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DNA二重鎖切断の認識と修復及び細胞応答統御におけるDNAーPKの機能と存在意義

研究課題

研究課題/領域番号 20H04334
研究種目

基盤研究(B)

配分区分補助金
応募区分一般
審査区分 小区分63020:放射線影響関連
研究機関東京工業大学

研究代表者

松本 義久  東京工業大学, 科学技術創成研究院, 教授 (20302672)

研究分担者 横谷 明徳  国立研究開発法人量子科学技術研究開発機構, 量子生命科学研究所, 専門業務員 (10354987)
島田 幹男  東京工業大学, 科学技術創成研究院, 助教 (20548557)
泉 雄大  国立研究開発法人量子科学技術研究開発機構, 量子生命科学研究所, 主任研究員 (20595772)
松尾 光一  広島大学, 放射光科学研究センター, 准教授 (40403620)
林 宣宏  東京工業大学, 生命理工学院, 教授 (80267955)
石合 正道  国立研究開発法人国立がん研究センター, 研究所, 施設長 (90298844)
研究期間 (年度) 2020-04-01 – 2023-03-31
研究課題ステータス 完了 (2022年度)
配分額 *注記
17,810千円 (直接経費: 13,700千円、間接経費: 4,110千円)
2022年度: 4,810千円 (直接経費: 3,700千円、間接経費: 1,110千円)
2021年度: 5,330千円 (直接経費: 4,100千円、間接経費: 1,230千円)
2020年度: 7,670千円 (直接経費: 5,900千円、間接経費: 1,770千円)
キーワードDNA依存性プロテインキナーゼ(DNA-PK) / 放射線 / DNA修復 / DNA損傷応答 / タンパク質リン酸化 / タンパク質間相互作用 / タンパク質構造解析 / がん放射線治療
研究開始時の研究の概要

DNA二重鎖切断(DSB)は、放射線によって生じる種々のDNA損傷の中で最も重篤で、放射線の人体影響の鍵を握ると考えられている。DNA依存性プロテインキナーゼ(DNA-PK)はDSBのセンサーと考えられるタンパク質リン酸化酵素である。本研究では、①DSBの形状に応じた修復の制御におけるリン酸化の意義を調べる。②AIを活用した新たなプロテオミクス手法により、新しいDNA-PKの標的やDSB応答現象を探索し、その生理的意義を調べる。本研究は、DNA-PKが何をしているのか、何のために存在するのかを明らかにすること、また、これを通じて放射線治療や放射線防護に資することを目的とする。

研究成果の概要

本研究は、DNA二重鎖切断(DSB)のセンサーであるDNA依存性プロテインキナーゼ(DNA-PK)の機能と存在意義を明らかにすることを目的として行った。本研究では、DNA-PKによるリン酸化がXRCC4の機能、構造に与える影響の一端を明らかにした。また、XRCC4の結合分子PNKPとAPTXに関して、DNA修復機能やDNA損傷部位への動員機構を明らかにした。さらに、XRCC4の小頭症、発育不全を呈する患者に見られる変異、がんリスクとの相関が報告されているバリアントにおいてDNA修復機能が低下していることなどを明らかにした。

研究成果の学術的意義や社会的意義

放射線によって生じるさまざまなDNA損傷の中で、DNA二重鎖切断(DSB)は最も重篤な損傷で、がんの治療効果や副作用の鍵を握ると考えられている。DNA-PKはDSBのセンサーとして働き、DNA修復をはじめとする種々の細胞応答を引き起こすために重要と考えられる。本研究は、DSBの結合を制御するXRCC4に注目し、これまで長年の研究にも関わらず明らかになっていなかったDNA-PKのDSB修復における機能や存在意義の一端を明らかにした。本研究の成果は、放射線感受性の予測や制御を通じてがん放射線治療のさらなる向上につながる可能性が期待される。

報告書

(4件)
  • 2022 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2021 実績報告書
  • 2020 実績報告書
  • 研究成果

    (53件)

すべて 2023 2022 2021 2020 その他

すべて 国際共同研究 (6件) 雑誌論文 (16件) (うち国際共著 6件、 査読あり 14件、 オープンアクセス 11件) 学会発表 (29件) (うち国際学会 5件、 招待講演 4件) 備考 (2件)

