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生体内分子イベントを指標とした老化要因物質の高速発光判定基盤技術の創成

研究課題

研究課題/領域番号 20K21851
研究種目

挑戦的研究(萌芽)

配分区分基金
審査区分 中区分63:環境解析評価およびその関連分野
研究機関国立研究開発法人産業技術総合研究所

研究代表者

金 誠培  国立研究開発法人産業技術総合研究所, エネルギー・環境領域, 主任研究員 (60470043)

研究分担者 小林 紀郎  国立研究開発法人理化学研究所, 情報システム本部, ユニットリーダー (20415160)
桝屋 啓志  国立研究開発法人理化学研究所, バイオリソース研究センター, 室長 (40321814)
研究期間 (年度) 2020-07-30 – 2022-03-31
研究課題ステータス 完了 (2021年度)
配分額 *注記
6,500千円 (直接経費: 5,000千円、間接経費: 1,500千円)
2021年度: 3,250千円 (直接経費: 2,500千円、間接経費: 750千円)
2020年度: 3,250千円 (直接経費: 2,500千円、間接経費: 750千円)
キーワード発光 / イメージング / 化学物質 / バイオアッセイ / セマンティックウェブ / In Silico / 健康リスク / スクリーニング / 生物発光 / 可視化 / 発光プローブ / 環境リスク / 老化要因物質 / 一分子型生物発光プロ ーブ / AI / ランキング
研究開始時の研究の概要

近年、一部の化学物質が寿命に影響することが各種動物実験などで明らかになっており、その分子機序には炎症・酸化・脂質代謝系の核内受容体が深く関与していることが示され
た。本研究では、不特定多数の化学物質を対象に老化要因活性を知識推論アルゴリズム(AI)を用いて効果的に絞り込む。その上位ランクの小分子化学物質を対象に、老化に関わる3大分子イベントを可視化する一分子型発光プローブを設計し、その発光色を指標に「老化要因活性」を高速かつ簡便に判定する発光プラットフォームを創生する。

研究成果の概要

本研究期間中、まずデータベース規模(約5万種)の化学物質から潜在的な環境リスクを推定するIn Silico探索実験を行い、リスク候補群をランク付けた。その上位ランクの化学物質に対し、産総研独自の高速発光スクリーニングによりリスク評価を行った。
これらの実験の結果、高速発光スクリーニングに用いる新規発光基質の開発、老化要因物質などのリスク候補化学物質に応答する一分子型発光プローブ類の開発、化学物質の多色発光イメージングポートフォリオの開発などができた。これらを纏め、11報の専門誌論文発表(一部は出版待ち)、研究総説、特許出願、3冊の単行本出版(一部は出版待ち)などの成果を得た。

研究成果の学術的意義や社会的意義

生涯にわたる化学物質の非意図的な曝露は潜在的な健康リスクである。当研究は、データベース規模の化学物質より老化要因物質などの健康リスクを効果的に評価する手法を提示するものである。今回のIn Silico研究とWet実験系の技術的融合と連携プレイにより、これまで不可能と思われたデータベース規模の化学物質を対象に、健康リスクという物差しで定量評価できた。今後、化学物質のリスク評価分野において技術的ブレイクスルーを引き起こすことを期待している。また本研究結果は、一般市民にも、化学物質選択の際に、「老化要因性」のような健康リスクを判断資料の一つとして提案するものであり、今後の社会変革に資する研究である。

報告書

(3件)
  • 2021 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2020 実施状況報告書
  • 研究成果

    (32件)

すべて 2022 2021 2020 その他

すべて 雑誌論文 (13件) (うち国際共著 6件、 査読あり 13件、 オープンアクセス 2件) 学会発表 (5件) 図書 (10件) 備考 (1件) 産業財産権 (3件)

  • [雑誌論文] One-Channel Microsliding Luminometer for Quantifying Low-Energy Bioluminescent Lights2022

    • 著者名/発表者名
      Sung Bae Kim, Ramasamy Paulmurugan
    • 雑誌名

      Methods Mol Biol

      巻: 2525 ページ: 365-375

    • DOI

      10.1007/978-1-0716-2473-9_28

    • ISBN
      9781071624722, 9781071624739
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Visible Light Bioluminescence Imaging Platform for Animal Cell Imaging2022

    • 著者名/発表者名
      Nobuo Kitada, Shojiro Maki, Sung Bae Kim
    • 雑誌名

      Methods Mol Biol

      巻: 2524

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Compact Eight-Channel Light-Sensing System for Bioassays2022

    • 著者名/発表者名
      Sung Bae Kim, Sharon Seiko Hori, Negar Sadeghipour, Uday Kumar Sukumar, Ramasamy Paulmurugan
    • 雑誌名

      Methods Mol Biol

      巻: 2525 ページ: 377-386

    • DOI

      10.1007/978-1-0716-2473-9_29

    • ISBN
      9781071624722, 9781071624739
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Quantitative imaging of retinoic acid activities in living mammalian cells2022

