生物医学研究推進のためのカニクイザルMHC多型情報基盤の整備

• 研究課題/領域番号: 21300155
• 研究種目: 基盤研究(B)
• 配分区分: 補助金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 実験動物学
• 研究機関: 東海大学
• 研究代表者: 椎名 隆 東海大学, 医学部, 准教授 (00317744)
• 研究分担者: 安藤 麻子 東海大学, 医学部, 准教授 (40101935) ; 鳥居 隆三 滋賀医科大学, 動物生命科学研究センター, 教授 (50106647) ; 土屋 英明 滋賀医科大学, 動物生命科学研究センター, 助教 (10378440) ; 伊藤 靖 滋賀医科大学, 医学部, 准教授 (90324566) ; 小笠原 一誠 滋賀医科大学, 医学部, 教授 (20169163) ; 細道 一善 国立遺伝学研究所, 総合遺伝研究系人類遺伝研究部門, 助教 (50420948) ; 太田 正穂 信州大学, 医学部, 准教授 (50115333)
• 研究期間 (年度): 2009 – 2011
• 研究課題ステータス: 完了 (2011年度)
• 配分額: 17,160千円 (直接経費: 13,200千円、間接経費: 3,960千円); 2011年度: 4,940千円 (直接経費: 3,800千円、間接経費: 1,140千円); 2010年度: 4,940千円 (直接経費: 3,800千円、間接経費: 1,140千円); 2009年度: 7,280千円 (直接経費: 5,600千円、間接経費: 1,680千円)
• キーワード: 遺伝育種 / カニクイザル / MHC / 再生医療 / 多型 / 薬剤感受性

研究概要

カニクイザルMHCクラスIおよびII遺伝子における多型解析法の開発ならびに200個体を用いたジェノタイピングから、新規アリルを同定し、MHCハプロタイプを推定した。また次世代シークエンサーを用いたMHCタイピング法を開発し、1, 222頭のカニクイザルを用いて比較的頻度の高いMHCアリルを有するMHCホモ接合体ならびにMHCヘテロ接合体を検索した結果、5頭のMHCホモ接合体ならびに43頭のMHCヘテロ接合体を特定した。さらに上記以外のMHCホモ接合体を検索した結果、計23頭のMHCホモ接合体を特定した。したがって本研究課題では、MHC多型の特徴付けとともにその選抜個体を生物医学研究に提供しうる環境基盤を構築した。

研究成果

• [雑誌論文] Memory Immune Responses Against Pandemic 1(H1N1) 2009 Influenza Virus Induced by a Whole Particle Vaccine in Cynomolgus Monkeys Carrying Mafa-A1 052 : 02 (2012)
  • 著者名/発表者名: Arikata M, Itoh Y, Okamatsu M, Maeda T, Shiina T, Tanaka K, Suzuki S, Nakayama M, Sakoda Y, Ishigaki H, Takada A, Ishida H, Soda K, Pham VL, Tsuchiya H, Nakamura S, Torii R, Shimizu T, Inoko H, Ohkubo I, Kida H, Ogasawara K
  • 雑誌名: PLoS ONE 巻: 7
  • 査読あり
• [雑誌論文] Application of high-resolution, massively parallel pyrosequencing for estimation of haplotypes and gene expression levels of swine leukocyte antigen (SLA) class I genes (2012)
  • 著者名/発表者名: Kita YF, et al
  • 雑誌名: Immunogenetics 巻: 64 ページ: 187-199
  • 査読あり
• [雑誌論文] Establishment of exome sequencing of cynomolgus macaque(Macaca fascicularis) (2011)
  • 著者名/発表者名: Suzuki S, Hosomichi K, Otabe K, Sakamoto K, Kurata M, Nomura M, Yamanaka H, Nakagawa H, Ota M, Inoko H, Inoue I, Shiina T
  • 雑誌名: DNA Polymorphism 巻: 19 ページ: 230-234
• [雑誌論文] Analysis of MHC class II gene polymorphisms(Mafa-DR-DQ genes) in Cynomolgus Macaques(Macaca fascicularis) originated from Philippine islands (2011)
  • 著者名/発表者名: Ota M, Tanaka T, Katsuyama Y, Kita Y, Otabe K, Sakamoto K, Kurata M, Nomura M, Yamanaka H, Nakagawa H, Asamura H, Inoko H, Shiina T
