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新規マスター転写因子ELF3による肺小細胞癌のサブタイプ化とその臨床的意義の解明

研究課題

研究課題/領域番号 20K16440
研究種目

若手研究

配分区分基金
審査区分 小区分50020:腫瘍診断および治療学関連
研究機関金沢大学 (2022)
大阪大学 (2020-2021)

研究代表者

堀江 真史  金沢大学, 医学系, 准教授 (60732659)

研究期間 (年度) 2020-04-01 – 2023-03-31
研究課題ステータス 完了 (2022年度)
配分額 *注記
4,160千円 (直接経費: 3,200千円、間接経費: 960千円)
2022年度: 780千円 (直接経費: 600千円、間接経費: 180千円)
2021年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円)
2020年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円)
キーワードELF3 / ATAC-seq / CUT&Tag / スーパーエンハンサー / ASCL1 / 肺小細胞癌 / マスター転写因子 / 個別化医療 / エピゲノム / エピジェネティクス
研究開始時の研究の概要

肺小細胞癌(SCLC:small cell lung cancer)は悪性度の高い難治性癌であり、約30年間治療法が殆ど進歩していない。近年ではマスター転写因子の発現および転写制御パターンによる癌のサブグループ化の臨床的妥当性が示され、予後や治療応答性との関連が明らかにされてきている。申請者はマスター転写因子に基づいたSCLCの類型化について解析を行ってきた。本研究ではSCLCにおけるマスター転写因子ELF3に注目し、その機能および転写制御メカニズムの全貌を明らかにし、さらにELF3の病的意義やバイオマーカーとしての有用性を検討する。

研究成果の概要

ELF3を高発現するSCLC等の3細胞株を用いて、ATAC-seqによるオープンクロマチン解析 、及びCUT&Tagによる網羅的ヒストン修飾解析を行い、ELF3がASCL1型のSCLCにおいてスーパーエンハンサー関連転写因子として機能していることを明らかにした。また抗ELF3特異的抗体を用いたCUT&Tag、及びsiRNAを用いたknockdown RNA-seqを行い、ELF3により制御される234遺伝子を同定した。さらにpathway解析やin vitro実験による検証を行い、ELF3ががん細胞の生存や細胞周期を制御し、悪性化に寄与していることを明らかにした。

研究成果の学術的意義や社会的意義

ELF3はASCL1型のSCLCではスーパーエンハンサー関連転因子として腫瘍促進的な役割を果たすことが示された。ELF3は膀胱癌や十二指腸癌ではがん抑制遺伝子として働いており、がん抑制促進の2面性を持つcontext-dependentな転写因子であることが本研究により明らかになった。

報告書

(4件)
  • 2022 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2021 実施状況報告書
  • 2020 実施状況報告書
  • 研究成果

    (1件)

すべて 2023

すべて 雑誌論文 (1件) (うち査読あり 1件、 オープンアクセス 1件)

  • [雑誌論文] An integrative epigenomic approach identifies ELF3 as an oncogenic regulator in ASCL1‐positive neuroendocrine carcinoma2023

    • 著者名/発表者名
      Horie M, Tanaka H, Suzuki M, Sato Y, Takata S, Takai E, Miyashita N, Saito A, Nakatani Y, Yachida S
    • 雑誌名

      Cancer Science

      巻: - 号: 6 ページ: 2596-2608

    • DOI

      10.1111/cas.15764

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス

URL: 

公開日: 2020-04-28   更新日: 2024-01-30  

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