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PDIファミリー酵素が触媒する新生鎖の酸化的フォールディング機構の解明

研究課題

研究課題/領域番号 19K16092
研究種目

若手研究

配分区分基金
審査区分 小区分43040:生物物理学関連
研究機関関西学院大学

研究代表者

金村 進吾  関西学院大学, 理学部, 助教 (50803178)

研究期間 (年度) 2019-04-01 – 2022-03-31
研究課題ステータス 完了 (2021年度)
配分額 *注記
4,290千円 (直接経費: 3,300千円、間接経費: 990千円)
2021年度: 910千円 (直接経費: 700千円、間接経費: 210千円)
2020年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円)
2019年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円)
キーワード小胞体 / ジスルフィド結合 / 酸化的フォールディング / 新生鎖 / PDIファミリー / 二次構造
研究開始時の研究の概要

全タンパク質の約3分の1は小胞体において、Protein Disulfide Isomerase (PDI)ファミリー酵素によるジスルフィド結合形成を伴った酸化的フォールディングを受け、天然型の立体構造を獲得し機能発現する。酸化的フォールディングの制御破綻は神経変性疾患などの原因として知られているが、新生鎖の酸化的フォールディングに関する知見は未だ乏しく、その研究が学術的、医学的にも急務となっている。そこで本研究では、「PDIファミリー酵素が触媒する新生鎖の酸化的フォールディング機構」に関する新たな概念の提唱を目指す。

研究成果の概要

タンパク質の機能発現に必須の酸化的フォールディングは、PDIファミリー酵素によって触媒される。本研究によって、タンパク質の二次構造がフォールディングにおける天然型のジスルフィド結合形成を促進させていることを明らかにした。さらに、PDIファミリー酵素ERp57, P5、PDI酸化酵素GPx7/8の構造機能相関を明らかにした。このように、PDIファミリー酵素が関与する小胞体内タンパク質品質管理ネットワークの一端を解明した。

研究成果の学術的意義や社会的意義

酸化的フォールディングの制御破綻は、アルツハイマー症、筋萎縮性側索硬化症をはじめとした神経変性疾患、糖尿病などの原因として知られている。本研究において、新生鎖の酸化的フォールディング機構及びPDIファミリー酵素による触媒機構を明らかにした。本研究成果は、タンパク質品質管理機構だけでなく神経変性疾患などの発症機構の解明にも繋がり、医学分野への貢献も大いに期待できる。

報告書

(4件)
  • 2021 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2020 実施状況報告書
  • 2019 実施状況報告書
  • 研究成果

    (30件)

すべて 2022 2021 2020 2019 その他

すべて 国際共同研究 (5件) 雑誌論文 (9件) (うち国際共著 6件、 査読あり 8件、 オープンアクセス 8件) 学会発表 (14件) (うち国際学会 1件、 招待講演 1件) 産業財産権 (2件) (うち外国 1件)

  • [国際共同研究] University of Glasgow(英国)

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [国際共同研究] Korea Basic Science Institute(韓国)

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [国際共同研究] University of Glasgow(英国)

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
  • [国際共同研究] Korea Basic Science Institute(韓国)

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
  • [国際共同研究] University of Glasgow(英国)

    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
  • [雑誌論文] Functional Interplay between P5 and PDI/ERp72 to Drive Protein Folding.2021

    • 著者名/発表者名
      Matsusaki M, Okada R, Tanikawa Y, Kanemura S, Ito D, Lin Y, Watabe M, Yamaguchi H, Saio T, Lee YH, Inaba K, and *Okumura M.
    • 雑誌名

      Biology

      巻: 10 号: 11 ページ: 1112-1112

    • DOI

      10.3390/biology10111112

    • NAID

      120007168792

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Ca2+ Regulates ERp57-Calnexin Complex Formation.2021

    • 著者名/発表者名
      Tanikawa Y,# Kanemura S,# Ito D, Lin Y, Matsusaki M, Kuroki K, Yamaguchi H, Maenaka K, Lee YH, Inaba K, and *Okumura M.
    • 雑誌名

