土壌RNAの直接抽出法開発および解析による微生物の土壌有機物分解過程の解明

• 研究課題/領域番号: 20880007
• 研究種目: 若手研究(スタートアップ)
• 配分区分: 補助金
• 研究分野: 植物栄養学・土壌学
• 研究機関: 秋田県立大学
• 研究代表者: 頼 泰樹 秋田県立大学, 生物資源科学部, 助教 (30503099)
• 研究期間 (年度): 2008 – 2009
• 研究課題ステータス: 完了 (2009年度)
• 配分額: 3,276千円 (直接経費: 2,520千円、間接経費: 756千円); 2009年度: 1,534千円 (直接経費: 1,180千円、間接経費: 354千円); 2008年度: 1,742千円 (直接経費: 1,340千円、間接経費: 402千円)
• キーワード: 土壌RNA / 土壌微生物 / 群集構造解析 / 火山灰土壌 / 土壌 / RNA / 直接抽出 / 土壌有機物 / 分解過程 / 元素動態 / 金属イオン / トレーサー

研究概要

火山灰土壌を含む様々なタイプの土壌からRNAを直接抽出できる方法を開発した。またRT-PCRなどの解析に適応した高純度なRNAの精製法も確立した。この土壌RNAの抽出法を用いて有機物添加後の土壌からrRNAを抽出、解析することにより土壌中での有機物分解微生物群集を解析することが可能となった。

研究成果

• [雑誌論文] A restriction factor of direct DNA extraction from volcanic ash soils. (2010)
  • 著者名/発表者名: Hiroki Rai, Saki Yokoyama, Shinmei Hashimoto, Shin-ichi Nakamura, Hiroyuki Hattori
  • 雑誌名: The proceeding 19th world congress of soil science.
  • 査読あり
• [雑誌論文] A restriction factor of direct DNA extraction from volcanic ash soils. (2010)
  • 著者名/発表者名: Hiroki Rai, Saki Yokoyama, Shinmei Hashimoto, Shin-ichi Nakamura, Hiroyuki Hattori
  • 雑誌名: The proceeding 19th world congress of soil science (Accepted)
  • 査読あり
• [雑誌論文] Non-invasive Imaging 0f Cadmium Distribution in Intact Oilseed Rape Plants. (2009)
  • 著者名/発表者名: S. Nakamura, N. Suzui, N. Ishioka, N. Kawachi, S. Ito, H. Rai, H. Hattori, M. Chino, S. Fujimaki
  • 雑誌名: The Proceeding of the International Plant Nutrition Colloquium vol.16 ページ: 1181-1181
• [雑誌論文] Non-invasive Imaging Of Cadmium Distribution in Intact Oilseed Rape Plants. (2009)
  • 著者名/発表者名: S.Nakamura, N.Suzui, N.Ishioka, N.Kawachi, S.Ito, H.Rai, H.Hattori, M.Chino, S.Fujimaki
  • 雑誌名: The Proceeding of the International Plant Nutrition Colloquium 16 ページ: 1181-1181
• [雑誌論文] Development of real-time autoradiography system to analyze the movement of the compounds labeled by β-ray emitting nuclide in a living plant. (2008)
  • 著者名/発表者名: Hiroki Rai, Satomi Kanno, Yoshitake Hayashi, Tomoyuki Ohya, Naoto Nihei, Tomoko. M. Nakanishi
  • 雑誌名: Radioisotopes 57(5) ページ: 13-20
  • 査読あり
• [雑誌論文] Development of a Fluorescent Microscope Combined with a Real-time Autoradiography System. (2008)
