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天然化合物の多様性拡張を志向した生合成分子基盤の解明

研究課題

研究課題/領域番号 20H00416
研究種目

基盤研究(A)

配分区分補助金
応募区分一般
審査区分 中区分38:農芸化学およびその関連分野
研究機関国立研究開発法人理化学研究所

研究代表者

高橋 俊二  国立研究開発法人理化学研究所, 環境資源科学研究センター, ユニットリーダー (30311608)

研究分担者 野川 俊彦  国立研究開発法人理化学研究所, 環境資源科学研究センター, 技師 (40462717)
滝田 良  東京大学, 大学院薬学系研究科(薬学部), 講師 (50452321)
永野 真吾  鳥取大学, 工学研究科, 教授 (60286440)
加藤 直樹  摂南大学, 農学部, 准教授 (90442946)
研究期間 (年度) 2020-04-01 – 2023-03-31
研究課題ステータス 完了 (2022年度)
配分額 *注記
45,370千円 (直接経費: 34,900千円、間接経費: 10,470千円)
2022年度: 13,910千円 (直接経費: 10,700千円、間接経費: 3,210千円)
2021年度: 13,910千円 (直接経費: 10,700千円、間接経費: 3,210千円)
2020年度: 17,550千円 (直接経費: 13,500千円、間接経費: 4,050千円)
キーワード放線菌 / 天然化合物 / 異種発現 / 生合成 / 遺伝子資源 / 化学資源
研究開始時の研究の概要

人知を超えた構造と強い生理活性から、微生物が作る天然化合物は創薬探索源として重要である。天然物生合成に仕組まれている新規酵素の機能を遺伝子工学、生化学、構造生物学、計算化学により総合的に解明し、天然化合物の多様化と新規生理活性物質の創出につなげることがポストゲノム時代の重要課題である。本研究では、長期に未解明であった天然化合物の生合成遺伝子資源を異種発現系により化学資源へと変換し、化合物の骨格形成を担う酵素や修飾酵素の機能解明により、天然化合物の構造多様性創出基盤を構築する。

研究成果の概要

微生物が作る天然化合物は創薬探索源として知られている。微生物が有している遺伝子情報を化合物資源へと変換することはポストゲノム時代の重要課題である。本研究では、生合成機構が長らく未解明であった天然化合物を生産する放線菌のゲノム解読情報、遺伝子機能アノテーション情報をもとに生合成遺伝子クラスターの解明に取り組んだ。放線菌異種発現解析、生合成遺伝子破壊と破壊株に蓄積する生合成中間体の構造決定、修飾酵素群の生化学解析を行うことによって、未解明生合成遺伝子クラスターの同定に成功した。本研究によって未解明の有用天然化合物の構造多様化に関わる分子基盤を解明することができた。

研究成果の学術的意義や社会的意義

本研究では、微生物が有している未解明の生合成遺伝子クラスターが有用化合物(核酸系化合物、ポリケチド、テルペノイド)へと変換される仕組みを解明した。本学術研究の成果は、天然化合物の多様性を拡張する研究の発展に資するものであり、社会に貢献する創薬シードの導出に向けた有用な遺伝子・酵素情報をもたらすことが出来た。

報告書

(5件)
  • 2022 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2021 実績報告書
  • 2020 審査結果の所見   実績報告書
  • 研究成果

    (33件)

すべて 2023 2022 2021 2020

すべて 雑誌論文 (12件) (うち国際共著 5件、 査読あり 12件、 オープンアクセス 3件) 学会発表 (21件) (うち国際学会 3件、 招待講演 1件)

  • [雑誌論文] Crystal structures of a 6-dimethylallyltryptophan synthase, IptA: Insights into substrate tolerance and enhancement of prenyltransferase activity2022

    • 著者名/発表者名
      Hironori Suemune, Doukan Nishimura, Kenjiro Mizutani, Yusuke Sato, Tomoya Hino, Hiroshi Takagi, Yumi Shiozaki-Sato, Shunji Takahashi*, Shingo Nagano*
    • 雑誌名

      Biochem. Biophys. Res. Commun.

