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植物におけるリボソームによるショ糖感知とC/N比の代謝統御機構の解明

研究課題

研究課題/領域番号 19K16159
研究種目

若手研究

配分区分基金
審査区分 小区分44030:植物分子および生理科学関連
研究機関北海道大学

研究代表者

山下 由衣  北海道大学, 農学研究院, 助教 (40803383)

研究期間 (年度) 2019-04-01 – 2021-03-31
研究課題ステータス 完了 (2020年度)
配分額 *注記
4,290千円 (直接経費: 3,300千円、間接経費: 990千円)
2020年度: 1,950千円 (直接経費: 1,500千円、間接経費: 450千円)
2019年度: 2,340千円 (直接経費: 1,800千円、間接経費: 540千円)
キーワードショ糖 / 上流ORF / 転写後遺伝子発現制御 / リボソーム / 翻訳制御 / 代謝制御 / uORF / 転写因子 / 翻訳 / 翻訳停滞 / C/N比
研究開始時の研究の概要

シロイヌナズナのS1グループbZIP転写因子ファミリー(S1-bZIP) mRNAのuORFは,リボソームの停滞を介してショ糖センサーとして働く。S1-bZIPは細胞内のショ糖濃度に応答して,アミノ酸代謝を調節する機能を持つ。光合成産物であるショ糖は植物にとって最も重要な炭素源であり,加えて炭素と窒素のバランスは 植物の成長や組織分化の統御で重要な役割をもつ。本研究は,S1-bZIP mRNAのuORFを翻訳中のリボソームが如何にしてショ糖センサーとして機能するのか,さらにはその炭素・窒素代謝統御の生理学的意義を明らかにするものである。

研究成果の概要

上流ORF(uORF)は真核生物の約半数のmRNAの5’非翻訳領域に存在する遺伝子発現の制御ユニットである。シロイヌナズナのS1-bZIP ファミリー遺伝子がコードするmRNAは,共通のショ糖感知ユニットとして,ショ糖に応答して翻訳停滞を起こすuORF2をもつ。本研究では,遺伝子間で共通するショ糖感知ユニットとしてのuORF2の機能の横断的解析を実施した。ショ糖のみならず,窒素栄養にも着目し,ショ糖センサーとしての共通の性質と,その転写後制御の多様な分子機構の関与が明らかになった。

研究成果の学術的意義や社会的意義

光合成産物として,そして植物細胞内での糖の輸送態としてのショ糖は,多くの植物生理学的応答に関与する重要な分子である。本研究によって,ショ糖感知の制御ユニットとしての上流ORFの機能の解明を通じて,遺伝子間でショ糖感知のアウトプットが異なることが示された。uORFによる転写後遺伝子発現制御の分子機構の解明に資するものである。また,ショ糖感知による遺伝子発現制御の多様性から,ショ糖の多様な生理学的意義の解明にもつながるものである。

報告書

(3件)
  • 2020 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2019 実施状況報告書
  • 研究成果

    (7件)

すべて 2021 2020 2019

すべて 雑誌論文 (1件) (うち査読あり 1件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (6件) (うち国際学会 2件)

  • [雑誌論文] Reverse genetics-based biochemical studies of the ribosomal exit tunnel constriction region in eukaryotic ribosome stalling: spatial allocation of the regulatory nascent peptide at the constriction.2020

    • 著者名/発表者名
      Seidai Takamatsu, Yubun Ohashi, Noriyuki Onoue, Yoko Tajima, Tomoya Imamichi, Shinya Yonezawa, Kyoko Morimoto, Hitoshi Onouchi, Yui Yamashita, Satoshi Naito
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Res.

      巻: 48 号: 4 ページ: 1985-1999

    • DOI

      10.1093/nar/gkz1190

    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] シロイヌナズナにおけるショ糖濃度に応答した翻訳停滞とmRNA分解2021

    • 著者名/発表者名
      Shugo Sugawara, Tomoya Imamichi, Yugo Honda, Hitoshi Onouchi, Satoshi Naito and Yui Yamashita
    • 学会等名
      第62回日本植物生理学会年会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] シロイヌナズナにおけるショ糖濃度に応答した翻訳停滞とmRNA分解の解析2020

    • 著者名/発表者名
      Shugo Sugawara, Tomoya Imamichi, Yugo Honda, Hitoshi Onouchi, Satoshi Naito and Yui Yamashita
    • 学会等名
      第43回日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] シロイヌナズナS1グループbZIP遺伝子のショ糖に応答した転写後発現制御2020

    • 著者名/発表者名
      菅原 収吾,尾之内 均,内藤 哲,山下 由衣
    • 学会等名
      第61回日本植物生理学会年会
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
  • [学会発表] Nascent peptide-mediated ribosome stalling in eukaryotes: What we see from pulse-chase experiments2020

    • 著者名/発表者名
      Tomoya Imamichi, Shugo Sugawara, Seidai Takamatsu, Hitoshi Onouchi, Yui, Yamashita and Satoshi Naito
    • 学会等名
      第61回日本植物生理学会年会
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
  • [学会発表] Reverse genetics-based biochemical strudies of the ribosomal exit tunnel constriction region on eukaryotic programed ribosome stalling systems2019

    • 著者名/発表者名
      Seidai Takamatsu, Yubun Ohashi, Noriyuki Onoue, Yoko Tajima, Tomoya Imamichi, Kyoko Morimoto, Shinya Yonezawa, Hitoshi Onouchi, Yui Yamashita, and Satoshi Naito
    • 学会等名
      EMBO Conference: Protein Synthesis and Translational Control
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] In vivo status of S-adenosyl-L-methionine-induced translation arrest on Arabidopsis CGS1 mRNA2019

    • 著者名/発表者名
      Miku Fujita, Seidai Takamatsu, Tomoya Imamichi, Yukako Chiba, Satoshi Naito and Yui Yamashita
    • 学会等名
      EMBO Conference: Protein Synthesis and Translational Control
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
    • 国際学会

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公開日: 2019-04-18   更新日: 2022-01-27  

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