• 研究課題をさがす
  • 研究者をさがす
  • KAKENの使い方
  1. 前のページに戻る

陸上植物において側生葉状器官の獲得を可能にした根幹原理の探索と解析

研究課題

研究課題/領域番号 20K06682
研究種目

基盤研究(C)

配分区分基金
応募区分一般
審査区分 小区分44030:植物分子および生理科学関連
研究機関東京大学

研究代表者

中山 北斗  東京大学, 大学院理学系研究科(理学部), 助教 (30610935)

研究期間 (年度) 2020-04-01 – 2024-03-31
研究課題ステータス 完了 (2023年度)
配分額 *注記
4,160千円 (直接経費: 3,200千円、間接経費: 960千円)
2023年度: 520千円 (直接経費: 400千円、間接経費: 120千円)
2022年度: 780千円 (直接経費: 600千円、間接経費: 180千円)
2021年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円)
2020年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
キーワード発生進化学 / 発生学 / 進化学 / 植物 / 葉 / 多様性 / 発生 / 進化 / シロイヌナズナ / アンボレラ / 被子植物 / Amborella trichopoda / Arabidopsis thaliana / Evo-Devo / RNA-seq / インフォマティクス / 進化発生学 / Solanum lycopersicum / 形態 / トランスクリプトーム
研究開始時の研究の概要

本研究計画は、陸上植物の中で最も反映している被子植物において、葉の獲得を可能にした分子機構を世界に先駆けて明らかにしようとするものである。植物において葉などの側生葉状器官の獲得は光合成の効率化をもたらし、放出される酸素が地球の大気組成の変化をももたらした。応募者は、これまでその詳細が全くの謎であった葉の獲得を可能にした分子機構を、進化学的観点から複数の植物群を選択し、分子生物学的手法、インフォマティクスなどを駆使して4年計画で明らかにする計画である。

研究成果の概要

本研究では、現生の被子植物の系統樹において最基部で分岐したことが明らかになっているAmborella trichopoda(アンボレラ)と最も葉の発生の分子機構が明らかになっているモデル植物であるArabidopsis thaliana(シロイヌナズナ)との、発生、形態、そしてRNA-seqによる遺伝子発現プロファイルの比較により、葉の発生に関わる遺伝子制御ネットワークが広範な被子植物の間で保存されていることを明らかにした。このことは独立に複数回獲得されたことが明らかになっている、陸上植物の葉の進化に関して、その共通性や独自性を明らかにするための基盤ができ、大きな成果であったと言える。

研究成果の学術的意義や社会的意義

研究成果の意義としては、葉の進化過程はこれまで化石研究が主であり、その進化過程も背景にある分子機構も全く明らかになっていなかった。今回の研究で被子植物において葉の発生に関わる遺伝子制御ネットワークが被子植物の間で保存されている事を明らかとし、陸上植物における葉の進化を考える上で比較基盤として利用できる点は成果と言える。またこの事は葉の発生に必要な根元的な遺伝子群を同定することに繋がるため、それらを用いて、葉を持たない植物、あるいは本来葉が発生しない部位に葉を持たせることで新奇形態の園芸植物や光合成効率を向上させた作物を作出する技術の基盤の創出を導くことができるという社会的意義も挙げられる。

報告書

(5件)
  • 2023 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2022 実施状況報告書
  • 2021 実施状況報告書
  • 2020 実施状況報告書
  • 研究成果

    (23件)

すべて 2024 2023 2022 2021 2020 その他

すべて 国際共同研究 (3件) 雑誌論文 (11件) (うち国際共著 9件、 査読あり 11件、 オープンアクセス 7件) 学会発表 (9件) (うち国際学会 2件、 招待講演 3件)

  • [国際共同研究] University of California, Davis(米国)

    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [国際共同研究] University of California, Davis(米国)

    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
  • [国際共同研究] University of California, Davis(米国)

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
  • [雑誌論文] A chromosome-level genome assembly for the amphibious plant Rorippa aquatica reveals its allotetraploid origin and mechanisms of heterophylly upon submergence2024

    • 著者名/発表者名
      Sakamoto Tomoaki、Ikematsu Shuka、Nakayama Hokuto、Mand?kov? Terezie、Gohari Gholamreza、Sakamoto Takuya、Li Gaojie、Hou Hongwei、Matsunaga Sachihiro、Lysak Martin A.、Kimura Seisuke
    • 雑誌名

      Communications Biology

      巻: 7 号: 1 ページ: 1-14

    • DOI

      10.1038/s42003-024-06088-7

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Leaf form diversity and evolution: a never-ending story in plant biology2024

    • 著者名/発表者名
      Nakayama Hokuto
    • 雑誌名

      Journal of Plant Research

      巻: - 号: 4 ページ: 547-560

    • DOI

      10.1007/s10265-024-01541-4

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Dancing in the sun: maize azimuthal canopy re-orientation for efficient light capture2024

    • 著者名/発表者名
      Jhu Min-Yao、Nakayama Hokuto
    • 雑誌名

      The Plant Cell

      巻: - 号: 5 ページ: 1568-1569

    • DOI

      10.1093/plcell/koae026

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] How to utilize comparative transcriptomics to dissect morphological diversity in plants2023