  • 雑誌名: DNA Polymorphism 巻: 19 ページ: 47-49
  • NAID: 10029668569
• [雑誌論文] Comparative genome analysis of the major histocompatibility complex (MHC) class i B/C segments in primates elucidated by genomic sequencing in common marmoset (Callithrix jacchus) (2011)
  • 著者名/発表者名: Shiina, T., Kono, A., Westphal, N., Suzuki, S., Hosomichi, K., Kita, Y.F, Roos, et al
  • 雑誌名: Immunogenetics 巻: 63:8 号: 8 ページ: 485-499
  • DOI: 10.1007/s00251-011-0526-8
  • 査読あり
• [雑誌論文] Establishment of exome sequencing of cvnomolgus macaque (Macaca fascicularis) (2011)
  • 著者名/発表者名: Suzuki S, et al
  • 雑誌名: DNA polymorphism 巻: 19 ページ: 230-234
• [雑誌論文] Analysis of MHC class II gene polymorphisms (Mafa-DR-DQ genes) in Cynomolgus Macaques (Macaca fascicularis) originated from Philippine islands (2011)
  • 著者名/発表者名: Ota M, et al
  • 雑誌名: DNA polymorphism 巻: 19 ページ: 47-49
  • NAID: 10029668569
• [雑誌論文] Development of MHC typing method and gene expression method using by next generation sequencer Roche 454 FLX (2011)
  • 著者名/発表者名: Kita YF, et al
  • 雑誌名: DNA polymorphism 巻: 19 ページ: 223-229
• [雑誌論文] Primordial Linkage of {beta}2-Microglobulin to the MHC (2011)
  • 著者名/発表者名: Ohta Y, et al.
  • 雑誌名: J Immunol. 巻: 186 ページ: 3563-3571
  • 査読あり
• [雑誌論文] Study of Cynomolgus monkey(Macaca fascicularis) DRA polymorphism in four populations (2010)
  • 著者名/発表者名: Aarnink A, Estrade L, Apoil PA, Kita YF, Saitou N, Shiina T, Blancher A
  • 雑誌名: Immunogenetics 巻: 62 ページ: 123-136
  • 査読あり
• [雑誌論文] Mitochondrial DNA diversity among three subpopulations of cynomolgus macaques(Macaca fascicularis) originating from the Indochinese region (2010)
  • 著者名/発表者名: Shiina T, Tanaka K, Katsuyama Y, Otabe K, Sakamoto K, Kuratani M, Nomura M, Yamanaka H, Nakagawa H, Inoko H, Ota M
  • 雑誌名: Exp. Anim 巻: 59 ページ: 567-578
  • NAID: 130000419251
  • 査読あり
• [雑誌論文] Mitochondrial DNA diversity among three subpopulations of cynomolgus macaques (Macaca fascicularis) originating from the Indochinese region (2010)
  • 著者名/発表者名: Shiina T, et al.
  • 雑誌名: Exp.Anim. 巻: 59 ページ: 567-578
  • NAID: 130000419251
  • 査読あり
• [雑誌論文] Haplotype and allele frequency differences for polymorphic Alu insertions at five loci and two HLA class II genes in Japanese and Caucasians (2010)
  • 著者名/発表者名: Kulski JK, et al.
