木質形成過程における転写制御ネットワークの解明

• 研究課題/領域番号: 21770064
• 研究種目: 若手研究(B)
• 配分区分: 補助金
• 研究分野: 植物分子生物・生理学
• 研究機関: 独立行政法人産業技術総合研究所
• 研究代表者: 光田 展隆 独立行政法人産業技術総合研究所, 生物プロセス研究部門, 研究員 (80450667)
• 研究期間 (年度): 2009 – 2011
• 研究課題ステータス: 完了 (2011年度)
• 配分額: 4,420千円 (直接経費: 3,400千円、間接経費: 1,020千円); 2011年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円); 2010年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円); 2009年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円)
• キーワード: 植物 / ゲノム / 発現制御 / 遺伝子 / バイオマス / シロイヌナズナ / 木質 / 転写因子 / 転写制御 / 酵母 / ワンハイブリッド

研究概要

植物の様々な現象に関わる遺伝子制御ネットワークを解明するために、モデル植物であるシロイヌナズナの制御因子だけからなる人工遺伝子ライブラリーを作成し、それを利用して高効率な制御因子の同定を可能とする改良酵母ワンハイブリッド法を開発した。本法を利用して、木質形成に関わる遺伝子の制御領域に結合する制御因子を新規に多数同定し、遺伝子制御ネットワークの全体像がおぼろげながら見えてきた。また、木質を形成しない変異体の表現型を回復できる制御因子を複数同定し、それらの機能解析を行った。

