研究課題/領域番号 |
21K10418
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研究種目 |
基盤研究(C)
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配分区分 | 基金 |
応募区分 | 一般 |
審査区分 |
小区分58020:衛生学および公衆衛生学分野関連:実験系を含む
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研究機関 | 埼玉県立大学 |
研究代表者 |
岸井 こずゑ 埼玉県立大学, 保健医療福祉学部, 准教授 (10629570)
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研究期間 (年度) |
2021-04-01 – 2025-03-31
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研究課題ステータス |
交付 (2022年度)
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配分額 *注記 |
2,600千円 (直接経費: 2,000千円、間接経費: 600千円)
2024年度: 130千円 (直接経費: 100千円、間接経費: 30千円)
2023年度: 780千円 (直接経費: 600千円、間接経費: 180千円)
2022年度: 390千円 (直接経費: 300千円、間接経費: 90千円)
2021年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
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キーワード | One health approach / 下水流入水 / 臨床由来株 / ESBL産生大腸菌 / blaCTX-M-27 / ST131 / blaCTX-M-9 group / blaCTX-M-1 group |
研究開始時の研究の概要 |
ESBL産生大腸菌は、1980年代から欧米で出現し、瞬く間に全世界の医療機関に広まった。我が国では、2000年代に入り徐々に増加が見られ、その後、急激に増加した。近年では、健常者の腸管内にESBL 産生大腸菌が保菌されていることも明らかにされ、ESBL 産生菌の感染対策には、臨床だけではなく市中及び環境を含め、継続的に監視する必要性が高まっている。本研究では、環境及び臨床由来ESBL産生 大腸菌を対象として薬剤感受性試験、耐性遺伝子解析及び全ゲノム解析を行い、各分野の薬剤耐性の状況や相互の関係性を明らかにすることを目的とする。本研究結果は、環境及び臨床の垣根を超えた感染制御に大きく貢献する。
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研究実績の概要 |
本研究は、埼玉県内の環境及び臨床由来ESBL産生Escherichia coliを対象として薬剤感受性試験、耐性遺伝子解析および全ゲノム解析を行い、各分野の薬剤耐性の状況や相互の関係性を明らかにすることを目的とする。本年度は、埼玉県内の下水処理場流入水(2020年10, 12月, 2021年2, 4, 6, 8月採水)より分離したESBL産生E. coli 30株および当該下水処理場の流域下水道処理区域内の病院から同時期に分離された臨床由来ESBL産生 E. coli 55株の詳細なCTX-M遺伝子型を決定し、さらにMLSTによる菌株の系統解析を進めた。CTX-M遺伝子型については、臨床由来株ではCTX-M-27(44.4%)が最も多かったが、下水由来株ではCTX-M-15(30.0%)やCTX-M-14(23.3%)がCTX-M-27(20.0%)よりも多く検出された。MLST型については、臨床由来株のSTはST131が81.5%を占め、圧倒的に高い割合となった。ST131に次いで多く見られたSTは、近年徐々に増加傾向を示すハイリスククローンとして報告されているST1193(5.6%)であった。一方、下水由来株のSTにおいては、ST131(26.7%)が最多、次いでST1193(16.7%)が多く見られたが、臨床由来株に比べてST1193の占める割合が高い結果となり、他にも非常に多種類のSTが検出された。いくつかのSTがCCとしてまとめられたが、独立性の高いSTが多く、臨床由来株に比べてバリエーションに富んでいた。起源が多様なため、臨床では見られていないクローンも含め網羅的に検出された可能性が示唆される。今後は、下水および臨床から分離されたESBL産生E. coliの中から各STの代表株を選び、既に全ゲノム配列が決定している基準株を含めた比較ゲノム解析を進めていく。
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現在までの達成度 (区分) |
現在までの達成度 (区分)
2: おおむね順調に進展している
理由
2021年度からの持ち越し課題として簡易型別により検出された薬剤耐性遺伝子(blaCTX-M genes)の詳細な遺伝子型の決定を抱えていたが、当初計画した2022年度の課題である「MLST解析」まで進めることができた。
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今後の研究の推進方策 |
これまでに公開されているESBL産生E. coliのゲノム配列のうち、手始めに全配列が完了している株について薬剤耐性遺伝子および遺伝子伝播に関与する遺伝子をリストアップし比較する。さらに下水および臨床から分離されたESBL産生E. coliの中から各STの代表株を選び、全ゲノムシークエンスを行う。基準株のみならず、下水および臨床由来株における薬剤耐性遺伝子や遺伝子伝播に関与する遺伝子の保有・変異状況を調査する。加えて、各STの起源についても基準株の情報を基に明らかにしていく。
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