  • 雑誌名: Tissue Antigens 巻: 76 ページ: 35-47
  • 査読あり
• [雑誌論文] Study of Cynomolgus monkey (Macaca fascicularis) DRA polymorphism in four populations (2010)
  • 著者名/発表者名: Aarnink A, et al
  • 雑誌名: Immunogenetics 62 ページ: 123-136
  • 査読あり
• [雑誌論文] MHC class I A loci polymorphism and diversity in three Southeast Asian populations of cynomolgus macaque (2009)
  • 著者名/発表者名: Kita YF, Hosomichi K, Kohara S, Itoh Y, Ogasawara K, Tsuchiya H, Torii R, Inoko H, Blancher A, Kulski JK, Shiina T
  • 雑誌名: Immunogenetics 巻: 61 ページ: 635-648
  • 査読あり
• [雑誌論文] The HLA genomic loci map : expression, interaction, diversity and disease (2009)
  • 著者名/発表者名: Kulski Jk, et al
  • 雑誌名: Immunogenetics 61 ページ: 257-270
  • 査読あり
• [雑誌論文] MHC class I A loci polymorphism and diversity in three Southeast Asian populations of cynomolgus macaque. (2009)
  • 著者名/発表者名: Kita YF, et al
  • 雑誌名: Immunogenetics 61 ページ: 635-648
  • 査読あり
• [雑誌論文] A novel system of diverse NK cell receptors in primates (2009)
  • 著者名/発表者名: Averdam A, et al
  • 雑誌名: Plos Genetics 10
  • 査読あり
• [雑誌論文] BG1 has a major role in MHC-linked resistance to malignant lymphoma in the chicken (2009)
  • 著者名/発表者名: Goto RM, et al
  • 雑誌名: Proc Natl Acad Sci USA 106 ページ: 16740-16745
  • 査読あり
• [雑誌論文] Nomenclature report on the major histocompatibility complexes, genes, and alleles of non-human primate species
  • 著者名/発表者名: Groot NG, Otting N, Robinson J, Blancher A, Lafont BA, Marsh SGE, 0' Connor DH, Shiina T, Walter L, Watkins DI, Bontrop RE
  • 雑誌名: Immunogenetics 巻: (In press)
  • 査読あり
• [雑誌論文] Study of cynomolgus monkey(Macaca fascicularis) MhcDRB polymorphism in four populations
  • 著者名/発表者名: Blancher A, Aarnink A, Tanaka K, Ota M, Inoko H, Yamanaka H, Nakagawa H, Apoil PA, Shiina T
  • 雑誌名: Immunogenetics 巻: (In press)
  • 査読あり
• [学会発表] カニクイザルMHC多型情報基盤と生物医学研究への展開、シンポジウムI「MHCからみた種内多様性と進化」 (2011)
  • 著者名/発表者名: 椎名隆
  • 学会等名: 第20回日本組織適合性学会大会
  • 発表場所: ツインメッセ静岡
  • 年月日: 2011-08-29
• [学会発表] カニクイザルMHC多型情報基盤と生物医学研究への展開 (2011)
  • 著者名/発表者名: 椎名隆
  • 学会等名: 第20回日本組織適合性学会大会