      Molecules

      巻: 26 号: 10 ページ: 2853-2853

    • DOI

      10.3390/molecules26102853

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] A unique leucine-valine adhesive motif supports structure and function of protein disulfide isomerase P5 via dimerization2021

    • 著者名/発表者名
      Okumura M, Kanemura S., Matsusaki M., Kinoshita M., Saio T., Ito D., Hirayama C., Kumeta H., Watabe M., Amagai Y., Lee Y. H., Akiyama S. and Inaba K.
    • 雑誌名

      Structure

      巻: 29 号: 12 ページ: 1-14

    • DOI

      10.1016/j.str.2021.03.016

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Antipsychotic olanzapine-induced misfolding of proinsulin in the endoplasmic reticulum accounts for atypical development of diabetes2020

    • 著者名/発表者名
      Ninagawa Satoshi、Tada Seiichiro、Okumura Masaki、Inoguchi Kenta、Kinoshita Misaki、Kanemura Shingo、Imami Koshi、Umezawa Hajime、Ishikawa Tokiro、Mackin Robert B、Torii Seiji、Ishihama Yasushi、Inaba Kenji、Anazawa Takayuki、Nagamine Takahiko、Mori Kazutoshi
    • 雑誌名

      eLife

      巻: 9 ページ: 23-31

    • DOI

      10.7554/elife.60970

    • NAID

      120006898101

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Characterization of the endoplasmic reticulum-resident peroxidases GPx7 and GPx8 shows the higher oxidative activity of GPx7 and its linkage to oxidative protein folding2020

    • 著者名/発表者名
      Kanemura S., Sofia E. F., Hirai N., Okumura M., Kadokura H. and Inaba K.
    • 雑誌名

      J. Biol. Chem.

      巻: 295 号: 36 ページ: 12772-12785

    • DOI

      10.1074/jbc.ra120.013607

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] PDI Family Members as Guides for Client Folding and Assembly2020

    • 著者名/発表者名
      Kanemura S., Matsusaki M., Inaba K. and Okumura M.
    • 雑誌名

      Int. J. Mol. Sci.

      巻: 21 号: 24 ページ: 9351-9351

    • DOI

      10.3390/ijms21249351

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] 小胞体内におけるMHCの品質管理2020

    • 著者名/発表者名
      金村進吾、松崎元紀、前仲勝実、稲葉謙次、奥村正樹
    • 雑誌名

      臨床免疫・アレルギー科

      巻: 74 ページ: 419-426

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
  • [雑誌論文] Protein secondary structure determines the temporal relationship between folding and disulfide formation2020

    • 著者名/発表者名
      Robinson Philip J.、Kanemura Shingo、Cao Xiaofei、Bulleid Neil J.
    • 雑誌名

      Journal of Biological Chemistry

      巻: 295 号: 8 ページ: 2438-2448

    • DOI

      10.1074/jbc.ra119.011983

    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Protein Disulfide Isomerase family: from Proteostasis to Pathogenesis2019

    • 著者名/発表者名
      Matsusaki M.#, Kanemura S.#, Kinoshita M.#, Lee Y.H., Inaba K.*, and Okumura M.* (#equal contribution *corresponding authors)
    • 雑誌名

      Biochim Biophys Acta-general subjects

      巻: in press 号: 2 ページ: 30080-30087

    • DOI

      10.1016/j.bbagen.2019.04.003

    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [学会発表] 小胞体ストレスセンサーの会合状態分布を介した応答制御機構の研究2022

    • 著者名/発表者名
      松崎元紀、横山武司、次田篤史、金村進吾、田尻道子、明石知子、齋尾智英、稲葉謙次、奥村正樹
    • 学会等名
      日本農芸化学会2022年度大会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] Ca2+によるERp57-CNX複合体の構造機能調節メカニズムの解明2021

    • 著者名/発表者名
      金村進吾、谷川雄哉、伊藤大、林雨曦、松崎元紀、黒木喜美子、山口宏、前仲勝実、李映昊、稲葉謙次、奥村正樹
    • 学会等名
      第44回 日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] PDIファミリー酵素による前駆体タンパク質の酸化的フォールディング触媒機構の解明2021

