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病原微生物の「浸潤進化」に学ぶ休眠遺伝子活性化と創薬シード分子の創製

研究課題

研究課題/領域番号 21H02639
研究種目

基盤研究(B)

配分区分補助金
応募区分一般
審査区分 小区分47050:環境および天然医薬資源学関連
研究機関慶應義塾大学

研究代表者

荒井 緑  慶應義塾大学, 理工学部(矢上), 教授 (40373261)

研究分担者 齋藤 駿  慶應義塾大学, 理工学部(矢上), 講師 (20846117)
研究期間 (年度) 2021-04-01 – 2024-03-31
研究課題ステータス 完了 (2023年度)
配分額 *注記
17,420千円 (直接経費: 13,400千円、間接経費: 4,020千円)
2023年度: 5,070千円 (直接経費: 3,900千円、間接経費: 1,170千円)
2022年度: 5,460千円 (直接経費: 4,200千円、間接経費: 1,260千円)
2021年度: 6,890千円 (直接経費: 5,300千円、間接経費: 1,590千円)
キーワード休眠遺伝子 / 天然物 / 共培養 / 病原真菌 / 免疫抑制作用 / マクロファージ / 微生物 / ケミカルバイオロジー / 進化
研究開始時の研究の概要

我々は「病原微生物と動物細胞との共培養」による微生物の休眠遺伝子活性化法を開発した.本研究では病原微生物が免疫細胞の攻撃に打ち勝とうと,化合物を生産する能力に着目する.新規構造と新規活性の天然物が多く含まれる「共培養エキスライブラリー」を作成し,独自手法の「標的タンパク質指向型天然物単離法」によりタンパク質に結合する活性天然物を迅速に単離・構造決定する.得られた天然物の生物活性を検証し,神経再生,抗がんへも応用する.さらに合成化学,計算科学により誘導体展開しより高活性な化合物を得,作用機序解析を行いこれまでに無い新規医薬シード創出を目指す.

研究成果の概要

我々は,病原微生物と動物細胞の共培養法を開発し,微生物の休眠遺伝子活性化に成功した.この新規手法は,疑似感染状態を模倣したもので,国内外でも初めての例であり独創的で新規性が高い.臨床検体から分離された病原真菌と免疫細胞を様々な条件下共培養を行い,共培養特異的化合物を見いだした.共培養特異的化合物には,大変興味深いことに免疫抑制作用を示す化合物が複数見いだされた.本共培養法を病原菌だけでなく,酒,味噌等を作る麹カビや,熱に耐性の耐熱カビ,また乳酸菌にも適用し,それぞれが共培養特異的化合物を生産しうることを突き止めた.またその生産メカニズムの解明研究も行い,興味深い知見を得ることができた.

研究成果の学術的意義や社会的意義

放線菌や真菌は,多くの有用な化合物を提供してきた.しかしながらその遺伝子は2割程度しか働いておらず,新たな新規天然物を生産するであろう生合成遺伝子が眠ったままの休眠遺伝子であることがわかっている.したがって,この休眠遺伝子を活性化する新規な方法が熱望されており,本研究で開発した動物細胞と真菌の共培養法での新規天然物の取得は,学術的意義が大変高い.また,得られた天然物は免疫抑制作用を持つものも多く,自己免疫疾患や,免疫異常が含まれる多発性硬化症の治療薬など,多くの難病の医薬シードになり得るため,社会的意義も大変,大きいと考えられる.

報告書

(4件)
  • 2023 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2022 実績報告書
  • 2021 実績報告書
  • 研究成果

    (39件)

すべて 2024 2023 2022 2021 2020 その他

すべて 雑誌論文 (11件) (うち国際共著 1件、 査読あり 11件) 学会発表 (24件) (うち国際学会 7件、 招待講演 11件) 備考 (4件)

  • [雑誌論文] 3-Hydroxy-3-(2-oxopropyl) indolin-2-one, a product of a human-derived Enterocloster strain, is an inhibitor of nitric oxide production2024

    • 著者名/発表者名
      Saito, S.; Banno, T.; Arai, M. A.
    • 雑誌名

      Biosci. Biotechnol. Biochem.

