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H3K9me2ドメインの形成基盤と高次クロマチン構造形成における役割の解明

研究課題

研究課題/領域番号 19K16049
研究種目

若手研究

配分区分基金
審査区分 小区分43010:分子生物学関連
研究機関国立研究開発法人理化学研究所

研究代表者

福田 渓  国立研究開発法人理化学研究所, 開拓研究本部, 研究員 (00756786)

研究期間 (年度) 2019-04-01 – 2022-03-31
研究課題ステータス 完了 (2021年度)
配分額 *注記
4,160千円 (直接経費: 3,200千円、間接経費: 960千円)
2021年度: 780千円 (直接経費: 600千円、間接経費: 180千円)
2020年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円)
2019年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円)
キーワードヘテロクロマチン / H3K9メチル化 / 高次クロマチン構造 / H3K9メチル化酵素 / クロマチン修飾 / H3K9me2
研究開始時の研究の概要

真核生物のゲノムはメガベース(Mb;10^6塩基)単位の高次クロマチン構造やヒストンH3の9番目のリジン残基のジメチル化(H3K9me2)のようなエピゲノム修飾によって規定されるクロマチン修飾ドメインを形成する。高次クロマチン構造とクロマチン修飾ドメインは、遺伝子発現制御に重要な役割を果たすことが知られているが、その形成機構や両者の相互関係はほとんど明らかではない。本研究では、H3K9me2ドメインの形成過程におけるクロマチン動態を調べ、H3K9me2ドメインの形成機構と、高次クロマチン構造の形成におけるH3K9me2ドメインの役割を明らかにしたい。

研究成果の概要

転写不活性なゲノム領域であるヘテロクロマチンは主にH3K9メチル化により修飾されており、その異常はがん、不妊、精神疾患など様々な病気との関連が報告されている。本研究ではH3K9メチル化の制御機構を調べるため、哺乳類に5種類あるH3K9メチル化酵素をそれぞれ欠損させたマウス胚性幹細胞におけるH3K9メチル化状態、遺伝子発現、核内高次構造を解析した。その結果、H3K9メチル化は核内の区画により異なるセットのH3K9メチル化酵素で制御されること、H3K9メチル化の欠乏はヘテロクロマチンの空間配置を変化させることがわかり、H3K9メチル化と核内高次構造は互いに制御し合うことが明らかとなった。

研究成果の学術的意義や社会的意義

転写不活性なゲノム領域であるヘテロクロマチンは主にH3K9メチル化により修飾されており、その異常はがん、不妊、精神疾患など様々な病気との関連が報告されている。本研究により、核内の空間配置によりH3K9メチル化が制御される機構が異なることがはじめて明らかになった。この研究成果はH3K9メチル化異常により生じる疾患の形成機序の理解につながると期待される。

報告書

(4件)
  • 2021 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2020 実施状況報告書
  • 2019 実施状況報告書
  • 研究成果

    (2件)

すべて 2021 2019

すべて 雑誌論文 (2件) (うち査読あり 2件、 オープンアクセス 2件)

  • [雑誌論文] Regulation of mammalian 3D genome organization and histone H3K9 dimethylation by H3K9 methyltransferases2021

    • 著者名/発表者名
      Fukuda Kei、Shimura Chikako、Miura Hisashi、Tanigawa Akie、Suzuki Takehiro、Dohmae Naoshi、Hiratani Ichiro、Shinkai Yoichi
    • 雑誌名

      Communications Biology

      巻: 4 号: 1 ページ: 571-571

    • DOI

      10.1038/s42003-021-02089-y

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書 2020 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Characterization of genetic‐origin‐dependent monoallelic expression in mouse embryonic stem cells2019

    • 著者名/発表者名
      Ohishi Hiroaki、Au Yeung Wan Kin、Unoki Motoko、Ichiyanagi Kenji、Fukuda Kei、Maenohara Shoji、Shirane Kenjiro、Chiba Hatsune、Sado Takashi、Sasaki Hiroyuki
    • 雑誌名

      Genes to Cells

      巻: 25 号: 1 ページ: 54-64

    • DOI

      10.1111/gtc.12736

    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス

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公開日: 2019-04-18   更新日: 2023-01-30  

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