定量的リン酸化プロテオミクスによるシグナル伝達ネットワークの解析

• 研究課題/領域番号: 20710168
• 研究種目: 若手研究(B)
• 配分区分: 補助金
• 研究分野: 生物分子科学
• 研究機関: 九州大学
• 研究代表者: 松本 雅記 九州大学, 生体防御医学研究所, 准教授 (60380531)
• 研究期間 (年度): 2008 – 2009
• 研究課題ステータス: 完了 (2009年度)
• 配分額: 4,420千円 (直接経費: 3,400千円、間接経費: 1,020千円); 2009年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円); 2008年度: 2,730千円 (直接経費: 2,100千円、間接経費: 630千円)
• キーワード: シグナル伝達 / システム生物学 / リン酸化 / プロテオミクス / ネットワーク解析 / システム岸物学

研究概要

細胞は外的刺激に対して、様々な応答を示すことが知られているが、その特異性を決定する機構は未だ不明な点が多い。このようなシグナル伝達の本質的な問題を解くために,申請者は細胞内シグナル伝達の担い手であるタンパク質リン酸化の網羅的同定・定量法の開発を行い、数千ヶ所のリン酸化部位の同定・定量を可能とするシステムを構築した。本システムを用いて、様々な細胞株等を用いて各種刺激下でのリン酸化情報を取得し、のべ2,5000カ所以上のリン酸化部位に関する時間依存的な変動情報取得に成功した。

研究成果

• [雑誌論文] Fbxo45, a novel ubiquitin ligase, regulates synaptic activity. (2010)
  • 著者名/発表者名: Tada, H., Okano, H.J., Takagi, H., Shibata, S., Yao, I., Matsumoto, M., Saiga, T., Nakayama, K. I,. Kashima, H., Takahashi, T., Setou, M., Okano, H
  • 雑誌名: J. Biol. Chem. 285(6) ページ: 3840-3849
• [雑誌論文] Plasma gelsolin facilitates interaction between beta(2) glycoprotein I and alpha5beta1 integrin. (2009)
  • 著者名/発表者名: Bohgak, M., Matsumoto, M., Atsumi, T, Kondo, T., Yasuda, S., Horita, T., Nakayama, K.I., Okumura, F., Hatakeyama, S., Koike, T.
  • 雑誌名: J Cell Mol Med. (in press)
• [雑誌論文] Large-scale proteomic analysis of tyrosine phosphorylation induced by TCR or BCR activation reveals new signaling pathways. (2009)
  • 著者名/発表者名: Matsumoto, M., Oyamada, K., Takahashi, H., Sato, T., Hatakeyama, S., Nakayama, K. I
  • 雑誌名: Proteomics 9 ページ: 3549-3563
• [雑誌論文] Fbxo45 forms a novel ubiquitin ligase complex and is required for neuronal development Mol. (2009)
  • 著者名/発表者名: Saiga, T., Fukuda, T., Matsumoto, M., Tada, H., Okano, H.J., Okano, H., Nakayama KI
  • 雑誌名: Cell. Biol. 29 ページ: 3529-3543
• [雑誌論文] Nucleolar structure and function are regulated by the deubiquitylating enzyme USP36. (2009)
  • 著者名/発表者名: Endo, A., Matsumoto, M., Inada, T., Yamamoto, A., Nakayama, K.I., Kitamura, N., Komada, M.
  • 雑誌名: J. Cell Sci 122 ページ: 678-686
• [雑誌論文] Large-scale proteomic analysis of tyrosine phosphorylation induced by TCR or BCR activation reveals new signaling pathways. (2009)
  • 著者名/発表者名: Matsumoto, M., Oyamada, K., Takahashi, H., Sato, T., Hatakeyama, S., Nakayama, K.I.
  • 雑誌名: Proteomics 9 ページ: 3549-3563
  • 査読あり
• [雑誌論文] Fbxo45 forms a novel ubiquitin ligase complex and is required for neuronal development (2009)
  • 著者名/発表者名: Saiga, T., Fukuda, T., Matsumoto, M., Tada, H., Okano, H.J., Okano, H., Nakayama KI.
  • 雑誌名: Mol.Cell.Biol. 29 ページ: 3529-3543
  • 査読あり
• [雑誌論文] Nucleolar structure and function are regulated by the deubiquitylating enzyme USP36. (2009)
  • 著者名/発表者名: Endo, A., Matsumoto, M., Inada, T., Yamamoto, A., Nakayama, K.I., Kitamura, N., Komada, M.
  • 雑誌名: J.Cell Sci. 122 ページ: 678-686
  • 査読あり
• [雑誌論文] Large-scale proteomic analysis of tyrosine phosphorylation induced by TCR or BCR activation reveals new signaling pathways (2009)
  • 著者名/発表者名: Matsumoto, M, Oyamada, K., To kahashi, H., Sato, T., Hatakeya ma, S., Nakayama KI.
  • 雑誌名: Proteomics (In press)
  • 査読あり
• [雑誌論文] Nucleolar structure and function are regulated by the deubiquitylating enzyme USP36 (2009)
  • 著者名/発表者名: Endo A, Matsumoto M, Inada T, Yamamoto A, Nakayama KI, Kitamura N, Komada M.
  • 雑誌名: J Cell Sci 122 ページ: 678-686
  • 査読あり
• [学会発表] 定量リン酸化プロテオミクスによるシグナル伝達の包括的解析 (2009)
  • 著者名/発表者名: 松本雅記、小山田浩二、中山敬一
  • 学会等名: 第82回日本生化学会大会
  • 発表場所: 神戸
  • 年月日: 2009-10-23
• [学会発表] 定量リン酸化プロテオミクスによるシグナル伝達の包括的解析 (2009)
  • 著者名/発表者名: 松本雅記
  • 学会等名: 蛋白質化学会年会
  • 発表場所: 熊本
  • 年月日: 2009-05-21
• [学会発表] A GLOBAL MAP OF MITOTIC PHOSPHOPROTEOME UNCOVERS U NEXPECTED SIGNALING PATHWAYS IN MITOSIS (2008)
  • 著者名/発表者名: Masaki Matsumoto, Koji Oyamada, Keiichi I. Nakayama
  • 学会等名: Cold spring harbor meeting, The Cell Cycle
  • 発表場所: New York, USA
  • 年月日: 2008-05-15
• [備考]
  • URL: http://www.bioreg.kyushu-u.ac.jp/saibou/index.html
• [備考]
  • URL: http://www.bioreg.kyushu-u.ac.jp/saibou/index.html
• [備考]
  • URL: http://www.bioreg.kyushu-u.ac.jp/saibou/imdex.htm1