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生細胞のRNAイメージングを志向した膜透過プローブの開発

研究課題

研究課題/領域番号 19K15713
研究種目

若手研究

配分区分基金
審査区分 小区分37030:ケミカルバイオロジー関連
研究機関学習院大学

研究代表者

友池 史明  学習院大学, 理学部, 助教 (70708586)

研究期間 (年度) 2019-04-01 – 2022-03-31
研究課題ステータス 完了 (2021年度)
配分額 *注記
4,160千円 (直接経費: 3,200千円、間接経費: 960千円)
2021年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
2020年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
2019年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
キーワード核酸プローブ / ヒストン様タンパク質 / 細胞内輸送 / 遺伝子検出 / 核酸輸送 / 細胞膜 / 核酸 / RNA / プローブ
研究開始時の研究の概要

RNAは細胞内の遺伝子発現とその調整を担っている。また、作られるRNAの種類、量は個々の細胞で異なり、これが細胞の機能や組織の分化を担っている。すでにqPCRやマイクロアレイなど、細胞集団からRNAを抽出し、作られているRNAの種類、量を調べる方法が確立されているが、この方法では個々の細胞のRNAを解析することができない。そこで本研究では、特異的にRNAが検出できる核酸プローブに、膜透過性が報告されている修飾を導入することで自発的に細胞内に局在し、RNAを検出するプローブを開発し、個々の生細胞中のRNAを特異的にイメージングする技術の実現を目指す。

研究成果の概要

生細胞内での遺伝子発現を検出するため、膜透過性核酸プローブおよび核酸をヒストン様タンパク質で輸送する手法を検討した。膜透過性核酸プローブでは、核酸の糖骨格に硫黄を導入することで膜透過性を核酸プローブに付与した。この修飾によって核酸プローブによる標的核酸の検出能は損なわれないことがわかった。しかし、遺伝子発現検出にはより効率的に細胞内へ輸送する修飾を検討する必要が示唆された。タンパク質による輸送する手法についてはヒストン様タンパク質を改変することで、細胞内に核酸を輸送することを示唆する結果が得られた。また、輸送された核酸が機能する条件を検討する必要があることがわかった。

研究成果の学術的意義や社会的意義

核酸プローブを生細胞に効率的に導入することができれば、生体組織での遺伝子発現変化の理解が促進される。本研究で検討した膜透過性プローブおよび改変したヒストン様タンパク質による核酸輸送では、生細胞における遺伝子発現の観察に至らなかったものの、本研究で得られたホスホロチオエート体の核酸プローブの性質および膜透過性が付与されたヒストン様タンパク質の知見は、将来的に生細胞での遺伝子発現イメージングの実現に貢献が期待できる。また、改変されたヒストン様タンパク質は、輸送する核酸が核酸プローブに限定されないため、今後最適化によってヒストン様タンパク質による核酸医薬への貢献も期待できる。

報告書

(4件)
  • 2021 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2020 実施状況報告書
  • 2019 実施状況報告書
  • 研究成果

    (16件)

すべて 2022 2021 2020 2019

すべて 雑誌論文 (10件) (うち国際共著 4件、 査読あり 10件、 オープンアクセス 2件) 学会発表 (5件) 産業財産権 (1件)

  • [雑誌論文] Completely Chemically Synthesized Long DNA Can be Transcribed in Human Cells2021

    • 著者名/発表者名
      Yamaoka Kazuki、Oikawa Ryota、Abe Naoko、Nakamoto Kosuke、Tomoike Fumiaki、Hashiya Fumitaka、Kimura Yasuaki、Abe Hiroshi
    • 雑誌名

      ChemBioChem

      巻: 22 号: 23 ページ: 3273-3276

    • DOI

      10.1002/cbic.202100312

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Intracellular Delivery of Antisense DNA and siRNA with Amino Groups Masked with Disulfide Units2020

    • 著者名/発表者名
      Shu Zhaoma、Ota Azumi、Takayama Yukiya、Katsurada Yuri、Kusamori Kosuke、Abe Naoko、Nakamoto Kosuke、Tomoike Fumiaki、Tada Seiichi、Ito Yoshihiro、Nishikawa Makiya、Kimura Yasuaki、Abe Hiroshi
    • 雑誌名

      CHEMICAL & PHARMACEUTICAL BULLETIN

      巻: 68 号: 2 ページ: 129-132

    • DOI

      10.1248/cpb.c19-00811

    • NAID

      130007793432

    • ISSN
      0009-2363, 1347-5223
    • 年月日
      2020-02-01
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Chemically synthesized circular RNAs with phosphoramidate linkages enable rolling circle translation2020

    • 著者名/発表者名
      Nakamoto Kosuke、Abe Naoko、Tsuji Genichiro、Kimura Yasuaki、Tomoike Fumiaki、Shimizu Yoshihiro、Abe Hiroshi
    • 雑誌名

