| 研究課題/領域番号 |
21H04358
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| 研究種目 |
基盤研究(A)
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| 配分区分 | 補助金 |
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| 応募区分 | 一般 |
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| 審査区分 |
中区分3:歴史学、考古学、博物館学およびその関連分野
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| 研究機関 | 金沢大学 |
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研究代表者 |
覚張 隆史 金沢大学, 古代文明・文化資源学研究所, 助教 (70749530)
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| 研究分担者 |
松前 ひろみ 東海大学, 医学部, 助教 (00735681)
金原 正明 奈良教育大学, ESD・SDGsセンター, 研究部員 (10335466)
本橋 慶一 東京農業大学, 国際食料情報学部, 教授 (10527542)
岡崎 健治 鳥取大学, 医学部, 助教 (10632937)
中込 滋樹 金沢大学, 古代文明・文化資源学研究所, 客員准教授 (40625208)
石谷 孔司 国立研究開発法人産業技術総合研究所, 生命工学領域, 研究員 (40826062)
細川 正人 早稲田大学, 理工学術院, 准教授(任期付) (60722981)
和久 大介 東京農業大学, 国際食料情報学部, 助教 (60793578)
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| 研究期間 (年度) |
2021-04-05 – 2024-03-31
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| 研究課題ステータス |
完了 (2023年度)
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| 配分額 *注記 |
42,250千円 (直接経費: 32,500千円、間接経費: 9,750千円)
2023年度: 11,570千円 (直接経費: 8,900千円、間接経費: 2,670千円)
2022年度: 12,870千円 (直接経費: 9,900千円、間接経費: 2,970千円)
2021年度: 17,810千円 (直接経費: 13,700千円、間接経費: 4,110千円)
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| キーワード | パレオゲノミクス / 微量サンプリング / 古人骨 / 絶滅哺乳類 / 植物病理標本 / 寄生虫卵 / シングルセル / 絶滅動物 / 植物標本 / シングルセル解析 / 遺跡出土骨 / 博物館 / 生物標本 |
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| 研究開始時の研究の概要 |
遺跡から出土する骨や寄生虫卵などの微化石、博物館に収蔵されている生物標本のゲノム解析をパレオゲノミクスと呼ぶ。これまでのパレオゲノミクスは、保存状態が劣悪な資料から高品質のゲノムデータを取得することが困難であったため、新たな技術の応用が求められていた。本研究は1細胞分取技術（シングルセル解析）をパレオゲノミクスに応用し、「難ゲノム配列決定資料群」からの高品質なゲノムデータ取得と集団ゲノム解析を試みる。
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| 研究成果の概要 |
本研究は、これまで蓄積されてきたパレオゲノミクス（古代ゲノム分析）の分析手法を博物館に収蔵された様々な生物資料へ応用することを目的として実施された。特に、劣化度合いが強い多様な標本を対象にしたゲノム解析の新たな展開として、微量サンプリングによるパレオゲノミクスを実践し、これまで分析が困難であった「難ゲノム解析資料群」からゲノムデータ取得及び取得ゲノムデータを用いた比較ゲノム解析を実践することを試みた。古人骨、博物館の絶滅哺乳動物、真菌類標本、植物病理標本、寄生虫卵などを対象としたパレオゲノミクスを実施し、これまで分析が困難であった資料群へパレオゲノミクスが応用できることを実証した。
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| 研究成果の学術的意義や社会的意義 |
これまでのパレオゲノミクス研究は、DNA分子の保存環境が良好な資料を対象にした研究が中心的であったが、既存のパレオゲノミクスの手法では分析が困難な「難ゲノム解析資料群」が膨大な数存在している。これらの資料からゲノムデータを取得することが可能になれば、今まではDNAが保存されやすい地域や時代だけの点々としたデータを比較解析していた研究の制約状況を改善することができ、これまで以上に膨大な資料群のゲノムデータを用いた新しいパレオゲノミクスの研究が可能になると期待される。新たな分析手法を応用することで、生物学だけでなく、農学や法医学などの他分野の研究領域に対しても、有益な情報を提示できる考えられる。
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