研究課題
基盤研究(C)
感染マウスの胃懸濁液からを免疫磁気ビーズSepa-Max Hpを用いて分離し、ゲノムDNAを調製した。次にフラグメントライブラリを作製し、ABI SOLiD 4システムにより塩基配列を決定した。目的のH. heilmannii TKYとH. suis SNTW101の配列以外にマウスゲノムと腸内細菌のゲノム由来の配列がかなりあったので、種々の条件でアセンブルを行った。その結果H. heilmannii TKYとH. suis SNTW101それぞれに総コンティグ長が、推定されるゲノムサイズをカバーできる程度になった。このデーターを基に既にゲノム解析が終了しているHelicobacter属細菌との比較を行い、幾つかのH. heilmannii特異的な病原遺伝子を発見した。
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