  • 発表場所: ツインメッセ静岡(招待講演)
  • 年月日: 2011-08-29
• [学会発表] Elucidation of Genomic Structure and Diversity of the Macaca Fascicularis MHC (2011)
  • 著者名/発表者名: Takashi Shiina, et al
  • 学会等名: SMBE2011
  • 発表場所: 京都大学
  • 年月日: 2011-07-28
• [学会発表] Elucidation of Genomic Structure and Diversity of the Macaca Fascicularis MHC (2011)
  • 著者名/発表者名: Shiina T, Suzuki S, Tanaka K, Yamanaka H, Nakagawa H, Ota M, Torii R, Ogasawara K, Inoko H, Blancher A
  • 学会等名: SMBE2011
  • 発表場所: Kyoto University
  • 年月日: 2011-07-27
• [学会発表] 次世代シークエンサーを用いたカニクイザルにおける薬物代謝関連遺伝子内SNP検出 (2011)
  • 著者名/発表者名: 鈴木進悟, ら
  • 学会等名: 第58回日本実験動物学会
  • 発表場所: タワーホール船堀
  • 年月日: 2011-05-27
• [学会発表] 次世代シークエンサーを用いたカニクイザルにおける薬物代謝関連遺伝子内SNP検出 (2011)
  • 著者名/発表者名: 鈴木進悟、小田部耕二、坂本憲吾、倉田昌明、野村護、山中久、中川博司、太田正穂、猪子英俊、椎名隆
  • 学会等名: 第58回日本実験動物学会総会
  • 発表場所: タワーホール船堀
  • 年月日: 2011-05-25
• [学会発表] 次世代シークエンサーを用いたカニクイザルにおけるExome変異検出法の確立 (2010)
  • 著者名/発表者名: 鈴木進悟, ら
  • 学会等名: 第33回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 神戸交際会議場(兵庫県)
  • 年月日: 2010-12-09
• [学会発表] 次世代シークエンサーRoche FLXを用いたMHCタイピング法の試み (2010)
  • 著者名/発表者名: 北夕紀, ら
  • 学会等名: 第33回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 神戸交際会議場(兵庫県)
  • 年月日: 2010-12-09
• [学会発表] コモンマーモセットMHC領域のゲノム構造 (2010)
  • 著者名/発表者名: 河野あつみ, ら
  • 学会等名: 第33回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 神戸交際会議場(兵庫県)
  • 年月日: 2010-12-08
• [学会発表] 次世代シークエンサーを用いたカニクイザルにおけるExome変異検出法の確立 (2010)
  • 著者名/発表者名: 鈴木進悟、細道一善、小田部耕二、坂本憲吾、倉田昌明、野村護、山中久、中川博司、太田正穂、猪子英俊、井ノ上逸朗、椎名隆
  • 学会等名: 第33回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 三島市民文化会館・ゆうゆうホール
  • 年月日: 2010-11-18
• [学会発表] 次世代シークエンサーを用いたカニクイザルにおけるExome変異検出法の確立 (2010)
  • 著者名/発表者名: 鈴木進悟、細道一善、小田部耕二、坂本憲吾、倉田昌明、野村護、山中久、中川博司、太田正穂、猪子英俊、井ノ上逸朗、椎名隆
  • 学会等名: 日本DNA多型学会第19回学術集会
  • 発表場所: 三島市民文化会館・ゆうゆうホール
  • 年月日: 2010-11-18
• [学会発表] 生物医学研究推進のためのフィリピン産カニクイザルMHC遺伝子の多型解析 (2010)
  • 著者名/発表者名: 太田正穂、田中景子、勝山善彦、北夕紀、小田部耕二、坂本憲吾、倉田昌明、野村護、山中久、中川博司、浅村英樹、猪子英俊、椎名隆
  • 学会等名: 第19回DNA多型学会
  • 発表場所: 三島市民文化会館・ゆうゆうホール
  • 年月日: 2010-11-18
• [学会発表] 次世代シークエンサーを用いたカニクイザルにおけるExome変異検出法の確立 (2010)
