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新規高速超解像顕微鏡による転写因子促進拡散挙動の可視化

研究課題

研究課題/領域番号 19K15406
研究種目

若手研究

配分区分基金
審査区分 小区分28040:ナノバイオサイエンス関連
研究機関大学共同利用機関法人自然科学研究機構(新分野創成センター、アストロバイオロジーセンター、生命創成探究

研究代表者

堤 元佐  大学共同利用機関法人自然科学研究機構(新分野創成センター、アストロバイオロジーセンター、生命創成探究, 生命創成探究センター, 特任助教 (60782422)

研究期間 (年度) 2019-04-01 – 2022-03-31
研究課題ステータス 完了 (2021年度)
配分額 *注記
4,290千円 (直接経費: 3,300千円、間接経費: 990千円)
2020年度: 2,080千円 (直接経費: 1,600千円、間接経費: 480千円)
2019年度: 2,210千円 (直接経費: 1,700千円、間接経費: 510千円)
キーワード深部超解像イメージング / 高速超解像イメージング / 生体イメージング / 先端蛍光顕微鏡 / 蛍光顕微鏡 / 超解像顕微鏡 / 生体超解像イメージング / イメージング / 転写因子 / 促進拡散 / スフェロイド / 2光子顕微鏡
研究開始時の研究の概要

転写因子はDNAと結合することで生体機能の発現を制御するタンパク質である。近年、DNA鎖近傍で生じる転写因子の探索挙動「促進拡散」の存在が明らかになり、膨大なDNA情報の中から目的の遺伝子配列を見つけ出すために重要であることが示唆されている。しかし、促進拡散を観察するには、数十ミリ秒の時間と数十ナノメートルの空間を見分ける能力(分解能)を兼ね備えた観察手法が必要であり、生体における促進拡散の意義は未だ十分には明らかになっていない。本研究では、新たな超解像顕微鏡法を導入することで、上記の分解能での観察を生きた細胞で実現し、転写因子の促進拡散挙動の変化を詳細に比べることで、その意義を検討する。

研究成果の概要

微小時空間で生じる生細胞内分子挙動の可視化を目指し、高速かつ深部観察可能な超解像観察法を確立した。画像解析による新規超解像法SRRFを駆使し、研究グループが保有する先端2光子励起蛍光顕微鏡に適用することで、数十枚/秒での高速観察と、ミリメートルオーダーの生体・組織深部での超解像観察を実証した。また、研究期間中に生じた新型コロナ情勢に対応するため、共同研究者とリモート観察システムを構築し、海を越えた超解像観察を実証した。これらの成果を複数の学会・国際会議で発表し、2021年度には学会発表賞を授与された。また、本研究で得られた知見を活用した共同研究成果として、共著論文3報を海外学術誌に発表した。

研究成果の学術的意義や社会的意義

本研究で確立された高速・深部超解像観察法は、転写因子の高速DNA認識動態の観察のみならず、脳をはじめとする生体組織、臓器、3次元培養細胞など、既存超解像顕微鏡法では観察困難な対象における微細分子挙動や形態観察に適用でき、生命科学研究の発展に貢献する。また、本研究に関連して得られた細胞スフェロイド培養法やその2光子観察法の知見は薬剤活性の評価モデルとして有用であり、国際共同研究を含む複数の研究に応用されている。さらに、本研究で実証したリモート顕微鏡観察の系は、感染症蔓延下の対応だけではなく、遠隔地に住む研究者が先端顕微鏡観察の機会を得られる点から、海外顕微鏡共用施設の運営者からも注目されている。

報告書

(4件)
  • 2021 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2020 実施状況報告書
  • 2019 実施状況報告書
  • 研究成果

    (22件)

すべて 2022 2021 2020 2019 その他

すべて 国際共同研究 (3件) 雑誌論文 (3件) (うち国際共著 2件、 査読あり 3件、 オープンアクセス 3件) 学会発表 (16件) (うち国際学会 3件、 招待講演 5件)

  • [国際共同研究] KU Leuven(ベルギー)

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [国際共同研究] Katholieke Universiteit Leuven(ベルギー)

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
  • [国際共同研究] Columbia University(米国)

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
  • [雑誌論文] FBP17-mediated finger-like membrane protrusions in cell competition between normal and RasV12-transformed cells2021

    • 著者名/発表者名
      Kamasaki Tomoko、Miyazaki Yumi、Ishikawa Susumu、Hoshiba Kazuya、Kuromiya Keisuke、Tanimura Nobuyuki、Mori Yusuke、Tsutsumi Motosuke、Nemoto Tomomi、Uehara Ryota、Suetsugu Shiro、Itoh Toshiki、Fujita Yasuyuki
    • 雑誌名

      iScience

      巻: 24 号: 9 ページ: 102994-102994

    • DOI

      10.1016/j.isci.2021.102994

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] 3DeeCellTracker, a deep learning-based pipeline for segmenting and tracking cells in 3D time lapse images2021

