niphawan、Hayashi Junji、Toyotake Yosuke、Matsui Daisuke、Yano Shigekazu、Wakayama Mamoru、Hibi Takao
    • 雑誌名

      Biochemical and Biophysical Research Communications

      巻: 533 号: 4 ページ: 1170-1176

    • DOI

      10.1016/j.bbrc.2020.09.133

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Enhanced solubility and permeability of quercetin by composite formation between α-glucosyl stevia and hydrophilic polymer2019

    • 著者名/発表者名
      H. Uchiyama, Y. Wada, Y. Hatanaka, Y. Hirata, M. Taniguchi, A. Nakanishi, M. Tandia, K. Kadota, Y. Tozuka
    • 雑誌名

      J. Pharm. Sci.

      巻: 108 号: 6 ページ: 2033-2040

    • DOI

      10.1016/j.xphs.2019.01.007

    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Creation of thermostable l-tryptophan dehydrogenase by protein engineering and its application for l-tryptophan quantification2019

    • 著者名/発表者名
      Matsui Daisuke、Asano Yasuhisa
    • 雑誌名

      Analytical Biochemistry

      巻: 579 ページ: 57-63

    • DOI

      10.1016/j.ab.2019.05.010

    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Comparative review of the recent enzymatic methods used for selective assay of l-lysine2019

    • 著者名/発表者名
      Isobe Kimiyasu、Matsui Daisuke、Asano Yasuhisa
    • 雑誌名

      Analytical Biochemistry

      巻: 584 ページ: 113335-113335

    • DOI

      10.1016/j.ab.2019.06.006

    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] 機械学習による高度好熱菌由来タンパク質遺伝子の大腸菌発現情報から得た可溶性発現予測法の開発2022

    • 著者名/発表者名
      松井大亮, 山村義弥, 鈴木皓大, 北條佑斗, 篠田優, 中村正樹, 榊原一紀, 浅野泰久
    • 学会等名
      日本農芸化学会 2022年度大会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] L-アミノ酸代謝関連酵素の産業利用技術に関する研究2022

    • 著者名/発表者名
      松井大亮
    • 学会等名
      日本農芸化学会 2022年度大会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 機械学習を用いたアミノ酸構造情報に基づくタンパク質の可溶性予測2021

    • 著者名/発表者名
      鈴木皓大, 榊原一紀, 中村正樹, 篠田優, 松井大亮, 浅野泰久
    • 学会等名
      2021年度電気・情報関係学会北陸支部連合大会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] D-アミノ酸酸化酵素により調製したケト酸とヒドロキシルアミンとの 縮合によるアミド化合物の合成2021

    • 著者名/発表者名
      岩川晃久, 平田佳之, 豊竹洋佑, 若山守, 松井大亮
    • 学会等名
      日本農芸化学会 2021年度 西日本・中四国・関西支部 合同大会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] Pseudomonas nitroreducens 由来γ-グルタミルトランスペプチダーゼの活性部位を構成する芳香族アミノ酸残基の役割解明2021

    • 著者名/発表者名
      小笹彰宏, 池添浩輝, 松井大亮, 豊竹洋佑, 日ビ隆雄, 伊藤貴文, 若山守
    • 学会等名
      第73回日本生物工学会大会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] 芳香族アミド化合物のOne-pot chemoenzymatic 合成法を利用した簡便ヒストン脱アセチル化酵素1阻害剤スクリーニング法の開発2021

    • 著者名/発表者名
      平田佳之, 上里新一, 松井大亮
    • 学会等名
      第73回日本生物工学会大会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] 新規L-リジン-α-オキシダーゼの同定と反応機構の解明2021

    • 著者名/発表者名
      杉浦紗也加, 中野祥吾, 丹羽正純, 長谷部文人, 松井大亮, 伊藤創平
    • 学会等名
      第73回日本生物工学会大会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] Bacillus sp. OxdB-1 由来アルドキシム脱水酵素の結晶構造解析:結晶化に適した表面に位置するアミノ酸残基の重要性2021

    • 著者名/発表者名
      松井大亮, 村木則文, Ke Chen, 森智也, Aaron Ingram, 大池敬子, Harald Groeger, 青野重利, 浅野泰久
    • 学会等名
      第73回日本生物工学会大会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] Bacillus sp. OxB-1由来アルドキシム脱水酵素の結晶構造解析2021

    • 著者名/発表者名
      村木則文, 松井大亮, 浅野泰久, 青野重利
    • 学会等名
      令和3年度日本結晶学会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] Prediction of Solubility Mechanism of Proteins by Machine Learning Techniques2021

    • 著者名/発表者名
      Sakakibara K, Nakamura M, Matsui D, Shinoda S, Asano Y
    • 学会等名
      The 2021 International Chemical Congress of Pacific Basin Societies (Pacifichem 2021)
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] ケト酸を介したアミド化合物のケモエンザイマティック合成2021

    • 著者名/発表者名
      松井大亮、平田佳之、岩川晃久、若林香菜子、久保梓、豊竹洋佑、若山守、浅野泰久
    • 学会等名
      日本化学会第101春季年会
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
  • [学会発表] 結晶化が困難なアルドキシム脱水酵素の変異導入による結晶構造解析2020

    • 著者名/発表者名
      松井大亮、村木則文、Chen Ke、森智也、青野重利、浅野泰久
    • 学会等名
      日本農芸化学会2020年度大会
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
  • [学会発表] ビンロウジ (Areca catechu)アルカロイドのSIRT1阻害活性2019

    • 著者名/発表者名
      平田 佳之、上山 浩世、平櫛 実穂、根上 朋子、礒野 悠也、佐々木 勉、上里 新一、芝野 真喜雄、谷口 雅彦
    • 学会等名
      日本薬学会第139年会
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
  • [学会発表] ニガキ由来アルカロイドpicrasidine L のヒト神経芽腫細胞株 SHSY5Y に対するオートファジー誘導効果2019

    • 著者名/発表者名
      木村 耕介、平田 佳之、光高 蓉平、佐々木 勉、長岡 康夫、上里 新一、芝野 真喜雄、谷口 雅彦
    • 学会等名
      日本生薬学会第66回年会
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
  • [学会発表] ケミカルプルダウン法を用いたビンロウジアルカロイドの神経突起成長関連タンパク質の探索2019

    • 著者名/発表者名
      平田 佳之、佐々木 勉、長岡 康夫、上里 新一、芝野 真喜雄、谷口 雅彦
    • 学会等名
      第69回 日本薬学会関西支部総会・大会
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
  • [学会発表] ヒドロキシニトリルリアーゼによる立体選択的なアミノニトリル合成2019

    • 著者名/発表者名
      松井 大亮、板倉 葵、浅野 泰久
    • 学会等名
      酵素・補酵素研究会2019
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
  • [学会発表] Crystal screening of aldoxime dehydratase from Bacillus sp. OxdB-1 for structural analysis2019

    • 著者名/発表者名
      Daisuke Matsui, Norifumi Muraki, Chen Ke, Tomoya Mori, Shigetoshi Aono, and Yasuhisa Asano
    • 学会等名
      1st JGS workshop
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
    • 国際学会

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公開日: 2019-04-18   更新日: 2023-01-30  

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