  • [国際共同研究] SPC Government College(インド)

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  • [国際共同研究] Mahidol University(タイ)

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  • [雑誌論文] Structural study of wild-type and phospho-mimic XRCC4 dimer and multimer proteins using circular dichroism spectroscopy2023

    • 著者名/発表者名
      Nishikubo K, Hasegawa M, Izumi Y, Fujii K, Matsuo K, Matsumoto Y, *Yokoya A.
    • 雑誌名

      International Journal of Radiation Biology

      巻: Accepted for publication

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      2022 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] APTX acts in DNA double-strand break repair in a manner distinct from XRCC42023

    • 著者名/発表者名
      Imamura Rikiya、Saito Mizuki、Shimada Mikio、Kobayashi Junya、Ishiai Masamichi、Matsumoto Yoshihisa
    • 雑誌名

      Journal of Radiation Research

      巻: Online ahead of print 号: 3 ページ: 1-11

    • DOI

      10.1093/jrr/rrad007

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Implication of E3 ligase RAD18 in UV-induced mutagenesis in human induced pluripotent stem cells and neuronal progenitor cells.2023

    • 著者名/発表者名
      Shimada M, Tokumiya T, Miyake T, Tsukada K, Kanzaki N, Yanagihara H, Kobayashi J, Matsumoto Y.
    • 雑誌名

      J Radiat Res.

      巻: 64 号: 2 ページ: 343-351

    • DOI

      10.1093/jrr/rrac099

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] The role of DNA double-strand break repair through non-homologous end joining in the dose-rate effect in terms of clonogenic ability2022

    • 著者名/発表者名
      Tsuchiya H, Shimada M, Tsukada K, Meng Q, Kobayashi J, Matsumoto Y.
    • 雑誌名

      Radiation Protection Dosimetry

      巻: -

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      2021 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Development and evolution of DNA-dependent protein kinase inhibitors toward cancer therapy.2022

    • 著者名/発表者名
      Matsumoto Y.
    • 雑誌名

      International Journal of Molecular Science

      巻: 23 号: 8 ページ: 4264-4264

    • DOI

      10.3390/ijms23084264

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      2021 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] 放射線によるDNA損傷の修復2022

    • 著者名/発表者名
      松本 義久
    • 雑誌名

      生体の科学

      巻: 73 ページ: 110-114

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      2021 実績報告書
  • [雑誌論文] Phosphorylation of PNKP mediated by CDKs promotes end-processing of Okazaki fragments during DNA replication2021

    • 著者名/発表者名
      Tsukada K, Imamura R, Saikawa K, Saito M, Kase N, Miyake T, Ishiai M, Matsumoto Y, Shimada M
    • 雑誌名

      bioRxiv

      巻: -

    • DOI

      10.1101/2021.07.29.452278

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      2021 実績報告書
    • オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] α-glucosyl-rutin activates immediate early genes in human induced pluripotent stem cells.2021

    • 著者名/発表者名
      Miyake T, Kuge M, Matsumoto Y, Shimada M.
    • 雑誌名

      Stem Cell Research

      巻: 56 ページ: 102511-102511

    • DOI

      10.1016/j.scr.2021.102511

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      2021 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] DNA-dependent protein kinase catalytic subunit: The sensor for DNA double-strand breaks structurally and functionally related to Ataxia-Telangiectasia Mutated.2021

    • 著者名/発表者名
      Matsumoto Y, Asa ADDC, Modak C, Shimada M.
    • 雑誌名

      Genes

      巻: 12 号: 8 ページ: 1143-1143

    • DOI

      10.3390/genes12081143

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      2021 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Prediction of treatment response from the microenvironment of tumor immunity in cervical cancer patients treated with chemoradiotherapy2021

    • 著者名/発表者名
      Someya Masanori、Tsuchiya Takaaki、Fukushima Yuki、Hasegawa Tomokazu、Hori Masakazu、Kitagawa Mio、Gocho Toshio、Mafune Shoh、Ikeuchi Yutaro、Hirohashi Yoshihiko、Torigoe Toshihiko、Iwasaki Masahiro、Matsuura Motoki、Saito Tsuyoshi、Matsumoto Yoshihisa、Sakata Koh-ichi
    • 雑誌名

