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多数のコホートに適応可能な強い汎化性能を持ったRadiomics解析方法の開発

研究課題

研究課題/領域番号 20K17982
研究種目

若手研究

配分区分基金
審査区分 小区分56010:脳神経外科学関連
研究機関国立研究開発法人理化学研究所

研究代表者

高橋 慧  国立研究開発法人理化学研究所, 革新知能統合研究センター, 研究員 (00852120)

研究期間 (年度) 2020-04-01 – 2022-03-31
研究課題ステータス 完了 (2021年度)
配分額 *注記
4,160千円 (直接経費: 3,200千円、間接経費: 960千円)
2021年度: 1,040千円 (直接経費: 800千円、間接経費: 240千円)
2020年度: 3,120千円 (直接経費: 2,400千円、間接経費: 720千円)
キーワード深層学習 / MRI / Radiomics / glioma / Radiogenomics / Deep learning / Glioma / Domain shift / 機械学習 / 神経膠腫 / domain shift / 医療用画像
研究開始時の研究の概要

神経膠腫の腫瘍特性の予測においてRadiomics解析は有用な方法と考えられている。しかしながら施設毎に得られるデータの分布が異なるため、あるコホートのデータで学習し高い予測精度を示した予測機を別のコホートに適用した場合に大きく性能が低下するという問題が生じる。この問題はRadiomics解析を社会実装する上で非常に大きな問題であるが、データの希少性から殆ど研究が行われていない。本研究では公開データを学習用データとして用いて機械学習装置を作成し、多施設のデータをテスト用のデータとして用いて多数のコホートに適応可能な強い汎化性能を持った神経膠腫に対するRadiomics解析方法の開発を行う。

研究成果の概要

この研究は神経膠腫の遺伝子変異をMagnetic Resonance Imaging (MRI)で予測する方法を開発することを目的としています。このような試みはradiogenomicsと呼ばれており有望視されていますが撮影場所の違いで性能が大きく落ちることが予想されています。これは専門家の間でdomain shift problemとして認識されています。我々はまずMRIの腫瘍部分を囲むタスクでdomain shift problemが起こることを示した上でその解決方法を提示しました。またradiogenomicsにおいてもdomain shift problemが起こることを確認しました。

研究成果の学術的意義や社会的意義

社会意義神経膠腫は脳腫瘍の一群で、脳腫瘍の中では発生頻度が高いです。神経膠腫はその分類によって予後が変わります。そして神経膠腫の診断では遺伝子診断が重要視されています。現在この遺伝子診断を行うため開頭手術を行い腫瘍を入手していますがこれは患者さんにとって大きな負担になります。我々の研究は開頭手術を行わずにMRIのみを用いて遺伝子状態を予測するような予測装置を作ること、特にその実装を阻んでいる施設間の細かな画像の違いを乗り越える方法を開発することを目的にしています。この方法を開発することができれば遺伝子変異の有無を手術前に予測できるので患者さんの負担を大きく減らすことができると考えられています。

報告書

(3件)
  • 2021 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2020 実施状況報告書
  • 研究成果

    (15件)

すべて 2021 2020

すべて 雑誌論文 (4件) (うち査読あり 4件、 オープンアクセス 4件) 学会発表 (9件) (うち国際学会 1件) 図書 (2件)

  • [雑誌論文] Assessing Versatile Machine Learning Models for Glioma Radiogenomic Studies across Hospitals2021

    • 著者名/発表者名
      Kawaguchi Risa K.、Takahashi Masamichi、Miyake Mototaka、Kinoshita Manabu、Takahashi Satoshi、Ichimura Koichi、Hamamoto Ryuji、Narita Yoshitaka、Sese Jun
    • 雑誌名

      Cancers

      巻: 13 号: 14 ページ: 3611-3611

    • DOI

      10.3390/cancers13143611

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Fine-tuning approach for segmentation of gliomas in brain magnetic resonance images with a machine learning method to normalize image differences among facilities2021

    • 著者名/発表者名
      Takahashi Satoshi、Takahashi Masamichi、Kinoshita Manabu、et al
    • 雑誌名

