| 研究課題/領域番号 |
20770120
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| 研究種目 |
若手研究(B)
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| 配分区分 | 補助金 |
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| 研究分野 |
生物物理学
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| 研究機関 | 名古屋大学 |
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研究代表者 |
千見寺 浄慈 名古屋大学, 大学院・工学研究科, 助教 (10420366)
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| 研究期間 (年度) |
2008 – 2009
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| 研究課題ステータス |
完了 (2009年度)
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| 配分額 *注記 |
4,420千円 (直接経費: 3,400千円、間接経費: 1,020千円)
2009年度: 780千円 (直接経費: 600千円、間接経費: 180千円)
2008年度: 3,640千円 (直接経費: 2,800千円、間接経費: 840千円)
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| キーワード | タンパク質 / 立体構造予測 / フラグメントアセンブリ法 / 水素結合 / フォールディング / アロステリック |
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| 研究概要 |
タンパク質の立体構造構築原理を理解するために、また、構造予測の精度向上のために、タンパク質の局所構造に着目した研究を行った。特に、タンパク質の局所構造を表現する新しいモデルとしてゴーストウォーターモデルという陰溶媒モデルを導入し、そのモデルの開発と改良、構造予測のベンチマークテストを行った。大規模ベンチマークの結果、タンパク質の局所構造はそれ単独で取り出しても比較的安定であることが多いことわかった。
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