    • 著者名/発表者名
      新納翔悟、金村進吾、山口宏、日高雄二、稲葉謙次、奥村正樹
    • 学会等名
      第44回 日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] インスリン分解酵素による基質分解メカニズムの解明2021

    • 著者名/発表者名
      古川蘭、金村進吾、山口宏、李映昊、奥村正樹
    • 学会等名
      第44回 日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] プロインスリンのフォールディング中間体の理解2021

    • 著者名/発表者名
      関凪沙、金村進吾、荒井堅太、山口宏、稲葉謙次、奥村正樹
    • 学会等名
      第44回 日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] 酸化還元制御によるヒトガレクチン1の構造機能調節の理解2021

    • 著者名/発表者名
      岡田莉奈、金村進吾、黒井邦巧、松崎元紀、齋尾智英、山口宏、伊藤大、李映昊、中林孝和、稲葉謙次、奥村正樹
    • 学会等名
      第44回 日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] Elucidating the in vivo oxidative folding mechanism2021

    • 著者名/発表者名
      金村進吾、奥村正樹、稲葉謙次
    • 学会等名
      第21回 日本蛋白質科学会年会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] Structural basis for redox-regulated galectin1 function2021

    • 著者名/発表者名
      岡田莉奈、金村進吾、黒井邦巧、松崎元紀、山口宏、中林孝和、稲葉謙次、奥村正樹
    • 学会等名
      第21回 日本蛋白質科学会年会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] Elucidating the degradation mechanism of substrates by IDE2021

    • 著者名/発表者名
      古川蘭、金村進吾、山口宏、Lee Young-Ho、奥村正樹
    • 学会等名
      第21回 日本蛋白質科学会年会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] Understanding the folding pathways of proinsulin2021

    • 著者名/発表者名
      関凪沙、金村進吾、荒井堅太、山口宏、Lee Young-Ho、稲葉謙次、奥村正樹
    • 学会等名
      第21回 日本蛋白質科学会年会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] Impact of Ca2+ on the function interplay between ERp57 and Calnexin2021

    • 著者名/発表者名
      谷川雄哉、金村進吾、伊藤大、Lin Yuxi、松崎元紀、山口宏、黒木喜美子、前仲勝実、Lee Young-Ho、稲葉謙次、奥村正樹
    • 学会等名
      第21回 日本蛋白質科学会年会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] Biochemical characterizations of ER-resident peroxidases, GPx7 and GPx8, reveal their distinct oxidative activities2020

    • 著者名/発表者名
      Kanemura S., Sofia E. F., Hirai N., Okumura M., Kadokura H. and Inaba K.
    • 学会等名
      第20回日本蛋白質科学会年会
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
  • [学会発表] 小胞体内における新生鎖のジスルフィド結合形成機構の解明2019

    • 著者名/発表者名
      金村進吾、奥村正樹、Neil Bulleid、稲葉謙次
    • 学会等名
      第19回日本蛋白質科学会年会
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
  • [学会発表] Mechanisms of disulfide bond formation of newly synthesized polypeptide chains in the endoplasmic reticulum2019

    • 著者名/発表者名
      Kanemura S., Okumura M., Robinson P. J., Bulleid N. J. and Inaba K.
    • 学会等名
      International Symposium on Disordered Proteins, Protein Folding, and Disease-causing Aggregation
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [産業財産権] 液滴及びその製造方法2021

    • 発明者名
      奥村正樹、松﨑元紀、金村進吾、齋尾智英、稲葉謙次
    • 権利者名
      学校法人関西学院
    • 産業財産権種類
      特許
    • 出願年月日
      2021
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 外国
  • [産業財産権] 液滴及びその製造方法2020

    • 発明者名
      奥村正樹、松﨑元紀、金村進吾、齋尾智英、稲葉謙次
    • 権利者名
      学校法人関西学院
    • 産業財産権種類
      特許
    • 出願年月日
      2020
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書

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公開日: 2019-04-18   更新日: 2023-01-30  

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