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「分化の波」の進行を制御する複数シグナルの相互作用の理解

研究課題

研究課題/領域番号 19K06674
研究種目

基盤研究(C)

配分区分基金
応募区分一般
審査区分 小区分44020:発生生物学関連
研究機関金沢大学

研究代表者

八杉 徹雄  金沢大学, 新学術創成研究機構, 准教授 (90508110)

研究期間 (年度) 2019-04-01 – 2023-03-31
研究課題ステータス 完了 (2022年度)
配分額 *注記
4,290千円 (直接経費: 3,300千円、間接経費: 990千円)
2021年度: 1,040千円 (直接経費: 800千円、間接経費: 240千円)
2020年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円)
2019年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円)
キーワードショウジョウバエ / 視覚中枢 / 分化の波 / 数理モデル / 数理モデリング
研究開始時の研究の概要

様々な生命現象は多様なシグナル経路の複雑な相互フィードバックにより制御される。これまで、個々のシグナル経路の動作機構の理解が進んできたが、多細胞系において複雑なシグナル間相互作用を正確に記述することは困難であった。本研究では、シグナル間相互作用を包括的に理解するモデルとして、ショウジョウバエ視覚中枢の発生における「分化の波」に着目する。数理生物学的手法と実験生物学的手法を融合することにより、「分化の波」の進行を制御する複数シグナルの相互作用の包括的な理解を目指す。

研究成果の概要

様々な生命現象は多様なシグナル経路の複雑な相互作用により制御される。本研究では、数理生物学的手法と実験生物学的手法を融合することによる複数シグナルの相互作用の包括的な理解を目指した。具体的には、ショウジョウバエ視覚中枢にみられる「分化の波」の進行現象に着目し、進行を制御するシグナル経路の相互作用の解明を目指した。
「分化の波」の進行を制御するEGF、Notch、JAK/STATといった既知のシグナル経路に加え、インスリン、TOR、Wntシグナルに着目し、シグナル間相互作用の解明に取り組んだ。また、細胞の大きさや格子の形状の情報を保存したまま空間離散モデルを連続化する新規の数理手法を確立した。

研究成果の学術的意義や社会的意義

本研究では、数理生物学的手法と実験生物学的手法を組み合わせることにより、発生現象を制御するシグナル経路の相互作用の包括的な理解を目指した。ショウジョウバエ視覚中枢における「分化の波」の進行現象は発生現象が時空間的に制御された中で進行することから、数理生物学と実験生物学の融合研究の優れたモデルであると考えられる。また、本研究で扱ったEGF、Notch、JAK/STAT、Wnt、インスリン、TOR、シグナルなどのシグナル経路の機能は保存されており、「反応拡散」や「側方抑制」などの作用機構は今後他の生命現象を説明する数理モデルの構築にも応用できる可能性が高い。

報告書

(5件)
  • 2022 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2021 実施状況報告書
  • 2020 実施状況報告書
  • 2019 実施状況報告書
  • 研究成果

    (14件)

すべて 2022 2021 2020 2019

すべて 雑誌論文 (6件) (うち国際共著 1件、 査読あり 6件、 オープンアクセス 5件) 学会発表 (8件) (うち国際学会 1件、 招待講演 6件)

  • [雑誌論文] Mathematical modeling of Notch dynamics in <i>Drosophila</i> neural development2021

    • 著者名/発表者名
      Yasugi Tetsuo、Sato Makoto
    • 雑誌名

      Fly

      巻: 16 号: 1 ページ: 24-36

    • DOI

      10.1080/19336934.2021.1953363

    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Intracellular trafficking of Notch orchestrates temporal dynamics of Notch activity in the fly brain2021

    • 著者名/発表者名
      Wang Miaoxing、Han Xujun、Liu Chuyan、Takayama Rie、Yasugi Tetsuo、Ei Shin-Ichiro、Nagayama Masaharu、Tanaka Yoshitaro、Sato Makoto
    • 雑誌名

      Nature Communications

      巻: 12 号: 1 ページ: 1-15

    • DOI

      10.1038/s41467-021-22442-3

    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書 2020 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] A continuation method for spatially discretized models with nonlocal interactions conserving size and shape of cells and lattices2020

