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プロテオゲノミクス解析と患者由来モデルを用いた腹膜偽粘液腫の新しい治療法の開発

研究課題

研究課題/領域番号 21K08743
研究種目

基盤研究(C)

配分区分基金
応募区分一般
審査区分 小区分55020:消化器外科学関連
研究機関国立研究開発法人国立がん研究センター

研究代表者

野口 玲  国立研究開発法人国立がん研究センター, 研究所, 研究員 (30779682)

研究分担者 小迫 英尊  徳島大学, 先端酵素学研究所, 教授 (10291171)
近藤 格  国立研究開発法人国立がん研究センター, 研究所, 分野長 (30284061)
亀山 昭彦  国立研究開発法人産業技術総合研究所, 生命工学領域, 上級主任研究員 (80415661)
研究期間 (年度) 2021-04-01 – 2024-03-31
研究課題ステータス 完了 (2023年度)
配分額 *注記
4,160千円 (直接経費: 3,200千円、間接経費: 960千円)
2023年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
2022年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
2021年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円)
キーワードpseudomyxoma peritonei / patient-derived model / proteogenomics / 腹膜偽粘液腫 / 患者由来がんモデル / プロテオゲノミクス / 薬剤感受性試験 / 糖鎖
研究開始時の研究の概要

本研究の目的は、希少で難治な腹膜偽粘液腫(Pseudomyxoma peritonei: PMP)の治療法の開発に向けて、病態の分子生物学的背景の理解に基づき、抗がん剤および治療標的を見つけることである。PMPの全ゲノムシークエンス解析・RNA-Seq解析を行い、患者由来PMP細胞株を樹立した。本研究では、PMPの腫瘍組織を用いてプロテオミゲノミクス解析を行い、治療標的を同定する。患者由来細胞株を用いて抗がん剤スクリーニングを行い、有効な抗がん剤を同定する。PMPが産生する粘液(ムチン)の特性を分子マトリックス電気泳動及び糖鎖修飾解析で明らかにし、粘液を減量・除去する方法に資する知見を得る。

研究成果の概要

腹膜偽粘液腫(PMP)は粘液を産生する腫瘍細胞が腹腔に播種することで症状を呈する希少がんである。原発巣の切除、粘液の除去、腹腔内の灌流化学療法を組み合わせた複合治療が主流で、生命予後は改善された。しかし、術後再発や高率の合併症を発生し、新たな治療法開発が求められている。研究の目的は、PMPの治療法の開発に向けて、抗がん剤および治療標的を見つけることである。本研究では、申請者が樹立したPMPの患者由来細胞株を用いて、薬剤スクリーニングを行い、有効な抗がん剤を同定した。またPMPの大規模検体を用いてのプロテオゲノミクス解析のために、ホルマリン固定標本からのタンパク質抽出法を確立した。

研究成果の学術的意義や社会的意義

本研究成果により、腹膜偽粘液腫の患者由来細胞株を用いて、薬剤スクリーニングを行い、未だかつてない規模での薬剤の奏効性を調べることができた。また今までに取得した全ゲノムデータやRNA-Seqのデータから推測された治療標的から推測した薬剤と薬剤スクリーニングで実際奏効する薬剤の両方を検討することができた。これにより、患者由来モデルを用いての機能的アプローチと分子背景からの治療標的の同定の理論的アプローチの両方が重要であることがわかった。

報告書

(4件)
  • 2023 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2022 実施状況報告書
  • 2021 実施状況報告書
  • 研究成果

    (7件)

すべて 2024 2023 2022 2021

すべて 雑誌論文 (4件) (うち査読あり 4件、 オープンアクセス 4件) 学会発表 (3件) (うち招待講演 2件)

  • [雑誌論文] Genome-Wide Analysis of DNA Methylation in Pseudomyxoma Peritonei Originated from Appendiceal Neoplasms2024

    • 著者名/発表者名
      Takane Kiyoko、Cai Tingwei、Noguchi Rei、Gohda Yoshimasa、Ikenoue Tsuneo、Yamaguchi Kiyoshi、Ota Yasunori、Kiyomatsu Tomomichi、Yano Hideaki、Fukuyo Masaki、Seki Motoaki、Bahityar Rahmutulla、Kaneda Atsushi、Furukawa Yoichi
    • 雑誌名

      Oncology

      巻: - 号: 8 ページ: 1-12

    • DOI

      10.1159/000536219

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Establishment and characterization of NCC-PMP2-C1: a novel patient-derived cell line of pseudomyxoma peritonei with signet ring cells2023

    • 著者名/発表者名
      Noguchi Rei、Yoshimatsu Yuki、Sin Yooksil、Ono Takuya、Tsuchiya Ryuto、Yoshida Hiroshi、Kiyono Tohru、Yonemura Yutaka、Kondo Tadashi
    • 雑誌名

      Human Cell

      巻: 37 号: 2 ページ: 511-522

    • DOI

      10.1007/s13577-023-01015-0

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Correction: Noguchi et al. Establishment and Characterization of NCC-PMP1-C1: A Novel Patient-Derived Cell Line of Metastatic Pseudomyxoma Peritonei. J. Pers. Med. 2022, 12, 2582023

    • 著者名/発表者名
      Noguchi Rei、Yoshimatsu Yuki、Sin Yooksil、Ono Takuya、Tsuchiya Ryuto、Yoshida Hiroshi、Kiyono Tohru、Yonemura Yutaka、Kondo Tadashi
    • 雑誌名

      Journal of Personalized Medicine

      巻: 13 号: 9 ページ: 1383-1383

    • DOI

      10.3390/jpm13091383

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Establishment and Characterization of NCC-PMP1-C1: A Novel Patient-Derived Cell Line of Metastatic Pseudomyxoma Peritonei2022

    • 著者名/発表者名
      Noguchi Rei、Yoshimatsu Yuki、Sin Yooksil、Ono Takuya、Tsuchiya Ryuto、Yoshida Hiroshi、Kiyono Tohru、Yonemura Yutaka、Kondo Tadashi
    • 雑誌名

      Journal of Personalized Medicine

      巻: 12 号: 2 ページ: 258-258

    • DOI

      10.3390/jpm12020258

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書 2022 実施状況報告書 2021 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] 超希少がん、腹膜偽粘液腫の治療開発:患者由来細胞株の樹立と抗がん剤の同定2022

    • 著者名/発表者名
      野口玲、吉松有紀、申育實、大﨑珠理亜、秋山太郎、安達雄輝、小野拓、 町田香織、栁原五吉、吉田裕、清野透、米村豊、近藤格
    • 学会等名
      日本患者由来がんモデル学会
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [学会発表] 腹膜偽粘液腫の基礎研究2021

    • 著者名/発表者名
      野口玲
    • 学会等名
      第9階腹膜偽粘液腫患者の支援の会
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 私と基礎研究 隣の芝生へ飛び込め!2021

    • 著者名/発表者名
      野口玲
    • 学会等名
      武蔵野大学 薬学部
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
    • 招待講演

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公開日: 2021-04-28   更新日: 2025-01-30  

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