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ヒストンメチル基転移酵素SUV39H1を含むヘテロクロマチン様複合体の構造解析

研究課題

研究課題/領域番号 19K06609
研究種目

基盤研究(C)

配分区分基金
応募区分一般
審査区分 小区分43050:ゲノム生物学関連
研究機関東京大学

研究代表者

佐藤 祥子  東京大学, 定量生命科学研究所, 特任助教 (90624966)

研究期間 (年度) 2019-04-01 – 2022-03-31
研究課題ステータス 完了 (2021年度)
配分額 *注記
4,420千円 (直接経費: 3,400千円、間接経費: 1,020千円)
2021年度: 1,170千円 (直接経費: 900千円、間接経費: 270千円)
2020年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円)
2019年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円)
キーワードヘテロクロマチン / ヌクレオソーム / クライオ電子顕微鏡 / エピジェネティクス
研究開始時の研究の概要

真核生物のゲノムDNAは、ヒストンタンパク質八量体にDNAが巻き付いたヌクレオソームを基本単位としてクロマチン構造を形成している。クロマチンはさらに高次に折り畳まれ、構造的・機能的に異なる区画を形成する。遺伝子を多く含むユークロマチン領域に対し、構成的ヘテロクロマチン領域は、リピート配列やトランスポゾン由来の配列を多く含み、ゲノムの安定性に寄与している。本研究では、構成的ヘテロクロマチン維持の基盤となる複合体を試験管内で再構成し、その立体構造を明らかにする。

研究成果の概要

真核生物のゲノムDNAは、ヌクレオソームを基本単位としてクロマチンを形成し、構造的・機能的に異なる区画を形成して遺伝子発現やゲノムの安定性を制御している。本研究では、構成的ヘテロクロマチンのエピジェネティックマークの書き込み因子であるSUV39Hと、読み取り因子であるヘテロクロマチンタンパク質HP1、およびヌクレオソームとで形成される複合体の立体構造を解析することにより、ヘテロクロマチン形成の機構を明らかにすることを目的とした。本研究では、HP1-クロマチン複合体の電子線トモグラフィー像を得ることに成功した。また、クライオ電子顕微鏡解析の高度化の過程で、新規ヌクレオソーム構造を明らかにした。

研究成果の学術的意義や社会的意義

構成的ヘテロクロマチンは、その領域からの転写やDNA組換えを抑制することによりゲノムの安定性に寄与すると考えられている領域であり、その破綻は癌などの疾患に繋がる。本研究で行ったHP1-クロマチン複合体の構造解析は、ヘテロクロマチン領域の形成と維持の機構解明のための基盤情報となるものである。また、クライオ電子顕微鏡解析技術の高度化の過程で得られた新規構造のうち、ヒト病原性寄生虫であるジアルジアのヌクレオソーム構造は、創薬の基盤情報を提供するものである。

報告書

(4件)
  • 2021 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2020 実施状況報告書
  • 2019 実施状況報告書
  • 研究成果

    (8件)

すべて 2022 2021 2020 2019

すべて 雑誌論文 (3件) (うち国際共著 1件、 査読あり 3件、 オープンアクセス 3件) 学会発表 (5件) (うち国際学会 1件)

  • [雑誌論文] Cryo-EM structure of the nucleosome core particle containing <i>Giardia lamblia</i> histones2021

    • 著者名/発表者名
      Sato Shoko、Takizawa Yoshimasa、Hoshikawa Fumika、Dacher Mariko、Tanaka Hiroki、Tachiwana Hiroaki、Kujirai Tomoya、Iikura Yukari、Ho Cheng-Han、Adachi Naruhiko、Patwal Indu、Flaus Andrew、Kurumizaka Hitoshi
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Research

      巻: 49 号: 15 ページ: 8934-8946

    • DOI

      10.1093/nar/gkab644

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] The N‐terminal and C‐terminal halves of histone H2A.Z independently function in nucleosome positioning and stability2020

    • 著者名/発表者名
      Sato Shoko、Tanaka Naoki、Arimura Yasuhiro、Kujirai Tomoya、Kurumizaka Hitoshi
    • 雑誌名

      Genes to Cells

      巻: 25 号: 8 ページ: 538-546

    • DOI

      10.1111/gtc.12791

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Biochemical and structural analyses of the nucleosome containing human histone H2A.J2019

    • 著者名/発表者名
      Tanaka Hiroki、Sato Shoko、Koyama Masako、Kujirai Tomoya、Kurumizaka Hitoshi
    • 雑誌名

      The Journal of Biochemistry

      巻: 167 号: 4 ページ: 419-427

    • DOI

      10.1093/jb/mvz109

    • NAID

      40022211009

    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] Cryo-EM structure of the nucleosome containing human parasitic Giardia lamblia histones2022

    • 著者名/発表者名
      Shoko Sato, Yoshimasa Takizawa, Fumika Hoshikawa, Mariko Dacher, Hiroki Tanaka, Hiroaki Tachiwana, Tomoya Kujirai, Yukari Iikura, Cheng-Han Ho, Naruhiko Adachi, Indu Patwal, Andrew Flaus, Hitoshi Kurumizaka
    • 学会等名
      The 30th Hot Spring Harbor International Symposium, Chromatin Potential in Development and Differentiation, The 6th Symposium of the Inter-University Research Network for Trans-Omics Medicine
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 病原性寄生虫Giardia lamblia ヌクレオソームの構造と生化学的性質2021

    • 著者名/発表者名
      佐藤祥子、滝沢由政、星川史佳、ダッシェ マリコ、 田中大貴、立和名博昭、鯨井智也、飯倉ゆかり、 何承翰、安達成彦、Indu Patwal、Andrew Flaus、胡桃坂仁志
    • 学会等名
      第39回 染色体ワークショップ・第19回 核ダイナミクス研究会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] クライオ電子顕微鏡を用いたジアルジアヌクレオソームの構造解析と生化学的解析2021

    • 著者名/発表者名
      佐藤祥子、滝沢由政、星川史佳、ダッシェ マリコ、田中大貴、立和名博昭、飯倉ゆかり、鯨井智也、Cheng-Han Ho、安達成彦、Indu Patwal、Andrew Flaus、胡桃坂仁志
    • 学会等名
      第44回 日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] ランブル鞭毛虫ヌクレオソームの構造と生化学的性質2019

    • 著者名/発表者名
      佐藤祥子, 滝沢由政, 田中大貴, ダッシェ マリコ, Indu Patwal, Andrew Flaus, 胡桃坂仁志
    • 学会等名
      第42回日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
  • [学会発表] 再構成クロマチンを基質としたトランスポゾン転移酵素Tn5の生化学的解析2019

    • 著者名/発表者名
      佐藤祥子, 有村泰宏, 原田哲仁, 前原一満, 大川恭行, 胡桃坂仁志
    • 学会等名
      第37回染色体ワークショップ・第18回核ダイナミクス研究会
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書

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公開日: 2019-04-18   更新日: 2023-01-30  

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