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1細胞解像度イメージングによるオオムギ茎頂メリステムアトラスの創出

研究課題

研究課題/領域番号 19K05975
研究種目

基盤研究(C)

配分区分基金
応募区分一般
審査区分 小区分39010:遺伝育種科学関連
研究機関横浜市立大学

研究代表者

井藤 純  横浜市立大学, 木原生物学研究所, 特任助教 (20373269)

研究期間 (年度) 2019-04-01 – 2022-03-31
研究課題ステータス 完了 (2021年度)
配分額 *注記
4,420千円 (直接経費: 3,400千円、間接経費: 1,020千円)
2021年度: 780千円 (直接経費: 600千円、間接経費: 180千円)
2020年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円)
2019年度: 2,080千円 (直接経費: 1,600千円、間接経費: 480千円)
キーワード形態形成 / 茎頂分裂組織 / 花成 / ムギ / 幹細胞 / イメージング / シュート頂メリステム / オオムギ / 茎頂メリステム
研究開始時の研究の概要

茎頂メリステムは少数の未分化な幹細胞と器官形成に必要な細胞を生み出す分裂細胞など複数の細胞種から構成される。本研究では、オオムギ茎頂メリステム内のすべての細胞を解析する基盤技術を作り上げるため、全細胞の位置情報を含む茎頂メリステムのアトラスの創出を目指す。具体的には、様々な条件下におけるオオムギ茎頂メリステムの1細胞解像度アトラスを創出し、それらに細胞体積・分裂活性・マーカー遺伝子発現といった細胞動態変化をマッピングすることで、オオムギにおいて花芽形成を制御する細胞(群)の特性を明らかにするとともに、とくに野外環境下の刻々と変動する環境に応じる茎頂メリステム内の細胞動態を明らかにする。

研究成果の概要

植物の茎の先端には「茎頂メリステム」と呼ばれる組織が存在し、そこから地上部のあらゆる器官が作り出される。茎頂メリステムは少数の未分化な幹細胞と様々な器官・組織へと分化する細胞など複数の細胞種から構成される。本研究では、イネ科作物の一つ、オオムギの茎頂メリステムの形態や活性を細胞レベルで解析する技術基盤の確立を目指し、茎頂メリステムを構成する全細胞可視化と画像解析による観察手法の最適化を行った。確立した手法を用いて、発生過程に伴う茎頂メリステムの形態変化や茎頂メリステムの機能の消失過程を1細胞レベルで明らかにした。

研究成果の学術的意義や社会的意義

本研究では、様々な栽培環境における1細胞解像度のオオムギ茎頂メリステムのアトラス(地図)を創出した。これらの茎頂メリステムアトラスには、生理活性物質の局在や1細胞 RNA-seq 解析など様々な情報を書き込むことが可能である。今後、茎頂メリステムアトラスを用いることにより、茎頂メリステムに存在する全ての細胞を網羅的に分析することが可能となり、植物のボディプランの根幹をなす茎頂メリステムの1細胞レベルでの機能の理解につながることが期待される。また、本研究で確立した解析手法は他の作物にも利用可能であり、同様の解析基盤技術の整備の推進にも貢献できる。

報告書

(4件)
  • 2021 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2020 実施状況報告書
  • 2019 実施状況報告書
  • 研究成果

    (17件)

すべて 2022 2021 2020 2019

すべて 雑誌論文 (3件) (うち査読あり 3件、 オープンアクセス 3件) 学会発表 (14件) (うち国際学会 1件)

  • [雑誌論文] オオムギ茎頂部の3Dイメージング2021

    • 著者名/発表者名
      Ito Jun、Tsuji Hiroyuki
    • 雑誌名

      PLANT MORPHOLOGY

      巻: 33 号: 1 ページ: 25-30

    • DOI

      10.5685/plmorphol.33.25

    • ISSN
      0918-9726, 1884-4154
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Life-course monitoring of endogenous phytohormone levels under field conditions reveals diversity of physiological states among barley accessions2020

    • 著者名/発表者名
      Hirayama T, Saisho D, Matsuura T, Okada S, Takahagi K, Kanatani A, Ito J, Tsuji H, Ikeda Y, Mochida K
    • 雑誌名

      Plant Cell Physiologists

      巻: pcaa046 号: 8 ページ: 1-32

    • DOI

      10.1093/pcp/pcaa046

    • NAID

      120007019116

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Training instance segmentation neural network with synthetic datasets for crop seed phenotyping.2020

    • 著者名/発表者名
      Toda, Y., Okura, F., Ito, J. et al.
    • 雑誌名

      Commun Biol

      巻: 3 号: 1 ページ: 173-173

    • DOI

      10.1038/s42003-020-0905-5

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] シングルメリステムRNA-seq解析によるオオムギ茎頂メリステムの発生ステート推移の解明2022

