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周極要素植物の緯度傾度に伴う環境適応と進化多様性形成

研究課題

研究課題/領域番号 22405013
研究種目

基盤研究(B)

配分区分補助金
応募区分海外学術
研究分野 生物多様性・分類
研究機関京都大学

研究代表者

瀬戸口 浩彰  京都大学, 人間・環境学研究科(研究院), 教授 (70206647)

研究分担者 池田 啓  岡山大学, 資源植物科学研究所, 助教 (70580405)
藤井 紀行  熊本大学, 大学院自然科学研究科, 准教授 (40305412)
東 浩司  京都大学, 大学院理学研究科, 助教 (50362439)
研究期間 (年度) 2010-04-01 – 2014-03-31
研究課題ステータス 完了 (2013年度)
配分額 *注記
18,070千円 (直接経費: 13,900千円、間接経費: 4,170千円)
2013年度: 3,900千円 (直接経費: 3,000千円、間接経費: 900千円)
2012年度: 4,550千円 (直接経費: 3,500千円、間接経費: 1,050千円)
2011年度: 4,290千円 (直接経費: 3,300千円、間接経費: 990千円)
2010年度: 5,330千円 (直接経費: 4,100千円、間接経費: 1,230千円)
キーワード系統地理学 / 周極高山植物 / 適応 / 環境 / フィトクロム / 緯度 / 開花 / 起源 / 周極要素植物 / 高山植物 / 光環境 / 開花時期 / 種内多型 / 系統 / アブラナ科 / マメ科 / 花成 / 環境適応 / 周極植物 / 地域分化 / 異所的種分化 / 系統地理 / 進化
研究概要

本研究では、光受容色素タンパク質(フィトクロムなど)の花成に関与する遺伝子が、高緯度~低緯度の環境傾度の中で、機能分化をどのように起こしているか解析した。アブラナ科のCardamine nipponicaとC. bellidifoliaを主体にして用いて、計画通りに知見を得た:高緯度の個体は種を超えてPHYEを特化させており、C. nipponicaの低緯度個体は独自のPHYEアリルを保有していた。また、ツツジ科のツガザクラ属においては、周極要素植物の起源が北にあるという従来仮説を否定する知見を得た。以上の研究はロシア科学アカデミーやノルウエーのオスロ大学との共同研究体制にて遂行した。

報告書

(5件)
  • 2013 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2012 実績報告書
  • 2011 実績報告書
  • 2010 実績報告書
  • 研究成果

    (44件)

すべて 2014 2013 2012 2011 その他

すべて 雑誌論文 (25件) (うち査読あり 25件、 オープンアクセス 2件) 学会発表 (15件) 図書 (1件) 備考 (3件)

  • [雑誌論文] Molecular evidence of ancient relicts of arctic-alpine plants in East Asia2014

    • 著者名/発表者名
      Ikeda, H., Barkalov, V., Yakubov, V.V., Setoguchi, H.
    • 雑誌名

      New Phytologists

      巻: (in press)

    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Development of microsatellite markers for Vitex rotundifolia (Verbenaceae), an endangered coastal plant isolated in Lake Biwa, Japan2014

    • 著者名/発表者名
      T., Shoda, T., Kaneko, Y., Setogu
    • 雑誌名

      ApPlications in Plant Sciences.

      巻: 2(4) 号: 4 ページ: 1-3

    • DOI

      10.3732/apps.1300100

    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Genetic differentiation and genetic diversity of Castanopsis (Fagaceae), the dominant tree species in Japanese broadleaved evergreen forests, revealed by analysis of EST associated microsatellites2014

    • 著者名/発表者名
      Kyoko AOKI, Saneyosni UENO, Takashi KAMIJO, Hiroaki SETOGUCHI, Noriaki MURAKAMI, Makoto KATO, Yoshihiko TSUMURA
    • 雑誌名

      PLOS ONE

      巻: 9 号: 1 ページ: 1-13

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0087429

    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Molecular evidence of ancient relicts of arctic-alpine plants in East Asia.2014

    • 著者名/発表者名
      Ikeda, H., Barkalov, V., Yakubov, V.V., Setoguchi, H.
    • 雑誌名

      New Phytologists

      巻: in press

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Molecular phylogeny of Shortia sensu lato (Diapensiaceae) based on multiple nuclear sequences2014

    • 著者名/発表者名
      Higashi, H., Ikeda, H., Setoguchi, H.
    • 雑誌名

      Plant Systematics and Evolution

      巻: in press

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Geographical differentiation inferred from flavonoid content between coastal and freshwater populations of the coastal plant Lathyrus japonicus (Fabaceae)2013

