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早期検出の実現に向けた細菌が放出する生理活性化合物の解析

研究課題

研究課題/領域番号 21K16318
研究種目

若手研究

配分区分基金
審査区分 小区分54030:感染症内科学関連
研究機関大阪大学

研究代表者

山崎 聖司  大阪大学, 高等共創研究院, 准教授 (70757301)

研究期間 (年度) 2021-04-01 – 2024-03-31
研究課題ステータス 完了 (2023年度)
配分額 *注記
4,680千円 (直接経費: 3,600千円、間接経費: 1,080千円)
2022年度: 2,340千円 (直接経費: 1,800千円、間接経費: 540千円)
2021年度: 2,340千円 (直接経費: 1,800千円、間接経費: 540千円)
キーワード耐性菌 / 感染症 / 排出ポンプ / 細菌 / 抗生物質 / 抗菌薬 / 薬剤耐性 / 多剤耐性
研究開始時の研究の概要

治療困難な耐性菌への対応は、国を挙げて取り組まなければならない大きな問題となっている。耐性菌を出現させないためには、抗菌薬の適正使用が最も重要であり、速やかに原因菌とその薬剤耐性能に適した薬を用いた治療を行うことが求められている。

よって本研究では、即日での菌種同定と耐性菌検出を可能にする、細菌の迅速分析技術の基盤を構築する。具体的には、多数の遺伝子組み換え菌株を用いて解析技術の開発・条件の最適化を行うことで、臨床で必要とされている迅速な菌種同定・耐性菌検出に向けた、細菌由来放出化合物測定法を構築する。

研究成果の概要

本研究によって、細胞サイズとイオン漏出量を反映した特定の形状の電流シグナルが、マイクロポアを用いたブリッジ回路内の電位差により発生することを発見し、機械学習を用いたシグナル形状の分類により3種の細菌種を同定することに成功した。
また、抗生物質や生理活性化合物等を菌体外に排出する機能を持つ細菌薬剤排出ポンプに関して、薬剤耐性緑膿菌に存在する共通の変異を複数発見し、迅速な耐性菌判定手法の開発に繋がる成果として、論文を投稿することができた。
さらに、機械学習を用いた培養液から発生する臭気の解析・分類により、細菌種を同定することに成功した。現在菌種をふやして、実用化に向けたさらなる解析を進めている。

研究成果の学術的意義や社会的意義

早期に菌種の同定および耐性菌の検出ができれば、不要な抗菌薬投与を減らすことができ、細菌感染症による死亡者数を減らせるだけでなく、新たな耐性菌出現の抑制、医療費の削減にも大きく貢献することができる。研究期間全体を通じて、当目的の達成に寄与する新デバイスの開発に向けた技術基盤を構築することができた。

報告書

(4件)
  • 2023 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2022 実施状況報告書
  • 2021 実施状況報告書
  • 研究成果

    (46件)

すべて 2024 2023 2022 2021 その他

すべて 国際共同研究 (2件) 雑誌論文 (14件) (うち国際共著 3件、 査読あり 13件、 オープンアクセス 11件) 学会発表 (29件) (うち国際学会 6件、 招待講演 13件) 備考 (1件)

  • [国際共同研究] 国立農学研究所(フランス)

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [国際共同研究] 香港大学(中国)

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [雑誌論文] Changes in the expression of <i>mexB</i>, <i>mexY</i>, and <i>oprD</i> in clinical <i>Pseudomonas aeruginosa</i> isolates2024

    • 著者名/発表者名
      Y. Matsumoto, S. Yamasaki, K. Hayama, R. Iino, H. Noji, A. Yamaguchi, and K. Nishino
    • 雑誌名

      Proceedings of the Japan Academy. Ser. B: Physical and Biological Sciences

      巻: 100 号: 1 ページ: 57-67

    • DOI

      10.2183/pjab.100.006

    • ISSN
      0386-2208, 1349-2896
    • 年月日
      2024-01-11
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Development of a bacterial release compound assay for prevention and early detection of bacteria-derived diseases2024

    • 著者名/発表者名
      S. Yamasaki, N. Koga, T. Hosomi, M. Zwama, C. Jirayupat, T. Yanagida, and K. Nishino
    • 雑誌名

      Medical Science Digest

      巻: 50 ページ: 41-43

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Intestinal and fecal pH in human health2023