      Chemical Communications

      巻: - 号: 46 ページ: 6217-6220

    • DOI

      10.1039/d0cc02140g

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Phosphorothioate Modification of mRNA Accelerates the Rate of Translation Initiation to Provide More Efficient Protein Synthesis2020

    • 著者名/発表者名
      Daisuke Kawaguchi, Ayumi Kodama, Naoko Abe, Kei Takebuchi, Fumitaka Hashiya, Fumiaki Tomoike, Kosuke Nakamoto, Yasuaki Kimura, Yoshihiro Shimizu, and Hiroshi Abe
    • 雑誌名

      Angewandte Chemie International Edition

      巻: 59 号: 40 ページ: 17403-17407

    • DOI

      10.1002/anie.202007111

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Translational control by secondary-structure formation in mRNA in a eukaryotic system2020

    • 著者名/発表者名
      Daisuke Kawaguchi, Saaya Shimizu, Naoko Abe, Fumitaka Hashiya, Fumiaki Tomoike,Yasuaki Kimura, Hiroshi Abe
    • 雑誌名

      Nucleosides, Nucleotides and Nucleic Acids

      巻: 39 号: 1-3 ページ: 195-203

    • DOI

      10.1080/15257770.2019.1671593

    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Intracellular build-up RNAi with single-strand circular RNAs as siRNA precursors2020

    • 著者名/発表者名
      Kimura Yasuaki、Shu Zhaoma、Ito Mika、Abe Naoko、Nakamoto Kosuke、Tomoike Fumiaki、Shuto Satoshi、Ito Yoshihiro、Abe Hiroshi
    • 雑誌名

      Chemical Communications

      巻: 56 号: 3 ページ: 466-469

    • DOI

      10.1039/c9cc04872c

    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] N6-methyl adenosine in siRNA evades immune response without reducing RNAi activity2019

    • 著者名/発表者名
      Akihiro Imaeda, Fumiaki Tomoike, Mayu Hayakawa, Kosuke Nakamoto, Yasuaki Kimura, Naoko Abe, Hiroshi Abe
    • 雑誌名

      Nucleosides, Nucleotides and Nucleic Acids

      巻: 38 号: 12 ページ: 972-979

    • DOI

      10.1080/15257770.2019.1641205

    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] RNA imaging by chemical probes2019

    • 著者名/発表者名
      Tomoike Fumiaki、Abe Hiroshi
    • 雑誌名

      Advanced Drug Delivery Reviews

      巻: 147 ページ: 44-58

    • DOI

      10.1016/j.addr.2019.08.001

    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Ceritinib‐associated hyperglycemia in the Japanese Adverse Drug Event Report Database2019

    • 著者名/発表者名
      Fujita Haruka、Murakami Takaaki、Tomoike Fumiaki、Yabe Daisuke、Inagaki Nobuya
    • 雑誌名

      Journal of Diabetes Investigation

      巻: - 号: 3 ページ: 726-730

    • DOI

      10.1111/jdi.13168

    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Repertoire of morphable proteins in an organism2019

    • 著者名/発表者名
      Izumi Keisuke、Saho Eitaro、Kutomi Ayuka、Tomoike Fumiaki、Okada Tetsuji
    • 雑誌名

      PeerJ

      巻: 8

    • DOI

      10.1101/719260

    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] 膜透過性を持たせたヒストン様タンパク質による細胞への核酸導入2022

    • 著者名/発表者名
      鈴木満美子、友池史明、岡田哲二
    • 学会等名
      日本薬学会第142年会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] アクリルアミドゲルによるタンパク質結晶の保護2021

    • 著者名/発表者名
      室山 晴菜、加藤 誠一、友池 史明、岡田 哲二
    • 学会等名
      第94回日本生化学会大会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] ハイドロゲルファイバにおけるタンパク質結晶の保護2021

    • 著者名/発表者名
      室山 晴菜、永江 峰幸、友池 史明、岡田 哲二
    • 学会等名
      化学とマイクロナノシステム学会第44回研究会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] Distance Scoring Analysisによるヒストンタンパク質の解析2019

    • 著者名/発表者名
      久富彩友香、友池史明、岡田哲二
    • 学会等名
      第42回 日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
  • [学会発表] タンパク質結晶化後のゲル保護2019

    • 著者名/発表者名
      森田惇、友池史明、竹内昌治、岡田哲二
    • 学会等名
      第42回 日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
  • [産業財産権] タンパク質結晶のハイドロゲル包埋物の作製方法2019

    • 発明者名
      友池史明、森田惇、岡田哲二
    • 権利者名
      学習院大学
    • 産業財産権種類
      特許
    • 出願年月日
      2019
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書

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公開日: 2019-04-18   更新日: 2023-01-30  

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