    • 著者名/発表者名
      井藤純, 野村有子, 高萩航太郎, 岡田聡史, 佐藤奈緒, 松本大輝, 新井駿一, 杉村みどり, 関緑, 服部公央亮, 梅崎太造, 最相大輔, 持田恵一, 平山隆志, 辻寛之
    • 学会等名
      第63回日本植物生理学会年会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] 3D イメージングとレーザーマイクロダイセクション-RNA-seq によるオオムギ花序の機能未知構造”double ridge“の解析2022

    • 著者名/発表者名
      佐藤奈緒,井藤純,野村有子,杉村みどり,武田(神谷)紀子,豊岡公徳,辻寛之
    • 学会等名
      第63回日本植物生理学会年会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] シングルメリステムトランスクリプトームによるオオムギ茎頂部の発生トラジェクトリ解析2021

    • 著者名/発表者名
      井藤純,野村有子,佐藤奈緒,岡田聡史,高萩航太郎,杉村みどり,関緑,最相大輔,持田恵一,平山隆志,辻寛之
    • 学会等名
      日本育種学会第140回講演会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] オオムギ花序メリステムの細胞死過程の一細胞解像度動態解析2021

    • 著者名/発表者名
      松本大輝,井藤純,新井駿一,野村有子,杉村みどり,佐藤奈緒,関緑,宇野何岸,佐藤良勝,最相大輔,辻寛之
    • 学会等名
      日本育種学会第140回講演会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] 野外・室内環境下におけるオオムギシュート頂メリステムの細胞動態解析.2021

    • 著者名/発表者名
      新井駿一,井藤純,久下修平,佐藤奈緒,野村有子,杉村みどり,最相大輔,辻寛之
    • 学会等名
      日本植物生理学会第 62 回年会
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
  • [学会発表] オオムギの VRN1::GFP 形質転換体を用いた幼穂形成過程の 1 細胞解像度 3D イメージング2020

    • 著者名/発表者名
      佐藤奈緒,井藤純,久下修平,新井駿一,野村有子,辻寛之
    • 学会等名
      第 18 回ムギ類研究会
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
  • [学会発表] 野外環境下におけるオオムギシュート頂メリステムの一細胞動態解析.2020

    • 著者名/発表者名
      新井駿一,久下修平,佐藤奈緒,野村有子,杉村みどり,最相大輔,井藤純,辻寛之
    • 学会等名
      日本育種学会第 138 回講演会
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
  • [学会発表] オオムギの VRN1-GFP 形質転換体を用いた幼穂形成過程の 1 細胞解像度 3D イメージング.2020

    • 著者名/発表者名
      佐藤奈緒,井藤純,久下修平,新井駿一,野村有子,辻寛之
    • 学会等名
      日本育種学会第 138 回講演会
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
  • [学会発表] イメージングから探るオオムギシュート頂メリステムの発生過程.2020

    • 著者名/発表者名
      井藤純,久下修平,新井駿一,佐藤奈緒,鷲見典克,服部公央亮,野村有子,赤司裕子,田中真理,最相大輔,梅崎太造,平山隆志,辻寛之
    • 学会等名
      日本植物学会第 84 回大会
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
  • [学会発表] 野外環境におけるオオムギ茎頂メリステムの成長過程の系統間比較2019

    • 著者名/発表者名
      井藤純,野村有子,最相大輔,高萩航太郎,持田恵一,平山隆志,辻寛之
    • 学会等名
      日本育種学会第136回講演会
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
  • [学会発表] オオムギ茎頂メリステムの全層透明化による 3D イメージング2019

    • 著者名/発表者名
      久下修平,井藤純,野村有子,辻寛之
    • 学会等名
      日本育種学会第136回講演会
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
  • [学会発表] 1細胞RNA-seq解析に向けたオオムギ幼穂からの1細胞単離系の確立2019

    • 著者名/発表者名
      佐藤奈緒,井藤純,野村有子,武田紀子,辻寛之
    • 学会等名
      日本育種学会第136回講演会
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
  • [学会発表] 屋外環境におけるオオムギシュート頂メリステムの遺伝子発現変化2019

    • 著者名/発表者名
      井藤純,野村有子,高萩航太郎,最相大輔,持田恵一,平山隆志,辻寛之
    • 学会等名
      第17回ムギ類研究会
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
  • [学会発表] Coordinating the growth and cell division at the shoot apical meristem in barley2019

    • 著者名/発表者名
      Ito, J., Kuge, S., Goh, T., Hisanaga, T., Akashi H., Nomura, Y., Uno, K., Sato, Y., and Tsuji, H.
    • 学会等名
      International Symposium on the Future Direction of Plant Science by Young Researchers
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
    • 国際学会

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公開日: 2019-04-18   更新日: 2023-01-30  

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