  • 著者名/発表者名: 鈴木進悟, ら
  • 学会等名: 日本DNA多型学会第19回学術集会
  • 発表場所: 三島市民文化会館(静岡県)
  • 年月日: 2010-11-18
• [学会発表] 次世代シークエンサーRoche 454FLXを用いたMHCタイピング法の開発 (2010)
  • 著者名/発表者名: 北夕紀, ら
  • 学会等名: 日本DNA多型学会第19回学術集会
  • 発表場所: 三島市民文化会館(静岡県)
  • 年月日: 2010-11-18
• [学会発表] 生物医学研究推進のためのフィリピン産カニクイザルMHCクラスII遺伝子(Mafa-DR-DQ)の多型解析 (2010)
  • 著者名/発表者名: 太田正穂, ら
  • 学会等名: 日本DNA多型学会第19回学術集会
  • 発表場所: 三島市民文化会館(静岡県)
  • 年月日: 2010-11-18
• [学会発表] MHC全遺伝子ホモ接合体カニクイザルの特定 (2010)
  • 著者名/発表者名: 椎名隆、北夕紀、田中景子、河野あづみ、鈴木進悟、細道一善、勝山善彦、土屋英明、小田部耕二、坂本憲吾、倉田昌明、野村護、山中久、中川博司、伊藤靖、太田正穂、猪子英俊、鳥居隆三、小笠原一誠
  • 学会等名: 第19回日本組織適合性学会大会
  • 発表場所: 東京大学
  • 年月日: 2010-09-18
• [学会発表] コモンマーモセットMHCクラスI遺伝子(Caja-G)の遺伝的多様性 (2010)
  • 著者名/発表者名: 河野あつみ, ら
  • 学会等名: 第19回日本組織適合性学会大会
  • 発表場所: 東京大学本郷キャンパス(東京都)
  • 年月日: 2010-09-18
• [学会発表] MHC全遺伝子ホモ接合体カニクイザルの特定 (2010)
  • 著者名/発表者名: 椎名隆, ら
  • 学会等名: 第19回 日本組織適合性学会大会
  • 発表場所: 東京大学本郷キャンパス(東京都)
  • 年月日: 2010-09-18
• [学会発表] コモンマーモセットMHCクラスI遺伝子(Caja-G)の遺伝的多様性 (2010)
  • 著者名/発表者名: 河野あつみ, ら
  • 学会等名: 第19回 日本組織適合性学会大会
  • 発表場所: 東京大学本郷キャンパス(東京都)
  • 年月日: 2010-09-18
• [学会発表] Development of personal genome analysis method on the entire HLA region (2009)
  • 著者名/発表者名: Hosomichi K, Shiina T, Wang T, Kawata H, Inoko H, Inoue I
  • 学会等名: 第32回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: パシフィコ横浜(神奈川県)
  • 年月日: 2009-12-09
• [学会発表] カニクイザル3集団におけるMHCクラスI遺伝子(Mafa-A)の多型性の比較 (2009)
  • 著者名/発表者名: 北夕紀、田中景子、細道一善、小笠原一誠、鳥居隆三、猪子英俊、椎名隆
  • 学会等名: 第18回日本組織適合性学会
  • 発表場所: 名古屋国際会議場
  • 年月日: 2009-09-26
• [学会発表] HLA領域のパーソナルゲノム解析法の開発 (2009)
  • 著者名/発表者名: 細道一善、猪子英俊、河田寿子、井ノ上逸朗、椎名隆
  • 学会等名: 第18回日本組織適合性学会大会
  • 発表場所: 名古屋国爪会議場(愛知県)
  • 年月日: 2009-09-26
• [学会発表] HLA領域のパーソナルゲノム解析法の開発 (2009)
  • 著者名/発表者名: 細道一善、椎名隆、王〓、河田寿子、猪子英俊、井ノ上逸朗
  • 学会等名: 日本人類遺伝学会 第54回大会
  • 発表場所: グランドプリンスホテル高輪(東京都)
  • 年月日: 2009-09-25
• [産業財産権] カニクイザルMHC全遺伝子ホモ接合体を作成するためのキット及び方法 (2011)
  • 発明者名: 小笠原一誠、鳥居隆三、椎名隆
  • 権利者名: 学校法人東海大学、国立大学法人滋賀医科大学
  • 出願年月日: 2011-05-02
  • 外国
• [産業財産権] カニクイザルMHC全遺伝子ホモ接合体を作成するためのキット及び方法 (2010)
  • 発明者名: 椎名隆, 小笠原一誠, 鳥居隆三
  • 権利者名: 東海大学, 滋賀医科大学
  • 出願年月日: 2010-04-30