  • 著者名/発表者名: Hiroki Rai, Satomi Kanno, Yoshitake Hayashi, Naoto Nihei, Tomoko. M. Nakanishi
  • 雑誌名: Radioisotopes 57(6) ページ: 355-360
  • NAID: 10021071890
  • 査読あり
• [雑誌論文] (2008)
  • 著者名/発表者名: Naoto Nihei, Sayaka Masuda, Hiroki Rai, Tomoko. M. Nakanishi
  • 雑誌名: Radioisotopes 57(6) ページ: 361-366
  • 査読あり
• [雑誌論文] Development of real-time autoradiography system to analyze the movement of the compoun (2008)
  • 著者名/発表者名: Hiroki Rai, Satomi Kanno, Yoshitake Hayashi, Tomoyuki Ohya, Naoto Nihei Tomoko. M. Nakanishi
  • 雑誌名: Radioisotopes 57(5) ページ: 13-20
  • 査読あり
• [雑誌論文] Development of a Fluorescent Microscope Combined with a Real-time Autoradlography Sys (2008)
  • 著者名/発表者名: Hiroki Rai, Satom Hayashi, Yoshitake Hayashi, Tomoyuki Ohya, Naoto Nihei, Tomoko. M. nakanishi
  • 雑誌名: Radioisotopes 57(6) ページ: 355-360
  • 査読あり
• [雑誌論文] Imaging Analysis of Direct Alanine Uptake by Rice Seedlings. (2008)
  • 著者名/発表者名: Naoto Nihei, Sayaka Masuda, Hiroki Rai, Tomoko. M. Nakanishi
  • 雑誌名: Radioisotopes 57(6) ページ: 361-366
  • NAID: 10021071895
  • 査読あり
• [学会発表] アブラナの根に与えたグルタチオンは植物体の地上部へのカドミウムの移行と蓄積を選択的に阻害する (2010)
  • 著者名/発表者名: 中村進一, 鈴井伸郎, 長坂俊紀, 伊藤小百合, 河地有木, 石岡典子, 頼泰樹, 服部浩之, 茅野充男, 藤巻秀
  • 学会等名: 第51回日本植物生理学会年会
  • 発表場所: 熊本大学(ポスター発表)
• [学会発表] アブラナの根に与えたグルタチオンは植物体の地上部へのカドミウムの移行と蓄積を選択的に阻害する (2010)
  • 著者名/発表者名: 中村進一、鈴井伸郎、長坂俊紀、伊藤小百合、河地有木、石岡典子、頼泰樹、服部浩之、茅野充男、藤巻秀
  • 学会等名: 第51回日本植物生理学会
  • 発表場所: 熊本大学
• [学会発表] 土壌からの簡易的なRNA抽出方法の開発 (2009)
  • 著者名/発表者名: 頼泰樹, 中村進一, 服部浩之
  • 学会等名: 日本微生物生態学会第25回広島大会
  • 発表場所: 広島大学(口頭発表)
  • 年月日: 2009-11-21
• [学会発表] 種々の堆肥施用が作物の遊離アミノ酸含量に与える影響について (2009)
  • 著者名/発表者名: 橋本真明, 頼泰樹, 中村進一, 服部浩之
  • 学会等名: 根の研究会第31回根研究集会
  • 発表場所: 秋田県立大学(ポスター発表)
  • 年月日: 2009-11-21
• [学会発表] 異なる根系発達を及ぼすアミノ酸の窒素利用と代謝 (2009)
  • 著者名/発表者名: 二瓶直登, 増田さやか, 頼泰樹, 中西友子
  • 学会等名: 根の研究会第31回根研究集会
  • 発表場所: 秋田県立大学(ポスター発表)
  • 年月日: 2009-11-21
• [学会発表] 土壌からの簡易的なRNA抽出方法の開発 (2009)
  • 著者名/発表者名: 頼泰樹、中村進一、服部浩之
  • 学会等名: 日本微生物生態学会
  • 発表場所: 広島大学
  • 年月日: 2009-11-21
• [学会発表] 種々の堆肥施用が作物の遊離アミノ酸含量に与える影響について (2009)
  • 著者名/発表者名: 橋本真明、頼泰樹、中村進一、服部浩之
  • 学会等名: 根の研究会 第31回根研究集会
  • 発表場所: 秋田県立大学
  • 年月日: 2009-11-21
• [学会発表] 異なる根系発達を及ぼすアミノ酸の窒素利用と代謝 (2009)
  • 著者名/発表者名: 二瓶直登、増田さやか、頼泰樹、中西友子
