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中性子とX線を相補的に用いた蛋白質水和水の解析法の確立と構造的特長の解明

研究課題

研究課題/領域番号 21700329
研究種目

若手研究(B)

配分区分補助金
研究分野 生体生命情報学
研究機関独立行政法人日本原子力研究開発機構

研究代表者

大原 高志  独立行政法人日本原子力研究開発機構, 量子ビーム応用研究部門, 研究員 (60391249)

研究期間 (年度) 2009 – 2010
研究課題ステータス 完了 (2010年度)
配分額 *注記
4,290千円 (直接経費: 3,300千円、間接経費: 990千円)
2010年度: 2,210千円 (直接経費: 1,700千円、間接経費: 510千円)
2009年度: 2,080千円 (直接経費: 1,600千円、間接経費: 480千円)
キーワードバイオインフォマティックス / 中性子構造解析 / 量子ビーム / タンパク質水和水 / 不凍タンパク質
研究概要

本研究では同一の単結晶からの中性子およびX線回折データを相補的に利用することで、研究者の恣意性を排した蛋白質水和水の構造決定を可能とする手法を開発した。更に、水和水が重要とされる不凍蛋白質の抗凍結活性について、変異体を用いた作用部位の特定と、中性子およびX線を相補的に用いた構造解析により、抗凍結活性に対する水和水の役割の解明に成功した。

報告書

(3件)
  • 2010 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2009 実績報告書
  • 研究成果

    (39件)

すべて 2011 2010 2009 その他

すべて 雑誌論文 (18件) (うち査読あり 18件) 学会発表 (20件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] Structural Study of Hydrogen and Hydration by the IBARAKI Biological Crystal Diffractometer (iBIX)/Industrial Use2011

    • 著者名/発表者名
      I.Tanaka, T.Ohhara
    • 雑誌名

      Radioisotopes Vol.60

      ページ: 89-97

    • NAID

      10027807561

    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Structural Study of Hydrogen and Hydration by the IBARAKI Biological Crystal Diffractometer (iBIX)/Industrial Use2011

    • 著者名/発表者名
      I.Tanaka, T.Ohhara, et al.
    • 雑誌名

      Radioisotopes

      巻: 60 ページ: 89-97

    • NAID

      10027807561

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Neutron structure analysis using the IBARAKI biological crystal diffractometer (iBIX) at J-PARC2010

    • 著者名/発表者名
      Tanaka, T.Ohhara
    • 雑誌名

      Acta Crystallogr. D Biol.Crystallogr. Vol.66

      ページ: 1194-1197

    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Towards investigation of the inhibitor-recognition mechanisms of drug-target proteins by neutron crystallography2010

    • 著者名/発表者名
      R.Kuroki, T.Ohhara
    • 雑誌名

      Acta Crystallogra. D Biol.Crystallogr. Vol.66

      ページ: 1126-1130

    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Beginning of use of a new biological neutron diffractometer (iBIX) in J-PARC2010

    • 著者名/発表者名
      Tanaka, T.Ohhara
    • 雑誌名

      Yakugaku Zasshi vol.130

      ページ: 665-670

    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Collaborative use of neutron and X-ray for determination of drug target proteins2010

    • 著者名/発表者名
      R.Kuroki, T.Ohhara
    • 雑誌名

      Yakugaku Zasshi vol.130

      ページ: 657-664

    • NAID

      130000259451

    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Anomalous Water Molecules and Mechanistic Effects of Water Nanotube Clusters Confined to Molecular Porous Crystals2010

    • 著者名/発表者名
      M.Tadokoro, T.Ohhara
    • 雑誌名

      J.Phys.Chem.B vol.114

      ページ: 2091-2099

    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] 化学における単結晶中性子構造解析2010

    • 著者名/発表者名
      細谷孝明、大原高志
    • 雑誌名

      Radioisotopes vol.59

      ページ: 279-287

    • NAID

      10026244796

    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Neutron structure analysis using the IBARAKI biological crystal diffractometer (iBIX) at J-PARC.2010

    • 著者名/発表者名
      I.Tanaka, T.Ohhara, et.al.
    • 雑誌名

      Acta Crystallogr.D Biol.Crystallogr.

      巻: 66 ページ: 1194-1197

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Towards investigation of the inhibitor-recognition mechanisms of drug-target proteins by neutron crystallography.2010

    • 著者名/発表者名
      R.Kuroki, T.Ohhara, et al.
    • 雑誌名

      Acta Crystallogr.D Biol.Crystallogr.

