時間分解円二色性によるＤＮＡ-色素間相互作用の動的挙動解析

• 研究課題/領域番号: 21750164
• 研究種目: 若手研究(B)
• 配分区分: 補助金
• 研究分野: 生体関連化学
• 研究機関: 東北大学
• 研究代表者: 荒木 保幸 東北大学, 多元物質科学研究所, 助教 (80361179)
• 研究期間 (年度): 2009 – 2010
• 研究課題ステータス: 完了 (2010年度)
• 配分額: 4,420千円 (直接経費: 3,400千円、間接経費: 1,020千円); 2010年度: 1,170千円 (直接経費: 900千円、間接経費: 270千円); 2009年度: 3,250千円 (直接経費: 2,500千円、間接経費: 750千円)
• キーワード: 生体機能関連化学 / 円二色性 / DNA / 色素

研究概要

DNAがキラルであり、DNA-薬剤間で相互作用することにより生じた分子全体がキラリティを有することに着眼し、このDNA-薬剤相互作用の動的挙動を円二色性測定法に時間分解能を付与することで検出することを試みた。時間分解能を付与した円二色性測定法を新たに開発することに成功し、薬剤をレーザー誘起することによって生じるDNA-薬剤相互作用の動的挙動をマイクロ秒の時間スケールで検出することに成功した。