    • 著者名/発表者名
      Ohtsuki, T., Murai, S., Iwashina, T. Setoguchi, H.
    • 雑誌名

      Biochemical Systematics and Ecology

      巻: 51 ページ: 243-250

    • DOI

      10.1016/j.bse.2013.09.004

    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Multiple introgression events and range shifts in Schizocodon (Diapensiaceae) during the Pleistocene2013

    • 著者名/発表者名
      Higashi, H., Sakaguchi, S., Ikeda, H., Isagi, Y., Setoguchi, H.
    • 雑誌名

      Botanical Journal of the Linnean Society

      巻: 173 号: 1 ページ: 46-63

    • DOI

      10.1111/boj.12074

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書 2013 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Recent colonization by a coastal plant of inland habitats at an ancient freshwater lake, Lake Biwa : multilocus sequencing and a demographic history of Lathyrus japonicus (Fabaceae)2013

    • 著者名/発表者名
      Ohtsuki, T., Ikeda, H., Setoguchi, H.
    • 雑誌名

      Ecology and Evolution

      巻: 3 号: 8 ページ: 2600-2611

    • DOI

      10.1002/ece3.654

    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] A multilocus sequencing approach reveals the cryptic phylogeographic history of Phyllodoce nipponica Makino (Ericaceae)2013

    • 著者名/発表者名
      Ikeda, H., Setoguchi, H.
    • 雑誌名

      Biological Journal of the Linnean Society

      巻: 110 号: 1 ページ: 214-226

    • DOI

      10.1111/bij.12116

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書 2013 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Phylogeographic study of Phyllodoce aleutica (Ericaceae) in the Japanese archipelago2013

    • 著者名/発表者名
      Ikeda, H., Setoguchi, H.
    • 雑誌名

      Bulletin of the National Science Museum of Nature and Science, Series B

      巻: 39 ページ: 87-94

    • NAID

      40019655336

    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] New microsatellite markers for Tricyrtis macrantha (Convallariaceae) and cross-amplification in closely related species2013

    • 著者名/発表者名
      Ohki, M., Setoguchi, H.
    • 雑誌名

      Applications in Plant Sciences

      巻: 1 号: 5 ページ: 1200247-1200247

    • DOI

      10.3732/apps.1200247

    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Phylogeographic study of Phyllodoce aleutica (Ericaceae) in the Japanese archipelago.2013

    • 著者名/発表者名
      Ikeda, H., Setoguchi, H.
    • 雑誌名

      Bulletin of the National Science Museum of Nature and Science, Series B

      巻: 39 ページ: 87-94

    • NAID

      40019655336

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Demographic histories of adaptively diverged riparian and non-riparian species of Ainsliaea (Asteraceae) inferred from coalescent analyses using nuclear loci2012

    • 著者名/発表者名
      Mitsui Y., Setoguchi H.
    • 雑誌名

      BMC Evolutionary Biology

      巻: 12 号: 1 ページ: 1-14

    • DOI

      10.1186/1471-2148-12-254

    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書 2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Genetic diversity of symbiotic cyanobacteriain Cycas revoluta (Cycadaceae)2012

    • 著者名/発表者名
      Yamada, S., Okubo, S., Miyashita, H., Setoguchi, H.
    • 雑誌名

      FEMS Microbiology and Ecology

      巻: 81 号: 3 ページ: 696-706

    • DOI

      10.1111/j.1574-6941.2012.01403.x

    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書 2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Isolation and characterization of microsatellite loci in Asarumleucosepalum (Aristolochiaceae), an endangered plant endemic to Tokunoshima Island in the Ryukyu Archipelago2012

    • 著者名/発表者名
      Matsuda, J., Setoguchi, H.
    • 雑誌名

      Conservation Genetics Resources

      巻: 4 号: 3 ページ: 579-581

    • DOI

      10.1007/s12686-011-9596-z

    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Evolution of an alpine endemic plant at the arctic-alpine range periphery following Pleistocene climatic oscillations2012

    • 著者名/発表者名
      Ikeda, H., Carlsen, T., Fujii, N., Brochmann, C, Setoguchi, H.
    • 雑誌名

      New Phytologist

      巻: 194 号: 2 ページ: 583-594

    • DOI

      10.1111/j.1469-8137.2012.04061.x

    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書 2012 実績報告書 2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Polymorphismof DNA sequences of crypto chrome genes is not associated with the photoperiodic flowering of wild soybean along a latitudinal cline2012