    • 著者名/発表者名
      R. Yamamura, KY. Inoue, K. Nishino, and S. Yamasaki
    • 雑誌名

      Frontiers in Microbiomes

      巻: 2 ページ: 1192316-1192316

    • DOI

      10.3389/frmbi.2023.1192316

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Drug resistance and physiological roles of RND multidrug efflux pumps in Salmonella enterica, Escherichia coli and Pseudomonas aeruginosa2023

    • 著者名/発表者名
      Yamasaki Seiji、Zwama Martijn、Yoneda Tomohiro、Hayashi-Nishino Mitsuko、Nishino Kunihiko
    • 雑誌名

      Microbiology

      巻: 169 号: 6 ページ: 001322-001322

    • DOI

      10.1099/mic.0.001322

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Comprehensive analysis of the binding site for efflux transporter inhibitors in Pseudomonas aeruginosa2023

    • 著者名/発表者名
      S. Yamasaki, M. Zwama, N. Koga, K. Sakurai, R. Nakashima, A. Yamaguchi, and K. Nishino
    • 雑誌名

      BIO Clinica

      巻: 38 ページ: 74-78

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Investigating multidrug efflux pumps associated with fatty acid salt resistance in Escherichia coli2023

    • 著者名/発表者名
      Yamasaki Seiji、Yoneda Tomohiro、Ikawa Sota、Hayashi-Nishino Mitsuko、Nishino Kunihiko
    • 雑誌名

      Frontiers in Microbiology

      巻: 14 ページ: 954304-954304

    • DOI

      10.3389/fmicb.2023.954304

    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Vanadyl Naphthalocyanine-Doped Polymer Dots for Near-Infrared Light-Induced Nitric Oxide Release and Bactericidal Effects2023

    • 著者名/発表者名
      Liu Zuoyue、Okada Yuta、Ichinose Yuma、Saitoh Daisuke、Ieda Naoya、Yamasaki Seiji、Nishino Kunihiko、Nakagawa Hidehiko、Fujitsuka Mamoru、Osakada Yasuko
    • 雑誌名

      ACS Applied Nano Materials

      巻: 6 号: 2 ページ: 1487-1495

    • DOI

      10.1021/acsanm.2c05566

    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Drug resistance and physiological roles of RND multidrug efflux pumps in Salmonella enterica, Escherichia coli, and Pseudomonas aeruginosa2023

    • 著者名/発表者名
      Seiji Yamasaki, Martijn Zwama, Tomohiro Yoneda, Mitsuko Hayashi-Nishino, Kunihiko Nishino
    • 雑誌名

      Microbiology

      巻: -

    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Inhibitor binding pits analysis of bacterial multidrug efflux transporters for new drug development2022

    • 著者名/発表者名
      Seiji Yamasaki、Martijn Zwama、Naoki Koga、Keisuke Sakurai、Ryosuke Nakashima、Akihito Yamaguchi、Kunihiko Nishino
    • 雑誌名

      Precision Medicine

      巻: 5 ページ: 56-60

    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Spatial Characteristics of the Efflux Pump MexB Determine Inhibitor Binding2022

    • 著者名/発表者名
      Yamasaki Seiji、Koga Naoki、Zwama Martijn、Sakurai Keisuke、Nakashima Ryosuke、Yamaguchi Akihito、Nishino Kunihiko
    • 雑誌名

      Antimicrobial Agents and Chemotherapy

      巻: 66 号: 11

    • DOI

      10.1128/aac.00672-22

    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Role of the drug efflux pump in the intrinsic cefiderocol resistance of <i>Pseudomonas aeruginosa</i>2022

    • 著者名/発表者名
      Ikawa Sota、Yamasaki Seiji、Morita Yuji、Nishino Kunihiko
    • 雑誌名

      bioRxiv

      巻: -

    • DOI

      10.1101/2022.05.31.494263

    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • オープンアクセス
  • [雑誌論文] Evaluation of efflux pump inhibitors of MexAB- or MexXY-OprM in Pseudomonas aeruginosa using nucleic acid dyes2022

    • 著者名/発表者名
      Masasuke Fujiwara, Seiji Yamasaki, Yuji Morita, Kunihiko Nishino
    • 雑誌名

      Journal of infection and chemotherapy

      巻: 28 号: 5 ページ: 595-601

    • DOI

      10.1016/j.jiac.2022.01.003

    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書 2021 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Analysis of multidrug efflux transporters in resistance to fatty acid salts reveals a TolC-independent function of EmrAB in Salmonella enterica2022

