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新規クロマチンユニットの構造機能解析

研究課題

研究課題/領域番号 20K06599
研究種目

基盤研究(C)

配分区分基金
応募区分一般
審査区分 小区分43050:ゲノム生物学関連
研究機関東京工業大学 (2022)
東京大学 (2020-2021)

研究代表者

野澤 佳世  東京工業大学, 生命理工学院, 准教授 (10808554)

研究期間 (年度) 2020-04-01 – 2023-03-31
研究課題ステータス 完了 (2022年度)
配分額 *注記
4,420千円 (直接経費: 3,400千円、間接経費: 1,020千円)
2022年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
2021年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円)
2020年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
キーワードクライオ電子顕微鏡解析 / クロマチン / サブヌクレオソーム / 転写 / ゲノム解析
研究開始時の研究の概要

ゲノムDNAの情報はヌクレオソームを基本単位とするクロマチン構造の中に保存されており、通常ヌクレオソームはヒストンH2A、H2B、H3、H4、2分子ずつからなるヒストン8量体にDNAが左巻きに1.65回巻き付いた構造をとっている。一方、生体内にはサブヌクレオソームと呼ばれるヒストンの含有量やDNAの巻き付き方の異なる構造体が存在しており、クロマチンの高次構造とダイナミクスに多様性を与えている。本研究では、ヒストンH3、H4のみから構成されるサブヌクレオソームの高分解能構造の獲得に加え、このサブヌクレオソームをテンプレートとした転写実験、ゲノム解析、結合因子の探索を行いたいと考えている。

研究成果の概要

真核生物のゲノムDNAはディスク状のヌクレオソーム (NCP)構造に巻き取られて核内に収納されており、H2A、H2B、H3、H4の4種類のヒストン2分子ずつからなるヒストン8量体からなる均一な構造体だと考えられてきた。一方、申請者はヒトのリコンビナント・タンパク質を用いたクライオ電子顕微鏡単粒子解析を通じて、ヒストンH3、H4の2種類のみでもNCP様構造体 (H3-H4オクタソーム)が形成されることを発見した。また申請者は、出芽酵母を用いた細胞内タンパク質間架橋実験によって、H3-H4オクタソーム特異的な相互作用を検出し、H3-H4オクタソームが生体内に存在することを初めて実証した。

研究成果の学術的意義や社会的意義

NCPを構成するヒストンには多数のバリアントが存在し、その中には、がん細胞で高頻度に存在するものも報告され、ヒストン修飾がもたらすクロマチンの大規模な構造変換の破綻は、がんや生活習慣病、精神疾患などの疾患の原因となる。H3-H4オクタソームでは、DNA上のヒストンの配向が通常のNCPと全く異なるため、そのヒストン修飾のパターンも特徴的であることが想定される。本研究は、ヒストンの変異でも修飾でもなく、ヒストンの比率がゲノム機能を調節することを新たに提唱し、上述したエピジェネティクス制御の異常が関わる疾患の理解においても、新しい概念を加えられる可能性がある。

報告書

(4件)
  • 2022 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2021 実施状況報告書
  • 2020 実施状況報告書
  • 研究成果

    (13件)

すべて 2023 2022 2021 その他

すべて 国際共同研究 (2件) 雑誌論文 (3件) (うち国際共著 2件、 査読あり 2件、 オープンアクセス 3件) 学会発表 (7件) (うち国際学会 1件、 招待講演 5件) 備考 (1件)

  • [国際共同研究] Stony brook university(米国)

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [国際共同研究] Stony Brook University(米国)

    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
  • [雑誌論文] Cryo-electron microscopy structure of the H3-H4 octasome: A nucleosome-like particle without histones H2A and H2B2022

    • 著者名/発表者名
      Nozawa Kayo、Takizawa Yoshimasa、Pierrakeas Leonidas、Sogawa-Fujiwara Chizuru、Saikusa Kazumi、Akashi Satoko、Luk Ed、Kurumizaka Hitoshi
    • 雑誌名

      Proceedings of the National Academy of Sciences

      巻: 119 号: 45

    • DOI

      10.1073/pnas.2206542119

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Structural basis for p53 binding to its nucleosomal target DNA sequence2022

    • 著者名/発表者名
      Nishimura Masahiro、Takizawa Yoshimasa、Nozawa Kayo、Kurumizaka Hitoshi
    • 雑誌名

      PNAS Nexus

      巻: 1 号: 4

    • DOI

      10.1093/pnasnexus/pgac177

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Cryo-electron microscopy structure of the H3-H4 octasome without histones H2A and H2B2021

    • 著者名/発表者名
      K, Nozawa., Y, Takizawa., L, Pierrakeas., K, Saikusa., S Akashi., E, Luk., H, Kurumizaka.
    • 雑誌名

      bioRxiv

      巻: -

    • DOI

      10.1101/2021.10.27.466091

    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
    • オープンアクセス / 国際共著
  • [学会発表] Cryo-electron microscopic analysis reveal a nucleosome-like particle without histones H2A and H2B, H3-H4 octasome2023

    • 著者名/発表者名
      Kayo Nozawa, Yoshimasa Takizawa, Leonidas Pierrakeas, Chizuru Sogawa-Fujiwara, Kazumi Saikusa, Satoko Akashi, Ed Luk, Hitoshi Kurumizaka
    • 学会等名
      Chromatin Architecture: Structure and Function
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] クライオ電子顕微鏡解析から明らかになった新しいサブヌクレオソーム・H3-H4オクタソームの構造機能解析2022

    • 著者名/発表者名
      野澤 佳世、滝沢 由政、七種 和美、明石 知子、胡桃坂 仁志
    • 学会等名
      第45回日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 新しいクロマチン基盤ユニットであるH3-H4オクタソームのクライオ電子顕微鏡解析2022

    • 著者名/発表者名
      野澤 佳世、滝沢 由政、七種 和美、明石 知子、胡桃坂 仁志
    • 学会等名
      第60回生物物理年会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 新しいクロマチン基盤構造H3-H4オクタソームのクライオ電子顕微鏡解析2022

    • 著者名/発表者名
      野澤 佳世、滝沢 由政、七種 和美、明石 知子、胡桃坂 仁志
    • 学会等名
      第22回日本蛋白質科学会年会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Structural analysis of the Mediator complex in the eukaryotic transcription2021

    • 著者名/発表者名
      野澤佳世
    • 学会等名
      日本プロテオーム学会2021大会
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 遺伝子発現制御に関わるゲノム三次構造の構造機能解析2021

    • 著者名/発表者名
      野澤佳世
    • 学会等名
      第94回日本生化学会大会
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] ゲノム三次構造が遺伝子発現に与える影響2021

    • 著者名/発表者名
      野澤佳世
    • 学会等名
      第44回日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
  • [備考] 世界初・ゲノムDNAを巻き取る新しい基本単位H3-H4オクタソームを発見

    • URL

      https://www.titech.ac.jp/news/2022/065033

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書

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公開日: 2020-04-28   更新日: 2024-01-30  

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