    • 著者名/発表者名
      Ishibashi, N., Setoguchi, H.
    • 雑誌名

      Journal of Plant Research

      巻: (in press) 号: 4 ページ: 483-488

    • DOI

      10.1007/s10265-011-0470-6

    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書 2012 実績報告書 2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Population fragmentation caused randomly fixed genotype in each population of Arabidopsis kamchatica in the Japanese archinelago2012

    • 著者名/発表者名
      Higashi, H., Ikeda, H., Setoguchi, H.
    • 雑誌名

      Journal of Plant Research

      巻: 125 号: 2 ページ: 223-233

    • DOI

      10.1007/s10265-011-0436-8

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書 2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Molecular evolution of crypto chrome genes and the evolutionary manner of photoreceptor genes in Card amine nipponica2011

    • 著者名/発表者名
      Ikeda H., Fujii N., Setoguchi H
    • 雑誌名

      Journal of Plant Research

      巻: 124 号: 1 ページ: 85-92

    • DOI

      10.1007/s10265-010-0361-2

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Speciation by ecologically-based reproductive isolation in plant species under contrasting streamside and forest understory environments.2011

    • 著者名/発表者名
      Mitsui, Y., Nomura, N., Isagi, Y., Tobe, H., Setoguchi, H.
    • 雑誌名

      Evolution

      巻: 65 ページ: 335-349

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Homogeneous genetic structure and variation of tree architecture of Larix kaempferi along altitudinal gradients on Mt.Fuji.2011

    • 著者名/発表者名
      Nishimura, M, Setoguchi, H.
    • 雑誌名

      Journal of Plant Research

      巻: 124 ページ: 253-263

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Long-term isolation of coastal plant Calystegia soldanella in an ancient lake Biwa, Japan.2011

    • 著者名/発表者名
      Noda, A., Mitsui, Y., Ikeda, H., Setoguchi, H.
    • 雑誌名

      Biological Journal of the Linnean Society

      巻: 102 ページ: 51-66

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Molecular phylogeny of Shortia sensu lato (Diapensiaceae) based on multiple nuclear sequences

    • 著者名/発表者名
      Higashi, H., Ikeda, H., Setoguchi, H.
    • 雑誌名

      Plant Systematics and Evolution

      巻: (in press)

    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Polymorphisms of E1 and GIGANTEAin wild populations of Lotus japonicus

    • 著者名/発表者名
      Wakabayashi, T., Oh, H., Kawaguchi, M., Harada, K., Sato, S., Ikeda, H. Setoguchi, H.
    • 雑誌名

      Journal of Plant Research

      巻: (in press)

    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Reclassification of Schizocodon sildanelloides var. minimus (Diapensiaceae)

    • 著者名/発表者名
      Higashi, H., Setoguchi, H.
    • 雑誌名

      Acta Phytotaxonomica et Geobotanica

      巻: (in press)

    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] Pleistocene speciation and biogeographic history of arctic-alpine plant2013

    • 著者名/発表者名
      Ikeda, H., Yakubov, V., Barkalov, V., Setoguchi, H.
    • 学会等名
      ESBE 2013 XIV : Congress of the European Society for Evolutionary Biology
    • 発表場所
      The University of Lisbon, Lisbon, Portugal
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [学会発表] Multiple introgression events and range shifts in Schizocodon (Diapensiaceae) during the Pleistocene2013

    • 著者名/発表者名
      Higashi, H., Sakaguchi, S., Ikeda, H., Isagi, Y., Setoguchi, H.
    • 学会等名
      The 11^<th> IntEcol (The International Association for Ecology) 2013
    • 発表場所
      London, UK
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [学会発表] Unique genetic structure of an varctic-alpine plant, Vaccinium vitis-idaea (Ericaceae), in the Japanese archipelago2013

    • 著者名/発表者名
      Ikeda, H., Higashi, H., Brochmann, C., Setoguchi, H.
    • 学会等名
      日本生態学会
    • 発表場所
      静岡県コンベンションアーツセンター
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [学会発表] ツガザクラ属Phyllodoce の分子系統解析と日本固有高山植物ツガザクラPhyllodoce nipponica の起源2013

    • 著者名/発表者名
      池田啓,Valentin Yakubov,Viachenslav Barkalov,Marr Kendrik,瀬戸口浩彰
    • 学会等名
      日本植物学会第77大会
    • 発表場所
      北海道大学,札幌
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [学会発表] Pleistocene speciation and biogeographic history of arctic-alpine plant.2013