      Medical Molecular Morphology

      巻: 54 号: 3 ページ: 245-252

    • DOI

      10.1007/s00795-021-00290-w

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Diminished or inversed dose-rate effect on clonogenic ability in Ku-deficient rodent cells.2021

    • 著者名/発表者名
      Tsuchiya H, Shimada M, Tsukada K, Meng Q, Kobayashi J, Matsumoto Y
    • 雑誌名

      Journal of Radiation Research

      巻: 62 号: 2 ページ: 198-205

    • DOI

      10.1093/jrr/rraa128

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Functional analysis of XRCC4 mutations in reported microcephaly and growth defect patients in terms of radiosensitivity.2021

    • 著者名/発表者名
      Asa ADDC, Wanotayan R, Sharma MK, Tsukada K, Shimada M, Matsumoto Y.
    • 雑誌名

      Journal of Radiation Research

      巻: 62 号: 3 ページ: 380-389

    • DOI

      10.1093/jrr/rrab016

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Prediction of Results of Radiotherapy With Ku70 Expression and an Artificial Neural Network2020

    • 著者名/発表者名
      TOMOKAZU HASEGAWA, MASANORI SOMEYA, MASAKAZU HORI, TAKAAKI TSUCHIYA, YUUKI FUKUSHIMA, YOSHIHISA MATSUMOTO, KOH-ICHI SAKATA
    • 雑誌名

      in vivo

      巻: 34 号: 5 ページ: 2865-2872

    • DOI

      10.21873/invivo.12114

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Linker region is required for efficient nuclear localization of polynucleotide kinase phosphatase.2020

    • 著者名/発表者名
      Tsukada K, Matsumoto Y, Shimada M.
    • 雑誌名

      PLoS One

      巻: 15 号: 9 ページ: e0239404-e0239404

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0239404

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] The FHA domain of PNKP is essential for its recruitment to DNA damage sites and maintenance of genome stability2020

    • 著者名/発表者名
      Tsukada K, Shimada M, Imamura R, Saikawa K, Ishiai M, Matsumoto Y.
    • 雑誌名

      Mutat Res.

      巻: 822 ページ: 111727-111727

    • DOI

      10.1016/j.mrfmmm.2020.111727

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Dependent Protein Kinase in DNA Damage Response: Three Decades and Beyond.2020

    • 著者名/発表者名
      Matsumoto Y, Sharma MK.
    • 雑誌名

      Journal of Radiation and Cancer Research

      巻: 11 号: 4 ページ: 123-134

    • DOI

      10.4103/jrcr.jrcr_60_20

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [学会発表] The Functional Analysis of Genetic Disease Factor APTX in DNA Double Strand Break Repair2023

    • 著者名/発表者名
      Rikiya Imamura, Mizuki Saito, Mikio Shimada, Masamichi Ishiai, Yoshihisa Matsumoto
    • 学会等名
      International Symposium on Zero-Carbon Energy Systems
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Analysis of the phosphorylation mechanism of the C-terminus of XRCC4 in DNA double-strand break repair2023

    • 著者名/発表者名
      村松 麗斗, 塚田 海馬, 西内 巧, 島田 幹男, 松本 義久.
    • 学会等名
      日本原子力学会関東・甲越支部第21回若手研究者・技術者研究討論会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] DNA損傷と細胞周期2023

    • 著者名/発表者名
      松本 義久
    • 学会等名
      日本放射線腫瘍学会生物部会 第13回放射線生物学セミナー
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Molecular Radiation Biology on DNA Damage Response for Radiotherapy and Radioprotection in Next Generation2022

    • 著者名/発表者名
      Yoshihisa Matsumoto.
    • 学会等名
      5th Asian Congress of Radiation Research
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Role of genetic disease factor APTX in DNA double strand repair2022

    • 著者名/発表者名
      Rikiya Imamura, Mizuki Saito, Mikio Shimada, Masamichi Ishiai, Yoshihisa Matsumoto.
    • 学会等名
      5th Asian Congress of Radiation Research
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] DNA二重鎖切断の認識・修復の分子機構とがん治療への応用2022

    • 著者名/発表者名
      松本 義久.
    • 学会等名
      第27回癌治療増感研究会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 遺伝性疾患原因遺伝子APTX のDNA 二本鎖切断修復での役割2022

