メチル化CpG結合蛋白質による等温DNA増幅反応阻害機構の解析およびその応用

• 研究課題/領域番号: 21H02457
• 研究種目: 基盤研究(B)
• 配分区分: 補助金
• 応募区分: 一般
• 審査区分: 小区分43050:ゲノム生物学関連
• 研究機関: 弘前大学
• 研究代表者: 藤田 敏次 弘前大学, 医学研究科, 准教授 (10550030)
• 研究分担者: 元岡 大祐 大阪大学, 微生物病研究所, 助教 (10636830)
• 研究期間 (年度): 2021-04-01 – 2024-03-31
• 研究課題ステータス: 交付 (2023年度)
• 配分額: 14,820千円 (直接経費: 11,400千円、間接経費: 3,420千円); 2023年度: 4,940千円 (直接経費: 3,800千円、間接経費: 1,140千円); 2022年度: 5,330千円 (直接経費: 4,100千円、間接経費: 1,230千円); 2021年度: 4,550千円 (直接経費: 3,500千円、間接経費: 1,050千円)
• キーワード: メチル化DNA / エピジェネティクス / RPA / 等温増幅

研究開始時の研究の概要

本申請では、特定DNA領域の増幅におけるMBD2のRPA反応阻害様式を明らかにするとともに、ゲノムワイドなDNA増幅についても評価する。また、MBD2を解析した手法をもとに、他のメチル化CpG結合蛋白質等がMBD2と同様の作用機序によってRPA法を阻害するか判別する。さらに、RPA反応以外の等温DNA増幅反応におけるMBD2の影響についても詳細に評価する。以上の解析を通して、MBD2（及び他のメチル化CpG結合蛋白質等）と等温DNA増幅反応を組み合わせた、従来のCpGメチル化検出技術と一線を画す、超高速・高精度なCpGメチル化判定技術の技術基盤の確立につなげる。