    • 著者名/発表者名
      Yoneda Tomohiro、Sakata Hiroki、Yamasaki Seiji、Hayashi-Nishino Mitsuko、Nishino Kunihiko
    • 雑誌名

      PLOS ONE

      巻: 17 号: 4 ページ: e0266806-e0266806

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0266806

    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Function and Inhibitory Mechanisms of Multidrug Efflux Pumps2021

    • 著者名/発表者名
      Nishino Kunihiko、Yamasaki Seiji、Nakashima Ryosuke、Zwama Martijn、Hayashi-Nishino Mitsuko
    • 雑誌名

      Frontiers in Microbiology

      巻: 12 ページ: 737288-737288

    • DOI

      10.3389/fmicb.2021.737288

    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [学会発表] 健康な愛玩動物由来ステノトロフォモナスマルトフィリアのキノロン耐性機構2024

    • 著者名/発表者名
      齋藤博 、山崎聖司 、西野邦彦 、山岸純一
    • 学会等名
      日本薬学会第144年会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] 細菌共存学の開拓と発展-ヒトと病原細菌・腸内細菌との新たな関係の構築-2024

    • 著者名/発表者名
      山崎聖司
    • 学会等名
      ラボバタカイギin SeekSxpot
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] ポリマードットを活用した新規抗菌剤の開発2024

    • 著者名/発表者名
      山崎聖司、小阪田泰子
    • 学会等名
      SAKIGAKEクラブメンバー交流会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Development of Universal Inhibitors of Drug Efflux Pumps to Overcome Multidrug-Resistant Bacteria2024

    • 著者名/発表者名
      K. Nishino, M. Zwama, S. Yamasaki, M. Fujiwara, M. Shoji
    • 学会等名
      Meeting with CARB-X and Japanese researchers
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Development of Universal Inhibitors of Drug Efflux Pumps to Overcome Multidrug-Resistant Bacterial Infections2024

    • 著者名/発表者名
      S. Yamasaki, K. Nishino
    • 学会等名
      National Centre for Global Health and Medicine (NCGM) and Sir Howard Dalton Centre (HDC), the University of Warwick Joint Japan/ UK Science and Policy workshop
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] 薬剤耐性菌によるパンデミックの阻止に向けた細菌薬剤排出ポンプの構造解析と阻害剤探索2023

    • 著者名/発表者名
      山崎聖司
    • 学会等名
      日本感染症医薬品協会メディカル・サイエンス セミナー
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 消毒薬クロルヘキシジンに曝露したアシネトバクター属の多剤交差耐性機序―排出ポンプおよびポーリンの発現解析を中心としてー2023

    • 著者名/発表者名
      川井眞好、山崎聖司、西野邦彦、山岸純一
    • 学会等名
      日本化学療法学会西日本支部総会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] パンデミック回避に向けた薬剤耐性菌性状解析ナノデバイスの開発2023

    • 著者名/発表者名
      山崎聖司、柳田剛
    • 学会等名
      JASIS
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] 細菌共存学の開拓と発展-ヒトと病原細菌・腸内細菌との新たな関係の構築-2023

    • 著者名/発表者名
      山崎聖司
    • 学会等名
      ナノ薬剤研究会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 細菌共存学の開拓と発展-ヒトと病原細菌・腸内細菌との新たな関係の構築-2023

    • 著者名/発表者名
      山崎聖司
    • 学会等名
      チーム阪大project Meeting
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] パンデミック回避に向けた薬剤耐性菌性状解析ナノデバイスの開発2023

    • 著者名/発表者名
      山崎聖司
    • 学会等名
      人と知と物質で未来を創るクロスオーバーアライアンス活動報告会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 耐性菌感染症の治療薬開発に向けた細菌薬剤排出ポンプの阻害剤結合ピットの解析2023

    • 著者名/発表者名
      山崎聖司、古閑修輝、Martijn Zwama、櫻井啓介、中島良介、山口明人、西野邦彦
    • 学会等名
      チーム阪大Project Meetingリトリート
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] 耐性菌感染症の克服に向けた薬剤排出ポンプ阻害剤の結合部位解析2023

