研究課題/領域番号 |
21K05327
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研究種目 |
基盤研究(C)
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配分区分 | 基金 |
応募区分 | 一般 |
審査区分 |
小区分38010:植物栄養学および土壌学関連
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研究機関 | 香川大学 |
研究代表者 |
野村 美加 香川大学, 農学部, 教授 (50294749)
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研究期間 (年度) |
2021-04-01 – 2024-03-31
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研究課題ステータス |
完了 (2023年度)
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配分額 *注記 |
4,030千円 (直接経費: 3,100千円、間接経費: 930千円)
2023年度: 910千円 (直接経費: 700千円、間接経費: 210千円)
2022年度: 780千円 (直接経費: 600千円、間接経費: 180千円)
2021年度: 2,340千円 (直接経費: 1,800千円、間接経費: 540千円)
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キーワード | SNARE / nodule / LORE1 mutant / Legume / legume / LjSYP132 / スプライスバリアント / 根粒 / 花粉管伸長 / 共生 / マメ科植物 |
研究開始時の研究の概要 |
根粒菌がマメ科植物に感染すると根粒器官を形成し、共生窒素固定を行う。申請者は、根粒形成・窒素固定形成のための膜輸送に関与するLjSYP132sは、選択的スプライシングによりスプライスバリアントを生産し、LjSYP132aは感染糸からシンビオゾームへ到達する根粒形成メカニズムに、LjSYP132bは花粉管が伸長して受精の場へ到達する種子形成メカニズムに関与していることを見出した。本申請課題では、LjSYP132sのスプライスバリアントに着目し、未だその制御機構が不明な選択的スプライシングの実体についてその全容を解明することを目標としている。
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研究実績の概要 |
近年のゲノム情報や、mRNAの網羅的解析により一つの転写産物から多様なmRNAを生産できるmRNA前駆体の選択的スプライシングが主要な役割を担っていると考えられるようになったがその制御機構は不明である。根粒菌がマメ科植物に感染すると根粒器官を形成し、共生窒素固定を行う。申請者は、根粒形成・窒素固定形成のための膜輸送に関与するLjSYP132は、選択的スプライシングによりスプライスバリアント(LjSYP132aとLjSYP132bと名付けた)を生産し、LjSYP132aは感染糸からシンビオゾームへ到達する根粒形成メカニズムに、LjSYP132bは花粉管が伸長して受精の場へ到達する種子形成メカニズムに関与していることを見出した。 本申請課題では、LjSYP132sのスプライスバリアントに着目し、それぞれの細胞内局在性と機能相補性を調べ、選択的スプライシングに重要なシス領域を決定することで未だその制御機構が不明な選択的スプライシングの実体についてその全容を解明することを目的とした。 LjSYP132bLORE1変異体を利用して解析した結果、LjSYP132bの発現が減少するとLjSYP132aの発現が増加することが明らかとなった。またFLAG-タグを付加した細胞内局在性を確認した結果LjSYP132aもLjSYP132bも局在は変化しないことが明らかとなった。また、第14エキソンにはnon-codingRNAが発現することも明らかとなった。以上の結果から、LjSYP132aスプライシングバリアントはLjSY132bによって制御されておりncRNAが関与していることが裏付けられた。
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