    • 著者名/発表者名
      Ei Shin-Ichiro、Ishii Hiroshi、Sato Makoto、Tanaka Yoshitaro、Wang Miaoxing、Yasugi Tetsuo
    • 雑誌名

      Journal of Mathematical Biology

      巻: 81 号: 4-5 ページ: 981-1028

    • DOI

      10.1007/s00285-020-01534-6

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Role for phagocytosis in the prevention of neoplastic transformation in Drosophila2020

    • 著者名/発表者名
      Zhang Min、Nagaosa Kaz、Nakai Yuji、Yasugi Tetsuo、Kushihiki Masako、Rahmatika Dini、Sato Makoto、Shiratsuchi Akiko、Nakanishi Yoshinobu
    • 雑誌名

      Genes to Cells

      巻: 25 号: 10 ページ: 675-684

    • DOI

      10.1111/gtc.12804

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Dscam1 establishes the columnar units through lineage-dependent repulsion between sister neurons in the fly brain2020

    • 著者名/発表者名
      Liu Chuyan、Trush Olena、Han Xujun、Wang Miaoxing、Takayama Rie、Yasugi Tetsuo、Hayashi Takashi、Sato Makoto
    • 雑誌名

      Nature Communications

      巻: 11 号: 1 ページ: 4067-4067

    • DOI

      10.1038/s41467-020-17931-w

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Regulation of Proneural Wave Propagation Through a Combination of Notch-Mediated Lateral Inhibition and EGF-Mediated Reaction Diffusion2020

    • 著者名/発表者名
      Sato Makoto、Yasugi Tetsuo
    • 雑誌名

      Advances in Experimental Medicine and Biology

      巻: 1218 ページ: 77-91

    • DOI

      10.1007/978-3-030-34436-8_5

    • ISBN
      9783030344351, 9783030344368
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] ショウジョウバエにおいてPiwiは核内倍加を介して個体の発育を制御する2022

    • 著者名/発表者名
      八杉徹雄
    • 学会等名
      第45回日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] ショウジョウバエをモデルとした神経幹細胞分化の数理モデル解析と実証2021

    • 著者名/発表者名
      八杉徹雄
    • 学会等名
      文部科学省 科学研究補助金 新学術領域研究(研究領域提案型)細胞社会ダイバーシティーの統合的解明と制御 第6回公開シンポジウム「多階層1細胞解析と個体モデルで実証する細胞社会ダイバーシティー」
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
  • [学会発表] 神経幹細胞分化の時空間的制御機構2021

    • 著者名/発表者名
      八杉徹雄
    • 学会等名
      大阪大学 数理・データ科学教育研究センター(MMDS)講演会「医学研究における数理的方法」
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Mathematical Modeling and Experimental Verification of the “Proneural Wave”2021

    • 著者名/発表者名
      Tetsuo Yasugi
    • 学会等名
      JSPS Core-to-Core Program 「Establishing International Research Network of Mathematical Oncology -Fusion of Mathematics and Biology-」
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Notch dynamics regulate temporal patterning of neurogenesis in the developing fly brain2020

    • 著者名/発表者名
      Tetsuo Yasugi, Miaoxing Wang, Xujun Han, Chuyan Liu, Rie Takayama, Makoto Sato
    • 学会等名
      第43回日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 「分化の波」の空間離散モデルの連続化と生体内での検証II2020

    • 著者名/発表者名
      八杉徹雄
    • 学会等名
      反応拡散系と実験の融合3
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Understanding the Interactions of Multiple Signaling Pathways that Control the Proneural Wave Propagation2019

    • 著者名/発表者名
      Tetsuo Yasugi, Yoshitaro Tanaka, Hiroshi Ishii, Shin-Ichiro Ei, Makoto Sato
    • 学会等名
      第42回日本分子生物学会年会(招待講演)
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] ショウジョウバエ視覚系における「分化の波」の数理モデル解析と実証2019

    • 著者名/発表者名
      八杉徹雄
    • 学会等名
      第二回はこだて現象数理研究集会(招待講演)
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
    • 招待講演

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公開日: 2019-04-18   更新日: 2024-01-30  

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