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バリノマイシンのカリウムイオン選択性の水和効果の解明

研究課題

研究課題/領域番号 19K23624
研究種目

研究活動スタート支援

配分区分基金
審査区分 0501:物理化学、機能物性化学、有機化学、高分子、有機材料、生体分子化学およびその関連分野
研究機関東京工業大学

研究代表者

平田 圭祐  東京工業大学, 理学院, 助教 (80845777)

研究期間 (年度) 2019-08-30 – 2022-03-31
研究課題ステータス 完了 (2021年度)
配分額 *注記
2,860千円 (直接経費: 2,200千円、間接経費: 660千円)
2020年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
2019年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
キーワードイオン選択性 / バリノマイシン / 赤外分光法 / 冷却イオントラップ分光法 / 気相分光法 / 水和効果 / 赤外分光 / エレクトロスプレーイオン化 / 質量分析
研究開始時の研究の概要

親水-疎水界面でカリウムイオンのみを選択的に内包する生体分子であるバリノマイシンのK選択性の起源を水和効果の観点から明らかにする。溶液中での分光測定では困難であった親水-疎水界面のモデル化を実現するため、バリノマイシン-金属イオンの錯合体を気相(疎水環境)中に取り出し水分子を段階的に付加する。赤外分光法を用いて錯合体の水和構造を決定し、K選択性の原理に水和の微視的な構造論から迫る。

研究成果の概要

本研究では、バリノマイシンのカリウムイオン選択性の起源を明らかにするために、バリノマイシンー金属錯体とその水和クラスターの構造を気相赤外分光法により調べた。その結果、親和性が高いカリウムとの錯体では対称性の高いコンフォメーションが水和されても維持されるのに対して、親和性の低いナトリウムでは水分子が一つ付加しただけで対称性が崩れ構造が歪むことがわかった。このことから、バリノマイシンのみならず、他のイオン選択性を示す他の分子においても水和効果が重要な因子であることを強く示唆している。

研究成果の学術的意義や社会的意義

本研究では,水和効果が分子のイオン選択性に大きな影響を及ぼしていることが示された。これは気相環境下で分子の組成・水分子の個数を精密に規定したことにより初めて示されたものであり、気相赤外分光法の威力を物語っている。精密な分光測定に裏打ちされたイオン選択性の構造論を展開した本研究は、イオン選択性を示す多様な分子の原理を解明するだけでなく、イオン選択性分子の創出にも寄与するものと考えられ、イオン分離や創薬にも展開されることが期待される。

報告書

(4件)
  • 2021 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2020 実施状況報告書
  • 2019 実施状況報告書
  • 研究成果

    (16件)

すべて 2022 2021 2020 その他

すべて 国際共同研究 (3件) 雑誌論文 (9件) (うち国際共著 9件、 査読あり 9件、 オープンアクセス 2件) 学会発表 (4件) (うち国際学会 2件)

  • [国際共同研究] イリノイ大/パシフィックノースウェスト国立研究所(米国)

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [国際共同研究] パリ大学(フランス)

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [国際共同研究] ベルリン工科大学(ドイツ)

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [雑誌論文] Collision-assisted stripping for determination of microsolvation-dependent protonation sites in hydrated clusters by cryogenic ion trap infrared spectroscopy: the case of benzocaineH<sup>+</sup>(H<sub>2</sub>O)<sub><i>n</i></sub>2022

    • 著者名/発表者名
      Hirata Keisuke、Haddad Fuad、Dopfer Otto、Ishiuchi Shun-ichi、Fujii Masaaki
    • 雑誌名

      Physical Chemistry Chemical Physics

      巻: 24 号: 10 ページ: 5774-5779

    • DOI

      10.1039/d1cp05762f

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Gas phase protonated nicotine is a mixture of pyridine- and pyrrolidine-protonated conformers: implications for its native structure in the nicotinic acetylcholine receptor2022

    • 著者名/発表者名
      Takeda Naoya、Hirata Keisuke、Tsuruta Kazuya、Santis Garrett D.、Xantheas Sotiris S.、Ishiuchi Shun-ichi、Fujii Masaaki
    • 雑誌名

      Physical Chemistry Chemical Physics

      巻: 24 号: 10 ページ: 5786-5793

    • DOI

      10.1039/d1cp05175j

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Hydration-controlled excited-state relaxation in protonated dopamine studied by cryogenic ion spectroscopy2021

    • 著者名/発表者名
      Hirata Keisuke、Kasai Ken-ichi、Gregoire Gilles、Ishiuchi Shun-ichi、Fujii Masaaki
    • 雑誌名