      巻: 593 ページ: 144-150

    • DOI

      10.1016/j.bbrc.2022.01.018

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] RK-270D and E, Oxindole Derivatives from Streptomyces sp. with Anti-Angiogenic Activity2022

    • 著者名/発表者名
      Jang Jun-Pil、Jang Mina、Nogawa Toshihiko、Takahashi Shunji、Osada Hiroyuki、Ahn Jong Seog、Ko Sung-Kyun、Jang Jae-Hyuk
    • 雑誌名

      Journal of Microbiology and Biotechnology

      巻: 32 号: 3 ページ: 302-306

    • DOI

      10.4014/jmb.2110.10039

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Identification and Characterization of Bifunctional Drimenol Synthases of Marine Bacterial Origin2022

    • 著者名/発表者名
      Vo Nhu Ngoc Quynh、Nomura Yuhta、Kinugasa Kiyomi、Takagi Hiroshi、Takahashi Shunji
    • 雑誌名

      ACS Chemical Biology

      巻: 17 号: 5 ページ: 1226-1238

    • DOI

      10.1021/acschembio.2c00163

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Isolation of new lucilactaene derivatives from P450 monooxygenase and aldehyde dehydrogenase knockout Fusarium sp. RK97-94 strains and their biological activities2022

    • 著者名/発表者名
      Abdelhakim IA, Motoyama Takayuki, Nogawa Toshihiko, Mahmud FB, Futamura Yushi, Takahashi Shunji, Osada Hiroyuki
    • 雑誌名

      The Journal of Antibiotics

      巻: ahead of print 号: 7 ページ: 361-374

    • DOI

      10.1038/s41429-022-00529-3

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Identification of the kinanthraquinone biosynthetic gene cluster by expression of an atypical response regulator.2021

    • 著者名/発表者名
      Takao R, Sakai K, Koshino H, Osada H, Takahashi S.
    • 雑誌名

      Biosci Biotechnol Biochem

      巻: 85 号: 3 ページ: 714-721

    • DOI

      10.1093/bbb/zbaa082

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] 6,9-Dihydroxytetrangulol, a novel angucyclinone antibiotic accumulated in kiqO gene disruptant in the biosynthesis of kinanthraquinone2021

    • 著者名/発表者名
      Sakai Katsuyuki、Takao Risa、Koshino Hiroyuki、Futamura Yushi、Osada Hiroyuki、Takahashi Shunji
    • 雑誌名

      The Journal of Antibiotics

      巻: 74 号: 9 ページ: 593-595

    • DOI

      10.1038/s41429-021-00442-1

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Molecular Basis for Two Stereoselective Diels-Alderases that Produce Decalin Skeletons2021

    • 著者名/発表者名
      Fujiyama Keisuke、Kato Naoki、Re Suyong、Kinugasa Kiyomi、Watanabe Kohei、Takita Ryo、Nogawa Toshihiko、Hino Tomoya、Osada Hiroyuki、Sugita Yuji、Takahashi Shunji、Nagano Shingo
    • 雑誌名

      Angewandte Chemie International Edition

      巻: 60 号: 41 ページ: 22401-22410

    • DOI

      10.1002/anie.202106186

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Thiolactomide: A New Homocysteine Thiolactone Derivative from Streptomyces sp. with Neuroprotective Activity2021

    • 著者名/発表者名
      Jang Jun-Pil、Kwon Min Cheol、Nogawa Toshihiko、Takahashi Shunji、Osada Hiroyuki、Ahn Jong Seog、Ko Sung-Kyun、Jang Jae-Hyuk
    • 雑誌名

      Journal of Microbiology and Biotechnology

      巻: 31 号: 12 ページ: 1667-1671

    • DOI

      10.4014/jmb.2108.08015

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Dihydrolucilactaene, a Potent Antimalarial Compound from Fusarium sp. RK97-942021

    • 著者名/発表者名
      A. Abdelhakim Islam、Bin Mahmud Fauze、Motoyama Takayuki、Futamura Yushi、Takahashi Shunji、Osada Hiroyuki
    • 雑誌名

      Journal of Natural Products

      巻: 85 号: 1 ページ: 63-69

    • DOI

      10.1021/acs.jnatprod.1c00677

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] β-carboline chemical signals induce reveromycin production through a LuxR family regulator in Streptomyces sp. SN-593.2020