      巻: 66 ページ: 1126-1130

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Beginning of use of a new biological neutron diffractometer (iBIX) in J-PARC2010

    • 著者名/発表者名
      I.Tanaka, T.Ohhara, et al.
    • 雑誌名

      Yakugaku Zasshi

      巻: 130 ページ: 665-670

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Collaborative use of neutron and X-ray for determination of drug target proteins2010

    • 著者名/発表者名
      R.Kuroki, T.Ohhara, et al.
    • 雑誌名

      Yakugaku Zasshi

      巻: 130 ページ: 657-664

    • NAID

      130000259451

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Anomalous Water Molecules and Mechanistic Effects of Water Nanotube Clusters Confined to Molecular Porous Crystals2010

    • 著者名/発表者名
      M.Tadokoro, T.Ohhara, et al.
    • 雑誌名

      J.Phys.Chem.B 114

      ページ: 2091-2099

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] 化学における単結晶中性子構造解析2010

    • 著者名/発表者名
      細谷孝明、大原高志
    • 雑誌名

      RADIOISOTOPES 59

      ページ: 279-287

    • NAID

      10026244796

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Combined high-resolution neutron and X-ray analysis of inhibited elastase confirms the active-site oxyanion hole but rules against a low-barrier hydrogen bond2009

    • 著者名/発表者名
      T.Tamada, T.Ohhara
    • 雑誌名

      J.Am.Chem.Soc. vol.131

      ページ: 11033-11040

    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Structure of HIV-1 protease in complex with potent inhibitor KNI-272 determined by high-resolution X-ray and neutron crystallography2009

    • 著者名/発表者名
      M.Adachi, T.Ohhara
    • 雑誌名

      Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A. vol.106

      ページ: 4641-4646

    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Combined high-resolution neutron and X-ray analysis of inhibited elastase confirms the active-site oxyanion hole but rules against a low-barrier hydrogen bond2009

    • 著者名/発表者名
      T.Tamada, T.Ohhara, et al.
    • 雑誌名

      J.Am.Chem.Soc. 131

      ページ: 11033-11040

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Structure of HIV-1 protease in complex with potent inhibitor KNI-272 determined by high-resolution X-ray and neutron crystallography2009

    • 著者名/発表者名
      M.Adachi, T.Ohhara, et al.
    • 雑誌名

      Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A. 106

      ページ: 4641-4646

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] 中性子構造解析を用いた不凍タンパク質の作用機構解明2011

    • 著者名/発表者名
      大原高志
    • 学会等名
      JRR-3改造20周年記念シンポジウム
    • 発表場所
      日本未来館(東京都)
    • 年月日
      2011-02-28
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] 中性子で不凍タンパク質の構造と機能に迫る2011

    • 著者名/発表者名
      大原高志
    • 学会等名
      量子ビーム生命科学応用研究シンポジウム
    • 発表場所
      TKP代々木ビジネスセンター(東京都)(招待講演)
    • 年月日
      2011-01-21
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] 不凍タンパク質の構造解析2011

    • 著者名/発表者名
      大原高志
    • 学会等名
      第2回MLFシンポジウム
    • 発表場所
      高エネルギー加速器研究機構(茨城県つくば市)(招待講演)
    • 年月日
      2011-01-17
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書 2010 研究成果報告書
  • [学会発表] 単結晶回折計SENJUにおけるソフトウェアの開発2010

    • 著者名/発表者名
      大原高志, 他10名
    • 学会等名
      平成22年度日本中性子科学会年会
    • 発表場所
      東北大学(仙台市)
    • 年月日
      2010-12-09
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書 2010 研究成果報告書
  • [学会発表] 変異導入と結晶構造解析によるナガナジ由来不凍タンパク質の抗凍結機能の解析2010

    • 著者名/発表者名
      大原高志, 他7名
    • 学会等名
      平成22年度日本結晶学会
    • 発表場所
      大阪大学(大阪府吹田市)
    • 年月日
      2010-12-03
    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
  • [学会発表] 変異導入と結晶構造解析によるナガガジ由来不凍タンパク質の抗凍結機構の解析2010

    • 著者名/発表者名
      大原高志
    • 学会等名
      平成22年度日本結晶学会年会
    • 発表場所
      大阪大学コンベンションセンター(大阪府吹田市)
    • 年月日
      2010-12-03
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] Data processing software for a new TOF single crystal neutron diffractometer "iBIX" at J-PARC2010