    • 著者名/発表者名
      Sung Bae Kim, Rika Fujii, Ramasamy Paulmurugan
    • 雑誌名

      Methods Mol Biol

      巻: 2525 ページ: 111-122

    • DOI

      10.1007/978-1-0716-2473-9_8

    • ISBN
      9781071624722, 9781071624739
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Molecular Tension Probe for In Vitro Bioassays2022

    • 著者名/発表者名
      Sung-Bae Kim, Rika Fujii, Simon Miller, Mikio Tanabe
    • 雑誌名

      Methods Mol Biol

      巻: 2524 ページ: 91-103

    • DOI

      10.1007/978-1-0716-2453-1_7

    • ISBN
      9781071624524, 9781071624531
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Bioluminescent Imaging Systems for Assay Developments2021

    • 著者名/発表者名
      KIM Sung-Bae、PAULMURUGAN Ramasamy
    • 雑誌名

      Analytical Sciences

      巻: 37 号: 2 ページ: 233-247

    • DOI

      10.2116/analsci.20R003

    • NAID

      130007983504

    • ISSN
      0910-6340, 1348-2246
    • 年月日
      2021-02-10
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書 2020 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Color-tunable bioluminescence imaging portfolio for cell imaging2021

    • 著者名/発表者名
      Tamaki Shota、Kitada Nobuo、Kiyama Masahiro、Fujii Rika、Hirano Takashi、Kim Sung Bae、Maki Shojiro
    • 雑誌名

      Scientific Reports

      巻: 11 号: 1 ページ: 2219-2219

    • DOI

      10.1038/s41598-021-81430-1

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書 2020 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Ligand-Activatable BRET9 Probes for Imaging Molecular Events in Living Mammalian Cells2021

    • 著者名/発表者名
      Kim Sung-Bae、Fujii Rika、Paulmurugan Ramasamy
    • 雑誌名

      Methods Mol Biol

      巻: 2274 ページ: 261-270

    • DOI

      10.1007/978-1-0716-1258-3_22

    • ISBN
      9781071612576, 9781071612583
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Highly Bright NIR-BRET System for Imaging Molecular Events in Live Cells2021

    • 著者名/発表者名
      Nishihara Ryo、Suzuki Koji、Kim Sung-Bae、Paulmurugan Ramasamy
    • 雑誌名

      Methods Mol Biol

      巻: 2274 ページ: 247-259

    • DOI

      10.1007/978-1-0716-1258-3_21

    • ISBN
      9781071612576, 9781071612583
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Luciferase-Specific Coelenterazine Analogues for Optical Cross Talk-Free Bioassays2021

    • 著者名/発表者名
      Nishihara Ryo、Abe Masahiro、Suzuki Koji、Kim Sung-Bae
    • 雑誌名

      Methods Mol Biol

      巻: 2274 ページ: 127-138

    • DOI

      10.1007/978-1-0716-1258-3_12

    • ISBN
      9781071612576, 9781071612583
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Azide- and Dye-Conjugated Coelenterazine Analogues for Imaging Mammalian Cells2021

    • 著者名/発表者名
      Nishihara Ryo、Hoshino Emi、Kakudate Yoshiki、Suzuki Koji、Kim Sung-Bae
    • 雑誌名

      Methods Mol Biol

      巻: 2274 ページ: 111-126

    • DOI

      10.1007/978-1-0716-1258-3_11

    • ISBN
      9781071612576, 9781071612583
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Near-Infrared Bioluminescence Imaging of Animal Cells with Through-Bond Energy Transfer Cassette2021

    • 著者名/発表者名
      Abe Masahiro、Nishihara Ryo、Kim Sung-Bae、Suzuki Koji
    • 雑誌名

      Methods Mol Biol

      巻: 2274 ページ: 103-110

    • DOI

      10.1007/978-1-0716-1258-3_10

    • ISBN
      9781071612576, 9781071612583
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] A New Lineage of Artificial Luciferases for Mammalian Cell Imaging2021

    • 著者名/発表者名
      Kim Sung-Bae、Fujii Rika
    • 雑誌名

      Methods Mol Biol

      巻: 2274 ページ: 43-51

    • DOI

      10.1007/978-1-0716-1258-3_5

    • ISBN
      9781071612576, 9781071612583
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] Highly Sensitive Eight-Channel Light Sensing System for Biomedical Applications2020

    • 著者名/発表者名
      金 誠培、Sharon Hori、Ramasamy Paulmurugan
    • 学会等名
      日本分析化学会、第69回年会
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
  • [学会発表] In vitro Determiantion of Rapamycin-Triggered FKBP-FRB Interactions Using a Molecular Tension Probe2020

    • 著者名/発表者名
      金 誠培、西原 諒、鈴木 孝治
    • 学会等名
      日本分析化学会、第69回年会
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
  • [学会発表] Color-Tunable Bioluminescence Imaging Platform for Cell Imaging2020

