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高速1分子FRET計測によるEGFR構造変化ダイナミクス計測

研究課題

研究課題/領域番号 21710122
研究種目

若手研究(B)

配分区分補助金
研究分野 ナノ材料・ナノバイオサイエンス
研究機関独立行政法人理化学研究所

研究代表者

岡本 憲二  独立行政法人理化学研究所, 佐甲細胞情報研究室, 研究員 (40402763)

研究協力者 日比野 佳代  独立行政法人理化学研究所, 佐甲細胞情報研究室, 研究員 (40435673)
研究期間 (年度) 2009 – 2010
研究課題ステータス 完了 (2010年度)
配分額 *注記
4,550千円 (直接経費: 3,500千円、間接経費: 1,050千円)
2010年度: 2,600千円 (直接経費: 2,000千円、間接経費: 600千円)
2009年度: 1,950千円 (直接経費: 1,500千円、間接経費: 450千円)
キーワードEGFR / 単一分子計測 / FRET / 統計的データ解析 / 高時間分解計測 / 分子構造変化ダイナミクス
研究概要

細胞膜上で情報伝達に関わるEGFR分子の構造変化ダイナミクスを1分子FRET計測を用いて調べる実験系を構築した。EGFR分子の発現精製および蛍光ラベル条件を最適化した。EGFR発現条件が難しく予想以上の時間を費やしたためダイナミクス計測にまでは至らなかったものの、FRET信号を得ることに成功した。また実験データの解析法として、変分ベイズ法に基づいた手法を新たに開発し、精度と時間分解能の向上に成功した。

報告書

(3件)
  • 2010 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2009 実績報告書
  • 研究成果

    (4件)

すべて 2010 2009

すべて 学会発表 (4件)

  • [学会発表] Holliday Junctionの自発的Branch Migrationのタイムスタンプ1分子FRET計測2010

    • 著者名/発表者名
      岡本憲二、佐甲靖志
    • 学会等名
      日本生物物理学会第48回年会
    • 発表場所
      仙台
    • 年月日
      2010-09-21
    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
  • [学会発表] Single-molecule time-stamped FRET measurement of the spontaneous branch migration of the Holliday junction2010

    • 著者名/発表者名
      岡本憲二、佐甲靖志
    • 学会等名
      第48回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      東北大学(仙台市)
    • 年月日
      2010-09-21
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] 単一分子ダイナミクスの実時間観察を可能にする2チャンネル同時タイムスタンプ計測2009

    • 著者名/発表者名
      岡本憲二、佐甲靖志
    • 学会等名
      日本生物物理学会第47回年会
    • 発表場所
      徳島
    • 年月日
      2009-11-01
    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
  • [学会発表] 単一分子ダイナミクスの実時間観察を可能にする2チャンネル同時タイムスタンプ計測2009

    • 著者名/発表者名
      岡本憲二、佐甲靖志
    • 学会等名
      第47回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      アスティ徳島(徳島市)
    • 年月日
      2009-11-01
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書

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公開日: 2009-04-01   更新日: 2016-04-21  

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