研究成果

• [雑誌論文] A NAC domain protein family contributing to the regulation of wood formation in poplar (2011)
  • 著者名/発表者名: Ohtani, M., Nishikubo, N., Xu B., Yamaguchi, M., Mitsuda, N., and Goue, N., Shi, F., Ohme-Takagi, M., and Demura, T.
  • 雑誌名: Plant J 巻: 67 号: 3 ページ: 499-512
  • DOI: 10.1111/j.1365-313x.2011.04614.x
  • 査読あり
• [雑誌論文] VASCULAR-RELATED NAC-DOMAIN7 directly regulates the expression of a broad range of genes for xylem vessel formation (2011)
  • 著者名/発表者名: Yamaguchi, M., Mitsuda, N., Ohtani, M., Ohme-Takagi, M., Kato, K., and Demura, T
  • 雑誌名: Plant J 巻: 66 号: 4 ページ: 579-590
  • DOI: 10.1111/j.1365-313x.2011.04514.x
  • 査読あり
• [雑誌論文] VASCULAR-RELATED NAC-DOMAIN 7 directly regulates the expression of a broad range of genes for xylem vessel formation (2011)
  • 著者名/発表者名: 山口雅利、光田展隆, ほか
  • 雑誌名: PLANT JOURNAL 巻: (掲載確定)
  • 査読あり
• [雑誌論文] VND-INTERACTING2, a NAC domain transcription factor, negatively regulates xylem vessel formation in Arabidopsis (2010)
  • 著者名/発表者名: Yamaguchi, M., Ohtani, M., Mitsuda, N., Kubo, M., Ohme-Takagi, M., Fukuda, H., and Demura, T.
  • 雑誌名: Plant Cell 巻: 22 号: 4 ページ: 1249-1263
  • DOI: 10.1105/tpc.108.064048
  • 査読あり
• [雑誌論文] Efficient yeast one-/two-hybrid screening using a library composed only of transcription factors in Arabidopsis thaliana (2010)
  • 著者名/発表者名: Mitsuda, N., Ikeda, M., Takada, S., Takiguchi, Y., Kondou, Y., Yoshizumi, T., Fujita, M., Shinozaki, K., Matsui, M., and Ohme-Takagi, M.
  • 雑誌名: Plant Cell Physiol 巻: 51 号: 12 ページ: 2145-2151
  • DOI: 10.1093/pcp/pcq161
  • NAID: 10028056951
  • 査読あり
• [雑誌論文] Efficient Yeast One-/Two-Hybrid Screening Using a Library Composed Only of Transcription Factors in Arabidopsis thaliana (2010)
  • 著者名/発表者名: 光田展隆, ほか
  • 雑誌名: PLANT & CELL PHYSIOLOGY 巻: 51 ページ: 2145-2151
  • NAID: 10028056951
  • 査読あり
• [雑誌論文] VND-INTERACTING2, a NAC Domain Protein, Negatively Regulates Xylem Vessel Formation in Arabidopsis (2010)
  • 著者名/発表者名: 山口雅利、大谷美沙都、光田展隆, ほか
  • 雑誌名: PLANT CELL 巻: 22 ページ: 1249-1263
  • 査読あり
• [雑誌論文] Functional analysis of transcription factors in Arabidopsis. (2009)
  • 著者名/発表者名: 光田展隆, ほか
  • 雑誌名: Plant and Cell Physiology 50 ページ: 1232-1248
  • NAID: 10027341408
  • 査読あり
• [学会発表] 改良酵母ワンハイブリッド法を活用したシロイヌナズナとイネの転写制御ネットワーク解明の試み (2012)
  • 著者名/発表者名: 光田展龍, ほか
  • 学会等名: 第53回日本植物生理学会年会
  • 発表場所: 京都産業大学(京都府)
  • 年月日: 2012-03-16
• [学会発表] Comprehensive study of plant transcription factors (2011)
  • 著者名/発表者名: Nobutaka Mitsuda, et al
  • 学会等名: 22nd International Conference on Arabidopsis Research
  • 発表場所: University of Wisconsin(米国マディソン市)
  • 年月日: 2011-06-22
• [学会発表] 改良酵母ワンハイブリッド法により転写制御ネットワークを明らかにしようとする試み (2011)
  • 著者名/発表者名: 光田展隆, ほか
  • 学会等名: 第52回日本植物生理学会年会
  • 発表場所: 東北大学(仙台市)
  • 年月日: 2011-03-21
• [学会発表] 改良酵母ワンハイブリッド法により転写制御ネットワークを明らかにしようとする試み (2011)
  • 著者名/発表者名: 光田展隆、高木優
  • 学会等名: 第52回日本植物生理学会年会
  • 発表場所: 仙台市
  • 年月日: 2011-03-21
• [学会発表] Comprehensive study of plant transcription factors (2011)
  • 著者名/発表者名: Nobutaka Mitsuda, et al
  • 学会等名: Plant & Animal Genomes XIX Conference
  • 発表場所: 米国サンディエゴ市
  • 年月日: 2011-01-18
• [学会発表] Development of new methods to identify transcription factors that interact with promoter region (2010)
  • 著者名/発表者名: Nobutaka Mitsuda, et al
  • 学会等名: 21st International Conference on Arabidopsis Research
  • 発表場所: パシフィコ横浜(横浜市)
  • 年月日: 2010-06-08
• [学会発表] Development of new methods to identify transcription factors that interact with promoter region (2010)
  • 著者名/発表者名: 光田展隆, ほか
  • 学会等名: 21st International Conference on Arabidopsis Research
  • 発表場所: 横浜市
  • 年月日: 2010-06-08
• [学会発表] 上流転写制御因子を同定する新技術の開発 (2010)
  • 著者名/発表者名: 光田展龍, ほか
  • 学会等名: 第51回日本植物生理学会年会
  • 発表場所: 熊本大学(熊本市)
  • 年月日: 2010-03-20
• [学会発表] 上流転写制御因子を同定する新技術の開発 (2010)
  • 著者名/発表者名: 光田展隆, ほか
  • 学会等名: 日本植物生理学会
  • 発表場所: 熊本大学(熊本県)
  • 年月日: 2010-03-20
• [図書] Biomass to biofuels, strategies for global industries (2011)
  • 著者名/発表者名: Nobutaka Mitsuda, et al.
• [図書] Biomass to biofuels, strategies for global industries (2010)
  • 著者名/発表者名: 光田展隆, ほか
  • 出版者: WILEY