    • 著者名/発表者名
      T.Ohhara, 他12名
    • 学会等名
      10th Conference of the Asian Crystallographic Association (AsCA'10)
    • 発表場所
      Busan(Korea).
    • 年月日
      2010-11-02
    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
  • [学会発表] Data processing software for a new TOF single crystal neutron diffractometer "iBIX" at J-PARC2010

    • 著者名/発表者名
      T.Ohhara
    • 学会等名
      10^<th> Conference of the Asian Crystallographic Association (AsCA'10)
    • 発表場所
      Busan (Korea)
    • 年月日
      2010-11-02
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] 不凍タンパク質の構造解析2010

    • 著者名/発表者名
      大原高志
    • 学会等名
      茨城県中性子利用促進研究会 生命物質構造解析研究会 合同研究会
    • 発表場所
      東京国際フォーラム(東京都)(招待講演)
    • 年月日
      2010-10-01
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] 変異導入とX線結晶構造解析によるナガガジ由来不凍タンパク質の抗凍結機構の解析2010

    • 著者名/発表者名
      大原高志, 他7名
    • 学会等名
      第10回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      札幌コンベンションセンター(札幌市)
    • 年月日
      2010-06-17
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書 2010 研究成果報告書
  • [学会発表] 茨城県生命物質構造解析装置(iBIX)の概要について2010

    • 著者名/発表者名
      大原高志
    • 学会等名
      平成22年度第1回生命物質構造解析研究会
    • 発表場所
      いばらき量子ビーム研究センター(茨城県東海村)(招待講演)
    • 年月日
      2010-05-26
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書 2010 研究成果報告書
  • [学会発表] 茨城県生命物質構造解析装置(iBIX)におけるデータ処理ソフトの開発2010

    • 著者名/発表者名
      大原高志
    • 学会等名
      第1回MLFシンポジウム
    • 発表場所
      いばらき量子ビーム研究センター(茨城県東海村)(招待講演)
    • 年月日
      2010-03-30
    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
  • [学会発表] 茨城県生命物質構造解析装置(iBIX)におけるデータ処理ソフトの開発2010

    • 著者名/発表者名
      大原高志
    • 学会等名
      第1回MLFシンポジウム
    • 発表場所
      いばらき量子ビーム研究センター(茨城県)
    • 年月日
      2010-03-30
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] 茨城県生命物質構造解析装置(iBIX)の概要について2010

    • 著者名/発表者名
      大原高志
    • 学会等名
      茨城県中性子利用促進研究会 平成21年第2回生命物質構造解析研究会
    • 発表場所
      テクノ交流会館リコッティー(茨城県)
    • 年月日
      2010-03-25
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] 茨城県生命物質構造解析装置iBIXの現状と展望2010

    • 著者名/発表者名
      大原高志
    • 学会等名
      茨城県中性子利用促進研究会シンポジウム「中性子回折による物質構造研究の新展開」
    • 発表場所
      キャンパスイノベーションセンター東京(東京都)
    • 年月日
      2010-03-23
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] Development of data reduction software for iBIX2010

    • 著者名/発表者名
      大原高志
    • 学会等名
      中性子構造生物学研究会
    • 発表場所
      いばらき量子ビーム研究センター(茨城県)
    • 年月日
      2010-01-26
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] iBIXにおけるデータ処理ソフトの開発と標準試料の構造精密化2009

    • 著者名/発表者名
      大原高志, 他8名
    • 学会等名
      第9回日本中性子科学会年会
    • 発表場所
      いばらき量子ビーム研究センター(茨城県東海村)
    • 年月日
      2009-12-10
    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
  • [学会発表] iBIXにおけるデータ処理ソフトの開発と標準試料の構造精密化2009

    • 著者名/発表者名
      大原高志
    • 学会等名
      第9回日本中性子科学会年会
    • 発表場所
      いばらき量子ビーム研究センター(茨城県)
    • 年月日
      2009-12-10
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] ナガガジ由来不凍タンパク質の結晶化と単結晶中性子回折測定2009

    • 著者名/発表者名
      大原高志, 他6名
    • 学会等名
      第9回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      熊本全日空ホテルニュースカイ(熊本県熊本市)
    • 年月日
      2009-05-21
    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
  • [学会発表] ナガガジ由来不凍タンパク質の結晶化と単結晶中性子回折測定2009

    • 著者名/発表者名
      大原高志
    • 学会等名
      第9回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      熊本全日空ホテルニュースカイ(熊本県)
    • 年月日
      2009-05-21
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [備考]

    • URL

      http://www.jaea.go.jp/02/kihu/researcher/voice01/index.html

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書

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公開日: 2009-04-01   更新日: 2016-04-21  

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