    • 著者名/発表者名
      Panthee S, Kito N, Hayashi T, Shimizu T, Ishikawa J, Hamamoto H, Osada H, Takahashi S.
    • 雑誌名

      Sci Rep

      巻: 10 号: 1 ページ: 10230-10230

    • DOI

      10.1038/s41598-020-66974-y

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Developing Aspergillus niger as a cell factory for food enzyme production2020

    • 著者名/発表者名
      Li Cen、Zhou Jingwen、Du Guocheng、Chen Jian、Takahashi Shunji、Liu Song
    • 雑誌名

      Biotechnology Advances

      巻: 44 ページ: 107630-107630

    • DOI

      10.1016/j.biotechadv.2020.107630

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Heterologous Expression of the Biosynthetic Gene Cluster for Verticilactam and Identification of Analogues2020

    • 著者名/発表者名
      Nogawa Toshihiko、Terai Atsutaka、Amagai Keita、Hashimoto Junko、Futamura Yushi、Okano Akiko、Fujie Manabu、Satoh Noriyuki、Ikeda Haruo、Shin-ya Kazuo、Osada Hiroyuki、Takahashi Shunji
    • 雑誌名

      Journal of Natural Products

      巻: 83 号: 12 ページ: 3598-3605

    • DOI

      10.1021/acs.jnatprod.0c00755

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] Biosynthetic study of verticilactam, a polycyclic macrolactam from Streptomyces2023

    • 著者名/発表者名
      Yu ZHENG, Katsuyuki SAKAI, Hiroshi TAKAGI, Yumi SHIOZAKI-SATO, Toshihiko NOGAWA, Shunji TAKAHASHI
    • 学会等名
      4th International Conference on Natural Products Discovery and Development in the Genomic Era
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Identification of new lucilactaene derivatives with potent antimalarial activity2023

    • 著者名/発表者名
      Yushi Futamura, Islam A Abdelhakim, Takayuki Motoyama, Fauze Bin Mahmud, Harumi Aono, Nobumoto Watanabe, Shunji Takahashi, Kuniki Kino, Hiroyuki Osada
    • 学会等名
      4th International Conference on Natural Products Discovery and Development in the Genomic Era
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Biosynthetic study of verticilactam, a polycyclic macrolactam from Streptomyces2023

    • 著者名/発表者名
      Yu ZHENG, Katsuyuki SAKAI, Hiroshi TAKAGI, Yumi SHIOZAKI-SATO, Toshihiko NOGAWA, Shunji TAKAHASHI
    • 学会等名
      日本農芸化学会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] Reveromycin A生合成酵素RevK-RevL複合体モデル構造に基づくRevL変異導入酵素の解析と相互作用領域決定2023

    • 著者名/発表者名
      岡村英治、佐藤(汐﨑)裕美、奥村英夫、熊坂崇、長田裕之、高橋俊二
    • 学会等名
      日本農芸化学会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] Crystal structure analysis of drimenol synthase from marine bacterium.2023

    • 著者名/発表者名
      Keisuke FUJIYAMA, Vo Ngoc Quynh NHU, Shunji TAKAHASHI
    • 学会等名
      日本農芸化学会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] New elasnin derivatives identified by expression of a SARP family regulatory gene.2023

    • 著者名/発表者名
      Islam Amin, Jun Ishikawa, Sachiko Masuda, Ken Shirasu, Shunji Takahashi
    • 学会等名
      日本農芸化学会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] 遺伝子改変糸状菌より収集したデカリン含有テトラミン酸化合物の構造活性相関2023

    • 著者名/発表者名
      加藤直樹,野川俊彦,海老原佳奈,二村友史,松田一彦,丹羽隆介,高橋俊二,長田裕之
    • 学会等名
      日本農芸化学会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] Identification of elasnin derivatives by expression of regulatory gene2022

    • 著者名/発表者名
      Islam A. Abdelhakim, Naoko Kito, Sachiko Masuda, Ken Shirasu, Jun Ishikawa, and Shunji Takahashi
    • 学会等名
      日本放線菌学会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] リベロマイシンA生合成に関わる複合酵素の鍵相互作用残基の同定2022

