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カリウムチャネルKcsAの脂質内高分解能構造解析によるゲーティング機構の解明

研究課題

研究課題/領域番号 21K06030
研究種目

基盤研究(C)

配分区分基金
応募区分一般
審査区分 小区分43020:構造生物化学関連
研究機関大阪大学

研究代表者

高崎 寛子  大阪大学, 蛋白質研究所, 助教 (50610432)

研究分担者 清水 啓史  福井大学, 学術研究院医学系部門, 講師 (50324158)
安永 卓生  九州工業大学, 大学院情報工学研究院, 教授 (60251394)
研究期間 (年度) 2021-04-01 – 2024-03-31
研究課題ステータス 完了 (2023年度)
配分額 *注記
4,160千円 (直接経費: 3,200千円、間接経費: 960千円)
2023年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
2022年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
2021年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
キーワードチャネルタンパク質 / クライオ電子顕微鏡 / 単粒子解析 / ナノディスク / 膜タンパク質
研究開始時の研究の概要

カリウムチャネルKcsAは、分子量70k Daと非常に小さく、チャネル機能を示す最小単位と考えられている。その膜貫通部位の構造は、原核生物からヒトに至るまで高く保存され、さらにナトリウムやカルシウムのイオンチャネルとも共通している。このことから、KcsAをイオンチャネルのモデルタンパク質として用い、様々な研究が進められている。
本研究では、クライオ電子顕微鏡・単粒子解析法を用いて、生体内と同じ脂質二重膜内にあるKcsAの高分解能構造を取得し、多様に存在するイオンチャネル間にある共通のゲーティング機構を原子レベルで明らかにする。

研究成果の概要

本研究は、イオンチャネルのモデルタンパク質であるKcsAの構造解析を行い、多様に存在するイオンチャネル間の共通のゲーティング機構を明らかにすることを目的としている。目的達成のため、ナノディスク技術を用いて、生体内と同じ脂質二重膜内に存在するKcsAの構造解析を行うこととした。
本研究では、KcsAの活性が確認されているPOPEとPOPGの3:1混合脂質を用い、KcsAを含むナノディスク形成に成功した。これにより、今後の構造解析の基盤を作ることができた。また、KcsAを脂質二重膜内に埋め込んだ状態でのMDシミュレーションを開始し、動態解析やこれまでの構造解析の結果を含め、議論を進めている。

研究成果の学術的意義や社会的意義

カリウムチャネルのKcsAは、分子量70 kDaと非常に小さく、チャネル機能を示す最小単位と考えられる。その膜貫通部位の構造は、原核生物からヒトに至るまで高く保存され、さらにナトリウムやカルシウムのイオンチャネルとも共通する。KcsAの結晶構造は、KcsAを界面活性剤で可溶化し、さらに抗体を結合させた、特殊な構造であったため、より生体内に近い自然な状態での高分解能構造取得が求められている。
本研究によりナノディスク形成に成功したことで、KcsAの構造解析によってイオンチャネル共通のゲーティング機構を解明する基盤が整ったことは学術的に意義深く、それを用いた機能解析など、応用が期待される。

報告書

(4件)
  • 2023 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2022 実施状況報告書
  • 2021 実施状況報告書
  • 研究成果

    (10件)

すべて 2023 2022 2021

すべて 学会発表 (10件) (うち国際学会 3件)

  • [学会発表] Microfluidic-Based Diffracted X-ray Tracking Method for Precise Recording of Ion Channel Motion in Response to Sequential Chemical Solution Changes2023

    • 著者名/発表者名
      Yusuke Asagoe, Hirofumi Shimizu, Yoshikazu Hirai
    • 学会等名
      The 27th International Conference on Miniaturized Systems for Chemistry and Life Sciences
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Microfluidic Device for Diffracted X-ray Tracking Method to Measure the Conformational Change of Ion Channel in Response to Chemical Stimuli2023

    • 著者名/発表者名
      Yusuke Asagoe, Hirofumi Shimizu, Yoshikazu Hirai
    • 学会等名
      The 19th IEEE International Conference on Nano/Micro Engineered and Molecular Systems
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] pH変化に対するKcsAイオンチャネルの運動応答を解析するためのX線1分子動態計測用流体デバイス2023

    • 著者名/発表者名
      浅越雄介, 清水啓史, 平井義和
    • 学会等名
      化学とマイクロ・ナノシステム学会第47回研究会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] 化学刺激によるイオンチャネル構造変化を解析する1分子動態計測技術2023

    • 著者名/発表者名
      琴屋健太郎, 山内一慶, 清水啓史, 平井義和
    • 学会等名
      第40回「センサ・マイクロマシンと応用システム」シンポジウム
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] A new gating model of K+ channel based on cryo-EM structures and single-molecule dynamics measurements with x-ray2023

    • 著者名/発表者名
      Hirofumi Shimizu, Hiroko Takasaki, Yoshikazu Hirai, Takuo Yasunaga
    • 学会等名
      日本生理学会 第100回記念大会
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [学会発表] KcsA K+ Channel Structure Incorporated into Nanodisc2022

    • 著者名/発表者名
      Hiroko Takazaki, Hirofumi Shimizu, Takuo Yasunaga
    • 学会等名
      第60回日本生物物理学会年会
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [学会発表] Structural Basis for pH-gating of the K+ channel KcsA2022

    • 著者名/発表者名
      Hiroko Takazaki, Hirofumi Shimizu, Takuo Yasunaga
    • 学会等名
      日本顕微鏡学会2022年度若手シンポジウム
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [学会発表] Conformational Changes of KcsA K+ Channel upon Gating2021

    • 著者名/発表者名
      Hiroko Takazaki
    • 学会等名
      the PDB 50th Anniversary Symposium in Asia
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] カリウムチャネルKcsAの開閉にともなう構造変化 Conformational Changes of KcsA K+ Channel upon Gating2021

    • 著者名/発表者名
      髙﨑寛子, 清水啓史, 安永卓生
    • 学会等名
      第59回日本生物物理学会年会
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
  • [学会発表] カリウムチャネルKcsAの開閉時の構造変化 Conformational Changes between the Closed and Open States in KcsA K+ Channel2021

    • 著者名/発表者名
      髙﨑寛子, 清水啓史, 安永卓生
    • 学会等名
      日本顕微鏡学会 第64回シンポジウム
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書

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公開日: 2021-04-28   更新日: 2025-01-30  

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