    • 著者名/発表者名
      今村 力也, 齋藤 瑞樹, 島田 幹男, 石合 正道, 松本 義久.
    • 学会等名
      日本放射線影響学会第65回大会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] The role of DNA double-strand break repair through non-homologous end joining in the dose-rate effect in terms of clonogenic ability2021

    • 著者名/発表者名
      Hisayo Tsuchiya, Mikio Shimada, Kaima Tsukada, Qingmei Meng, Junya Kobayashi, Yoshihisa Matsumoto.
    • 学会等名
      Institute for Environmental Sciences International Symposium
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] DNA二重鎖修復タンパク質Ku欠損細胞における線量率効果2021

    • 著者名/発表者名
      土屋 尚代, 島田 幹男, 塚田 海馬, 孟 慶梅, 小林 純也, 松本 義久.
    • 学会等名
      日本放射線腫瘍学会生物部会第58回学術大会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] 遺伝病原因遺伝子 APTX の DNA 損傷応答での役割 (The role of hereditary disease factor APTX in DNA damage response.)2021

    • 著者名/発表者名
      今村 力也, 齋藤 瑞樹, 島田 幹男, 石合 正道, 松本 義久.
    • 学会等名
      令和三年度 第一回 日本放射線影響学会・若手部会 放射線影響研究会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] XRCC4 欠損細胞を用いた DNA 二本鎖修復効率の解析2021

    • 著者名/発表者名
      齋藤 瑞樹, 今村 力也, 塚田 海馬, 島田 幹男, 松本 義久.
    • 学会等名
      令和三年度 第一回 日本放射線影響学会・若手部会 放射線影響研究会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] ヒト iPS 細胞由来組織細胞における放射線誘発突然変異計測系の確立 (Establishment of a radiation-induced mutation measurement system in human iPS cell- derived tissue cell.)2021

    • 著者名/発表者名
      徳宮 巧実, 島田 幹男, 柳原 啓見, 神崎 訓枝, 三宅 智子, 松本 義久.
    • 学会等名
      令和三年度 第一回 日本放射線影響学会・若手部会 放射線影響研究会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] 高LET放射線照射はiPS細胞において多極性細胞分裂を誘導する(High LET radiation induces multipolar cell division in human induced pluripotent stem cells.)2021

    • 著者名/発表者名
      島田 幹男, 塚田 海馬, 齊川 昂太郎, 三宅 智子, 平山 亮一, 松本 義久.
    • 学会等名
      日本放射線影響学会第64回大会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] XRCC4およびDNA-PKによるXRCC4のリン酸化のDNA二本鎖切断修復における役割(Role of XRCC4 and its phosphorylation by DNA-PK in DNA double-strand break repair)2021

    • 著者名/発表者名
      齋藤 瑞樹, 塚田 海馬, 今村 力也, 島田 幹男, 松本 義久.
    • 学会等名
      日本放射線影響学会第64回大会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] 遺伝性疾患原因遺伝子APTXのDNA複製および複製ストレス下での役割(The role of hereditary disease factor APTX in DNA replication and replication stress)2021

    • 著者名/発表者名
      今村 力也, 齋藤 瑞樹, 島田 幹男, 石合 正道, 松本 義久.
    • 学会等名
      日本放射線影響学会第64回大会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] 擬似リン酸化によるXRCC4の構造変化(Structural change in XRCC4 mutants mimicking phosphorylation)2021

    • 著者名/発表者名
      西久保 開, 長谷川 真保, 泉 雄大, 藤井 健太郎, 松尾 光一, 松本 義久, 横谷 明徳.
    • 学会等名
      日本放射線影響学会第64回大会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] XRCC4-like factor (XLF)のヒトリンパ芽球TKにおけるDNA二本鎖切断修復およびV(D)J組換え機能解析(The function of XRCC4-like factor (XLF) in DNA double-strand break repair and V(D)J recombination in himan lymphoblastoid TK6)2021

    • 著者名/発表者名
      モウダク テャイティー, 塚田 海馬, デイ アニー, 島田 幹男, 松本 義久.
    • 学会等名
      日本放射線影響学会第64回大会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] DNA複製中の岡崎フラグメント成熟におけるDNA修復酵素PNKPの役割(The role of polynucleotide kinase phosphatase (PNKP) in Okazaki fragment maturation during DNA replication)2021