    • 著者名/発表者名
      Ikeda, H., Yakubov, V., Barkalov, V., Setoguchi, H.
    • 学会等名
      ESBE 2013 XIV: Congress of the European Society for Evolutionary Biology
    • 発表場所
      The University of Lisbon, Lisbon, Portugal.
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] Multiple introgression events and range shifts in Schizocodon (Diapensiaceae) during the Pleistocene.2013

    • 著者名/発表者名
      Higashi, H., Sakaguchi, S., Ikeda, H., Isagi, Y., Setoguchi, H.
    • 学会等名
      The 11th IntEcol (The International Association for Ecology) 2013
    • 発表場所
      London, UK.
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] ツガザクラ属Phyllodoceの分子系統解析と日本固有高山植物ツガザクラPhyllodoce nipponicaの起源.2013

    • 著者名/発表者名
      池田啓,Valentin Yakubov,Viachenslav Barkalov,Marr Kendrik,瀬戸口浩彰
    • 学会等名
      日本植物学会第77大会
    • 発表場所
      北海道大学,札幌
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] Molecular evolution of photoreceptor genes between sister species2012

    • 著者名/発表者名
      Ikeda, H., Gustafsson, L., Brochmann, C., Setoguchi, H.
    • 学会等名
      Evolution Ottawa (1^<st> Joint Congress on Evolutionary Biology : American Society of Naturalist, European Society for Evolutionary Biology, Society of the Study of Evolution, Society of Systemtic Biologist, Canadian Society of Systematic Biologists)
    • 発表場所
      Ottawa, Canada
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [学会発表] Molecular evolution of photoreceptor genes between sister species.2012

    • 著者名/発表者名
      Ikeda, H., Gustafsson, L., Brochmann, C., Setoguchi, H.
    • 学会等名
      Evolution Ottawa (1st Joint Congress on Evolutionary Biology)
    • 発表場所
      Ottawa, Canada
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] Recent colonization of a coastal plant into inland habitats at an ancient freshwater lake, Lake Biwa.2012

    • 著者名/発表者名
      Ohtsuki, T., Ikeda, H., Setoguchi, H.
    • 学会等名
      Evolution Ottawa (1st Joint Congress on Evolutionary Biology)
    • 発表場所
      Ottawa, Canada
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] 周極―高山植物における種分化と光受容体の分子進化2012

    • 著者名/発表者名
      池田啓、岡義人、Lovisa, G., Brochmann, C., 長谷あきら、瀬戸口浩彰
    • 学会等名
      日本植物学会第76回大会
    • 発表場所
      兵庫県立大学、姫路
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] ミヤコグサの開花時期変異とこれを制御する遺伝子群の多型:種内の進化をもたらす機構2012

    • 著者名/発表者名
      呉ハナ・川口正代司・原田久也・瀬戸口浩彰
    • 学会等名
      日本植物分類学会第11回大会
    • 発表場所
      大阪学院大学
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] ツガザクラにおける核遺伝子と葉緑体の矛盾した地理構造2012

    • 著者名/発表者名
      池田啓
    • 学会等名
      日本植物分類学会第11回大会
    • 発表場所
      大阪学院大学
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] 進化を続ける植物たち:環境適応と植物の種内分化2011

    • 著者名/発表者名
      瀬戸口浩彰
    • 学会等名
      首都大学東京バイオコンフェレンス
    • 発表場所
      首都大学東京(招待講演)
    • 年月日
      2011-11-11
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] Ecological speciation in the presence of gene flow in the flood-resistant plant Ainsliaea(Asteraceae).2011

    • 著者名/発表者名
      Yuki, M., Setoguchi, H.
    • 学会等名
      日中韓・東アジア植物分類学シンポジウム
    • 発表場所
      ソウル大学(韓国・ソウル市)(招待講演)
    • 年月日
      2011-08-22
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [図書] 日本の固有植物-国立科学博物舘叢書11巻2011

    • 著者名/発表者名
      瀬戸口浩彰(分担執筆)
    • 総ページ数
      503
    • 出版者
      東海大学出版会
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [備考]

    • URL

      http://setolab.h.kyoto-u.ac.jp

    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [備考]

    • URL

      http://web.mac.com/setoguch_labo/iWeb/Site/Welcome.html

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [備考]

    • URL

      http://web.mac.com/setoguchi_labo/iWeb/Site/Welcome.html

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書

URL: 

公開日: 2010-08-23   更新日: 2019-07-29  

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