    • 著者名/発表者名
      Li Siyu、Nakayama Hokuto、Sinha Neelima R.
    • 雑誌名

      Current Opinion in Plant Biology

      巻: 76 ページ: 102474-102474

    • DOI

      10.1016/j.pbi.2023.102474

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Regulatory Genes in Plant Development: Homeobox2023

    • 著者名/発表者名
      Nakayama Hokuto、Sinha Neelima R.
    • 雑誌名

      Encyclopedia of Life Sciences

      巻: 3 ページ: 1-9

    • DOI

      10.1002/9780470015902.a0029556

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Evolution of two gene networks underlying adaptation to drought stress in the wild tomato<i>Solanum chilense</i>2023

    • 著者名/発表者名
      Wei Kai、Sharifova Saida、Zhao Xiaoyun、Sinha Neelima、Nakayama Hokuto、Tellier Aur?lien、Silva-Arias Gustavo A
    • 雑誌名

      bioRxiv

      巻: -

    • DOI

      10.1101/2023.01.18.524537

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Diversity of tomato leaf form provides novel insights into breeding2023

    • 著者名/発表者名
      Nakayama Hokuto、Ichihashi Yasunori、Kimura Seisuke
    • 雑誌名

      Breeding Science

      巻: 73 号: 1 ページ: 76-85

    • DOI

      10.1270/jsbbs.22061

    • ISSN
      1344-7610, 1347-3735
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書 2022 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Molecular mechanisms underlying leaf development, morphological diversification, and beyond2022

    • 著者名/発表者名
      Nakayama Hokuto、Leichty Aaron R、Sinha Neelima R
    • 雑誌名

      The Plant Cell

      巻: 34 号: 7 ページ: 2534-2548

    • DOI

      10.1093/plcell/koac118

    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Looking beyond the gene network ? metabolic and mechanical cell drivers of leaf morphogenesis2022

    • 著者名/発表者名
      Nakayama Hokuto、Koga Hiroyuki、Long Yuchen、Hamant Olivier、Ferjani Ali
    • 雑誌名

      Journal of Cell Science

      巻: 135 号: 8

    • DOI

      10.1242/jcs.259611

    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Leaf form diversification in an ornamental heirloom tomato results from alterations in two different HOMEOBOX genes2021

    • 著者名/発表者名
      Nakayama Hokuto、Rowland Steven D.、Cheng Zizhang、Zumstein Kristina、Kang Julie、Kondo Yohei、Sinha Neelima R.
    • 雑誌名

      Current Biology

      巻: 31 号: 21 ページ: 4788-4799.e5

    • DOI

      10.1016/j.cub.2021.08.023

    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Leaf shape is a predictor of fruit quality and cultivar performance in tomato2020

    • 著者名/発表者名
      Rowland Steven D.、Zumstein Kristina、Nakayama Hokuto、Cheng Zizhang、Flores Amber M.、Chitwood Daniel H.、Maloof Julin N.、Sinha Neelima R.
    • 雑誌名

      New Phytologist

      巻: 226 号: 3 ページ: 851-865

    • DOI

      10.1111/nph.16403

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [学会発表] Amborella trichopodaとシロイヌナズナのトランスクリプトーム/ゲノムデータを用いた被子植物の葉の獲得に関する進化発生学的研究2024

    • 著者名/発表者名
      中山北斗、塚谷裕一
    • 学会等名
      日本植物生理学会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] 「UJA留学のすゝめ2023」 日本の科学技術を推進するネットワーク構築2023

    • 著者名/発表者名
      中山北斗
    • 学会等名
      日本分子生物学会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Toward elucidating the mechanisms of angiosperm leaf evolution2023

    • 著者名/発表者名
      Hokuto Nakayama
    • 学会等名
      Taiwan-Japan Plant Biology
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Crassothonna属(キク科)の多肉葉に見られる細胞サイズの増加は核内倍化と関連する2023

    • 著者名/発表者名
      中山北斗、澤﨑賢斗、ドル有生、古賀皓之、森山安武、塚谷裕一
    • 学会等名
      日本植物学会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] Investigation of the relationship between petiole formation and the adaxial-abaxial patterning in Arabidopsis2023

    • 著者名/発表者名
      YUJIE ZHAO, 中山北斗, 塚谷裕一
    • 学会等名
      日本植物形態学会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] Exploring Genetic Regulation of Compound Leaf Development in Eudicots: A Comparative Transcriptomic Approach2023

    • 著者名/発表者名
      Siyu Li, Hokuto Nakayama, Neelima, R., Sinha
    • 学会等名
      The American Society of Plant Biologists
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 被子植物の葉の獲得とその形態の多様化に関する進化発生生物学研究2022

    • 著者名/発表者名
      中山北斗
    • 学会等名
      日本植物学会
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 現生被子植物の最基部で分岐した系統であるAmborella trichopodaを用いたトランスクリプトーム解析2021

    • 著者名/発表者名
      中山北斗、塚谷裕一
    • 学会等名
      日本植物学会 第85回
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
  • [学会発表] 現生被子植物の系統樹上で最基部に位置するAmborella trichopodaを用いた葉の獲得に関わる進化発生学的研究2020

    • 著者名/発表者名
      中山北斗、塚谷裕一
    • 学会等名
      日本植物生理学会
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書

URL: 

公開日: 2020-04-28   更新日: 2025-01-30  

サービス概要 検索マニュアル よくある質問 お知らせ 利用規程 科研費による研究の帰属

Powered by NII kakenhi