      巻: 88 号: 3 ページ: 316-321

    • DOI

      10.1093/bbb/zbad172

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Notch activator cyclopiazonic acid induces apoptosis in HL-60 cells through calcineurin activation2024

    • 著者名/発表者名
      Suzuki, S.; Saito, S.; Narushima, Y.; Kodani, S.; Kagaya, N.; Suenaga, H.; Shin-ya, K.; Arai, M. A.
    • 雑誌名

      J. Antibiot.

      巻: 77 号: 1 ページ: 30-38

    • DOI

      10.1038/s41429-023-00673-4

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Dihydromaniwamycin E, a heat-shock metabolite from thermotolerant Streptomyces sp. JA74, exhibits antiviral activity against influenza and SARS-CoV-2 viruses2022

    • 著者名/発表者名
      Saito, S.; Funayama, K.; Kato, W.; Okuda, M.; Kawamoto, M.; Matsubara, T.; Sato, T.; Sato, A.; Otsuguro, S.; Sasaki, M.; Orba, Y.; Sawa, H.; Maenaka, K.; Shindo, K.; Imoto, M.; Arai, M. A.
    • 雑誌名

      J. Nat. Prod.

      巻: 85 号: 11 ページ: 2583-2591

    • DOI

      10.1021/acs.jnatprod.2c00550

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Noaoxazole, a new heat shock metabolite produced by thermotolerant Streptomyces sp. HR412022

    • 著者名/発表者名
      Saito, S.; Suzuki, S.; Arai, M. A.
    • 雑誌名

      J. Antibiot.

      巻: 75 号: 9 ページ: 509-513

    • DOI

      10.1038/s41429-022-00551-5

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Two bioactive compounds, uniformides A and B, isolated from a culture of Nocardia uniformis IFM0856T in the presence of animal cells2022

    • 著者名/発表者名
      Hara, Y.; Watanabe, K.; Takaya, A.; Ebihara, I.; Manome, T.; Arai, M. A.; Yaguchi, T.; Ishibashi, M.
    • 雑誌名

      Org. Lett.

      巻: 24 号: 27 ページ: 4998-5002

    • DOI

      10.1021/acs.orglett.2c02092

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Identification of 1 α,2β-epoxytagitinin C as a Notch inhibitor, oxidative stress mechanism and its anti-leukemia activity2022

    • 著者名/発表者名
      Makita, Y.; Saito, S.; Tsuchiya, A.; Ishibashi, M.; Arai, M. A.
    • 雑誌名

      J. Nat. Med.

      巻: 76 号: 1 ページ: 234-243

    • DOI

      10.1007/s11418-021-01584-0

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Evaluation of naturally occurring HIF-1 inhibitors for pulmonary arterial hypertension2021

    • 著者名/発表者名
      Midori A. Arai, Kota Sakuraba, Yoshinori Makita, Yasumasa Hara, Masami Ishibashi
    • 雑誌名

      ChemBioChem

      巻: 22 号: 18 ページ: 2799-2804

    • DOI

      10.1002/cbic.202100223

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Practical Stereoselective Synthesis of C3‐Spirooxindole‐ and C2‐Spiropseudoindoxyl‐Pyrrolidines via Organocatalyzed Pictet‐Spengler Reaction/Oxidative Rearrangement Sequence2021

    • 著者名/発表者名
      Kondo Masaru、Matsuyama Naoki、Aye Tin Z.、Mattan Irshad、Sato Tomoyuki、Makita Yoshinori、Ishibashi Masami、Arai Midori A.、Takizawa Shinobu、Sasai Hiroaki
    • 雑誌名

      Advanced Synthesis & Catalysis

      巻: 363 号: 10 ページ: 1-17

    • DOI

      10.1002/adsc.202001472

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Acacienone, a terpenoid-like natural product having an unprecedented C20 framework isolated from Acacia mangium leaves2021