    • 著者名/発表者名
      山崎聖司、古閑修輝、Martijn Zwama、櫻井啓介、中島良介、山口明人、西野邦彦
    • 学会等名
      日本生化学会近畿支部例会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] Efflux pump's spatial properties control inhibitor binding2023

    • 著者名/発表者名
      S. Yamasaki, N. Koga, M. Zwama, K. Sakurai, R. Nakashima, A. Yamaguchi, K. Nishino
    • 学会等名
      9th Symposium on Antimicrobial Resistance in Animals and the Environment (ARAE 2023)
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Global analysis of genes regulated by Rof in Salmonella enterica serovar Typhimurium2023

    • 著者名/発表者名
      Ryo Tanida, Sohei Nakano, Seiji Yamasaki, Atsushi Taguchi, and Kunihiko Nishino
    • 学会等名
      The 26th SANKEN International Symposium
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Development of Universal Inhibitors of Drug Efflux Pumps to Overcome Multidrug-Resistant Pseudomonas aeruginosa Infections2023

    • 著者名/発表者名
      Seiji Yamasaki, Ryosuke Nakashima, Takayoshi Suzuki, and Kunihiko Nishino
    • 学会等名
      Gordon Research Conference
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 細菌共存学の発展 ー病原性に寄与する薬剤排出ポンプの阻害剤開発に向けてー2023

    • 著者名/発表者名
      山崎聖司
    • 学会等名
      日本細菌学会総会
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 多剤耐性菌感染症治療を目的とした両親媒性ヘリカルペプチドの開発2022

    • 著者名/発表者名
      三澤隆史、平野元春、倉島恵愛、山崎聖司、西野邦彦、出水庸介
    • 学会等名
      メディシナルケミストリーシンポジウム
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [学会発表] 細菌共存学の開拓 -ヒトと病原細菌・腸内細菌との新たな関係の構築-2022

    • 著者名/発表者名
      山崎聖司
    • 学会等名
      産研学術講演会
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [学会発表] 新規制御手法の開発による細菌とのより良い共存関係の構築2022

    • 著者名/発表者名
      山崎聖司
    • 学会等名
      第4回COI 学術交流会
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
  • [学会発表] MacABの発現はRho依存型ターミネーターを介して、Rofによって調整されている2022

    • 著者名/発表者名
      中野草平、山崎聖司、田口厚志、西野邦彦
    • 学会等名
      日本薬学会第142年会
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
  • [学会発表] MacABの発現はRho依存型ターミネーターを介して、Rofによって調整されている2022

    • 著者名/発表者名
      中野草平、山崎聖司、田口厚志、西野邦彦
    • 学会等名
      第95回日本細菌学会総会
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
  • [学会発表] 細菌とのより良い共存関係の構築2022

    • 著者名/発表者名
      山崎聖司
    • 学会等名
      第10回大阪大学COIシンポジウム
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 新規抗菌薬セフィデロコル自然抵抗性における緑膿菌薬剤排出ポンプの役割解明2021

    • 著者名/発表者名
      井川創太、山崎聖司、森田雄二、西野邦彦
    • 学会等名
      第33回 微生物シンポジウム
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
  • [学会発表] 腸内フローラの改善による人間力活性化メカニズムの解明2021

    • 著者名/発表者名
      西野邦彦、山崎聖司、熊ノ郷淳
    • 学会等名
      イノベーションジャパン2021(JSTフェア)
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
  • [学会発表] イオン移動度分光の腸内環境センシングへの応用2021

    • 著者名/発表者名
      氏本勝也、向井琢雄、山崎聖司、西野邦彦
    • 学会等名
      イノベーションジャパン2021(JSTフェア)
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
  • [学会発表] 大阪大学拠点における若手活動の振り返り2021

    • 著者名/発表者名
      山崎聖司
    • 学会等名
      プレ第6回COI2021 会議
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] The increasingly pressing role of RND-type efflux pumps in multidrug resistant pathogens2021

    • 著者名/発表者名
      Martijn Zwama, Ryosuke Nakashima, Seiji Yamasaki, Kunihiko Nishino
    • 学会等名
      10th imec Handai International Symposium
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] 細菌活動のコントロールによる新たな共存関係の構築2021

    • 著者名/発表者名
      山崎聖司
    • 学会等名
      第3回ファーマラボEXPO
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [備考] researchmap

    • URL

      https://researchmap.jp/yamasakiseiji

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書

URL: 

公開日: 2021-04-28   更新日: 2025-01-30  

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