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高温応答遺伝子領域と転写活性の高い核内領域の解析から熱記憶構築機構の解明を目指す

研究課題

研究課題/領域番号 20K15836
研究種目

若手研究

配分区分基金
審査区分 小区分44040:形態および構造関連
研究機関山形大学 (2021-2022)
東京大学 (2020)

研究代表者

澁田 未央 (笠松未央)  山形大学, 理学部, 助教 (30849790)

研究期間 (年度) 2020-04-01 – 2023-03-31
研究課題ステータス 完了 (2022年度)
配分額 *注記
4,160千円 (直接経費: 3,200千円、間接経費: 960千円)
2022年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
2021年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
2020年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円)
キーワードイメージング / 熱ストレス / 翻訳後修飾 / RNAポリメラーゼII / 核構造 / クロマチンダイナミクス / 転写制御 / シロイヌナズナ / ライブイメージング / 画像解析 / ストレス応答 / エピジェネティック修飾 / 核 / 熱記憶 / RNAポリメラーゼ II / 核内構造 / 高温応答
研究開始時の研究の概要

植物は過去の高温ストレスを記憶し、次回ストレスに晒された際により効率的に応答することができる。「記憶」の構築には、エピジェネティック修飾制御が重要な役割を持つことが明らかにされたが、その過程における遺伝子配置ダイナミクスについての核内形態および構造学的な研究は技術的な問題から未だ不十分である。本研究では蛍光イメージングを主な解析手法とし、翻訳後修飾のライブイメージングツールやシングルコピー遺伝子の可視化法を取り入れることで核内転写活性環境フレームワークの構築メカニズムの解明を目指す。

研究成果の概要

植物は一度高温ストレスを感じるとそれを記憶し、次に同様のストレスを感じた際により効率的に対処することができる。高温ストレスにおけるクロマチン動態の構造学的な研究は技術的な問題から不十分であった。本研究ではシロイヌナズナに翻訳後修飾のライブイメージング手法を導入し、転写制御メカニズムの解明に取り組んだ。転写活性状態を示すRNA ポリメラーゼ II (PolII)のリン酸化修飾の観察手法を確立し、その成果を論文発表した。NGS解析から高温ストレス時の素早い転写応答にはPolII修飾制御が関与することが示唆された。今後はPolII制御因子を研究対象に、転写活性領域の核内分布変化を中心に解析を進める。

研究成果の学術的意義や社会的意義

本研究で構築した転写活性レベルイメージングシステムは植物にとどまらず様々な真核生物に応用可能であり、ストレス応答、発生・再生といった生命現象の研究や翻訳後修飾ダイナミクスに着目した創薬開発の促進に貢献できると考えられる。また転写活性領域制御への関与が示唆されたRNAポリメラーゼII-C末端領域修飾による転写制御と、知見の豊富な転写因子による転写制御とのクロストークの解析を進めることで、多層的で緻密な転写制御機構の解明が期待できる。

報告書

(4件)
  • 2022 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2021 実施状況報告書
  • 2020 実施状況報告書
  • 研究成果

    (10件)

すべて 2023 2022 2021 2020 その他

すべて 雑誌論文 (1件) (うち査読あり 1件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (8件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] A live imaging system to analyze spatiotemporal dynamics of RNA polymerase II modification in Arabidopsis thaliana2021

    • 著者名/発表者名
      M. Shibuta, T. Sakamoto, T. Yamaoka, M. Yoshikawa, S. Kasamatsu, N. Yagi, S. Fujimoto, T. Suzuki, S. Uchino, Y. Sato. H. Kimura, and S. Matsunaga
    • 雑誌名

      Communications Biology

      巻: 4 号: 1 ページ: 580-580

    • DOI

      10.1038/s42003-021-02106-0

    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] RNAポリメラーゼII-C末端ドメイン修飾酵素過剰発現細胞における転写活性領域の観察2023

    • 著者名/発表者名
      澁田未央
    • 学会等名
      第64回日本植物生理学会年会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] RNAポリメラーゼII-C末端ドメイン脱リン酸化酵素による転写活性領域制御機構の解明2022

    • 著者名/発表者名
      澁田未央
    • 学会等名
      東北植物学会第12回大会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] シロイヌナズナにおけるヒストン修飾H3K4me3のライブイメージング解析2022

    • 著者名/発表者名
      松岡慈、坂本卓也、澁田未央、佐藤優子、木村宏、松永幸大
    • 学会等名
      日本植物学会第86回大会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] RNAポリメラーゼII-CTD修飾の核内分布の観察2021

    • 著者名/発表者名
      澁田未央,坂本卓也,松永幸大
    • 学会等名
      日本植物形態学会第33回総会・大会
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
  • [学会発表] RNAポリメラーゼII-CTD修飾の核内分布から転写活性の高い核内領域を読み解く2021

    • 著者名/発表者名
      澁田未央,坂本卓也,松永幸大
    • 学会等名
      日本植物学会第85回大会
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
  • [学会発表] ヒストン修飾およびPolII-CTD修飾のイメージングと画像解析から時空間的転写ステータスを読み解く2021

    • 著者名/発表者名
      澁田未央,松岡慈、坂本卓也,松永幸大
    • 学会等名
      東北植物学会第11回大会
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
  • [学会発表] ヒストン修飾や RNA ポリメラーゼ II 修飾のライブイメージングシステムの構築2021

    • 著者名/発表者名
      澁田未央 、吉川真由、山岡珠子、坂本卓也 、木村宏 、松永幸大
    • 学会等名
      第62回日本植物生理学会
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
  • [学会発表] RNA ポリメラーゼ II セリン2リン酸化のライブイメージングシステムの構築2020

    • 著者名/発表者名
      澁田未央 、吉川真由、山岡珠子、坂本卓也 、木村宏 、松永幸大
    • 学会等名
      第43回日本分子生物学会
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
  • [備考] 細胞内抗体プローブを用いて 遺伝子の転写が活性化している細胞を生体内で特定することに成功

    • URL

      https://www.yamagata-u.ac.jp/jp/information/press/20210518_01/

    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書

URL: 

公開日: 2020-04-28   更新日: 2024-01-30  

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