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Small RNAの安定性を制御するGGDEF/EAL蛋白質の機能解析

研究課題

研究課題/領域番号 21580088
研究種目

基盤研究(C)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 応用微生物学
研究機関新潟大学

研究代表者

鈴木 一史  新潟大学, 自然科学系, 准教授 (00444183)

研究協力者 TONY Romeo  フロリダ大学, 微生物・細胞科学, 教授
研究期間 (年度) 2009 – 2011
研究課題ステータス 完了 (2011年度)
配分額 *注記
5,070千円 (直接経費: 3,900千円、間接経費: 1,170千円)
2011年度: 910千円 (直接経費: 700千円、間接経費: 210千円)
2010年度: 1,170千円 (直接経費: 900千円、間接経費: 270千円)
2009年度: 2,990千円 (直接経費: 2,300千円、間接経費: 690千円)
キーワード大腸菌 / バイオフィルム / GGDEFドメイン / EALドメイン / c-di-GMP / Csrシステム / small RNA / c-fi-GMP
研究概要

細菌バイオフィルムの形成制御メカニズムを解明するため、細菌に複数存在するGGDEF/EAL蛋白質の機能解析を行った。CsrDはc-di-GMP非代謝型のGGDEF/EAL蛋白質であり、増殖期によって活性を変化させてsmall RNAの安定性を調節することでバイオフィルム形成を制御していることが明らかとなった。一方、GGDEF蛋白質YliF及びEAL蛋白質YliEはc-di-GMPの合成及び分解を調節することでバイオフィルム形成を制御していた。

報告書

(4件)
  • 2011 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2010 実績報告書
  • 2009 実績報告書
  • 研究成果

    (14件)

すべて 2012 2010 2009 その他

すべて 学会発表 (10件) 備考 (4件)

  • [学会発表] 大腸菌におけるGGDEF-EALドメインタンパク質CsrDによるsmall RNA半減期の調節2012

    • 著者名/発表者名
      高橋優介,岡山明裕,伊藤学,杉本華幸,渡邉剛志,鈴木一史
    • 学会等名
      日本農芸化学会2012年度大会
    • 発表場所
      京都女子大学(京都市)
    • 年月日
      2012-03-24
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書 2011 研究成果報告書
  • [学会発表] 大腸菌におけるGGDEF/EALドメインタンパク質の機能解析2012

    • 著者名/発表者名
      塚田海斗,渡部大樹,杉本華幸,渡邉剛志,鈴木一史
    • 学会等名
      日本農芸化学会2012年度大会
    • 発表場所
      京都女子大学(京都市)
    • 年月日
      2012-03-24
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書 2011 研究成果報告書
  • [学会発表] 大腸菌におけるCsrB RNA分解中間産物の解析2010

    • 著者名/発表者名
      鈴木一史,岡山明裕,伊藤学,渡邉剛志, Tony Romeo
    • 学会等名
      第12回日本RNA学会
    • 発表場所
      一橋記念講堂(東京都千代田区)
    • 年月日
      2010-07-28
    • 関連する報告書
      2011 研究成果報告書
  • [学会発表] 大腸菌におけるCsrB RNA分解中間産物の解析2010

    • 著者名/発表者名
      鈴木一史
    • 学会等名
      第12回日本RNA学会年会
    • 発表場所
      一橋記念講堂(東京都)
    • 年月日
      2010-07-28
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] Analysis of turnover of the global regulatory RNA CsrB in Escherichia coli2010

    • 著者名/発表者名
      鈴木一史,岡山明裕,伊藤学,渡邉剛志, Tony Romeo
    • 学会等名
      American Society for Microbiology 110th General Meeting
    • 発表場所
      San Diego Convebtion Center(San Diego, California,アメリカ合衆国)
    • 年月日
      2010-05-26
    • 関連する報告書
      2011 研究成果報告書
  • [学会発表] Analysis of turnover of the global regulatory RNA CsrB in Escherichia coli2010

    • 著者名/発表者名
      鈴木一史
    • 学会等名
      American Society for Microbiology 110th General Meeting
    • 発表場所
      San Diego Convention Center(San Diego, CA, USA)
    • 年月日
      2010-05-26
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] 大腸菌CsrB RNAの分解機構2010

    • 著者名/発表者名
      鈴木一史
    • 学会等名
      日本農芸化学会2010年度大会
    • 発表場所
      東京大学駒場キャンパス
    • 年月日
      2010-03-29
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] 大腸菌CsrB RNAの分解機構2010

    • 著者名/発表者名
      鈴木一史,伊藤学,岡山明裕,水野孝彦,渡邉剛志, Tony Romeo
    • 学会等名
      日本農芸化学会2010年度大会
    • 発表場所
      名城大学(名古屋市)
    • 年月日
      2010-03-28
    • 関連する報告書
      2011 研究成果報告書
  • [学会発表] Analysis of CsrB small RNA decay in Escherichia coli2009

    • 著者名/発表者名
      Kazushi Suzuki, Manabu Ito, Takeshi Watanabe, and Tony Romeo
    • 学会等名
      第32回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜(横浜市)
    • 年月日
      2009-12-12
    • 関連する報告書
      2011 研究成果報告書
  • [学会発表] Analysis of CsrB small RNA decay in Escherichia coli2009

    • 著者名/発表者名
      鈴木一史
    • 学会等名
      第32回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜
    • 年月日
      2009-12-12
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [備考]

    • URL

      http://www.agr.niigata-u.ac.jp/~ksuzuki/ApplMicro/Welcome.html

    • 関連する報告書
      2011 研究成果報告書
  • [備考]

    • URL

      http://www.agr.niigata-u.ac.jp/~ksuzuki/ApplMicro/Welcome.html

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [備考]

    • URL

      http://www.agr.niigata-u.ac.jp/~ksuzuki/index.html

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [備考]

    • URL

      http://www.agr.niigata-u.ac.jp/profile/suzuki/index.html

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書

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公開日: 2009-04-01   更新日: 2016-04-21  

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