  • 学会等名: 根の研究会 第31回根研究集会
  • 発表場所: 秋田県立大学
  • 年月日: 2009-11-21
• [学会発表] 小松菜のミネラル含量の変動要因について (2009)
  • 著者名/発表者名: 浅利南, 頼泰樹, 中村進一, 服部浩之
  • 学会等名: 日本土壌肥料学会2009年度京都大会
  • 発表場所: (口頭発表)
  • 年月日: 2009-09-17
• [学会発表] アブラナ根におけるカドミウムの挙動に対するグルタチオンの影響 (2009)
  • 著者名/発表者名: 中村進一, 鈴井伸郎, 伊藤小百合, 河地有木, 石岡典子, 頼泰樹, 服部浩之, 茅野充男, 藤巻秀
  • 学会等名: 日本土壌肥料学会2009年度京都大会
  • 発表場所: 京都大学(口頭発表)
  • 年月日: 2009-09-17
• [学会発表] 小松菜のミネラル含量の変動要因について (2009)
  • 著者名/発表者名: 浅利南、頼泰樹、中村進一、服部浩之
  • 学会等名: 日本土壌肥料学会
  • 発表場所: 京都大学
  • 年月日: 2009-09-17
• [学会発表] アブラナ根におけるカドミウムの挙動に対するグルタチオンの影響 (2009)
  • 著者名/発表者名: 中村進一、鈴井伸郎、伊藤小百合、河地有木、石岡典子、頼泰樹、服部浩之、茅野充男、藤巻秀
  • 学会等名: 日本土壌肥料学会
  • 発表場所: 京都大学
  • 年月日: 2009-09-17
• [学会発表] 種々の堆肥施用が土壌および作物の遊離アミノ酸組成、含量に与える影響について (2009)
  • 著者名/発表者名: 橋本真明, 本田朋, 頼泰樹, 中村進一, 服部浩之
  • 学会等名: 日本土壌肥料学会2009年度京都大会
  • 発表場所: 京都大学(口頭発表)
  • 年月日: 2009-09-16
• [学会発表] 種々の堆肥施用が土壌および作物の遊離アミノ酸組成、含量に与える影響について (2009)
  • 著者名/発表者名: 橋本真明、本田朋、頼泰樹、中村進一、服部浩之
  • 学会等名: 日本土壌肥料学会
  • 発表場所: 京都大学
  • 年月日: 2009-09-16
• [学会発表] 土壌からの簡易なrna抽出・精製法 (2009)
  • 著者名/発表者名: 頼泰樹, 中村進一, 服部浩之
  • 学会等名: 日本土壌肥料学会2009年度京都大会
  • 発表場所: 京都大学(口頭発表)
  • 年月日: 2009-09-15
• [学会発表] 牛糞堆肥の腐熟化における大腸菌検出と微生物相解析 (2009)
  • 著者名/発表者名: 本田朋, 橋本真明, 頼泰樹, 中村進一, 服部浩之
  • 学会等名: 日本土壌肥料学会2009年度京都大会
  • 発表場所: 京都大学(口頭発表)
  • 年月日: 2009-09-15
• [学会発表] 土壌からの簡易なRNA抽出・精製法 (2009)
  • 著者名/発表者名: 頼泰樹、中村進一、服部浩之
  • 学会等名: 日本土壌肥料学会
  • 発表場所: 京都大学
  • 年月日: 2009-09-15
• [学会発表] 牛糞堆肥の腐熟化における大腸菌検出と微生物相解析 (2009)
  • 著者名/発表者名: 本田朋、橋本真明、頼泰樹、中村進一、服部浩之
  • 学会等名: 日本土壌肥料学会
  • 発表場所: 京都大学
  • 年月日: 2009-09-15
• [学会発表] ポジトロンイメージングを用いた植物の分子イメージング研究(2):イネにおけるカドミウム移行の動画像解析-品種間差の比較 (2009)
  • 著者名/発表者名: 中村進一, 工藤順一, 鈴井伸郎, 河地有木, 伊藤小百合, 石岡典子, 伊藤正志, 川本朋彦, 松本眞一, 小玉郁子, 猪谷富雄, 頼泰樹, 服部浩之, 茅野充男, 藤巻秀
  • 学会等名: 日本分子イメージング学会第4回総会・学術集会
  • 発表場所: 学術総合センター(ポスター発表)
• [学会発表] カドミウム高蓄積イネ「長香穀」を用いたカドミウムの地上部への輸送機構の解明 (2009)
  • 著者名/発表者名: 中村進一, 工藤順一, 鈴井伸郎, 河地有木, 伊藤小百合, 石岡典子, 伊藤正志, 川本朋彦, 松本眞一, 小玉郁子, 猪谷富雄, 頼泰樹, 服部浩之, 茅野充男, 藤巻秀
  • 学会等名: 日本土壌肥料学会東北支部講演会
  • 発表場所: 秋田県カレッジプラザ(口頭発表)
• [学会発表] Non-invasive Imaging Of Cadmium Distribution In Intact Oilseed Rape Plants. (2009)
  • 著者名/発表者名: S. Nakamura, N. Suzui, N. Ishioka, N. Kawachi, S. Ito, H. Rai, H. Hattori, M. Chino, S. Fujimaki