      The Journal of Chemical Physics

      巻: 155 号: 15 ページ: 151101-151101

    • DOI

      10.1063/5.0066919

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Double Ion Trap Laser Spectroscopy of Alkali Metal Ion Complexes with a Partial Peptide of the Selectivity Filter in K<sup>+</sup> Channels─Temperature Effect and Barrier for Conformational Conversions2021

    • 著者名/発表者名
      Suzuki Yukina、Hirata Keisuke、Lisy James M.、Ishiuchi Shun-ichi、Fujii Masaaki
    • 雑誌名

      The Journal of Physical Chemistry A

      巻: 125 号: 44 ページ: 9609-9618

    • DOI

      10.1021/acs.jpca.1c06440

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Potassium and sodium ion complexes with a partial peptide of the selectivity filter in K+ channels studied by cold ion trap infrared spectroscopy: the effect of hydration2021

    • 著者名/発表者名
      Negoro Takumi、Hirata Keisuke、Lisy James M.、Ishiuchi Shun-ichi、Fujii Masaaki
    • 雑誌名

      Physical Chemistry Chemical Physics

      巻: - 号: 21 ページ: 12045-12050

    • DOI

      10.1039/d1cp00936b

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Rethinking Ion Transport by Ionophores: Experimental and Computational Investigation of Single Water Hydration in Valinomycin-K+ Complexes2021

    • 著者名/発表者名
      Sato Eiko、Hirata Keisuke、Lisy James M.、Ishiuchi Shun-ichi、Fujii Masaaki
    • 雑誌名

      The Journal of Physical Chemistry Letters

      巻: 12 号: 6 ページ: 1754-1758

    • DOI

      10.1021/acs.jpclett.0c03372

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Chiral discrimination between tyrosine and β-cyclodextrin revealed by cryogenic ion trap infrared spectroscopy2020

    • 著者名/発表者名
      Hirata Keisuke、Mori Yuta、Ishiuchi Shun-ichi、Fujii Masaaki、Zehnacker Anne
    • 雑誌名

      Physical Chemistry Chemical Physics

      巻: 22 号: 43 ページ: 24887-24894

    • DOI

      10.1039/d0cp02968h

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Alkali and Alkaline Earth Metal Ions Complexes with a Partial Peptide of the Selectivity Filter in K+ Channels Studied by a Cold Ion Trap Infrared Spectroscopy2020

    • 著者名/発表者名
      Otsuka Remina, Hirata Keisuke, Yuta Sasaki, Lisy James M., Ishiuchi Shun-ichi, Fujii Masaaki
    • 雑誌名

      Chemphyschem

      巻: 21 号: 8 ページ: 712-724

    • DOI

      10.1002/cphc.202000033

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Excited-state proton transfer in protonated adrenaline revealed by cryogenic UV photodissociation spectroscopy2020

    • 著者名/発表者名
      Dezalay Jordan、Broquier Michel、Soorkia Satchin、Hirata Keisuke、Ishiuchi Shun-ichi、Fujii Masaaki、Gregoire Gilles
    • 雑誌名

      Physical Chemistry Chemical Physics

      巻: 22 号: 20 ページ: 11498-11507

    • DOI

      10.1039/d0cp01127d

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [学会発表] Vibrational spectroscopy of hydrated clusters of valinomycin-metal complexes: Watching single water hydration2021

    • 著者名/発表者名
      Keisuke Hirata, Eiko Sato, Shun-ichi Ishiuchi, Masaaki Fujii
    • 学会等名
      Pacifichem 2021
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Cold ion trap infrared spectroscopy of Beauvericin metal complexes - Ionic radius dependence of conformations2021

    • 著者名/発表者名
      Kien Vo, Keisuke Hirata, James M. Lisy, Shun-ichi Ishiuchi, Masaaki Fujii
    • 学会等名
      第15回分子科学討論会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] Cryogenic Ion Spectroscopy of Valinomycin-Metal Complexes: Effect of Water on Potassium Selectivity2020

    • 著者名/発表者名
      Keisuke Hirata
    • 学会等名
      Gordon Research Conferences: Molecular and Ionic Clusters 2020
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 冷却イオントラップ法によるバリノマイシンーアルカリ金属イオン水和クラスターの赤外分光2020

    • 著者名/発表者名
      佐藤映虹
    • 学会等名
      第13回分子科学討論会
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書

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公開日: 2019-09-03   更新日: 2023-01-30  

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