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植物Pol VのゲノムワイドなノンコーディングRNA転写メカニズムの解明

研究課題

研究課題/領域番号 19K23715
研究種目

研究活動スタート支援

配分区分基金
審査区分 0701:分子レベルから細胞レベルの生物学およびその関連分野
研究機関東京大学

研究代表者

都筑 正行  東京大学, 大学院総合文化研究科, 助教 (40845616)

研究期間 (年度) 2019-08-30 – 2021-03-31
研究課題ステータス 完了 (2020年度)
配分額 *注記
2,860千円 (直接経費: 2,200千円、間接経費: 660千円)
2020年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
2019年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
キーワード転写サイレンシング / DNAメチル化 / クロマチン / RNAポリメラーゼ / RNAサイレンシング / 転写 / 植物 / 転写制御
研究開始時の研究の概要

植物に特異的なRNAポリメラーゼV(Pol V)のゲノム領域に応じた転写の変化に着目し、ゲノムの安定性を高めるためのノンコーディングRNAの転写メカニズムとその機能を解析する。申請者がこれまでに行なった解析から、従来の標的領域以外に、ゲノムワイドな微量の転写が起きていることが示唆された。そこで本研究では、これまで研究されてきたDNAメチル化を維持するための転写と、ゲノムワイドな微量な転写の違いを決定づける因子を同定し、ゲノムワイドな転写のメカニズムと機能を明らかにする。

研究成果の概要

トランスポゾン等の抑制にはたらく植物特異的なRNAポリメラーゼV(Pol V)のゲノムワイドな転写のメカニズムと役割を明らかにすべく研究を行った。転写物の網羅的同定およびゲノミクス解析からゲノムワイドな転写はDNAメチル化や小分子RNAの蓄積を伴わなかった。またDNAメチル化変異体におけるPol Vの転写動態から、Pol Vの転写とDNAメチル化の間に正のフィードバックが存在することを示唆された。これらの結果は、Pol Vのゲノムワイドな転写は通常抑制される領域からの転写が起きた際に備えてあらかじめ起きていること、新規DNAメチル化が小分子RNAの蓄積依存的に起きることを示唆するものである。

研究成果の学術的意義や社会的意義

本研究は、植物の新規DNAメチル化機構についての大きな疑問点の1つである開始時のメカニズムについての新たな知見をもたらすものであり、当該分野において学術的に新規性の高い内容であると考える。また近年の網羅的なゲノミクス解析により、トランスポゾンの転移やDNAメチル化の多型が農作物の形質に影響を与えている例が数多く報告されていることから、DNAメチル化機構の解明は社会的にも重要性を備える。本研究ではこのDNAメチル化機構の解明の一端を成しており、農作物の品種改良等の応用面に向けた研究としても重要な成果を得たと考えている。

報告書

(3件)
  • 2020 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2019 実施状況報告書
  • 研究成果

    (14件)

すべて 2021 2020 2019 その他

すべて 国際共同研究 (2件) 雑誌論文 (2件) (うち国際共著 2件、 査読あり 2件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (7件) (うち招待講演 1件) 図書 (1件) 備考 (2件)

  • [国際共同研究] University of Michigan(米国)

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [国際共同研究] University of Michigan(米国)

    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
  • [雑誌論文] Broad noncoding transcription suggests genome surveillance by RNA polymerase V2020

    • 著者名/発表者名
      Tsuzuki Masayuki、Sethuraman Shriya、Coke Adriana N.、Rothi M. Hafiz、Boyle Alan P.、Wierzbicki Andrzej T.
    • 雑誌名

      Proceedings of the National Academy of Sciences

      巻: 117 号: 48 ページ: 30799-30804

    • DOI

      10.1073/pnas.2014419117

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] An Early Arising Role of the MicroRNA156/529-SPL Module in Reproductive Development Revealed by the Liverwort Marchantia polymorpha2019

    • 著者名/発表者名
      Tsuzuki Masayuki、Futagami Kazutaka、Shimamura Masaki、Inoue Chikako、Kunimoto Kan、Oogami Takashi、Tomita Yuki、Inoue Keisuke、Kohchi Takayuki、Yamaoka Shohei、Araki Takashi、Hamada Takahiro、Watanabe Yuichiro
    • 雑誌名

      Current Biology

      巻: 29 号: 19 ページ: 3307-3314

    • DOI

      10.1016/j.cub.2019.07.084

    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [学会発表] RNAポリメラーゼVによる広範囲のノンコーディング転写が示唆するゲノム安定性維持のメカニズム2021

    • 著者名/発表者名
      都筑正行
    • 学会等名
      第62回日本植物生理学会年会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] ゼニゴケにおけるRNA ポリメラーゼIV、Vの機能解析2021

    • 著者名/発表者名
      池田ひかり, 都筑正行, 渡邊雄一郎
    • 学会等名
      第62回日本植物生理学会年会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] RNAポリメラーゼVによるゲノムワイドなノンコーディングRNAの転写2020

    • 著者名/発表者名
      都筑 正行, Shriya Sethuraman, Andrzej T. Wierzbicki
    • 学会等名
      日本植物学会第84回大会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] RNAポリメラーゼVによる広範囲のノンコーディングRNA転写が示唆するゲノム安定性維持のメカニズム2020

    • 著者名/発表者名
      都筑 正行, Shriya Sethuraman, Adriana N. Coke, M. Hafiz Rothi, Alan P. Boyle, Andrzej T. Wierzbicki
    • 学会等名
      第9回植物RNA研究者ネットワークシンポジウム
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] RNA ポリメラーゼ V によるゲノムワイドなノンコーディング RNA の転写2020

    • 著者名/発表者名
      都筑正行, Shriya Sethuraman, Andrzej T. Wierzbicki
    • 学会等名
      第61回日本植物生理学会年会
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
  • [学会発表] ゼニゴケにおける RNA ポリメラーゼIV、Vの機能解析2020

    • 著者名/発表者名
      池田ひかり, 都筑正行, Mario Arteaga-Vazquez, 渡邊雄一郎
    • 学会等名
      第61回日本植物生理学会年会
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
  • [学会発表] RNAポリメラーゼVによるゲノムワイドなノンコーディングRNAの転写2019

    • 著者名/発表者名
      都筑正行, Shriya Sethuraman, Andrzej T. Wierzbicki
    • 学会等名
      第8回植物RNA研究ネットワークシンポジウム
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
  • [図書] 実験医学2020年6月号 News & Hot Paper Digest 離れた調節因子は植物に広く保存されている2020

    • 著者名/発表者名
      都筑正行
    • 総ページ数
      147
    • 出版者
      羊土社
    • ISBN
      9784758125321
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [備考] Researchmap

    • URL

      https://researchmap.jp/m_tsuzuki

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [備考] 渡邊雄一郎研究室ホームページ個人ページ

    • URL

      http://park.itc.u-tokyo.ac.jp/RNAwatanabe/profile_3.html

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書

URL: 

公開日: 2019-09-03   更新日: 2022-01-27  

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