    • 著者名/発表者名
      Yasumasa Hara, Yuichi Totsugi, Hiroshi Ichikawa, Shinji Harada, Kazuki Fujii, Firoj Ahmed, Samir K. Sadhu, Midori A. Arai, Masami Ishibashi
    • 雑誌名

      Journal of Natural Medicines

      巻: 75 号: 1 ページ: 99-104

    • DOI

      10.1007/s11418-020-01457-y

    • NAID

      40022463001

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Target Protein-Oriented Isolations for Bioactive Natural Products2021

    • 著者名/発表者名
      Arai Midori A.
    • 雑誌名

      Chem. Pharm. Bull.

      巻: 69 ページ: 503-515

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Isolation of nocobactin NAs as Notch signal inhibitors from Nocardia farcinica, a possibility of invasive evolution2020

    • 著者名/発表者名
      Arai Midori A.、Ebihara Itsuki、Makita Yoshinori、Hara Yasumasa、Yaguchi Takashi、Ishibashi Masami
    • 雑誌名

      The Journal of Antibiotics

      巻: 74 号: 4 ページ: 255-259

    • DOI

      10.1038/s41429-020-00393-z

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] 病原真菌と動物細胞の共培養による共培養特異的化合物の取得、およびその産生メカニズム2024

    • 著者名/発表者名
      荒井緑
    • 学会等名
      日本微生物資源学会,公益財団法人発酵研究所 学会・研究部会助成 公開シンポジウム「微生物リソース整備とその利活用:現状と今後の展望」
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 天然物に学ぶケミカルバイオロジー研究2023

    • 著者名/発表者名
      荒井緑
    • 学会等名
      第35回万有札幌シンポジウム「有機合成の限界を超える」
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 天然物に学ぶケミカルバイオロジー研究2023

    • 著者名/発表者名
      荒井緑
    • 学会等名
      第31回千葉大学大学院薬学研究院 薬友会生涯教育セミナー・宮木高明記念講演会「基礎から創薬へ」
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 合成とものとりが拓く天然物ケミカルバイオロジー2023

    • 著者名/発表者名
      荒井緑
    • 学会等名
      Visionary農芸化学100シンポジウム
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 合成とものとりが拓く天然物ケミカルバイオロジー2023

    • 著者名/発表者名
      荒井緑
    • 学会等名
      第18回有機合成化学談話会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Two approaches for isolation of bioactive natural products: Fishing by protein-beads and microorganism-animal cells co-incubation2023

    • 著者名/発表者名
      M. A. Arai
    • 学会等名
      Future Drug Discovery Empowered by Chemical Biology
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Chemical biology of heat shock metabolites (HSM) produced by Streptomyces species2023

    • 著者名/発表者名
      S. Saito, Y. Okumura, K. Funayama, W. Kato, M. A. Arai
    • 学会等名
      Future Drug Discovery Empowered by Chemical Biology
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Co-culture of pathogenic fungi Aspergillus species and immune cells for activating silent genes2023

    • 著者名/発表者名
      Y. Ujie, S. Saito, K. Fukaya, D. Urabe, T. Yaguchi, M. A. Arai
    • 学会等名
      Future Drug Discovery Empowered by Chemical Biology
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 新規探索法による生物活性天然物の開拓2022

    • 著者名/発表者名
      荒井緑
    • 学会等名
      新薬創製談話会「シン・新薬創製談話会」
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 合成とものとりが拓く天然物ケミカルバイオロジー2022

    • 著者名/発表者名
      荒井緑
    • 学会等名
      第66回 日本薬学会関東支部大会シンポジウム 「薬学の未来を開く有機化学」
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 乳酸菌と動物細胞の共培養による有用物質の探索2022

    • 著者名/発表者名
      細内梨央, 齋藤駿, 荒井緑
    • 学会等名
      第9回食品薬学シンポジウム
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] 麹菌Aspergillus luchuensisと動物細胞の共培養法による新規化合物の探索2022