研究成果

• [雑誌論文] Fullerene- and Pyromellitdiimide-Appended Tripodal Ligands Embedded in Light-Harvesting Porphyrin Macrorings (2011)
  • 著者名/発表者名: Kuramochi, Y., Araki, Y, 他4名
  • 雑誌名: Inorg. Chem. 巻: 50 ページ: 10249-10258
  • 査読あり
• [雑誌論文] Multiple photosynthetic reaction centres composed of supramolecular assemblies of zinc porphyrin dendrimers with a fullerene acceptor (2011)
  • 著者名/発表者名: Fukuzumi, S., Saito, K., Ohkubo, K., Kashiwagi, Y., Araki, Y., 他6名
  • 雑誌名: Chem. Commun. 巻: 47 ページ: 7980-7982
  • 査読あり
• [雑誌論文] Fullerene- and Pyromellitdiimide-Appended Tripodal Ligands Embedded in Light-Harvesting Porphyrin Macrorings (2011)
  • 著者名/発表者名: Kuramochi, Y.; Satake, A.; Sandanayaka, A.S.D.; Araki, Y.; Ito, O.; Kobuke, Y.
  • 雑誌名: Inorg.Chem. 巻: 50 ページ: 10249-10258
  • 査読あり
• [雑誌論文] Multiple photosynthetic reaction centres composed of supramolecular assemblies of zinc porphyrin dendrimers with a fullerene acceptor (2011)
  • 著者名/発表者名: Fukuzumi, S.; Saito, K.; Ohkubo, K.; Khoury, T.; Kashiwagi, Y.; Absalom, M.A.; Gadde, S.; D'Souza, F.; Araki, Y.; Ito, O.; Crossley, M.J.
  • 雑誌名: Chem.Commun. 巻: 47 ページ: 7980-7982
  • 査読あり
• [雑誌論文] Axle Length Effect on Photoinduced Electron Transfer in Triad Rotaxane with Porphyrin [60]Fullerene, and Triphenylamine (2010)
  • 著者名/発表者名: Sandanayaka, A. S. D., Sasabe, H., Araki, Y., 他4名
  • 雑誌名: Journal of Physical Chemistry A 巻: 114(16) ページ: 5242-5250
  • 査読あり
• [雑誌論文] The effect of atomic nitrogen on the C_<60> cage (2010)
  • 著者名/発表者名: Nikawa, H., Araki, Y., 他8名
  • 雑誌名: Chemical Communications (Cambridge, United Kingdom) 巻: 46(4) ページ: 631-633
  • 査読あり
• [雑誌論文] Role of Phe113 at the distal side of the heme domain of an oxygen-sensor(Ec DOS)in the characterization of the heme environment (2009)
  • 著者名/発表者名: Ito, Shinya, Araki, Yasuyuki, Tanaka, Atsunari, Igarashi, Jotaro, Wada, Takehiko, Shimizu, Toru
  • 雑誌名: Journal of Inorganic Biochemistry 103 ページ: 989-996
  • 査読あり
• [雑誌論文] Synthesis and Photophysical and Photovoltaic Properties of Porphyrin-Furan and-Thiophene Alternating Copolymers (2009)
  • 著者名/発表者名: Umeyama, Tomokazu, Takamatsu, Takeshi, Tezuka, Noriyasu, Matano, Yoshihiro, Araki, Yasuyuki, Wada, Takehiko, Yoshikawa, Osamu, Sagawa, Takashi, Yoshikawa, Susumu, Imahori, Hiroshi
  • 雑誌名: The Journal of Physical Chemistry C 113 ページ: 10798-10806
  • 査読あり
• [学会発表] Ellipticity-change-detected CD apparatus toward theapplication to the DNA/RNA conformational change (2011)
  • 著者名/発表者名: Yasuyuki Araki, Makoto Murakami, Yoshiki Hamada, Seiji Sakamoto, Takehiko Wada
  • 学会等名: The 38th International Symposium on Nucleic Acid Chemistry (ISNAC2011)
  • 発表場所: Clark Memorial Student Senter, Hokkaido University, Sapporo, Japan
• [学会発表] 円二色性の高感度検出へ向けた楕円率変化検出型円二色性測定法 (2011)
  • 著者名/発表者名: 荒木保幸, 村上慎, 濱田芳生, 坂本清志, 和田健彦
  • 学会等名: 2011年光化学討論会
  • 発表場所: 宮崎市河畔コンベンションセンター
• [学会発表] 楕円率変化検出による円二色測定法のフォトンカウンティング法による高感度化 (2011)
  • 著者名/発表者名: 荒木保幸, 村上慎, 坂本清志, 和田健彦
  • 学会等名: 第91回日本化学会春季年会
  • 発表場所: 神奈川大学横浜キャンパス
• [学会発表] Ellipticity-change-detected CD apparatus toward theapplication to the DNA/RNA conformational change (2011)
  • 著者名/発表者名: Yasuyuki Araki, Makoto Murakami, Yoshiki Hamada, Seiji Sakamoto, Takehiko Wada
  • 学会等名: The 38^<th> International Symposium on Nucleic Acid Chemistry (ISNAC2011)
  • 発表場所: Clark Memorial Student Senter, Hokkaido University, Sapporo, Japan
• [学会発表] トリフェニレンをコアとする亜鉛ポルフィリン6量体の不斉軸配位子による不斉誘起とその光励起挙動 (2010)
  • 著者名/発表者名: 荒木保幸, Atula Sandanayaka, Rabbani Mohamed, 羽曾部卓, 村上慎, 坂本清志, 和田健彦
  • 学会等名: 第90回日本化学会春季年会
  • 発表場所: 関西大学(大阪府)
  • 年月日: 2010-03-27
• [学会発表] New approach of time-resolved CD experiment for a biological application (2010)
  • 著者名/発表者名: Y. Araki, M. Murakami, S. Sakamoto, T. Wada
  • 学会等名: Pacifichem2010
  • 発表場所: Honolulu, Hawai, USA
• [学会発表] 不斉軸配位子による亜鉛ポルフィリン6量体の不斉誘起とその光励起挙動 (2010)
  • 著者名/発表者名: 荒木保幸, 村上慎, 坂本清志, 和田健彦, SANDANAYAKA Atula, RABBANI Mohammad, 羽曾部卓
  • 学会等名: 2010年光化学討論会
  • 発表場所: 千葉大学
• [学会発表] 光励起をトリガーとするDNA・カチオン性ポルフィリン錯体の動的挙動変化の時間分解CD測定法を用いた解析 (2010)
  • 著者名/発表者名: 村上慎, 荒木保幸, 坂本清志, 和田健彦
  • 学会等名: 2010年光化学討論会
  • 発表場所: 千葉大学
• [学会発表] TIME-RESOLVED CIRCULAR DICHROISM STUDY OF BINDING DYNAMICS OF H2TMPYP WITH DNA IN MICROSECOND TO MILLISECOND TIME-SCALE (2010)
  • 著者名/発表者名: Yasuyuki Araki, Makoto Murakami, Seiji Sakamoto, Takehiko Wada
  • 学会等名: 22nd International Symposium on Chirality
  • 発表場所: Sapporo, Japan
• [学会発表] 高時間分解CD測定装置を用いた二重らせんDNA-porphyrin間相互作用解析(東北大多元研) (2010)
  • 著者名/発表者名: 村上慎, 荒木保幸, 坂本清志, 和田健彦
  • 学会等名: 日本化学会第90春季年会(2010)
  • 発表場所: 近畿大学本部キャンパス
• [学会発表] トリフェニレンをコアとする亜鉛ポルフィリン6量体の不斉軸配位子による不斉誘起とその光励起挙動(東北大多元研・北陸先端大) (2010)
  • 著者名/発表者名: 荒木保幸, Atula, Sandanayaka, Rabbani, Mohammad, 羽曾部卓, 村上慎, 坂本清志, 和田健彦
  • 学会等名: 日本化学会第90春季年会(2010)
  • 発表場所: 近畿大学本部キャンパス
• [学会発表] 不斉軸配位子による亜鉛ポルフィリン6量体の不斉誘起とその光励起挙動 (2010)
  • 著者名/発表者名: 荒木保幸・村上慎・坂本清志・和田健彦・SANDANAYAKA Atula・RABBANI Mohammad・羽曾部卓
  • 学会等名: 2010年光化学討論会
  • 発表場所: 千葉大学西千葉キャンパス
• [学会発表] New approach of time-resolved CD experiment for a biological application (2010)
  • 著者名/発表者名: Araki, Y.; Murakami, M.; Sakamoto, S.; Wada, T.
  • 学会等名: Pacifichem 2010
  • 発表場所: Honolulu, Hawaii, USA
• [学会発表] DNAに結合したカチオン性ポルフィリンの時間分解円二色性測定による選択的検出 (2009)
  • 著者名/発表者名: 荒木保幸, 村上慎, 坂本清志, 和田健彦
  • 学会等名: 2009年光化学討論会
  • 発表場所: 群馬大学(群馬県)
  • 年月日: 2009-09-18
• [産業財産権] 円二色性測定装置 (2010)
  • 発明者名: 荒木保幸、和田健彦、和田明生
  • 権利者名: 日本分光株式会社
  • 産業財産権番号: 2010-190514
  • 出願年月日: 2010-08-27
• [産業財産権] 特許件 (2010)
  • 発明者名: 荒木保幸、和田健彦、和田明生
  • 権利者名: 日本分光株式会社
  • 産業財産権番号: 2010-190514
  • 出願年月日: 2010-08-27