    • 著者名/発表者名
      金 誠培、北田 昇雄、牧 昌次郎
    • 学会等名
      日本分析化学会、第69回年会
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
  • [学会発表] Luciferase-Specific Coelenterazine Analogues for Optical Contamination-Free Bioassays2020

    • 著者名/発表者名
      金 誠培、西原 諒、Daniel Citterio
    • 学会等名
      日本分析化学会、第69回年会
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
  • [学会発表] Fabrication of a New Lineage of Artificial Luciferases from Natural Luciferase Pools2020

    • 著者名/発表者名
      金 誠培、西原 諒、 Daniel Citterio、鈴木 孝治
    • 学会等名
      日本分析化学会、第69回年会
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
  • [図書] Bioluminescence: Methods and Protocols, Volume 12022

    • 著者名/発表者名
      Sung-Bae Kim (Ed.)
    • 総ページ数
      504
    • 出版者
      Humana Press
    • ISBN
      9781071624524
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [図書] Bioluminescence: Methods and Protocols, Volume 22022

    • 著者名/発表者名
      Sung-Bae Kim (Ed.)
    • 総ページ数
      444
    • 出版者
      Humana Press
    • ISBN
      9781071624722
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [図書] Live Cell Imaging: Methods and Protocols (Methods in Molecular Biology, 22742021

    • 著者名/発表者名
      Sung-Bae Kim (Ed.)
    • 総ページ数
      461
    • 出版者
      Humana Press
    • ISBN
      9781071612576
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [図書] Live Cell Imaging”2020

    • 著者名/発表者名
      Sung-Bae Kim
    • 総ページ数
      447
    • 出版者
      Springer US
    • ISBN
      9781071612576
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
  • [図書] Chapter 5 “A New Lineage of Artificial Luciferases for Mammalian Cell Imaging”2020

    • 著者名/発表者名
      Sung-Bae Kim, Rika Fujii
    • 総ページ数
      9
    • 出版者
      Springer US
    • ISBN
      9781071612576
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
  • [図書] Chapter 10 “Near Infrared Bioluminescence Imaging of Animal Cells with Through-Bond Energy Transfer Cassette”2020

    • 著者名/発表者名
      Masahiro Abe, Ryo Nishihara, Sung-Bae Kim, Koji Suzuki
    • 総ページ数
      7
    • 出版者
      Springer US
    • ISBN
      9781071612576
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
  • [図書] Chapter 11 “Azide- and Dye-Conjugated Coelenterazine Analogues for Imaging Mammalian Cells”2020

    • 著者名/発表者名
      Ryo Nishihara, Emi Hoshino, Yoshiki Kakudate, Koji Suzuki, Sung-Bae Kim
    • 総ページ数
      15
    • 出版者
      Springer US
    • ISBN
      9781071612576
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
  • [図書] Chapter 12 “Luciferase-Specific Coelenterazine Analogues for Optical Cross-talk-Free Bioassays”2020

    • 著者名/発表者名
      Ryo Nishihara, Masahiro Abe, Koji Suzuki, Sung-Bae Kim
    • 総ページ数
      12
    • 出版者
      Springer US
    • ISBN
      9781071612576
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
  • [図書] Chapter 21 “Highly bright NIR-BRET system for imaging molecular events in live cells”2020

    • 著者名/発表者名
      Ryo Nishihara, Koji Suzuki, Sung-Bae Kim, Ramasamy Paulmurugan
    • 総ページ数
      13
    • 出版者
      Springer US
    • ISBN
      9781071612576
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
  • [図書] Chapter 22 “Ligand-Activatable BRET9 Probes for Imaging Molecular Events in Living Mammalian Cells”2020

    • 著者名/発表者名
      Sung-Bae Kim, Rika Fujii, Ramasamy Paulmurugan
    • 総ページ数
      9
    • 出版者
      Springer US
    • ISBN
      9781071612576
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
  • [備考] 全可視光領域で発色する虹色発光標識のポートフォリオを開発

    • URL

      https://www.aist.go.jp/aist_j/press_release/pr2021/pr20210126_2/pr20210126_2.html

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
  • [産業財産権] 新規セレンテラジン誘導体2022

    • 発明者名
      金誠培、牧昌次郎、北田昇雄
    • 権利者名
      産総研と電通大
    • 産業財産権種類
      特許
    • 出願年月日
      2022
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [産業財産権] 生物発光酵素の長波長発光基質2020

    • 発明者名
      金誠培 牧昌次郎 北田昇雄
    • 権利者名
      国研)産業技術総合研究所と国大)電気通信大学
    • 産業財産権種類
      特許
    • 出願年月日
      2020
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
  • [産業財産権] マルチチャンネル光検出装置2020

    • 発明者名
      金誠培
    • 権利者名
      国立研究開発法人産業技術総合研究所
    • 産業財産権種類
      特許
    • 出願年月日
      2020
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書

URL: 

公開日: 2020-08-03   更新日: 2023-01-30  

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