      Cancers

      巻: 13 号: 6 ページ: 1

    • DOI

      10.3390/cancers13061415

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] A New Era of Neuro-Oncology Research Pioneered by Multi-Omics Analysis and Machine Learning2021

    • 著者名/発表者名
      Takahashi Satoshi、Takahashi Masamichi、Tanaka Shota、Takayanagi Shunsaku、Takami Hirokazu、Yamazawa Erika、Nambu Shohei、Miyake Mototaka、Satomi Kaishi、Ichimura Koichi、Narita Yoshitaka、Hamamoto Ryuji
    • 雑誌名

      Biomolecules

      巻: 11 号: 4 ページ: 565-565

    • DOI

      10.3390/biom11040565

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Predicting Deep Learning Based Multi-Omics Parallel Integration Survival Subtypes in Lung Cancer Using Reverse Phase Protein Array Data2020

    • 著者名/発表者名
      Takahashi Satoshi、Asada Ken、Takasawa Ken、Shimoyama Ryo、Sakai Akira、Bolatkan Amina、Shinkai Norio、Kobayashi Kazuma、Komatsu Masaaki、Kaneko Syuzo、Sese Jun、Hamamoto Ryuji
    • 雑誌名

      Biomolecules

      巻: 10 号: 10 ページ: 1460-1460

    • DOI

      10.3390/biom10101460

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] 多施設間の画像差に対して頑強なセグメンテーション方法の開発2021

    • 著者名/発表者名
      高橋 慧
    • 学会等名
      第3回日本メディカルAI学会学術総会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] Initial Result of Develop Robust Deep Learning Model for Detecting Genomic Status in Gliomas Against Image Differences among Facilities2021

    • 著者名/発表者名
      Satoshi Takahashi
    • 学会等名
      SNO 20222 Anual meeting
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] Development of an automatic segmentation machine learning model for brain tumor MR images that can be used at multiple domains2021

    • 著者名/発表者名
      Satoshi Takahashi
    • 学会等名
      JCA-AACR joint meeting
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] ドメインシフトによる性能の低下に耐えうる脳腫瘍領域の自動segmentation法の開発2021

    • 著者名/発表者名
      高橋 慧
    • 学会等名
      生命医薬情報学連合大会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] Initial Investigation to Developing Robust Deep Learning Model Against Image Differences among Facilities2021

    • 著者名/発表者名
      高橋 慧
    • 学会等名
      第59回癌治療学会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] 多施設にて適応可能な頑強なMRIを用いた遺伝子 診断方法の為の初期検討2021

    • 著者名/発表者名
      高橋 慧
    • 学会等名
      脳神経外科学会学術総会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] 多施設間の画像差を埋めるFine-tuning方法の開発2020

    • 著者名/発表者名
      高橋 慧
    • 学会等名
      第79回日本癌学会学術総会
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
  • [学会発表] 多施設にて使用可能な脳腫瘍領域の自動segmentation法の開発2020

    • 著者名/発表者名
      高橋 慧
    • 学会等名
      日本脳神経外科学会第79回学術総会
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
  • [学会発表] Developing automatic segmentation method for brain tumor MR images that can be used at multiple facilities2020

    • 著者名/発表者名
      Takahashi Satoshi、Takahashi Masamichi、Hamamoto Ryuji et.al.
    • 学会等名
      2020 SNO Annual Meeting
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [図書] アロスエルゴン Vol.1 No.3 AIの入門から応用、将来の展望ー医療の現場に進出するAIに対処するために2021

    • 著者名/発表者名
      鎌谷直之、田中順治、冨田桂公、高橋 慧、高橋雅道、岩藤和広、佐野元昭、猪俣武範、國吉保孝、福永 淳、松根彰志、安藤智暁、柳  裕一郎
    • 総ページ数
      128
    • 出版者
      クリニコ出版
    • ISBN
      9784910396187
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [図書] 医学のあゆみ274巻9号 AIが切り拓く未来の医療2020

    • 著者名/発表者名
      浜本 隆二
    • 総ページ数
      224
    • 出版者
      医歯薬出版
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書

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公開日: 2020-04-28   更新日: 2023-01-30  

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