    • 著者名/発表者名
      Wen Chentao、Miura Takuya、Voleti Venkatakaushik、Yamaguchi Kazushi、Tsutsumi Motosuke、Yamamoto Kei、Otomo Kohei、Fujie Yukako、Teramoto Takayuki、Ishihara Takeshi、Aoki Kazuhiro、Nemoto Tomomi、Hillman Elizabeth MC、Kimura Koutarou D
    • 雑誌名

      eLife

      巻: 10

    • DOI

      10.7554/elife.59187

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Adaptive Optical Two-Photon Microscopy for Surface-Profiled Living Biological Specimens2020

    • 著者名/発表者名
      Yamaguchi Kazushi、Otomo Kohei、Kozawa Yuichi、Tsutsumi Motosuke、Inose Tomoko、Hirai Kenji、Sato Shunichi、Nemoto Tomomi、Uji-i Hiroshi
    • 雑誌名

      ACS Omega

      巻: 6 号: 1 ページ: 438-447

    • DOI

      10.1021/acsomega.0c04888

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [学会発表] Image analysis based super-resolution two-photon microscopy for in vivo imaging2022

    • 著者名/発表者名
      Tsutsumi M
    • 学会等名
      第4回 ExCELLS若手交流リトリート
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] Image analysis based super-resolution two-photon microscopy for in vivo imaging2022

    • 著者名/発表者名
      Tsutsumi M, Nemoto T
    • 学会等名
      第11回 生理研-霊長研-新潟脳研 合同シンポジウム
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] 光学顕微鏡の観察の新展開 -光学分解能を超える観察とリモート観察 -2022

    • 著者名/発表者名
      堤 元佐
    • 学会等名
      北海道大学 技術支援・設備共用コアステーション オンライン会議
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 画像解析による超解像法SRRFのin vivoイメージングへの適用2021

    • 著者名/発表者名
      堤 元佐、髙橋泰伽、小林健太郎、根本知己
    • 学会等名
      第30回 日本バイオイメージング学会学術集会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] Remote support of optical microscope observation beyond 1000 km distance2021

    • 著者名/発表者名
      Tsutsumi M, Kobayashi K, Nemoto T
    • 学会等名
      Global Bio Imaging -Exchange of Experience VI- online meeting
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] 蛍光イメージングの最新動向:より速く、より深く、より細かく、そしてより優しく2021

    • 著者名/発表者名
      堤 元佐
    • 学会等名
      琉球大学 理学部海洋自然科学科生物系 公開講演会
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 空間光位相変調器を用いた収差補正による生体組織深部の微細構造の可視化2021

    • 著者名/発表者名
      山口和志、大友康平、小澤祐市、堤 元佐、猪瀬朋子、平井健二、佐藤俊一、根本知己、雲林院 宏
    • 学会等名
      日本化学会 第101春季年会
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
  • [学会発表] Two-photon 3D live imaging of cellular ERK activation in multicellular tumor spheroid adhering gold nanostar for plasmonic photothermal effects2021

    • 著者名/発表者名
      Kazushi Yamaguchi, Kohei Otomo, Yuichi Kozawa, Motosuke Tsutsumi, Tomoko Inose, Kenzi Hirai, Syunichi Sato, Tomomi Nemoto, Hiroshi Uji-i
    • 学会等名
      The 3rd Australia-Belgium-Japan joint symposium on excitonics and cellular communication
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] TP-SRRF, Image analysis based super-resolution two-photon microscopy for deep imaging2021

    • 著者名/発表者名
      Motosuke Tsutsumi
    • 学会等名
      第3回 ExCELLS若手交流リトリート
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
  • [学会発表] SRRF-時空間蛍光相関超解像法 ~画像解析による新規超解像顕微鏡~2020

    • 著者名/発表者名
      堤 元佐
    • 学会等名
      オックスフォード・インストゥルメンツ社 Andor ウェビナー 第2回
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 多点走査型2光子顕微鏡によるAβオリゴマー曝露時のアストロサイトCa2+動態の可視化解析2020

    • 著者名/発表者名
      中田開人、鎌田恭史、大友康平、石井宏和、堤 元佐、榎木亮介、根本知己
    • 学会等名
      第29回 日本バイオイメージング学会学術集会
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
  • [学会発表] Image analysis based super-resolution two-photon microscopy TP-SRRF for deep imaging2020

    • 著者名/発表者名
      Motosuke Tsutsumi, Tomomi Nemoto
    • 学会等名
      第3回 ExCELLSシンポジウム
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
  • [学会発表] Application of novel image analysis method SRRF for deep and fast super resolution imaging2020

    • 著者名/発表者名
      堤 元佐、根本知己
    • 学会等名
      ExCELLS若手リトリート
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
  • [学会発表] Application of novel image analysis method SRRF for deep and fast super resolution imaging2020

    • 著者名/発表者名
      Tsutsumi M., Nemoto T
    • 学会等名
      ABiS International Symposium 2020
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 深部高速超解像イメージングのための新規画像解析法SRRFの適用検討2019

    • 著者名/発表者名
      堤 元佐、根本知己
    • 学会等名
      第2回ExCELLSシンポジウム
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
  • [学会発表] Application of novel image analysis method SRRF for deep and fast super resolution imaging2019

    • 著者名/発表者名
      堤 元佐、根本知己
    • 学会等名
      大学共同利用機関法人若手コロキウム
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書

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公開日: 2019-04-18   更新日: 2023-01-30  

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