    • 著者名/発表者名
      浅野友里, 齋藤駿, 矢口貴志, 荒井緑
    • 学会等名
      第9回食品薬学シンポジウム
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] 休眠遺伝子活性化を目指した病原真菌と免疫細胞の共培養2022

    • 著者名/発表者名
      氏江優希子, 齋藤駿, 矢口貴志, 荒井緑
    • 学会等名
      日本ケミカルバイオロジー学会 第16回年会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] 麹菌Aspergillus luchuensisと動物細胞の共培養法による新規化合物の探索2022

    • 著者名/発表者名
      浅野友里, 齋藤駿, 矢口貴志, 荒井緑
    • 学会等名
      日本ケミカルバイオロジー学会 第16回年会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] Ascl1発現阻害作用を有するヘテロ環含有ロカグラミド誘導体の創製 (第2報)2022

    • 著者名/発表者名
      蒔田吉功,齋藤 駿,石橋正己,荒井 緑
    • 学会等名
      日本薬学会第142年会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] 病原真菌と免疫細胞の共培養法を用いた休眠遺伝子活性化による新規天然物の探索2022

    • 著者名/発表者名
      氏江優希子,齋藤 駿,矢口貴志,荒井 緑
    • 学会等名
      日本薬学会第142年会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] 腸内細菌が生産する代謝物からの免疫機能制御物質の探索2022

    • 著者名/発表者名
      細内梨央,齋藤 駿,荒井 緑
    • 学会等名
      日本薬学会第142年会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] 耐熱性放線菌JA74株が生産する熱ショック代謝物maniwamycin類の全合成及び生物活性評価2022

    • 著者名/発表者名
      船山佳世,齋藤 駿,加藤 航,新藤一敏,川本芽子,松原輝彦,佐藤智典,乙黒聡子,前仲 勝実,井本正哉,荒井 緑
    • 学会等名
      日本薬学会第142年会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] Search for bioactive natural products by original methods: Fishing by protein-beads and microorganism-animal cells co-incubation2021

    • 著者名/発表者名
      Arai Midori A.
    • 学会等名
      Pacifichem2021
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] 新規探索法による生物活性天然物の開拓:魚釣り法と微生物ー動物細胞共培養法2021

    • 著者名/発表者名
      荒井緑
    • 学会等名
      有機合成化学講習会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 新規探索法による生物活性天然物の開拓 :魚釣り法と微生物―動物細胞共培養法2021

    • 著者名/発表者名
      荒井緑
    • 学会等名
      近畿化学協会合成部会 第1回合成フォーラム
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Synthesis of rocaglamide derivatives with TRAIL-resistance overcoming activity2021

    • 著者名/発表者名
      Y. Makita, M. A. Arai, M. Ishibashi
    • 学会等名
      Pacifichem2021
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Search for new natural products from pathogenic actinomycetes of the genus Nocardia by co-culture with animal cells2021

    • 著者名/発表者名
      Y. Hara, M. A. Arai, T. Yaguchi, M. Ishibashi
    • 学会等名
      Pacifichem2021
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Search for natural products with BMI1 promoter inhibitory activity from Andrographis paniculata2021

    • 著者名/発表者名
      K. Fujii, M. A. Arai, Y. Hara, S. K. Sadhu, F. Ahmed, M. Ishibashi
    • 学会等名
      Pacifichem2021
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 国際学会
  • [備考] 荒井研究室HP

    • URL

      https://keiochembio.com

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [備考] researchmap

    • URL

      https://researchmap.jp/mido_arai

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [備考] 慶應義塾大学理工学部生命情報学科 荒井研究室HP

    • URL

      https://keiochembio.com

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [備考] 慶應義塾大学理工学部生命情報学科 ケミカルバイオロジー研究室

    • URL

      https://keiochembio.com

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書

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公開日: 2021-04-28   更新日: 2025-11-21  

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