    • 著者名/発表者名
      塚田 海馬, 今村 力也, 齋藤 瑞樹, 石合 正道, 島田 幹男, 松本 義久.
    • 学会等名
      日本放射線影響学会第64回大会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] ヒト細胞におけるアプラタキシン(APTX)のDNA損傷応答解析(Function of Aprataxin (APTX) in DNA damage response and repair in human cells)2021

    • 著者名/発表者名
      神元 梨穂, 今村 力也, 島田 幹男, 松本 義久.
    • 学会等名
      日本放射線影響学会第64回大会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] Molecular characterization of radiosensitivity and radiation response of liver cancer cells2021

    • 著者名/発表者名
      Enkhbaatar Milai, Yoshihisa Matsumoto, Mikio Shimada, Kaima Tsukada, Tomoko Miyake.
    • 学会等名
      日本放射線影響学会第64回大会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] iPS細胞由来組織細胞における放射線依存的突然変異計測系の確立(Establishment of a radiation-dependent mutation measurement system for human iPS cell-derived tissue cells)2021

    • 著者名/発表者名
      徳宮 巧実, 島田 幹男, 柳原 啓見, 神﨑 訓枝, 三宅 智子, 松本 義久.
    • 学会等名
      日本放射線影響学会第64回大会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] 活性化XRCC4のSAXS構造解析とDNA修復.2021

    • 著者名/発表者名
      長谷川 真保, 西久保 開, 藤原 悟, 松尾 龍人, 松本 義久, 横谷 明徳.
    • 学会等名
      第34回日本放射光学会年会・放射光科学合同シンポジウム
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] Basic Mechanisms for DNA Double-strand Break Repair.2020

    • 著者名/発表者名
      Matsumoto Y.
    • 学会等名
      Second International School on Radiation Research (ISRR-2020)
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] 蛍光ライブセルイメージングを用いたDNA修復酵素PNKP制御メカニズム解析.2020

    • 著者名/発表者名
      塚田 海馬, 今村 力也, 島田 幹男, 石合 正道, 松本 義久.
    • 学会等名
      日本放射線影響学会第63回大会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] DNA修復酵素PNKP欠損細胞の樹立とDNA損傷・複製ストレスにおける機能解析.2020

    • 著者名/発表者名
      今村 力也, 塚田 海馬, 齊川 昂太郎, 島田 幹男, 松本 義久.
    • 学会等名
      日本放射線影響学会第63回大会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] DNA修復タンパク質XRCC4多量体のリン酸化による構造変化.2020

    • 著者名/発表者名
      西久保 開, 長谷川 真保, 泉 雄大, 藤井 健太郎, 松尾 光一, 松本 義久, 横谷 明徳.
    • 学会等名
      日本放射線影響学会第63回大会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] 肝臓がんの放射線感受性に関する分子特性.2020

    • 著者名/発表者名
      Milai Enkhbaatar, 三宅 智子, 塚田 海馬, 島田 幹男, 松本 義久.
    • 学会等名
      日本放射線影響学会第63回大会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] ヒトiPS細胞由来組織細胞における放射線依存的突然変異頻度解析.2020

    • 著者名/発表者名
      島田 幹男, 神崎 訓枝, 柳原 啓見, 三宅 智子, 松本 義久.
    • 学会等名
      日本放射線影響学会第63回大会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] DNA修復酵素PNKPの天然変性領域が担う細胞安定性における役割.2020

    • 著者名/発表者名
      齊川 昂太郎, 塚田 海馬, 今村 力也, 島田 幹男, 松本 義久.
    • 学会等名
      日本放射線影響学会第63回大会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [備考] 東京工業大学 科学技術創成研究院 ゼロカーボンエネルギー研究所 松本研究室

    • URL

      http://www.nr.titech.ac.jp/~yoshim/

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書 2021 実績報告書
  • [備考] 東京工業大学 科学技術創成研究院 先導原子力研究所 松本研究室

    • URL

      http://www.nr.titech.ac.jp/~yoshim/

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書

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公開日: 2020-04-28   更新日: 2024-01-30  

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