  • 学会等名: XVI International Plant Nutrition Colloquium
  • 発表場所: サクラメントコンベンションセンターUSA(ポスター発表)
• [学会発表] Glutathione, Administered to the Roots, Reduce Cd accumulation in the Shoots of Oilseed Rape Plants. (2009)
  • 著者名/発表者名: S. Nakamura, N. Suzui, T. Nagasaka, S. Ito, N. Kawachi, N.S. Ishioka, H. Rai, H. Hattori, M. Chino, S. Fujimaki
  • 学会等名: MARCO Symposium 2009
  • 発表場所: つくば国際会議場(ポスター発表)
• [学会発表] ポジトロンイメージング技術を用いたイネのカドミウムの移行・蓄積における品種間差の解析 (2009)
  • 著者名/発表者名: 中村進一, 工藤順一, 頼泰樹, 服部浩之, 茅野充男, 鈴井伸郎, 伊藤小百合, 河地有木, 石岡典子, 藤巻秀, 伊藤正志, 川本朋彦, 松本眞一, 小玉郁子, 猪谷富雄
  • 学会等名: 第4回高崎量子応用研究シンポジウム
  • 発表場所: 高崎シティギャラリー(ポスター発表)
• [学会発表] ポジトロンイメージング技術を用いた植物体地上部へのカドミウム移行抑制の解析 (2009)
  • 著者名/発表者名: 中村進一, 鈴井伸郎, 長坂俊紀, 伊藤小百合, 河地有木, 石岡典子, 頼泰樹, 服部浩之, 茅野充男, 藤巻秀
  • 学会等名: 第13回放射線プロセスシンポジウム
  • 発表場所: 日本未来館(ポスター発表)
• [学会発表] ポジトロンイメージングを用いた植物の分子イメージング研究(2):イネにおけるカドミウム移行の動画像解析-品種間差の比較 (2009)
  • 著者名/発表者名: 中村進一、工藤順一、鈴井伸郎、河地有木、伊藤小百合、石岡典子、伊藤正志、川本朋彦、松本眞一、小玉郁子、猪谷富雄、頼泰樹、服部浩之、茅野充男、藤巻秀
  • 学会等名: 日本分子イメージング学会 第4回総会・学術集会
  • 発表場所: 学術総合センター
• [学会発表] カドミウム高蓄積イネ「長香穀」を用いたカドミウムの地上部への輸送機構の解明 (2009)
  • 著者名/発表者名: 中村進一、工藤順一、鈴井伸郎、河地有木、伊藤小百合、石岡典子、伊藤正志、川本朋彦、松本眞一、小玉郁子、猪谷富雄、頼泰樹、服部浩之、茅野充男、藤巻秀
  • 学会等名: 日本土壌肥料学会 東北支部講演会
  • 発表場所: 秋田県カレッジプラザ
• [学会発表] Non-invasive Imaging Of Cadmium Distribution In Intact Oilseed Rape Plants. (2009)
  • 著者名/発表者名: S.Nakamura, N.Suzui, N.Ishioka, N.Kawachi, S.Ito, H.Rai, H.Hattori, M.Chino, S.Fujimaki
  • 学会等名: XVI International Plant Nutrition Colloquium
  • 発表場所: サクラメントコンベンションセンター(USA)
• [学会発表] Glutathione, Administered to the Roots, Reduce Cd accumulation in the Shoots of Oilseed Rape Plants. (2009)
  • 著者名/発表者名: S.Nakamura, N.Suzui, T.Nagasaka, S.Ito, N.Kawachi, N.S.Ishioka, H.Rai, H.Hattori, M.Chino, S.Fujimaki
  • 学会等名: MARCO Symposium 2009
  • 発表場所: つくば国際会議場
• [学会発表] ポジトロンイメージング技術を用いたイネのカドミウムの移行・蓄積における品種間差の解析 (2009)
  • 著者名/発表者名: 中村進一、工藤順一、頼泰樹、服部浩之、茅野充男、鈴井伸郎、伊藤小百合、河地有木、石岡典子、藤巻秀、伊藤正志、川本朋彦、松本眞一、小玉郁子、猪谷富雄
  • 学会等名: 第4回高崎量子応用研究シンポジウム
  • 発表場所: 高崎シティギャラリー
• [学会発表] ポジトロンイメージング技術を用いた植物体地上部へのカドミウム移行抑制の解析 (2009)
  • 著者名/発表者名: 中村進一、鈴井伸郎、長坂俊紀、伊藤小百合、河地有木、石岡典子、頼泰樹、服部浩之、茅野充男、藤巻秀
  • 学会等名: 第13回放射線プロセスシンポジウム
  • 発表場所: 日本未来館