    • 著者名/発表者名
      岡村英治、 佐藤(汐﨑)裕美、奥村英夫、 熊坂崇、長田裕之、高橋俊二
    • 学会等名
      日本放線菌学会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] 生合成モジュールの機能解析に向けたPikromycin 生合成中間体の合成研究2022

    • 著者名/発表者名
      大澤宏祐、伴秀俊、杉山良幸、岡村英治、高橋俊二、 土井隆行
    • 学会等名
      日本薬学会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] デカリン合成酵素の阻害剤同定と共結晶構造解析2022

    • 著者名/発表者名
      加藤 直樹,藤山 敬介,永野 真吾,高橋 俊二
    • 学会等名
      日本農芸化学会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] ReveromycinA生合成酵素RevKLMのin sillico解析による相互作用予測と実験的検証2022

    • 著者名/発表者名
      岡村 英治,佐藤(汐﨑)裕美,奥村 英夫,熊坂 崇, 長田 裕之,高橋 俊二
    • 学会等名
      日本農芸化学会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] Functional characterization of a novel bifunctional drimenol synthase of bacterial origin: A step toward the discovery of drimane sesquiterpenes in bacteria2022

    • 著者名/発表者名
      Nhu Ngoc Quynh Vo,Yuhta Nomura,Kiyomi Kinugasa, Hiroshi Takagi,Yumi Shiozaki-Sato,Shunji Takahashi
    • 学会等名
      日本農芸化学会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] Characterization of cytochrome P450 function in verticilactam biosynthesis2022

    • 著者名/発表者名
      Yu ZHENG,Hiroshi TAKAGI,Katsuyuki SAKAI, Yumi SHIOZAKI-SATO,Toshihiko NOGAWA, Risa TAKAO,Shunji TAKAHASHI
    • 学会等名
      日本農芸化学会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] Discovery of new lucilactaene derivatives with potent antimalarial activity and their structure-activity relationship2022

    • 著者名/発表者名
      Islam Adel Abdelhakim Amin,Fauze Mahmud, Motoyama Takayuki,Nogawa Toshihiko,Futamura Yushi, Takahashi Shunji,Osada Hiroyuki
    • 学会等名
      日本農芸化学会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] Mode of action study of dihydrolucilactaene,a new highly potent antimalarial compound2022

    • 著者名/発表者名
      Fauze Mahmud,Futamura Yushi, Islam A. Abdelhakim,Motoyama Takayuki, Takahashi Shunji,Ngit Shin Lai,Osada Hiroyuki
    • 学会等名
      日本農芸化学会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] Aspergillus 糸状菌におけるアミラーゼ生産を誘導する代謝耐性イソマルトースアナログ2022

    • 著者名/発表者名
      沼本 穂,森山 貴博,田邉 理子,寄立 麻琴,平井 剛, 高橋 俊二,加藤 直樹
    • 学会等名
      日本農芸化学会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] Analysis of verticilactam biosynthetic gene cluster2021

    • 著者名/発表者名
      Toshihiko Nogawa, Atsutaka Terai, Keita Amagai, Junko Hashimoto, Manabu Fujie, Noriyuki Satoh, Haruo Ikeda, Kazuo Shin-ya, Hiroyuki Osada, Shunji Takahashi
    • 学会等名
      Pacifichem 2021
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 非典型OmpRレスポンスレギュレーターを用いたkinanthraquinone生産改善と生合成中間体の取得2021

    • 著者名/発表者名
      高尾 理沙, 坂井 克行, 越野 広雪, 長田 裕之, 高橋 俊二
    • 学会等名
      日本放線菌学会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] 放線菌の二次代謝生合成機構と生産性増強に関する研究2021

    • 著者名/発表者名
      高橋 俊二
    • 学会等名
      日本放線菌学会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] デカリン合成酵素Phm7およびFsa2のin vitroアッセイ系の構築2021

    • 著者名/発表者名
      加藤直樹、藤山敬介、野川俊彦、長田裕之、永野真吾、高橋俊二
    • 学会等名
      日本農芸化学会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書

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公開日: 2020-04-28   更新日: 2024-01-30  

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